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一种基于有界核范数正则化的新冠肺炎药物筛选模型

摘要

本发明公开了一种基于有界核范数正则化的新冠肺炎药物筛选模型。首先,通过公开可用的数据库整理方法所需要的病毒和药物的相关信息;其次,分别计算病毒和药物的相似性;再次,构建异构网络,整合邻接矩阵;第四,提出VDA‑GBNNR模型,填补病毒与药物之间的未知的关联,根据得分排名先后筛选出抗新冠病毒的候选药物;最后,将预测出的排名靠前的小分子药物与受体蛋白进行分子对接,得到分子结合能与结合位点。本发明通过结合核范数正则化来实现有噪声的矩阵补全,有效地解决了过拟合问题,并且加入一个范围约束,强制所有预测结果的输出矩阵内的所有值在特定范围内。实验结果表明,该方法得到的AUC值较高,能够较为准确地预测病毒与药物的关联。

著录项

  • 公开/公告号CN113921106A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-01-11

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 湖南工业大学;

    申请/专利号CN202110809155.X

  • 申请日2021-07-16

  • 分类号G16H20/10(20180101);G16H70/40(20180101);G16B50/00(20190101);G16B20/50(20190101);

  • 代理机构44102 广州粤高专利商标代理有限公司;

  • 代理人杨千寻;杜梅花

  • 地址 412000 湖南省株洲市天元区泰山路88号

  • 入库时间 2023-06-19 13:51:08

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