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磷酸化位点特异激酶的预测方法

摘要

本发明涉及一种磷酸化位点特异激酶的预测方法,具体步骤如下:根据数据库中的数据构建激酶‑底物异构网络,并计算赋予其边不同的权重;基于建立的网络,采用加权最大二部图匹配算法预测潜在的激酶‑底物关系;对于查询的磷酸化位点,截取其氨基酸片段并计算该片段和不同激酶催化的底物片段之间的序列相似性打分;结合预测出的激酶‑底物关系和序列相似性打分,预测所给磷酸化位点的催化激酶。本发明磷酸化位点特异激酶的预测方法,有效结合了PPI网络信息和蛋白质局部序列信息;针对查询位点给出不同阈值下各激酶的催化可能性;在不同的激酶上均获得了比现有方法更高的预测准确率。

著录项

  • 公开/公告号CN113450872A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-09-28

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南昌大学;

    申请/专利号CN202110751661.8

  • 发明设计人 施绍萍;郭昕昀;张菊;

    申请日2021-07-02

  • 分类号G16B20/20(20190101);C12Q1/48(20060101);

  • 代理机构36123 南昌青远专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人刘爱芳

  • 地址 330000 江西省南昌市东湖区红谷滩新区学府大道999号

  • 入库时间 2023-06-19 12:43:46

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-12-02

    授权

    发明专利权授予

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