一种基于片段组装的蛋白质构象空间优化算法

摘要

针对蛋白质构象空间优化问题,提出一种基于片段组装的构象空间优化算法.算法利用基于Rosetta粗粒度的知识能量模型有效地提高了收敛速度;同时,借助片段组装技术可以有效弥补因能量函数不精确而导致的预测精度不足的缺陷;此外,差分进化算法的引入使得算法具有较好的全局搜索能力.5种测试蛋白的实验结果表明,所提算法具有较好的搜索性能和预测精度.