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一种基于Nanopore测序的m6A分析方法

摘要

本发明涉及表观遗传学领域,具体涉及一种基于Nanopore测序的m6A分析方法。所述分析方法可鉴定4种模式(AGACT、GGACA、GGACC、GGACT)下的m6A位点,可以检测CLIP无法检测到的m6A位点,且有较高的准确率。基于鉴定得到的m6A位点,分析m6A位点在mRNA功能元件上的分布以说明其分布的偏好,分析m6A位点甲基化水平的分布以说明其模式偏好,分析转录本水平的甲基化水平分析,可以结合mRNA表达研究其表达偏好。同时,基于鉴定得到的m6A位点,可以分析不同处理样本之间的差异m6A情况。

著录项

  • 公开/公告号CN113130006A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-07-16

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京百迈客生物科技有限公司;

    申请/专利号CN202110418078.5

  • 发明设计人 郑洪坤;聂佩瑶;刘敏;张雪川;

    申请日2021-04-19

  • 分类号G16B20/30(20190101);G16B5/00(20190101);G16B40/00(20190101);

  • 代理机构11002 北京路浩知识产权代理有限公司;

  • 代理人张璐

  • 地址 101300 北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢6层605A

  • 入库时间 2023-06-19 11:52:33

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-08-23

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B20/30 专利申请号:2021104180785 申请日:20210419

    实质审查的生效

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