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一种基于Nanopore宏基因组测序检测环境样品中新抗性基因的方法

摘要

本发明提供一种基于Nanopore宏基因组测序检测环境样品中新抗性基因的方法,该方法包括以下步骤:1)从样品中提取总DNA,并进行DNA纯化;2)对纯化后的DNA进行宏基因组测序;3)对宏基因组测序后的数据进行分析。本发明通过提取、纯化、提纯等步骤获得满足三代Nanopore测序要求的DNA;通过序列组装以及纠错、校正,获得高质量的长序列,增加序列比对的准确性和可靠性;通过对抗生素抗性基因数据库进行扩展,使得检测结果更加准确、全面。

著录项

  • 公开/公告号CN113512603A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-10-19

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 清华大学深圳国际研究生院;

    申请/专利号CN202110789136.5

  • 发明设计人 李炳;雷华新;黄锦;梁贺彬;

    申请日2021-07-13

  • 分类号C12Q1/689(20180101);C12Q1/6869(20180101);

  • 代理机构11430 北京市诚辉律师事务所;

  • 代理人范盈;李玉娜

  • 地址 518055 广东省深圳市南山区西丽街道深圳大学城清华校区A栋二楼

  • 入库时间 2023-06-19 12:54:37

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