通过毛细管电泳(CE)DNA图谱对微卫星进行的比较分析

摘要

本发明涉及一种基于毛细管电泳(CE)图谱的偏移(CE图谱偏移)来确定至少一个微卫星不稳定性(MSI)的方法，CE图谱偏移是通过至少一个微卫星的靶序列的毛细管电泳(CE)图谱(MSI靶图谱)和其特定野生型序列的毛细管电泳(CE)图谱(MS野生型图谱)之间的比较确定的。此外，本发明包括用于所述方法的合适的引物、包含成功执行所述方法的所有必要组件的试剂盒、作为系统的完全封闭的装置，即“MSI Modaplex分析系统”和用于诊断与一种炎症、癌症、炎症相关癌症和/或自身免疫疾病相关的MSI表型的方法，其中所述诊断包括用于确定如上所述的至少一种CE图谱偏移的方法。最后，本发明涉及改进的MSI组用于确定和优选诊断MSI肿瘤的用途，所述组由STR生物标志物NR‑21、NR‑24、Mono27、D2S123、D5S346、D17S250、Bat‑25和Bat‑26组成。