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一种具有单碱基分辨率的检测DNA甲基化和单核苷酸变异的测序文库及应用

摘要

本发明提供了一种发夹状的接头以及利用所述发夹状接头同时检测DNA甲基化和单核苷酸变异的方法,属于基因变异检测和表观遗传修饰检测技术领域;所述接头具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列,所述发夹状接头的5’至3’方向3位和4位上的胞嘧啶是甲基化修饰的胞嘧啶。所述方法包括以下步骤:基因组DNA片段化后进行末端修复加A尾,连接所述的发夹状接头和甲基化测序接头,重亚硫酸盐转化,PCR扩增,收集扩增产物获得测序文库;测序后进行生物信息学分析获得DNA甲基化和单核苷酸变异位点,本方法可以在只测一套数据的情况下同时精确检测DNA甲基化和单核苷酸变异,可以节省50%的成本。

著录项

  • 公开/公告号CN108949945B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-02-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国科学院动物研究所;

    申请/专利号CN201810913924.9

  • 发明设计人 梁加龙;张坤;滕花景;孙中生;

    申请日2018-08-10

  • 分类号C40B40/08(20060101);

  • 代理机构11569 北京高沃律师事务所;

  • 代理人刘奇

  • 地址 100000 北京市朝阳区北辰西路1号院5号

  • 入库时间 2022-08-23 11:33:19

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