基于转录组的肿瘤新抗原鉴定方法

摘要

本发明公开了基于转录组的肿瘤抗原鉴定方法，包括获取患者肿瘤组织的RNA样本，对RNA样本建库和扩增，获得肿瘤组织的RNA样本测序结果；将RNA样本测序结果的短读段比对到人类参考基因组，获得RNA比对结果；根据RNA比对结果计算基因表达量，根据RNA比对结果进行突变检测和预测融合基因事件；根据比对结果预测转录组HLA分型；计算基因表达量、突变检测和预测融合基因事件；将转录组样本的基因表达量，转录组突变位点在全外测序样本中的深度，新生短肽与患者HLA分型的结合力作为分析结果交给下游分析人员四个步骤。本发明提供了一种能够从肿瘤患者转录组NGS数据中鉴定出个体样本的肿瘤特异性抗原的方法。