一种与黄瓜果皮颜色基因连锁的分子标记及应用

摘要

本发明公开了一种与黄瓜果皮颜色基因连锁的分子标记及应用。利用项目组收集的289份种质资源，采用全基因组关联分析（GWAS）结合QTL定位等方法，鉴定了影响黄瓜果皮颜色调控的关键变异区间，利用F2群体进行精细定位将候选区间定位至94kb，对候选区间内的基因进行荧光定量分析发现浅绿果皮和深绿果皮近等基因系材料中Csa3G912920基因有差异显著，认为该基因为控制黄瓜果皮颜色的候选基因。根据该基因的位置设计了1个KASP分子标记，利用该标记对分离群体中进行基因型鉴定，符合率达到100%。研究结果不仅有助于果皮颜色黄瓜品种的早期鉴别及辅助育种，且为解析颜色调控的分子机理提供了基础，具有广泛的推广价值。