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基于kendall相关系数的DNA序列相似性比对方法

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本发明公开基于kendall相关系数的DNA序列相似性比对方法，其包括如下步骤：1)获取N条待比对的DNA序列；2)选取长度k，按滑动窗口的方式获取每对组合DNA序列的相应的k词，并组合成相应的向量3)以步骤2)所获取的k词，计算每个k词在DNA序列中出现的次数即计算k词在DNA序列中出现的频率向量，将其记为x

著录项

公开/公告号CN106778078B

专利类型发明专利
公开/公告日2019-04-09

原文格式PDF
申请/专利权人福建师范大学;
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申请/专利号CN201611186639.9
发明设计人林劼;林丽玉;江育娥;
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申请日2016-12-20
分类号
代理机构福州君诚知识产权代理有限公司;
代理人彭东
地址 350108 福建省福州市闽侯县上街镇大学城福建师范大学科技处
入库时间 2022-08-23 10:29:11

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2019-04-09

授权

授权
2017-06-23

实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/22 申请日:20161220

实质审查的生效
2017-06-23

实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/22 申请日:20161220

实质审查的生效
2017-05-31

公开

公开
2017-05-31

公开

公开

相似文献

专利
中文文献
外文文献

1. 基于kendall相关系数的DNA序列相似性比对方法 [P] . 中国专利： CN106778078B . 2019.04.09
2. 基于kendall相关系数的DNA序列相似性比对方法 [P] . 中国专利： CN106778078A . 2017-05-31
3. Based on the similarity of the alignment of the counting method for quantifying the differences between the related biopolymer sequences [P] . 德国专利： DE69737215T2 . 2007-11-08

机译：基于比对方法的相似性，用于量化相关生物聚合物序列之间的差异的计数方法
4. The difference which is during living body high-molecular arraying which it is related is based on the alignment in order to measure the similarity evaluation method [P] . 日本专利： JP3073533B2 . 2000-08-07

机译：相关的活体高分子排列时的差异是基于比对，以测量相似性评价方法
5. Alignment-based similarity scoring methods for quantifying the differences between related biopolymer sequences [P] . 美国专利： US5873052A . 1999-02-16

机译：基于比对的相似性评分方法，用于量化相关生物聚合物序列之间的差异