一种病原微生物基因组快速分析方法及系统

摘要

本发明公开了一种病原微生物基因组快速分析方法及数据分析平台；该方法在菌株数据库系统的基础上提供了基于细菌基因组序列的分型与溯源功能，用户只需作简单的参数设置并上传菌株的基因组序列，系统将在极短的时间内反馈该菌株的MLST分型结果、耐药与毒力基因分布、参考菌株名称并提供用户上传菌株与数据库中所有菌株间的系统发生树。该方法适用于建立一个整合遗传学、基因组学和系统发育学研究的病原微生物学数据分析平台。与现有的分型技术相比，分辨率更高，能更准确区同一克隆的菌株；结果反馈速度快，采用高效的参考菌株设定与基因组SNP序列映射技术，用户可快速获得数据分析结果，便于病原微生物克隆传播的实时跟踪与快速溯源。