一种基于布谷鸟搜索算法识别关键蛋白质的方法

摘要

本发明公开的一种基于布谷鸟搜索算法识别关键蛋白质的方法，发明属于生物信息技术领域，通过将蛋白质相互作用网络转化为无向图、对蛋白质相互作用网络进行去噪处理、获取蛋白质对应的基因表达数据、亚细胞定位信息、标准的蛋白质复合物信息以及GO注释信息、对纯化后的蛋白质相互作用网络的边和结点进行加权处理、产生鸟巢、产生布谷鸟、更新鸟巢适应值并产生关键蛋白质。本发明能准确地识别关键蛋白质；仿真实验结果表明，灵敏度、特异性、F测度、阳性预测值、阴性预测值以及正确率等指标较优；与其他现有识别方法相比，将布谷鸟搜索算法的优化特性与蛋白质相互作用网络的拓扑特征进行结合来识别关键蛋白质，提高了关键蛋白质的识别准确率。