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基于动态加权蛋白质相互作用网络的蛋白质复合物挖掘方法

摘要

本公开提供一种基于动态加权蛋白质相互作用网络的蛋白质复合物挖掘方法,包括以下步骤:利用基因表达谱数据过滤不具有活性的蛋白质,构建动态蛋白质相互作用网络,再利用综合权值度量为动态蛋白质相互作用网络加权并添加新的相互作用,进而构建动态加权蛋白质相互作用网络;利用蛋白质的关键性和复合物的内在属性来构建蛋白质复合核;采用模糊粒度的相似度函数改进蚁群算法的拾起规则,利用紧密度优化放下规则,实现蛋白质复合物的挖掘;利用局部权值更新策略来实现不同代蚁群之间的最优解信息的传递,采用全局权值更新策略实现相邻时刻动态加权蛋白质相互作用网络之间的功能信息传递;以及输出挖掘出的蛋白质复合物。

著录项

  • 公开/公告号CN109509509B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-12-22

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 江西理工大学;

    申请/专利号CN201811145616.2

  • 发明设计人 毛伊敏;朱海湾;胡健;

    申请日2018-09-29

  • 分类号G16B25/10(20190101);G16B20/00(20190101);G16B40/30(20190101);

  • 代理机构11551 北京鼎承知识产权代理有限公司;

  • 代理人李伟波;韩德凯

  • 地址 341000 江西省赣州市章贡区红旗大道86号

  • 入库时间 2022-08-23 11:26:06

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