深度鉴定马铃薯癌肿病原菌和种内DNA分型的方法

摘要

本发明公开深度鉴定马铃薯癌肿病原菌和种内DNA分型的方法，包括以下步骤：病原菌样品收集、孢子囊富集、PCR法鉴定病原菌分子、内生集壶菌基因组测序、基于GBS重测序的基因分型、全转录组测序和基因表达数据的分析以及共表达基因网络构建和表达模式分析；本发明首先从病原菌分子鉴定的角度搜集相应的病原菌样品并进行感病实验和PCR检测，对确认样品中的内生集壶菌进行全基因组序列测定和GBS分型，以了解马铃薯癌肿病不同发生地病原菌的基因组序列差异及其与感病马铃薯品种间的关系，有利于尽早发现马铃薯癌肿病病原菌类型，并揭示马铃薯感染癌肿病途径的关键作用因子，推动马铃薯癌肿病抗性基因研究及相关分子育种工作的开展。