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一种基于通量平衡分析的代谢网络关键因子挖掘方法

摘要

本发明公开了一种基于通量平衡分析的代谢网络关键因子挖掘方法。该方法不需要复杂的领域知识,通过输入代谢网络以及目标化合物,可以直接挖掘对目标化合物影响最大的多个反应,用于快速辅助生物学家优化的代谢网络。本发明首先对已有代谢网络进行建模,并且确定需要生产的目标产物,并依据FBA对代谢网络中可以产生目标产物的反应进行分析,进而使用基于遗传算法的最大通量变化计算方法来计算每个反应对目标代谢物通量对影响,并依次确定对通量影响最大的top‑k个代谢反应作为关键因子。本发明为代谢途径设计和优化提供了候选的关键因子。

著录项

  • 公开/公告号CN115762663A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2023-03-07

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 武汉大学;

    申请/专利号CN202211432147.9

  • 发明设计人 刘娟;杨锋;杨志辉;张小蕾;张蔷;

    申请日2022-11-16

  • 分类号G16C20/60;G16C20/70;

  • 代理机构武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙);

  • 代理人李炜

  • 地址 430072 湖北省武汉市武昌区珞珈山武汉大学

  • 入库时间 2023-06-19 18:46:07

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-03-07

    公开

    发明专利申请公布

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