检测pSTAT3表达水平的试剂在鉴别PTCL-NOS与ALK-ALCL中的应用

摘要

本发明公开了检测pSTAT3表达水平的试剂在鉴别PTCL‑NOS与ALK‑ALCL中的应用，涉及生物医疗技术领域，本发明发现通过对样本STAT3‑S727的磷酸化水平进行检测，能够很好的用于鉴定表达CD30的PTCL‑NOS和ALK‑ALCL，鉴别过程简单快速，且特异性高，灵敏度好，为表达CD30的PTCL‑NOS和ALK‑ALCL的鉴别诊断提供了新的有效途径。

说明书

技术领域

本发明涉及生物医疗技术领域，具体而言，涉及检测pSTAT3表达水平的试剂在鉴别PTCL-NOS与ALK-ALCL中的应用。

背景技术

外周T细胞淋巴瘤非特指型(PTCL-NOS)是一个具有异质性生物学特征和临床表现的疾病实体。由于PTCL-NOS是排除性诊断，因此，需与各种其他类型的成熟T细胞淋巴瘤进行鉴别诊断。

在实际工作，一部分PTCL-NOS可弥漫强表达CD30，需与ALK阴性的间变大细胞淋巴瘤(ALK-ALCL)进行鉴别诊断。然而，当组织学形态不典型或标本处理问题造成的CD30染色不可靠时，PTCL-NOS难与ALK-ALCL进行鉴别。

同时，临床研究发现将表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL进行区分对于患者接受可靠的治疗有重要意义。表达CD30的PTCL-NOS在预后和对CD30靶向治疗的反应方面与ALK-ALCL不同，这就要求病理学家能使用新的生物标志物来辅助CD30+PTCL-NOS和ALK-ALCL的鉴别诊断。

鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的目的在于提供检测pSTAT3表达水平的试剂在鉴别PTCL-NOS与ALK-ALCL中的应用。

本发明是这样实现的：

第一方面，本发明实施例提供了检测样本中pSTAT3表达水平的试剂在制备用于鉴别表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的试剂或试剂盒中的应用，所述pSTAT3包括pSTAT3-S727。

第二方面，本发明实施例提供了一种表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别模型的训练方法，其包括：获取训练样本中pSTAT3表达水平以及对应的标注结果，所述pSTAT3为如前述实施例中所述的pSTAT3；将所述训练样本中pSTAT3表达水平输入预先构建好的鉴别模型中，获得鉴别结果；所述鉴别模型用于根据样本中pSTAT3表达水平判断样本为表达CD30的PTCL-NOS或ALK-ALCL；根据所述标注结果和所述鉴别结果对所述模型进行参数更新。

第三方面，本发明实施例提供了一种表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别装置，其包括获取模块和鉴别模块。获取模块，用于获取待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果，所述pSTAT3为如前述实施例中所述的pSTAT3；鉴别模块，用于将所述待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果输入如前述实施例所述的训练方法训练好的鉴别模型中，获得待测样本的鉴别结果。

第四方面，本发明实施例提供了一种表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别模型的训练装置，其包括获取模块、鉴别模块和参数更新模块。获取模块，用于获取训练样本中pSTAT3表达水平以及对应的标注结果，所述pSTAT3为如前述实施例中所述的pSTAT3；鉴别模块，用于将所述训练样本中pSTAT3表达水平输入预先构建好的鉴别模型中，获得鉴别结果；所述鉴别模型用于根据样本中pSTAT3表达水平判断样本为表达CD30的PTCL-NOS或ALK-ALCL；参数更新模块，用于根据所述标注结果和所述鉴别结果对所述模型进行参数更新。

第五方面，本发明实施例提供了一种电子设备，所述电子设备包括处理器和存储器；所述存储器用于存储程序，当所述程序被所述处理器执行时，使得所述处理器实现如前述实施例所述的表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别模型的训练方法或表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别方法；所述鉴别方法包括以下步骤：获取待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果，将所述待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果输入如前述实施例所述的训练方法训练好的鉴别模型中，获得待测样本的鉴别结果。

第六方面，本发明实施例提供了一种计算机可读介质，所述计算机可读介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现如前述实施例所述的表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别模型的训练方法或表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别方法；所述鉴别方法包括以下步骤：获取待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果，将所述待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果输入如前述实施例所述的训练方法训练好的鉴别模型中，获得待测样本的鉴别结果。

本发明具有以下有益效果：

本发明发现，通过对样本STAT3的丝氨酸(S727)的磷酸化水平进行检测，能够很好的用于鉴定CD30+表达CD30的PTCL-NOS和ALK-ALCL，鉴别过程简单快速，且特异性高，灵敏度好，为表达CD30的PTCL-NOS和ALK-ALCL的鉴别诊断提供了新的有效途径。

附图说明

为了更清楚地说明本发明实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，应当理解，以下附图仅示出了本发明的某些实施例，因此不应被看作是对范围的限定，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他相关的附图。

图1为CD30+PTCL-NOS与ALK-ALCL鉴别的ROC曲线。

具体实施方式

为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市售购买获得的常规产品。

本发明实施例提供了检测样本中pSTAT3表达水平的试剂在制备用于鉴别表达CD30的PTCL-NOS(CD30+PTCL-NOS)与ALK-ALCL的试剂或试剂盒中的应用，所述pSTAT3包括pSTAT3-S727。

本发明发现，通过对样本STAT3的丝氨酸(S727)的磷酸化水平进行检测，能够很好的用于鉴定CD30+表达CD30的PTCL-NOS和ALK-ALCL，鉴别过程简单快速，且特异性高，灵敏度好。

对检测样本中pSTAT3表达水平的试剂的类型不做具体限定，只要是可以达到检测pSTAT3表达水平的都属于本申请的范围，包括但不限于检测pSTAT3抗体。

优选地，所述样本包括组织样本。所述组织样本优选为“石蜡包埋组织标本”。在进行鉴定前，所述样本为确诊为PTCL-NOS和/或ALK-ALCL的样本，排除了其他情况，如(1)，表达CD30的其他T细胞淋巴瘤，包括但不限于NK/T细胞淋巴瘤(2)，血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(3)等。

优选地，所述pSTAT3还包括pSTAT3-T705。

本发明实施例提供了一种表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别模型的训练方法，其包括以下步骤：

获取训练样本中pSTAT3表达水平以及对应的标注结果，所述pSTAT3为如前述任意实施例中所述的pSTAT3；

将所述训练样本中pSTAT3表达水平输入预先构建好的鉴别模型中，获得鉴别结果；所述鉴别模型用于根据样本中pSTAT3表达水平判断样本为表达CD30的PTCL-NOS或ALK-ALCL；

根据所述标注结果和所述鉴别结果对所述模型进行参数更新。

优选地，所述标注结果可以为样本为表达CD30的PTCL-NOS或ALK-ALCL。

本发明实施例还提供了一种表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别装置，其包括获取模块和鉴别模块，具体如下。

获取模块，用于获取待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果，所述pSTAT3为如前述任意实施例中所述的pSTAT3；

鉴别模块，用于将所述待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果输入如前述实施例所述的训练方法训练好的鉴别模型中，获得待测样本的鉴别结果。

优选地，所述鉴别装置还包括存储模块，用于存储所述鉴别模型。

优选地，所述检测结果为免疫组学的检测结果，所述鉴别模型还包括根据免疫组化评分H-Score计算并判断待测样本为表达CD30的PTCL-NOS或ALK-ALCL。

优选地，所述H-Score的计算公式如下：H-Score＝100×∑(i×Pi)；其中，i代表染色强度，Pi代表染色阳性细胞占肿瘤总细胞数的百分数。

优选地，所述染色强度包括：1、2和3，染色强度可以基于本领域的常规方法进行判断，例如，1代表弱，染色结果为淡黄色，2代表中等，染色结果为淡棕色，3代表强，染色结果为棕色或深棕色。

优选地，所述鉴别模型基于阳性阈值判断待测样本为表达CD30的PTCL-NOS或ALK-ALCL：若样本的H-Score＞所述阳性阈值，则判断样本为ALK-ALCL；若样本的H-Score≤所述阳性阈值，则判断样本为表达CD30的PTCL-NOS。

优选地，当pSTAT3为pSTAT3-S727，阳性阈值为140～150，具体可以为140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150中的任意一种或任意两种之间的范围。优选为142～147，更优选为145。

当pSTAT3为pSTAT3-T705，阳性阈值为160～170，具体可以为160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170中的任意一种或任意两种之间的范围。优选为163～167，更优选为165。优选范围的鉴别效果更好。

本发明实施例还提供了一种表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别模型的训练装置，其包括获取模块、鉴别模块和参数更新模块。

获取模块，用于获取训练样本中pSTAT3表达水平以及对应的标注结果，所述pSTAT3为如前述任意实施例中所述的pSTAT3；

鉴别模块，用于将所述训练样本中pSTAT3表达水平输入预先构建好的鉴别模型中，获得鉴别结果；所述鉴别模型用于根据样本中pSTAT3表达水平判断样本为表达CD30的PTCL-NOS或ALK-ALCL；

参数更新模块，用于根据所述标注结果和所述鉴别结果对所述模型进行参数更新。

需要说明的是，上述任意实施例所述的模块可以软件或固件(Firmware)的形式存储于存储器中或固化于本申请提供的电子设备的操作系统(Operating System，OS)中，并可由电子设备中的处理器执行。同时，执行上述模块所需的数据、程序的代码等可以存储在存储器中。

本发明实施例还提供了一种电子设备，所述电子设备包括处理器和存储器；所述存储器用于存储程序，当所述程序被所述处理器执行时，使得所述处理器实现如前述实施例所述的表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别模型的训练方法或表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别方法。

所述鉴别方法包括：获取待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果；将所述待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果输入如前述任意实施例所述的训练方法训练好的鉴别模型中，获得待测样本的鉴别结果。所述鉴别方法具体可以对应前述任意实施例所述的鉴别装置的执行步骤，具体不再赘述。

该电子设备还可以包括总线和通信接口，存储器、处理器和通信接口相互之间直接或间接地电性连接，以实现数据的传输或交互。例如，这些元件相互之间可通过一条或多条总线或信号线实现电性连接。

存储器可以是但不限于，随机存取存储器(Random Access Memory，RAM)，只读存储器(Read Only Memory，ROM)，可编程只读存储器(Programmable Read-Only Memory，PROM)，可擦除只读存储器(Erasable Programmable Read-Only Memory，EPROM)，电可擦除只读存储器(Electric Erasable Programmable Read-Only Memory，EEPROM)等。

处理器可以是一种集成电路芯片，具有信号处理能力。该处理器可以是通用处理器，包括中央处理器(Central Processing Unit，CPU)、网络处理器(Network Processor，NP)等；还可以是数字信号处理器(Digital Signal Processing，DSP)、专用集成电路(Application Specific Integrated Circuit，ASIC)、现场可编程门阵列(Field－Programmable Gate Array，FPGA)或者其他可编程逻辑器件、分立门或者晶体管逻辑器件、分立硬件组件。

在实际应用中，该电子设备可以是服务器、云平台、手机、平板电脑、笔记本电脑、超级移动个人计算机(ultra-mobile personal computer，UMPC)、手持计算机、上网本、个人数字助理(personal digital assistant，PDA)、可穿戴电子设备、虚拟现实设备等设备，因此本申请实施例对电子设备的种类不做限制。

此外，本发明实施例还提供了一种计算机可读介质，所述计算机可读介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现如前述实施例所述的表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别模型的训练方法或表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别方法。

所述鉴别方法包括：获取待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果；将所述待测样本中pSTAT3表达水平的检测结果输入如前述任意实施例所述的训练方法训练好的鉴别模型中，获得待测样本的鉴别结果。所述鉴别方法具体可以对应前述任意实施例所述的鉴别装置的执行步骤，具体不再赘述。

计算机可读介质可以为通用的存储介质，如移动磁盘、硬盘等。

以下结合实施例对本发明的特征和性能作进一步的详细描述。

实施例1

一种表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别方法，其包括以下步骤。

采用免疫组化法分析组织样本组织中磷酸化STAT3-S727的表达水平：采用Abcam公司anti-phosph-STAT3(S727)对样本进行检测，并使用H-score对免疫组化结果进行判读。

H-Score的计算公式如下：H-Score＝100×∑(i×Pi)；其中，i代表染色强度，所述染色强度包括：1、2和3，1代表弱，染色结果为淡黄色，2代表中等，染色结果为淡棕色，3代表强，染色结果为棕色或深棕色；Pi代表阳性细胞百分比，取值范围为0～100％。

判断的阳性阈值为145，当H-Score的计算分数＞该阳性阈值时，判断样本为ALK-ALCL，当H-Score的计算分数≤该阳性阈值时，判断CD30+PTCL-NOS。

实施例2

一种表达CD30的PTCL-NOS与ALK-ALCL的鉴别方法，其包括以下步骤。

采用免疫组化法分析组织样本组织中磷酸化STAT3-S727的表达水平：采用Abcam公司anti-phosph-STAT3(Y705)和anti-phosph-STAT3(S727)对样本进行检测，并使用H-score对免疫组化结果进行判读，H-Score的计算公式同实施例1。

pSTAT3(S727)判断的阳性阈值为145，当H-Score的计算分数＞该阳性阈值时，判断样本为ALK-ALCL，当H-Score的计算分数≤该阳性阈值时，判断样本为CD30+PTCL-NOS。

pSTAT3(Y705)判断的阳性阈值为165，当H-Score的计算分数＞该阳性阈值时，判断样本为ALK-ALCL，当H-Score的计算分数≥该阳性阈值时，判断CD30+PTCL-NOS。

当pSTAT3(S727)和pSTAT3(Y705)的判读结果均为ALK-ALCL时，才认定最终的结果为ALK-ALCL，否则为CD30+PTCL-NOS。

试验例1

采用实施例1和2的鉴别方法，设置4组试验组，分别对病理诊断明确的22例ALK-ALCL和34例表达CD30的PTCL-NOS(其中10例CD30+表达CD30的PTCL-NOS)进行检测，使用H-score对免疫组化结果进行判读。结果如表1所示和图1所示。

表1鉴别结果

pSTAT3-Y705为基于对pSTAT3-Y705表达水平检测对ALK-ALCL和34例表达CD30的PTCL-NOS进行判断的情况，具体过程参照实施例2中的对应步骤；

pSTAT3-S727：对应实施例1；

pSTAT3-Y705|S727：与实施例2相同，区别在于：当pSTAT3(S727)或pSTAT3(Y705)的任意判读结果为阳性时，认定最终的结果为ALK-ALCL，否则为阴性。

pSTAT3-Y705&S727：对应实施例2；

由结果可知，当使用165作为pSTAT-Y705判读阳性阈值时，ALK-ALCL和CD30+表达CD30的PTCL-NOS鉴别诊断的敏感性为0.68，特异性为1；当使用145作为pSTAT3-S727判读阳性阈值时，ALK-ALCL和CD30+表达CD30的PTCL-NOS鉴别诊断的敏感性为0.86，特异性为0.9。与单独使用pSTAT3-S727相比，联合使用pSTAT3-Y705和pSTAT3-S727(pSTAT3-Y705&S727)能提高鉴别诊断的敏感性，但降低了特异性；或者在提高鉴别诊断特异性的同时降低其敏感性。因此，单用pSTAT3-S727可达到较好的鉴别ALK-ALCL和CD30+表达CD30的PTCL-NOS的目的。

以上所述仅为本发明的优选实施例而已，并不用于限制本发明，对于本领域的技术人员来说，本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的精神和原则之内，所作的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本发明的保护范围之内。