一种基于副本交换和有偏分布估计的蛋白质构象空间优化方法

摘要

一种基于副本交换和有偏分布估计的蛋白质构象空间优化方法，首先，根据种群初始化得到多个在不同温度下初始化后副本种群构象；然后，交换相邻温度的种群个体，增加了构象空间采样的多样性；在完成副本交换最大迭代次数后，统计每个片段的组装概率，使用有偏分布估计算法，获得比例更高的低能量构象，加快了搜索向全局最优收敛的速度，提高了搜索效率；最后，将所有副本种群合并成一个种群，按能量由低到高排序，挑选排名靠前的优秀个体作为最终种群个体，输出最终种群构象，本发明提供一种预测精度较高的基于副本交换和有偏分布估计的蛋白质构象空间优化方法。