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一种识别蛋白质相互作用网络中关键蛋白质的方法

摘要

本发明公开了一种识别蛋白质相互作用网络中关键蛋白质的方法,根据蛋白质相互作用数据,构建无向图G,计算图的边聚类系数,本发明与现有的技术相比,在考虑蛋白质相互作用网络拓扑结构特性的基础上,结合基因表达谱数据和基因功能注释信息数据,整合三组数据来预测关键蛋白,能有效的减少单个数据源数据噪声对预测准确性的影响,通过计算蛋白质相互作用网络的边聚类系数、基因表达值的皮尔逊相关系数以及基因功能相似性指数这三类数据所体现的关键蛋白特性结合起来预测网络中关键蛋白,本发明可以显著提高蛋白质相互作用网络中关键蛋白的识别准确度,并且可以一次预测出大量的关键蛋白质,解决了生物实验方法的昂贵成本和耗时的问题。

著录项

  • 公开/公告号CN105279397B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-12-19

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 华东交通大学;

    申请/专利号CN201510701754.4

  • 发明设计人 张伟;徐佳;朱姝;李雄政;

    申请日2015-10-26

  • 分类号G06F19/18(20110101);

  • 代理机构36126 南昌华成联合知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人黄晶

  • 地址 330000 江西省南昌市昌北经济开发区双港路

  • 入库时间 2022-08-23 10:04:51

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-12-19

    授权

    授权

  • 2017-12-12

    著录事项变更 IPC(主分类):G06F19/18 变更前: 变更后: 申请日:20151026

    著录事项变更

  • 2016-02-24

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/18 申请日:20151026

    实质审查的生效

  • 2016-01-27

    公开

    公开

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