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蛋白质复合体挖掘的加权组装聚类方法

摘要

本发明公开了一种蛋白质复合体挖掘的加权组装聚类方法,包括:输入一个蛋白质相互作用网络,产生一个无向图,选择m个聚类方法应用到这个网络上,得到m个聚类结果;对每个基本聚类结果,重新生成一个特征网络,得到m个特征网络,对应m个特征矩阵;对m个特征矩阵进行合成,获取合成矩阵W:其中uq是第q个特征网络的权重,uq≥0,且满足合成矩阵W对应一个新的网络,其中元素Wi,j是度量新网络中蛋白质i和蛋白质j的相似程度;采用贝叶斯非负矩阵分解算法挖掘该新网络中的聚类;把权重的学习和复合体发现整合为一个优化目标,从而通过聚类结果来优化权重,反之用权重结果来指导聚类;优化终止后获取最终的蛋白质复合体挖掘结果。

著录项

  • 公开/公告号CN103235900B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2016-03-30

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中山大学;

    申请/专利号CN201310104854.X

  • 发明设计人 欧阳乐;戴道清;张晓飞;

    申请日2013-03-28

  • 分类号G06F19/12(20110101);

  • 代理机构44102 广州粤高专利商标代理有限公司;

  • 代理人林丽明

  • 地址 510275 广东省广州市新港西路135号中山大学

  • 入库时间 2022-08-23 09:37:28

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2016-03-30

    授权

    授权

  • 2013-09-04

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/12 申请日:20130328

    实质审查的生效

  • 2013-08-07

    公开

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