σ-1激动剂治疗的优化和受治疗者的筛选方法

摘要

本公开提供了遗传多态性,这些多态性会导致受试者对σ‑1受体疗法的不同反应。还描述了使用这些多态性对需要σ‑1受体疗法的受试者进行个性化治疗，诸如治疗神经发育和神经退行性疾病和病症。

说明书

相关申请的交叉引用

本申请要求于2018年5月18日提交的美国临时专利申请第62/673,369号的申请日的权益，所述美国临时专利申请的全部公开内容以引用方式并入本文中。

技术领域

本发明大体涉及确定受试者对σ-1受体疗法具有反应还是无反应的方法。

背景技术

阿尔茨海默病(AD)是一种进行性的神经退行性障碍，其特征是丧失记忆和其他认知功能，从而干扰日常生活。目前，缺乏能改变此疾病进程的药物。σ-1受体(SIGMAR1)，一种钙内稳态和线粒体功能的调节剂，是神经退行性和神经发育性障碍或适应症(包含AD)的新靶标。SIGMAR1激活已被表明会减少AD的关键病理生理学过程，包含τ的过度磷酸化、神经保护、神经退行性变和氧化应激。SIGMAR1的激活还导致人体细胞和体内自噬通量的增加。然而，AD患者群体的基因异质性和缺乏客观的预测性生物标志物测量会严重限制治疗效果。这种异质性是可掩盖治疗的成功性。

因此，为了实现对σ-1受体疗法的个性化治疗，需要找到其预测性生物标志物及方法。

发明内容

本公开的一个方面包含一种选择方法，所述方法能选择出对σ-1受体激动剂疗法具有反应的受试者。所述方法包括获得或已经获得来自受试者的生物样品的测试的结果，所述测试确定至少一种多态性在所述受试者中的存在，所述多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L、DHCR7_M220T、HLA-DRB1_A244T、HLA-DRB1_S66Y、HLA-DRB1_Y89S、MS4A6E_M59T、RIN3_H215R、DPYD_I543V和其组合组成的群组。所述方法还包含如果所述受试者中存在多态性，则排除对σ-1受体激动剂疗法无反应的所述受试者。

本公开的另一个方面包含一种选择方法，所述方法能选择出对σ-1受体激动剂疗法具有反应的受试者。所述方法包括通过对包括多态性的基因座进行测序，来检测或已经检测从所述受试者获得的生物样品中的基因座处是否存在至少一种所述多态性。所述方法还包括如果所述受试者中存在多态性，则排除对σ-1受体激动剂疗法无反应的所述受试者。所述至少一种多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L、DHCR7_M220T、HLA-DRB1_A244T、HLA-DRB1_S66Y、HLA-DRB1_Y89S、MS4A6E_M59T、RIN3_H215R、DPYD_I543V和其组合组成的群组。

本公开的再一个方面包含一种选择方法，所述方法能选择出对σ-1受体激动剂疗法具有反应的受试者。所述方法包括获得或已经获得来自所述受试者的生物样品的测试的结果，所述测试确定由至少一个基因编码的RNA的表达水平，所述基因选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3、DPYD和其组合组成的群组；和将所述测试样品中的所述RNA的所述水平与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的RNA的水平进行比较。所述测试样品中的所述RNA水平基本上类似于对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的所述RNA水平，从而认定所述受试者是对σ-1受体疗法具有反应的受试者。

本公开的另一个方面包含一种选择方法，所述方法能选择出对σ-1受体激动剂疗法具有反应的受试者。所述方法包括确定或已经确定由至少一个基因编码的RNA的表达水平，所述基因选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3、DPYD和其组合组成的群组。所述方法还包括如果所述测试样品中的所述RNA的所述水平与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的RNA的水平有本质上的不同，则排除对σ-1受体激动剂疗法无反应的所述受试者。

本公开的一个方面包含一种治疗方法，所述方法针对需要σ-1受体激动剂疗法的受试者。所述方法包括获得或已经获得来自所述受试者的生物样品的测试的结果，所述测试检测至少一种多态性在所述受试者中的存在，所述多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L、DHCR7_M220T、HLA-DRB1_A244T、HLA-DRB1_S66Y、HLA-DRB1_Y89S、MS4A6E_M59T、RIN3_H215R、DPYD_I543V和其组合组成的群组。所述方法还包括如果所述受试者中不存在多态性，则向所述受试者施用治疗有效量的σ-1受体激动剂。

本公开的另一个方面包含一种治疗方法，所述方法针对需要σ-1受体激动剂疗法的受试者。所述方法包括获得或已经获得来自所述受试者的生物样品的测试的结果，所述测试确定由至少一个基因编码的RNA的表达水平，所述基因选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3、DPYD和其组合组成的群组。所述方法还包括将所述测试样品中的所述RNA的所述水平与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的RNA的水平进行比较，且如果所述测试样品中的所述RNA的水平与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的RNA的水平基本上相似，则向所述受试者施用治疗有效量的σ-1受体激动剂。

本公开的再一方面包含一种检测受试者多态性的方法，所述多态性与σ-1受体疗法的反应相关联。所述方法包括从所述受试者获得或已经获得生物样品，和通过评估包括所述多态性的基因座的序列来检测所述生物样品中的所述多态性。在所述受试者中，所述至少一种多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L、DHCR7_M220T、HLA-DRB1_A244T、HLA-DRB1_S66Y、HLA-DRB1_Y89S、MS4A6E_M59T、RIN3_H215R、DPYD_I543V和其组合组成的群组。

参考彩色图

本申请文件含有至少一个彩色照片。如需要带有彩色照片的本专利申请公开的副本，请向专利局提出要求并支付必要的费用。

附图说明

图1用图示概述了临床研究的方案、数据可用性和分析方法。(a)连续性临床试验(002研究)包括两部分：部分A历时5周，而部分B历时52周(共计57周)，紧接着是为期208周的003延长研究，临床试验时段累积为265周。(b)概述了综合数据的来源。(c)给出了在两个分析步骤中使用的患者性征：1)基于FCA规则对在第57周的治疗反应进行无监督分析，2)使用混合效应模模型对在第57周发现的标志物做为期148周的纵向确认，以对两组ANAVEX2-73浓度进行建模。

图2是ANAVEX2-73和ANAVEX19-144的剂量和血浆浓度的示意图。(a)剂量施用交叉设计，包含八种可能的施用方案，其中在每个时期(静脉内(IV)或经口(口服))给出单一剂量方案，或者从静脉内施用或口服施用开始，随机分配两种可能的剂量。(b)在57周研究的部分A中，以不同的随机化施用剂量首次施用(试验的前24小时)后，ANAVEX2-73在0至无穷大(AUC0-inf)之间的曲线下药代动力学参数面积。(c)血浆中的ANAVEX2-73的平均浓度组的箱线图。

图3是利用VistaPDB 1.0软件显示的SIGMAR1的三维晶体结构。

图4是描绘MMSE和ADCS-ADL在148周内相对于基线变化的MMRM-LME模型的图。(a)针对经调整ΔMMSE，高浓度(绿色)队列相对于低中浓度患者队列(品红色)随时间(以周为单位)变化的经MMRM-LME调整的斜率。在每个时间点(虚线)绘制了在群体水平上具有残差的平均调整值。(b)针对经调整ΔMMSE，高浓度(绿色)队列相对于低中浓度患者队列(品红色)随时间(以周为单位)变化的经MMRM-LME调整的斜率。在每个时间点(虚线)绘制了在群体水平上具有残差的平均调整值。

图5是在148周内ΔADCS-ADL数值变化图(使用的是未调整值)。该图呈现根据生物标志物状态(不存在或存在)和给予标准护理的患者在208周中的148周的ΔADCS-ADL得分的(未调整值)平均轨迹。根据鉴定的生物标志物和基线性征，将参与208周研究的患者分成六个小组，在图中表示为不同颜色(蓝色、绿色、橙色、粉色、紫色和绿松石色)。

图6是在148周期间的治疗反应图，纵轴为DeltaΔMMSE和DeltaΔADCS-ADL。在(a)和(b)中呈现的患者具有SIGMAR1基因原生型、血浆中ANAVEX2-73的高平均浓度水平出现在图6B和基线MMSE≥20。

图7是在SIGMAR1 Pro2存在及不存在时，MMSEΔ(a)和ADCS-ADLΔ(b)两者与强度的关系，显示出SIGMAR1 Pro2突变的存在与对σ-1激动剂疗法缺乏反应相关联。

图8是(a)显示出框移COMT Leu146突变与相对于基线(BL)的高ADCS-ADLΔ强烈关联。(b)显示出KANSL1 Pro304/946/1010突变的不存在与相对于BL的高ADCS-ADLΔ强烈关联。(c)显示出SIGMAR1 Pro2突变的不存在与相对于BL的高ADCS-ADLΔ强烈关联。(d)显示出框移COMT Leu146突变的不存在与相对于BL的高MMSEΔ强烈关联。(e)显示出KANSL1Pro304/946/1010突变的不存在与相对于BL的高MMSEΔ强烈关联。(f)显示出SIGMAR1 Pro2突变的不存在与相对于BL的高MMSEΔ强烈关联。

图9显示出高SIGMAR1 RNA表达与相对于BL的高ADCS-ADL斜率值强烈关联(改进)。数据来自参加测试的所有患者(100％，N＝21)。TPM意指每千碱基每百万转录量。

具体实施方式

本公开部分基于一种方法，这种方法可确定受试者对σ-1受体疗法有反应还是无反应。所述方法可包括检测与对σ-1受体疗法的改变反应相关联的多态性的存在。所述方法还可包括确定由与对σ-1受体疗法的改变反应相关联的基因编码的RNA的表达水平。所述方法可用于优化需要σ-1受体疗法的受试者的治疗。基于受试者对疗法的预测反应性，可向每个受试者提供个性化治疗。例如，可选择具有反应的受试者来使用σ-1受体激动剂进行治疗，而在疾病发展过程的早期和/或甚至在治疗开始之前，可向无反应的受试者提供替代的、更适当的治疗方案。这与当前方法形成对比，在当前方法中，受试者在一定的治疗期后，才能被确定为具有反应或无反应。多态性、确定多态性的方法以及使用多态性的方法描述如下。

I.

本发明的一个方面揭示了哪些遗传多态性可负面影响σ-1受体疗法的疗效。这些多态性可位于受试者中的基因组中的任何基因座处，条件是多态性与受试者对σ-1受体疗法的阳性反应相关联。例如，多态性可在受试者基因组的编码区或非编码区中，包含线粒体DNA。多态性可由基因或基因座中的插入、缺失或单核苷酸多态性(SNP)引起。

在一些方面中，与对σ-1受体疗法的反应相关联的多态性位于选自SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3、GAMT、IL10、MTUS1、PPARG和其组合的基因中。在一个方面中，多态性位于选自SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3和其组合的基因中。在另一个方面中，多态性位于选自SIGMAR1、COMT、KANSL1和其组合的基因中。

在一些方面中，与对σ-1受体疗法的反应相关联的多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L、DHCR7_M220T、HLA-DRB1_A244T、HLA-DRB1_S66Y、HLA-DRB1_Y89S、MS4A6E_M59T、RIN3_H215R、DPYD_I543V或其组合组成的群组。表A详细说明这些多态性。

在一个方面中，与对σ-1受体疗法的反应相关联的多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs(rs113895332/rs61143203)、KANSL1_P1010L/P304L/P946L和其组合组成的群组。在另一个方面中，与对σ-1受体疗法的反应相关联的多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs(rs113895332或rs61143203)、KANSL1_P1010L/P304L/P946L和其组合组成的群组。在再一方面中，与对σ-1受体疗法的反应相关联的多态性是SIGMAR1_Q2P。在一个方面中，与对σ-1受体疗法的反应相关联的多态性是COMT_L146fs(rs113895332或rs61143203)。在另一个方面中，与对σ-1受体疗法的反应相关联的多态性是KANSL1_P1010L/P304L/P946L。

II.

本发明的另一方面提供了一种方法，用以确定受试者对σ-1受体疗法具有反应还是无反应。所述方法可包括检测与对σ-1受体疗法的低疗效相关联的多态性的存在。所述方法还可包括确定与对σ-1受体疗法低疗效相关联的至少一个基因编码的RNA的表达水平。

在一个方面中，所述方法包括检测与对σ-1受体疗法的低疗效相关联的至少一种多态性的存在。至少一种多态性的存在鉴定对σ-1受体疗法具有反应的受试者。多态性和包括多态性的基因如节I所述。

可检测一种或多于一种多态性的存在。例如，可检测1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种多态性的存在。在一些方面中，可检测1、2、3、4、5、6、7、8、9或10种多态性的存在。在其他方面中，可检测1、2、3、4或5种多态性的存在。在另一些方面中，可检测1、2或3种多态性的存在。

多态性的存在或不存在可通过评估受试者中的核酸序列来检测。作为另一选择，多态性的存在或不存在可通过评估来自包括多态性的基因或基因座的核酸或蛋白的表达来检测。

在某些方面中，多态性的存在或不存在可通过针对多态性在包括多态性的基因座处的存在评估核酸序列来检测。核酸序列可为从包括多态性的基因座表达的DNA或RNA序列。适用于检测多态性的方法是本领域中众所周知的。例如，所述方法包含鸟枪法测序、桥接PCR、高通量方法、等位基因特异性实时PCR、5'-核酸酶测定、模板导向的染料-终止子掺入、分子信标等位基因特异性寡核苷酸测定、采用以Flap核酸酶的侵入性切割的测定、等位基因特异性杂交(ASH)、基于阵列的杂交、等位基因特异性连接、引物延伸、单碱基延伸(SBE)测定、测序、焦磷酸测序、实时焦磷酸测序、序列长度多态性分析、限制长度片段多态性(RFLP)、RFLP-PCR、单链构象多态性(SSCP)、PCR-SSCP、片段定尺寸毛细管电泳、异源双链分析和质量阵列系统。扩增序列的分析可使用诸如微芯片、荧光偏振测定和基质辅助激光解吸电离(MALDI)质谱的各种技术来实现。高通量测序方法包含大规模并行签名测序(MPSS)、聚合酶克隆测序、454焦磷酸测序、illumina(Solexa)测序、组合探针锚合成(cPAS)、SOLiD测序、离子激流半导体测序、DNA纳米球测序、heliscope单分子测序、单分子实时(SMRT)测序、纳米孔DNA测序、穿隧电流DNA测序、杂交测序、质谱测序、微流控桑格测序、基于显微镜的技术、RNAP测序和体外病毒高通量测序。

在另一个方面中，所述方法包括确定由与对σ-1受体疗法的改变反应相关联的至少一个基因编码的RNA的表达水平。根据所述方法，与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的RNA水平基本上类似的RNA水平鉴定对σ-1受体疗法具有反应的受试者。与对σ-1受体疗法的改变反应相关联的基因选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3、DPYD和其组合组成的群组。

例如，可检测由1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多个基因编码的RNA的表达水平。在一些方面中，可检测由1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个基因编码的RNA的表达水平。在其他方面中，可检测由1、2、3、4或5个基因编码的RNA的表达水平。在另一些方面中，可检测由1、2或3个基因编码的RNA的表达水平。

RNA表达水平的测量可通过多种方法完成，所述方法包含北方印迹、定量实时PCR(qRT-PCR)、核酸微阵列、Luminex微球和核酸酶保护测定。确定基本上不同的RNA表达水平的方法是本领域中已知的，并且包含分布分析。在一些方面中，通过将RNA表达值归一化为每千碱基百万个转录物(TPM)来确定基本上不同的RNA表达水平。

在其他方面中，确定受试者对σ-1受体疗法具有反应还是无反应可通过测量由包括多态性的基因表达的蛋白水平来检测。测量蛋白表达的方法包含多种方法，诸如高效液相色谱(HPLC)、液相色谱-质谱(LC/MS)、酶联免疫吸附测定(ELISA)、蛋白免疫沉淀、免疫电泳、西方印迹和蛋白免疫染色。

可在受试者体内或体外检测确定受试者对σ-1受体疗法具有反应还是无反应。通常，受试者对σ-1受体疗法的反应性可通过体外分析实现，分析从受试者获得的生物样品中的核酸或蛋白来确定。可使用本领域中众所周知的方法从生物样品中分离核酸或蛋白。关于更多信息，参见Ausubel et al.,2003或Sambrook&Russell,2001。可使用市售核酸和蛋白提取试剂盒或市售提取试剂来从生物样品中分离核酸。

合适的生物样品可包含，但不限于流体样品、活检样品、皮肤样品和毛发样品。流体样品可包含血液、血清、唾液、眼泪和淋巴液。在一些方面中，生物样品是血液。从受试者收集生物样品的方法是本领域中众所周知的。

在一些方面中，确定受试者对σ-1受体疗法具有反应还是无反应的方法包括获得对来自受试者的生物样品的测试结果，所述测试确定至少一种多态性的存在。在其他方面中，确定受试者对σ-1受体疗法的反应性的方法包括通过对包括多态性的基因座进行测序，来检测从受试者获得的生物样品中的基因座处是否存在至少一种多态性。在另一些方面中，确定受试者对σ-1受体疗法具有反应还是无反应的方法包括获得对来自受试者的生物样品的测试结果，所述测试确定由与对σ-1受体疗法的改变反应相关联的基因编码的至少一种RNA的水平。在其他方面中，确定受试者对σ-1受体疗法的反应性的方法包括通过确定由与对σ-1受体疗法的改变反应相关联的基因编码的至少一种RNA的表达水平，来检测从受试者获得的生物样品中的基因座处是否存在至少一种多态性。

III.

所述方法可针对受试者优化σ-1受体激动剂疗法。例如，所述方法可用于在对受试者启动治疗方案之前选择对σ-1受体疗法具有反应的受试者。相反，如果发现受试者对σ-1受体疗法无反应，则可使用所述方法在治疗前排除所述受试者。多态性可用于在治疗前确定受试者是否将会在使用σ-1受体激动剂治疗时出现毒性。此外，所述方法可用于确定受试者中是否或何时应中断σ-1受体激动剂治疗。此外，所述方法可用于评估受试者对停止治疗的反应。

所述方法包括检测受试者中多态性的存在，以及确定受试者是否是σ-1受体疗法的候选对象。所述方法还可包括确定与对σ-1受体疗法的低疗效相关联的一个或多个基因的RNA的表达水平。多态性、与对σ-1受体疗法的低疗效相关联的基因、检测多态性的方法和确定RNA表达水平的方法可如节I所述，且检测多态性的方法可如节II所述。

本文所用的术语“具有反应的”可用于描述当用σ-1受体激动剂治疗时经历阳性结果的任何受试者。确定受试者对σ-1受体疗法的反应性的方法可以并且将根据病症或疾病、受试者、治疗方案及其他变量而变化，且可通过实验来确定。反应性可在本领域技术人员认为对疾病或病症合适的任何时间点确定。例如，治疗结果可在治疗开始后约57周、约148周或约208周确定。

当治疗用于阿尔茨海默病(AD)时，阳性结果可通过Δ或斜率MMSE(细微精神状态检查)或ADCS-ADL(阿尔茨海默病合作研究-日常生活活动)来测量。具有反应的受试者的特征在于具有正的或零MMSE和/或ADCS-ASL斜率，而无反应的受试者的特征在于具有负的MMSE和/或ADCS-ASL斜率。具有反应的受试者的特征还在于具有高的MMSE和/或ADCS-ASLΔ，而无反应的受试者的特征在于具有低的MMSE和/或ADCS-ASLΔ。低MMSEΔ可在约-9至约-6、约-6至约-2或约-9至约-2的范围内，而高MMSEΔ可在约-6至-2或约-2至约6的范围内。确定Δ或斜率MMSE或ADCS-ADL的方法可如本文的示例中所述。

在一些方面中，所述方法用于选择对σ-1受体激动剂疗法具有反应的受试者。所述方法包括获得对来自受试者的生物样品的测试结果，所述测试确定至少一种多态性的存在，以及如果受试者中存在多态性，则排除对σ-1受体激动剂疗法无反应的所述受试者。作为另一选择，如果受试者中存在多态性，则可包含对所述疗法具有反应的所述受试者。在一个方面中，多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L、DHCR7_M220T、HLA-DRB1_A244T、HLA-DRB1_S66Y、HLA-DRB1_Y89S、MS4A6E_M59T、RIN3_H215R、DPYD_I543V和其组合组成的群组。在另一个方面中，多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L和其组合组成的群组。多态性的存在可通过评估核酸序列来获得。

在其他方面中，所述方法用于选择对σ-1受体激动剂疗法具有反应的受试者。所述方法包括通过对包括多态性的基因座进行测序来检测从受试者获得的生物样品中的基因座处是否存在至少一种多态性，且如果受试者中存在多态性，则将该受试者排除在σ-1受体激动剂疗法之外，因为他是无反应者。作为另一选择，如果受试者不存在多态性，则所述受试者适于σ-1受体激动剂疗法。在一个方面中，多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L、DHCR7_M220T、HLA-DRB1_A244T、HLA-DRB1_S66Y、HLA-DRB1_Y89S、MS4A6E_M59T、RIN3_H215R、DPYD_I543V和其组合组成的群组。在另一个方面中，多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs和其组合组成的群组。多态性的存在可通过评估核酸序列来检测。

在其他方面中，所述方法用于选择对σ-1受体激动剂疗法具有反应的受试者。所述方法包括获得对来自受试者的生物样品的测试的结果，所述测试确定由至少一个基因编码的RNA的表达水平，所述基因选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3和其组合组成的群组，且如果RNA水平与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的RNA水平本质上不同，则排除对σ1受体激动剂疗法无反应的所述受试者。作为另一选择，如果RNA水平与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的RNA水平基本上相似，则可包含对所述疗法具有反应的受试者。在一个方面中，确定由选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1和其组合组成的群组中的基因编码的RNA的表达水平。

在一些方面中，所述方法用于选择对σ-1受体激动剂疗法具有反应的受试者。所述方法包括检测来自所述受试者的生物样品的测试中的RNA表达，所述测试确定由至少一个基因编码的RNA的表达水平，所述基因选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3和其组合组成的群组。所述方法包括如果RNA水平与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的所述RNA水平基本上不同，则排除对σ-1受体激动剂疗法无反应的所述受试者。作为另一选择，所述方法包括如果RNA水平与对σ-1受体疗法具有反应的受试者中的所述RNA水平基本上相似，则鉴定对σ-1受体激动剂疗法具有反应的所述受试者。在一个方面中，确定由选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1和其组合组成的群组中的基因编码的RNA的表达水平。

在一些方面中，所述方法用于治疗需要σ-1受体激动剂疗法的受试者。所述方法包括获得来自所述受试者的生物样品的测试的结果，所述测试确定至少一种多态性的存在。如果受试者中不存在多态性，则向受试者施用治疗有效量的σ-1受体激动剂。作为另一选择，如果受试者中存在多态性，则向受试者施用治疗有效量的σ-1受体激动剂的替代物。在一个方面中，多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L、DHCR7_M220T、HLA-DRB1_A244T、HLA-DRB1_S66Y、HLA-DRB1_Y89S、MS4A6E_M59T、RIN3_H215R、DPYD_I543V和其组合组成的群组。在另一个方面中，多态性选自由SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs、COMT_L146fs、KANSL1_P1010L/P304L/P946L和其组合组成的群组。多态性的存在可通过评估核酸序列来获得。

在其他方面中，所述方法用于治疗需要σ-1受体激动剂疗法的受试者。所述方法包括获得来自所述受试者的生物样品的测试的结果，所述测试确定由基因编码的RNA的表达水平，所述基因选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1、DHCR7、HLA-DRB1、MS4A6E、RIN3和其组合组成的群组。如果测试样品中的RNA水平与从对σ-1受体疗法具有反应的受试者获得的RNA水平基本上相同，则向受试者施用治疗有效量的σ-1受体激动剂。作为另一选择，如果测试样品中的RNA水平与从对σ-1受体疗法具有反应的受试者获得的RNA水平本质上不同，则向受试者施用治疗有效量的σ-1受体激动剂的替代物。在另一个方面中，确定由选自由SIGMAR1、COMT、KANSL1和其组合组成的群组中的基因编码的RNA的表达水平。

将会认识到，受试者可具有多于一种多态性。例如，受试者可具有1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多种多态性。在一些方面中，受试者具有1、2、3、4、5、6、7、8、9或10种多态性。在其他方面中，受试者具有1、2、3、4或5种多态性。在另一些方面中，受试者具有1、2或3种多态性。

IV.

Sig-1R的表达或活性与神经退行性病变相关联，人体实验及其它体外及体内模型都证明Sig-1R的活性与神经保护相关联。因此，本公开揭示的治疗方法可适用于任何与σ-1受体相关的神经元系统疾病或病症。这些病症包含各种被称为神经发育和神经退行性疾病和病症的病症，且可用于神经保护。神经退行性疾病包含，且不仅限于包含，阿尔茨海默病、帕金森氏病、朊病毒病、亨廷顿氏病、运动神经元疾病(MND)(诸如肌萎缩性侧索硬化、脊髓小脑性共济失调(SCA)、脊髓性肌萎缩症(SMA)、痴呆、自闭症谱系障碍、脑瘫、雷特综合征、安格尔曼综合征、威廉斯综合征、未分类的广泛性发育障碍(PDD-NOS)、多发性硬化、儿童崩解性障碍、脆性X、婴儿痉挛和史密斯-马吉斯综合征)、精神分裂症、创伤后应激障碍(PTSD)和任何神经元损伤(诸如中风导致的损伤、创伤性脑损伤和脊髓损伤)。

SIGMAR1也可用作癌症治疗的靶标。因此，本公开还适用于治疗任何与σ-1受体相关癌症或肿瘤。正如本领域技术人员将认识到的，本公开提到的所有癌症均可为一种或多种肿瘤或癌症。肿瘤可为恶性的或良性的，癌症可为原发性的或转移性的；肿瘤或癌症可为早期或晚期。可治疗的肿瘤或癌症包含，且不仅限于包含，急性淋巴母细胞白血病、急性髓细胞白血病、肾上腺皮质癌、AIDS相关癌症、AIDS相关淋巴瘤、肛门癌、阑尾癌、星形细胞瘤(儿童小脑或大脑)、基底细胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨癌、脑干神经胶质瘤、脑瘤(小脑星形细胞瘤、脑星形细胞瘤/恶性神经胶质瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、幕上原始神经外胚层肿瘤、视觉途径和下丘脑神经胶质瘤)、乳腺癌、支气管腺瘤/类癌、伯基特淋巴瘤、类癌瘤(儿童，胃肠道)、原发灶不明癌、中枢神经系统淋巴瘤(原发性)、小脑星形细胞瘤、脑星形细胞瘤/恶性神经胶质瘤、宫颈癌、儿童癌症、慢性淋巴细胞白血病、慢性骨髓性白血病、慢性骨髓增生性障碍、结肠癌、皮肤T细胞淋巴瘤、促结缔组织增生性小圆细胞瘤、子宫内膜癌、室管膜瘤、食道癌、尤因瘤家族肿瘤中的尤因氏肉瘤、颅外生殖细胞瘤(儿童)、性腺外生殖细胞瘤、肝外胆管癌、眼癌(眼内黑色素瘤、视网膜母细胞瘤)、胆囊癌、胃部(胃)癌、胃肠类癌、胃肠间质瘤、生殖细胞瘤(儿童颅外、性腺外、卵巢)、妊娠滋养细胞肿瘤、神经胶质瘤(成人、儿童脑干、儿童脑星形细胞瘤、儿童视觉途径和下丘脑)、胃类癌、毛细胞白血病、头颈癌、肝细胞(肝)癌、霍奇金淋巴瘤、下咽癌、下丘脑和视觉途径神经胶质瘤(儿童)、眼内黑色素瘤、胰岛细胞癌、卡波西肉瘤、肾癌(肾细胞癌)、喉癌、白血病(急性淋巴母细胞性、急性髓细胞性、慢性淋巴细胞性、慢性髓细胞性、毛细胞性)、唇癌和口腔癌、肝癌(原发性)、肺癌(非小细胞、小细胞)、淋巴瘤(AIDS相关、伯基特、皮肤T细胞、霍奇金、非霍奇金、原发性中枢神经系统)、巨球蛋白血症(瓦尔登斯特伦)、骨恶性纤维组织细胞瘤/骨肉瘤、髓母细胞瘤(儿童)、黑色素瘤、眼内黑色素瘤、默克尔细胞癌、间皮瘤(成人恶性、儿童)、隐匿性原发性转移性颈部鳞状细胞癌、口癌、多发性内分泌瘤综合征(儿童)、多发性骨髓瘤/浆细胞瘤、蕈样真菌病、骨髓增生异常综合征、骨髓增生异常/骨髓增生性疾病、骨髓性白血病(慢性)、髓系白血病(成人急性、儿童急性)、多发性骨髓瘤、骨髓增生性障碍(慢性)、鼻腔和副鼻窦癌、鼻咽癌、成神经细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、口腔癌、口咽癌、骨肉瘤/骨恶性纤维组织细胞瘤、卵巢癌、卵巢上皮癌(表面上皮-间质肿瘤)、卵巢生殖细胞瘤、卵巢低度恶性潜能肿瘤、胰腺癌、胰腺癌(胰岛细胞)、副鼻窦和鼻腔癌、甲状旁腺癌、阴茎癌、咽癌、嗜铬细胞瘤、松果体星形细胞瘤、松果体生殖细胞瘤、松果体母细胞瘤和幕上原始神经外胚层肿瘤(儿童)、垂体腺瘤、浆细胞瘤、胸膜肺母细胞瘤、原发性中枢神经系统淋巴瘤、前列腺癌、直肠癌、肾细胞癌(肾癌)、肾盂和输尿管移行细胞癌、视网膜母细胞瘤、横纹肌肉瘤(儿童)、唾液腺癌、肉瘤(尤因肿瘤家族、卡波西、软组织、子宫)、塞扎里综合征、皮肤癌(非黑色素瘤、黑色素瘤)、皮肤癌(默克尔细胞)、小细胞肺癌、小肠癌、软组织肉瘤、鳞状细胞癌、隐匿性原发鳞状颈部癌(转移性)、胃癌、幕上原始神经外胚层肿瘤(儿童)、T细胞淋巴瘤(皮肤)、睾丸癌、喉癌、胸腺瘤(儿童)、胸腺瘤和胸腺癌、甲状腺癌、甲状腺癌(儿童)、肾盂和输尿管的移行细胞癌、滋养细胞肿瘤(妊娠)、未知原发部位(成人、儿童)、输尿管和肾盂移行细胞癌、尿道癌、子宫癌(子宫内膜癌)、子宫肉瘤、阴道癌、视觉途径和下丘脑神经胶质瘤(儿童)、外阴癌、瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症和肾母细胞瘤(儿童)。

所述方法还包括当确定需要σ-1受体激动剂疗法的受试者对所述疗法无反应时，施用治疗有效量的σ-1受体激动剂的替代物。σ-1受体激动剂的替代物包含，且不仅限于包含加兰他敏、美金刚胺和卡巴拉汀。

所述方法还包括当确定需要σ-1受体激动剂疗法的受试者对所述疗法具有反应时，施用治疗有效量的σ-1受体激动剂。σ-1受体激动剂可以是能够提供σ-1受体激动剂疗法的任何治疗剂或活性剂。例如，受体激动剂可为生物化合物(诸如抗体或肽)或小分子活性剂。σ-1受体激动剂包含，且不仅限于包含恩他卡朋、奈比卡朋、尼泰卡朋、阿哌卡朋、托卡朋、四氢-N,N-二甲基-2,2-二苯基-3-呋喃甲胺盐酸盐(ANAVEX2-73、AV2-73或A2-73)、1-(2,2-二苯基四氢呋喃-3-基)-N-甲基甲胺盐酸盐(ANAVEX19-144或A19-144)、氨基四氢呋喃衍生物四氢-N,N-二甲基-5,5-二苯基-3-呋喃甲胺盐酸盐(ANAVEX1-41)、1-(3-4(((1R,3S,5S)-金刚烷-1-基)(苯基)甲基)丙基)-4-甲基哌嗪(ANAVEX

在一个方面中，σ-1受体激动剂是A2-73。当激动剂是A2-73时，A2-73的治疗有效量可介于约0.5mg至约20mg、约1mg至约60mg、约30mg至约50mg或约3mg至约5mg的范围内。A2-73的治疗有效量可介于约0.5mg/天至约100mg/天、约1mg/天至约60mg/天、约20mg/天至约50mg/天、约20mg/天至约30mg/天或约15mg/天至约25mg/天的范围内。施用抗神经退行性变有效量的A2-73可提供约10ng/ml、约12ng/ml的A2-73的血液水平。

A2-73可对受试者每天施用或每天施用一次以上。此外，A2-73可每2、3、4、5、6、7、14或每30天施用一次。A2-73可在介于约1天至约1年、约1天至约1周、约3天至约1个月、约2周至约6个月或约2个月至约4个月范围内的时期内施用。A2-73也可在约1天、约7天、约30天、约60天、约120天或约180天或更长时间内施用。在一些方面中，A2-73在约57周、约148周、约208周的时期内、无限期地施用或施用至所治疗的病症得到解决。

其他施用A2-73的方法可见于例如公开内容以引用方式全文并入本文中的美国专利第9750746号、美国专利公开第20170360798号、美国专利公开第20190022052号、美国专利公开第20180360796号、美国专利公开第20180169059号、美国专利公开第20180177756号、美国专利公开第20180169060号及美国专利公开第20190117615中。

V.

本公开还包含相关的药物制剂，用于σ-1受体激动剂的诊断和递送。药物制剂包括治疗有效量的激动剂及其任何药学上可接受的盐。

包括式(II)或(IIa)的化合物的药学上可接受的盐包含但不限于乙酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、酒石酸氢盐、柠檬酸盐、甲酸盐、葡萄糖酸盐、葡糖醛酸盐、谷氨酸盐、延胡索酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、次磷酸盐、异丁酸盐、异柠檬酸盐、乳酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、袂康酸盐、甲基溴化物、甲磺酸盐、一水合物、粘酸盐、硝酸盐、草酸盐、苯基丙酸盐、磷酸盐、邻苯二甲酸盐、丙酸盐、丙酮酸盐、水杨酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、鞣酸盐、酒石酸盐、对苯二甲酸盐、戊酸盐等。

当σ-1受体激动剂为A2-73时，制剂可包括约1mg至约50g、约0.1g至约5g、约0.5g至约3g、约1mg至约55mg、约40mg至约60mg、约80mg至约120mg、约180mg至约220mg、约0.1g至约5g或约0.5g至约3g的A2-73。包括A2-73的制剂可见于例如公开内容以引用方式全文并入本文中的美国专利第9750746号、美国专利公开第20170360798号、美国专利公开第20190022052号、美国专利公开第20180360796号、美国专利公开第20180169059号、美国专利公开第20180177756号、美国专利公开第20180169060号及美国专利公开第20190117615号中。

σ-1受体激动剂可通过几种不同的方法配制成制剂并施用于受试者。例如，药剂通常可根据需要辅以常规且无毒的药学上可接受的佐剂、载体、赋形剂和介体的剂量单位制剂进行胃肠外、腹膜内、血管内、透皮、皮下或肺内施用。本文使用的术语胃肠外包含皮下、静脉内、肌内、鞘内或胸骨内注射或输注技术。药物组合物的制剂论述在例如Hoover,JohnE.,Remington's Pharmaceutical Sciences,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.(1975)和Liberman,H.A.and Lachman,L.,Eds.,Pharmaceutical Dosage Forms,Marcel Decker,New York,N.Y.(1980)中。

药物制剂包括一种或多种药学上可接受的赋形剂。赋形剂包含，且不限于包含化学增强剂、湿润剂、压敏粘合剂、抗氧化剂、增溶剂、增稠剂、增塑剂、佐剂、载体、赋形剂、介体、包衣及其任意组合。可选择一种或多种赋形剂用于口服、透皮、胃肠外、腹膜内、血管内、皮下、吸入喷雾、直肠或肺内施用。

σ-1受体激动剂制成的剂型可有利于改善患者的依从性，或者防止受试者移除药物递送装置。例如，σ-1受体激动剂可被制成延长释放的制剂，以改善患者依从性并防止药物递送装置的移除。延长的药物递送时限可介于一天以上至数月。这种制剂特别适宜于认知受损和/或运动控制能力受损的患者。延长释放制剂的递送时期可介于约1天至约1年、约1天至约1周、约3天至约1个月、约2周至约6个月或约2个月至约4个月的范围内。

延长释放制剂能以预选的速率基本连续地递送药品。例如，对于晶体A2-73，药品可以约1mg/天至约100mg/天、约40gm/天至约60gm/天或约10gm/天至约30gm/天的速率递送。晶体A2-73的适当量的确定可由普通技术人员基于例如药品通过延长释放制剂的预期施用持续时间、递送机制、特定制剂和药品的相对效力及其他因素来容易地确定。

i.

粘合剂可适用于不同制剂中，粘合剂包含，且不仅限于淀粉、预胶化淀粉、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素、甲基纤维素、羧甲基纤维素钠、乙基纤维素、聚丙烯酰胺、聚乙烯氧代偶氮烷酮、聚乙烯醇、C

粘合剂可以固体形式引入待制粒的混合物中，包含但不限于晶体、颗粒、粉末或本领域中已知的任何其他细分固体形式。作为另一选择，粘合剂可溶解或悬浮在溶剂中，并在制粒过程中作为粘合剂流体喷射至制粒装置中的混合物上。

ii.

稀释剂(也称为“填充剂”或“冲淡剂”)包含但不限于碳水化合物、无机化合物和生物相容性聚合物，诸如聚乙烯吡咯烷酮(PVP)。稀释剂的其他非限制性示例包含二元硫酸钙、三元硫酸钙、淀粉、碳酸钙、碳酸镁、微晶纤维素、二元磷酸钙、三元磷酸钙、碳酸镁、氧化镁、硅酸钙、滑石、改性淀粉、糖类(诸如蔗糖、右旋糖、乳糖、微晶纤维素、果糖、木糖醇和山梨醇)、多元醇；淀粉；预制直接压缩稀释剂；以及任何前述物质的混合物。

iii.

崩解剂可为泡腾的或非泡腾的。非泡腾崩解剂包含但不限于淀粉(诸如玉米淀粉、马铃薯淀粉、其预胶化和改性淀粉)、甜味剂、粘土(诸如膨润土)、微晶纤维素、海藻酸盐、淀粉乙醇酸钠、树胶(诸如琼脂)、瓜尔豆、刺槐豆、刺梧桐树胶、果胶和黄蓍胶。合适的泡腾崩解剂包含但不限于碳酸氢钠与柠檬酸的组合，以及碳酸氢钠与酒石酸的组合。

iv.

防腐剂包含但不限于抗坏血酸及其盐、抗坏血酸棕榈酸酯、抗坏血酸硬脂酸酯、阿诺克索默、N-乙酰半胱氨酸、异硫氰酸苄酯、间氨基苯甲酸、邻氨基苯甲酸、对氨基苯甲酸(PABA)、丁基化羟基茴香醚(BHA)、丁基化羟基甲苯(BHT)、咖啡酸、崁萨黄素、α-胡萝卜素、β-胡萝卜素、β-caraotene、β-阿朴-胡萝卜素酸、鼠尾草酚、香芹酚、儿茶素、鲸蜡基没食子酸酯、绿原酸、柠檬酸及其盐、丁香提取物、咖啡豆提取物、对香豆酸、3,4-二羟基苯甲酸、N,N'-二苯基对苯基二胺(DPPD)、二月桂基硫代二丙酸酯、二硬脂基硫代二丙酸酯、2,6-二叔丁基苯酚、十二烷基没食子酸酯、依地酸、鞣花酸、异抗坏血酸、异抗坏血酸钠、七叶亭、七叶灵、6-乙氧基-1,2-二氢-2,2,4-三甲基喹啉、没食子酸乙酯、乙基麦芽酚、乙二胺四乙酸(EDTA)、桉树提取物、丁香酚、阿魏酸、黄酮类(例如，儿茶素、表儿茶素、表儿茶素没食子酸酯、表没食子儿茶素(EGC)、表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)、多酚表没食子儿茶素-3-没食子酸酯)、黄酮(例如，芹菜素、白杨素、木犀草素)、黄酮醇(例如，橡精、杨梅素、山茶酚)、黄烷酮、秦皮素、富马酸、没食子酸、龙胆草提取物、葡萄糖酸、甘氨酸、愈创木胶、橙皮素、α-羟基苄基次膦酸、羟基肉桂酸、羟基戊二酸、氢醌、N-羟基琥珀酸、羟基酪醇、羟基脲、米糠提取物、乳酸及其盐、卵磷脂、卵磷脂柠檬酸盐；R-α-硫辛酸、叶黄素、番茄红素、苹果酸、麦芽酚、5-甲氧基色胺、没食子酸甲酯、柠檬酸单甘油酯；柠檬酸单异丙酯；桑色素、β-萘酚黄酮、去甲二氢愈创木酸(NDGA)、没食子酸辛酯、草酸、柠檬酸棕榈酯、吩噻嗪、磷脂酰胆碱、磷酸、磷酸盐、植酸、植酸铬、甜椒提取物、没食子酸丙酯、多磷酸盐、槲皮素、反式白藜芦醇、迷迭香提取物、迷迭香酸、鼠尾草提取物、芝麻酚、水飞蓟素、芥子酸、琥珀酸、硬脂基柠檬酸、丁香酸、酒石酸、麝香草酚、生育酚(即，α-、β-、γ-和δ-生育酚)、生育三烯酚(即，α-、β-、γ-和δ-生育三烯酚)、酪醇、香草酸、2,6-二叔丁基-4-羟甲基苯酚(即，lonox 100)、2,4-(三-3',5'-二叔丁基-4'-羟基苄基)-均三甲苯(即，lonox 330)、2,4,5-三羟基丁酰苯、泛醌、叔丁基氢醌(TBHQ)、硫代二丙酸、三羟基丁酰苯、色胺、酪胺、尿酸、维生素K及衍生物、维生素Q10、小麦胚芽油、玉米黄质或其组合。

v.

合适的口味改良剂包含食用香料、掩味剂、甜味剂等。食用香料包含但不限于合成食用风味油和调味香料和/或天然油，植物、叶子、花、果实的提取物及其组合。口味改良剂还可包含肉桂油、冬青油、薄荷油、三叶草油、干草油、茴香油、桉树油、香草油、柑橘油(诸如柠檬油、橙油、葡萄和葡萄柚油)、水果香精(包含苹果、桃、梨、草莓、覆盆子、樱桃、李子、菠萝和杏)。

掩味剂包含但不限于纤维素羟丙基醚(HPC)，诸如

甜味剂可包含葡萄糖(玉米糖浆)、右旋糖、转化糖、果糖及其混合物(当不用作载体时)；糖精及其各种盐，诸如钠盐；二肽甜味剂，诸如阿斯巴甜；二氢查尔酮化合物、甘草甜素；甜叶菊(蛇菊苷)；蔗糖的氯衍生物，诸如三氯蔗糖；糖醇，诸如山梨醇、甘露醇、木糖醇、氢化淀粉水解产物和合成甜味剂3,6-二氢-6-甲基-1,2,3-氧杂噻嗪-4-酮-2,2-二氧化物，特别是钾盐(醋磺内酯钾)及其钠盐和钙盐。

vi.

润滑剂组合物可用于润滑药物组合物的任何成分。作为助流剂，润滑剂有助于在制造过程中移除固体剂型。润滑剂和助流剂包含但不限于，硬脂酸镁、硬脂酸钙、硬脂酸锌、氢化植物油、sterotex、聚氧乙烯单硬脂酸酯、滑石、聚乙二醇、苯甲酸钠、月桂基硫酸钠、月桂基硫酸镁和轻质矿物油。药物组合物通常使用约0.01重量％至约10重量％的润滑剂。在一些方面中，药物组合物将使用约0.1重量％至约5重量％的润滑剂。在另一些方面，药物组合物将包括约0.5重量％至约2重量％的润滑剂。

vii.

分散剂可包含但不限于淀粉、海藻酸、聚乙烯吡咯烷酮、瓜尔胶、高岭土、膨润土、纯化的木质纤维素、羟乙酸钠淀粉、同晶硅酸盐和微晶纤维素作为高亲水亲油平衡(HLB)乳化剂表面活性剂。

viii.

某些方面，本公开可包含着色剂。合适的颜色添加剂包含但不限于食品、药品和化妆品颜色(FD&C)、药品和化妆品颜色(D&C)或外用药品和化妆品颜色(Ext.D&C)。这些颜色或染料连同其对应的色块以及某些天然着色剂，以及天然着色剂的衍生物可适用于本公开的不同方面。

ix.

pH调节剂包含但不限于柠檬酸、乙酸、酒石酸、苹果酸、富马酸、乳酸、磷酸、山梨酸、苯甲酸、碳酸钠和碳酸氢钠。

x.

本公开的制剂中可包含螯合剂，它作为赋形剂来固定氧化基团(包含但不限于金属离子)，以抑制这些氧化基团对吗啡喃的氧化降解。螯合剂包含但不限于赖氨酸、蛋氨酸、甘氨酸、葡萄糖酸盐、多糖、谷氨酸盐、天冬氨酸盐和乙二胺四乙酸二钠(Na

xi.

抗微生物剂可作为赋形剂被包含在内，以减少本公开的化合物被微生物(包含但不限于细菌和真菌)降解。抗微生物剂的非限制性示例包含对羟基苯甲酸酯、氯代丁醇、苯酚、丙酸钙、硝酸钠、亚硝酸钠、Na

xii.

控释聚合物可包含在本公开的化合物的固体剂量药物组合物中。在一个方面中，控释聚合物可用作片剂包衣。在其他方面(包含但不限于双层片剂)中，在通过已知工艺形成片剂之前，控释聚合物可与颗粒和其他赋形剂混合，所述已知工艺包含但不限于在片剂模具中压制。合适的控释聚合物包含但不限于亲水聚合物和疏水聚合物。

合适的亲水性控释聚合物包含但不限于乙酸纤维素、二乙酸纤维素、三乙酸纤维素、纤维素醚、羟乙基纤维素、羟丙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、微晶纤维素、硝基纤维素、交联淀粉、琼脂、酪蛋白、几丁质、胶原、明胶、麦芽糖、甘露醇、麦芽糖糊精、果胶、支链淀粉、山梨醇、木糖醇、多糖、海藻酸氨、海藻酸钠、海藻酸钙、海藻酸钾、海藻酸丙二醇酯、海藻酸羧甲醚纤维素钠、羧甲基纤维素钙、卡拉胶、岩藻聚糖硫酸酯、叉红藻胶、阿拉伯树胶、角叉菜胶、印度树胶、瓜尔胶、卡拉亚胶、槐树豆胶、秋葵胶、黄蓍胶、硬葡聚糖胶、黄原胶、沙菜属、昆布多糖、丙烯酸聚合物、丙烯酸酯聚合物、羧乙烯基聚合物、马来酸酐和苯乙烯的共聚物、马来酸酐和乙烯的共聚物、马来酸酐丙烯的共聚物或马来酸酐异丁烯的共聚物、交联聚乙烯醇和聚N-乙烯基-2-吡咯烷酮、聚葡聚糖的二酯、聚丙烯酰胺、聚丙烯酸、聚酰胺、聚乙二醇、聚氧化乙烯、聚(甲基丙烯酸羟烷基酯)、聚乙酸乙烯酯、聚乙烯醇、聚氯乙烯、聚苯乙烯、聚乙烯吡咯烷酮、阴离子和阳离子水凝胶及其组合。

xiii.

包括根据本公开的化合物的固体剂量可包括包衣，其中这种包衣可控制化合物的释放，充当防潮层，或缓冲或调节pH。本文所用的“控释包衣(control releasing coat)”或“控释包衣(controlled release coat)”被定义为指功能性包衣，其可例如包括至少一种与pH无关的聚合物、pH相依性聚合物(例如肠溶型或反向肠溶型聚合物)、可溶性聚合物、不溶性聚合物、脂质、脂质材料或其组合。当包衣被施用至剂型上时，可减缓(例如当施用至正常释放基质剂型上时)、进一步减缓(例如当施用至控释基质剂型上时)或修改施用至未包衣剂型上时根据本公开化合物的释放速率。例如，当控释包衣与剂型结合时，结合后的剂型可以以不同方式释放本公开的化合物，诸如“修改释放”、“控释”、“缓释”、“延长释放”、“延迟释放”、“拖延释放”或其组合。“控释包衣”可任选地包括可改变控释包衣的功能的附加材料。

本文使用的术语“防潮层”是指阻碍或延缓水分吸收的物质。本公开的化合物可为吸湿性的，因而在高湿度条件下随着时间的推移可能容易分解。通常施用在控释包衣或芯上的防潮层的用量和组分的比例会使得防潮层不落在USP对肠溶包衣的定义和要求的范围内。适合的防潮层可包括肠溶和/或丙烯酸聚合物，比如丙烯酸聚合物，也可选用增塑剂和渗透增强剂。渗透增强剂是允许水进入而不会破坏包衣的亲水性物质。防潮层可另外包括其他常规惰性赋形剂，其可改善延长释放制剂的制作过程。

根据本发明可使用的包衣和基质材料是本领域中已知的用于控释制剂的材料，诸如聚乙烯型合成聚合物，例如聚氯乙烯、聚乙酸乙烯酯及其共聚物、聚乙烯醇和聚乙烯吡咯烷酮；聚乙烯类型的合成聚合物，例如聚乙烯和聚苯乙烯；丙烯酸聚合物；生物聚合物或改性生物聚合物，诸如纤维素聚合物、虫胶和明胶；脂肪、油、高级脂肪酸和高级醇(即，含有至少10个碳原子的烷基链的酸和醇)，例如单硬脂酸铝、鲸蜡醇、氢化牛油、氢化蓖麻油、12-羟基硬脂醇、甘油单棕榈酸酯或甘油二棕榈酸酯；甘油单硬脂酸酯、甘油二硬脂酸酯或甘油三硬脂酸酯；肉豆蔻醇、硬脂酸、硬脂醇和聚乙二醇；蜡；糖和糖醇。

包衣的pH缓冲性质可通过在包衣中引入选自抗酸制剂中常用的一组化合物的物质来增强，例如氧化镁、氢氧化镁或碳酸镁、氢氧化铝或氢氧化钙、碳酸铝或碳酸钙或硅酸铝或硅酸钙；复合铝/镁化合物，例如Al

pH相依性包衣用于在胃肠(GI)道(例如，胃或小肠)的所需区域释放药品。当需要与pH无关的包衣时，所述包衣被设计成不管环境流体(例如，胃肠道)中的pH如何变化都能获得最佳的释放。当包衣被配制成在肠(尤其是小肠上部)中释放时，所述包衣通常被称为“肠溶包衣”。pH相依性包衣可包含但不限于丙烯酸聚合物和共聚物，例如由丙烯酸、甲基丙烯酸、丙烯酸甲酯、甲基丙烯酸铵、丙烯酸乙酯、甲基丙烯酸甲酯和/或甲基丙烯酸乙酯形成的聚合物(例如，Eudragit

VI.

本公开的一个方面囊括σ-1受体激动剂的剂型。当激动剂为A2-73时，剂型可包括约1mg至约50g、约1mg至约500mg、约1mg至约100mg、约1mg至约500mg、约50mg至约400mg、约75mg至约150mg、约150mg至约200mg、约40mg至约60mg、约80mg至约120mg或约180mg至约220mg的A2-73。例如，剂型可包括1mg、10mg、20mg、30mg、40mg、50mg、60mg、70mg、80mg、90mg、100mg、120mg、140mg、160mg、180mg、200mg、220mg、240mg、260mg、280mg或300mg或更多的A2-73。在一些方面中，剂型可包括约1mg至约500mg或约1mg至约100mg的A2-73。

剂型包含被配制用于延长或缓慢释放的剂型及被配制用于立即释放的剂型。例如，立即释放剂型可包含A2-73的结晶形式，A2-73以游离碱或本文公开的盐的形式存在于晶体中。例如，速溶性口服剂型可包含例如A2-73盐，诸如HCl盐。作为另一选择，剂型可包含A2-73的结晶形式作为游离碱或配制用于吸入药品递送的A2-73盐，作为干粉或气溶胶喷雾。

剂型也包含配制用于局部施用的剂型。例如，剂型可配制成凝胶、软膏、乳液、微乳液、溶液、悬浮液、膏、凝胶、泡沫、喷雾、洗剂或霜剂中的一种或多种。在一个方面中，局部施用剂型是透皮贴剂。当剂型被配制成透皮贴剂时，透皮贴剂可含有约40mg至约60mg、约80mg至约120mg或约180mg至约220mg的结晶形式的A2-73游离碱。

作为另一选择，剂型可配制用于口服施用。被配置用于口服施用的剂型可为吞咽、咀嚼或溶于水或舌下的片剂、胶囊和可咀嚼胶囊、粉末、颗粒、茶、滴剂或液体药物或糖浆。在一些方面中，剂型是肠溶包衣口服制剂。

当剂型是肠溶包衣口服制剂时，制剂可包括约0.1mg至约60mg的A2-73游离碱，优选约1mg至约50mg的A2-73游离碱。

肠溶包衣口服制剂也可含有结晶形式的A2-73盐。A2-73盐可为富马酸盐、硫酸盐、甲磺酸盐、磷酸二氢盐、乙二磺酸盐、苯甲酸盐、盐酸盐和草酸盐。在一个方面中，A2-73盐是富马酸盐。当A2-73盐是富马酸盐时，肠溶包衣口服制剂可包括约0.1mg至约100mg的A2-73富马酸盐，优选约1mg至约55mg的A2-73富马酸盐。

剂型也囊括被配制用于皮下和/或肌肉注射的那些剂型。例如，肌内剂型可包括溶解在用于肌内注射的油基质中的游离碱形式或者作为另一选择被制备成用于肌内注射的游离碱的悬浮液的A2-73。被配制用于皮下或肌肉注射的剂型可包括本文公开的使用本领域中已知的方法制备成微球的盐或游离碱形式的A2-73。作为另一选择，游离碱或盐形式的A2-73可例如使用原子层沉积(ALD)技术，用薄层包衣(诸如氧化锌包衣)涂覆，并用于皮下或肌肉注射的制剂中。作为另一选择，A2-73游离碱可溶解在可生物降解的聚合物基质中，且然后皮下植入(或用于透皮贴剂，如下文进一步详述的)。

VII.

本公开的另一方面提供用于本公开的方法的包括一种或多种试剂的试剂盒。试剂盒可包括细胞生长培养基、选择培养基、核酸测序和纯化试剂、蛋白纯化试剂、缓冲液等。本文提供的试剂盒通常包含实施本公开的使用说明。试剂盒中包含的使用说明可贴在包装材料上，或者也可作为包装插页被包含在试剂盒内。虽然使用说明通常是书写或印刷材料，但它们并不限于此。本公开设想到能够存储此种说明并将其传达给最终用户的任何介质。这种介质包含但不限于电子存储介质(例如，磁盘、磁带、盒式磁带、芯片)、光学介质(例如，CDROM)等。本文所使用的术语“说明”可包含提供说明的互联网站点的地址。

除非另有定义，否则本文使用的所有技术和科学术语具有本发明所属领域的技术人员通常理解的含义。以下参考文献为技术人员提供了本发明中使用的许多术语的一般定义：Singleton et al.,Dictionary of Microbiology and Molecular Biology(2nded.1994)；The Cambridge Dictionary of Science and Technology(Walker ed.,1988)；The Glossary of Genetics,5th Ed.,R.Rieger et al.(eds.),Springer Verlag(1991)；和Hale&Marham,The Harper Collins Dictionary of Biology(1991)。除非另有说明，否则本文中使用的下列术语具有赋予它们的含义。

当介绍本公开的元素或其优选方面时，冠词“一”、“一个”和“该”及“所述”旨在表示存在元素中的一个或多个。术语“包括”、“包含”和“具有”旨在是包含性的，且意味着除了列出的元素之外，还可存在附加元素。

由于在不脱离本发明的范围的情况下，可对上述单元和方法进行各种改变，因此上述说明中以及以下给出的示例中含有的所有内容都应被解释为说明性的，而不是限制性的。

术语“包括”意指“包含但不限于”；其具体指示在所述组合、群组、系列等中的开放式包含或成员资格。本文使用的术语“包括”和“包含”是包含性的和/或开放式的，且不排除附加的、未引用的元素或方法过程。术语“实质上由……组成”比“包括”更具限制性，但不如“由……组成”具有限制性。具体地说，术语“实质上由……组成”将成员资格限制为特定的材料或步骤，以及那些实质上不影响所要求保护的发明的基本特征的材料或步骤。

如本文所用，“表达”包含但不限于以下中的一或多种：将基因转录成前体mRNA；对前体mRNA进行剪接和其他处理以产生成熟的mRNA；mRNA稳定性；将成熟的mRNA翻译成蛋白质(包含密码子使用和tRNA的可用性)；以及翻译产物的糖基化和/或其他修饰(如果正确表达和功能要求的话)。

本文所用的术语“基因”意指含有RNA产物的受调控生物合成的所有信息的DNA片段，包含启动子、外显子、内含子和其他控制表达的未翻译区。

本文所用的术语“基因型”意指在个体中的一对同源染色体的基因座中的一个或多个多态性位点处发现的核苷酸对的混淆5'至3'序列。本文所用的基因型包含全基因型和/或子基因型。

本文所用的术语“座(locus)”或“基因座(genetic locus)”可互换使用，且指染色体或DNA分子上对应于基因或物理或表型特征的位置。

本文所用的术语“突变体”是指由突变导致的野生型的任何可遗传变异，例如，单核苷酸多态性(“SNP”)和插入/缺失。在说明书通篇中，术语“突变体”与术语“标志物”、“生物标志物”和“靶标”可互换使用。

本文所用的术语“医学病症”包含但不限于表现为需要对其进行治疗的一种或多种身体和/或心理症状的任何病症或疾病，并且包含先前和新鉴定的疾病和其他障碍。

本文所用的术语“核苷酸对”意指在个体染色体的两个拷贝上的多态性位点处发现的核苷酸。

本文所用的术语“多态性”、“多态性变体”和“多态性位点”可互换使用，且指基因座中发现至少两个替代序列的位置。基因的多态性变体可导致蛋白的异常表达或异常形式的产生；这种异常可能导致疾病或与疾病相关联。

本文所用的术语“多核苷酸”意指任何RNA或DNA，其可为未修饰或修饰的RNA或DNA。多核苷酸包含但不限于单链和双链DNA、单链和双链区域的混合物的DNA、单链和双链RNA、单链和双链区域的混合物的RNA以及包括可为单链或更典型地双链或单链和双链区域的混合物的DNA和RNA的杂交分子。此外，多核苷酸是指包括RNA或DNA或RNA和DNA两者的三链区域。术语多核苷酸还包含含有一个或多个修饰碱基的DNA或RNA，以及为了稳定性或其他原因而修饰主链的DNA或RNA。

本文所用的术语“多肽”意指包括通过肽键或修饰的肽键相互连接的两个或更多个氨基酸的任何多肽，即，肽等排体。多肽既指通常称为肽、糖肽或寡聚物的短链，也指通常称为蛋白的长链。多肽可能含有20种基因编码的氨基酸以外的氨基酸。多肽包含通过天然过程(例如翻译后处理)或通过本领域中众所周知的化学修饰技术修饰的氨基酸序列。这种修饰在基础文本和更详细的专著中以及在大量的研究文献中有很好的描述。

本文所用的术语“单核苷酸多态性(SNP)”意指基因组中单个位置的核苷酸可变性，其中两个替代碱基以人群中可感知的频率出现(即，>1％)。SNP可能发生在基因内或基因组的基因间区域内。根据本发明的SNP探针是与SNP及其侧翼核酸序列互补的寡核苷酸。

本文所用的术语“受试者”意指优选受试者是哺乳动物(诸如人)，但也可为动物，例如家畜(例如狗、猫等)、农场动物(例如牛、羊、猪、马等)和实验室动物(例如食蟹猴、大鼠、小鼠、豚鼠等)。

如本文所用，对受试者或患者施用药剂或药品包含自我施用和由另一者施用。还应当理解，所述的治疗或预防医学病症的各种模式旨在意指“基本上”，其包含全部或少于全部的治疗或预防，并且成功达到一些生物学或医学相关的结果。

以上讨论的出版物仅用于在本申请的提交日之前公开。本文中的任何内容都不应被解释为承认这些出版物所公开的内容先于本发明。

包含以下示例来证明本公开。本领域技术人员应理解，以下示例中公开的技术表示本发明人发现的在本公开的实践中发挥良好作用的技术。然而，根据本公开，本领域技术人员应理解，在不脱离本公开的精神和范围的情况下，可在本公开中进行许多改变，并且仍然获得相似或类似的结果，因此，所阐述的所有内容将被解释为说明性的，而不是限制性的。

示例1.ANAVEX2-73的研究设计、安全性和耐受性以及患者特征。

ANAVEX2-73(SIGMAR1激动剂)已通过PET扫描显示直接结合其靶标并调节小鼠中的胆碱能毒蕈碱受体。ANAVEX2-73在AD中的临床潜力最初是在小鼠中评估的，随后是在健康志愿者中的阶段1研究和57周的阶段2a AD研究。这项57周研究(图1a)登记了32名轻度至中度AD的患者，且满足其安全性和耐受性的主要端点(表1)，对其中24位进行了208周的延长研究，被称为208周研究(图1a)。在2项研究中登记的患者在基线时和每次就诊时进行特征描述，包含收集关于临床描述符、体检、药代动力学以及MMSE和ADCS-ADL作为疗效度量的数据(图1b和表3)。

表1. 57周研究和208周延长研究中的受试者部署总结。

Ext.study：延长研究

*：中期累积第148周正在进行的ANAVEX2-73-003试验中的患者人数

表3.基线特征

示例2.基因组生物标志物的鉴定。

在肿瘤学研究中，对患者肿瘤的基因组特征进行常规分析，以鉴定和排序疾病和治疗反应的基因组生物标志物。遗传多态性与治疗反应的变化相关联，调节患者群体内的治疗反应。在本研究中，在109-135周(图1b)对21个仍在延长试验中的患者进行了全外显子组测序(WES)和基因表达分析(RNAseq)。基因组数据与纵向临床和其他患者特征(包含疗效结果度量和衍生的进展度量)相结合导致表型和基因型精确药物分析(图1b、c)。

病人观察的数量比属性的数量少几个数量级的小队列构成分析挑战。在本研究中，使用如在KEM软件(v.3.6.2)中实现的基于伽罗瓦格的无监督形式概念分析方法(FCA)来确定和排序表型和基因型生物标志物。在这项分析中，没有假设生物标志物和结果之间存在任何联系，从而得到了无假设关联条件下的、纯粹反映数据关系的结果。

探索了所有可用特征之间的总共3,145,630种关系。严格的筛选排除了含有编码不存在DNA变体和中等RNA表达组的变量的规则。规则的数字筛选涉及以下阈值：支持度(n>3)、置信度(>50％)、提升度(≥1.2)和p值(费希尔精确测试或曼-惠特尼-威尔克森<0.05)。筛选步骤产生了1,019个将临床、基因组和转录组患者特征与多个时间点的反应联系起来的关联规则的子集。第二个筛选步骤仅集中在与第57周反应的关系，提高的支持度≥5，以及提升度≥1.5，并从部分A中排除RNA表达、CYP变体和剂量/浓度。这进一步将规则的数量减少至15个与结果联系的关联，如通过Δ(二值化离散化；见补充表格表4)或第57周的MMSE或ADCS-ADL的斜率测量的。这15条规则是按照最高置信度和最高提升度的顺序呈现的。严格的筛选集中在第57周(部分B的末尾)的反应关系上，与结果联系的关联的数量减少至只有15个，如根据Δ或斜率MMSE或ADCS-ADL测量的(表4)。在鉴定的15个关系中，在第57周，部分B中ANAVEX2-73的平均血液浓度高于4ng/mL将改善MMSE结果的概率增加了1.88倍(表4)。浓度越高，ΔADCS-ADL得分越高(p＝0.03)(图2c)。较低的MMSE基线得分(<20)使MMSE结果恶化的相对概率(提升度)增加了1.5倍，而较高的MMSE基线得分(>20)使MMSE改善的相对概率增加了1.62倍，两者均发生在第57周。

表4.

进一步集中在显示100％置信度与ΔMMSE和ΔADCS-ADL为真的关系上，鉴定了两个DNA变体，SIGMAR1_Q2P和COMT_L146fs。表5示出综合数据源的总结。来自1,152个描述符的总共2,527个特征用于每个受试者，包含来自总共27,155个注释基因的具有氨基酸变化的837个基因组序列；和185个RNA表达谱。患者描述符显示为灰色，且结果显示为粉色。c.患者描述符数量的描述包含在研究中所应用的所述两个分析步骤中：1)对第57周的反应进行基于无监督的FCA规则的分析，2)使用包含在第57周发现的标志物的历时148周的反应的混合效应建模进行纵向确认，以对两组ANAVEX2-73浓度进行建模。

表5.

还调查了SIGMAR1 Q2P的3维结构影响。使用VistaPDB 1.0软件将SIGMAR1的3维晶体结构可视化(图3)。每种单体展示N末端跨膜α螺旋。蛋白的N末端被认为面向胞质溶胶，并被认为与其他配体相互作用。鉴定的SIGMAR1变体(在2位变为脯氨酸的谷氨酰胺(Gln)-SIGMAR1_p.Q2P)位于蛋白的N末端，且因此可能影响结构和功能。Gln(Q)至脯氨酸(P)的改变影响侧链的长度(在Gln中延伸)，且可能影响氨基酸形成α螺旋的能力。脯氨酸被认为是“螺旋破坏剂”，在某些情况下，N末端螺旋的解旋可归因于脯氨酸。回顾性排除SIGMAR1_Q2P或COMT_L146fs变体和低基线MMSE得分的患者，提高了在第57周MMSE和ADCS-ADL得分。与标准护理相比，在整个阶段2a队列中，每天使用ANAVEX2-73治疗57周，对ΔMMSE和ΔADCS-ADL的效应量分别为0.57和0.18(表6)。如果排除SIGMAR1_Q2P和COMT_L146fs变体和低基线MMSE得分的患者(21名患者中有9名)，则MMSE和ADCS-ADL的效应量分别增加至1.05和0.93(表6)，根据科恩的d指南，这两者都被认为‘大’。

表6.第57周的平均ΔMMSE得分和平均ΔADCS-ADL得分、与取决于SIGMAR1_Q2P和COMT_L146fs基因组变体状态的标准护理相比的科恩的d效应量计算和/或基线MMSE得分总结。

示例3.验证结果。

作为对第57周结果的内部验证，使用回归分析，在208周研究延长研究中，用中期第148周的纵向数据测试了第57周反应的预测因子。此分析包含具有基因组数据和14个时间点的287项观察结果的21名患者(表7)。使用在第57周被鉴定为结果预测因子的部分B中的ANAVEX2-73浓度来定义MMRM-LME模型的2个支臂。除了在第57周鉴定的参数(ANAVEX2-73浓度水平、基线MMSE得分、SIGMAR1_Q2P和COMT_L146fs变体)之外，年龄、性别、APOEε4状态和多奈哌齐联合用药也包含在ΔMMSE和ΔADCS-ADL的MMRM-LME模型中。此分析显示出在148周内，在经调整MMSE和经调整ADCS-ADL中，较高的ANAVEX2-73浓度支臂与低/中浓度支臂相比分别具有78％和88％的有利于治疗结果的差异(p值分别<0.0008和<0.0001)。除了时间之外，APOEε4状态(p<0.0001)和ANAVEX2-73平均浓度也是重要的预测因子(图4a、4b和表8以及表6A)。此外，SIGMAR1_Q2P、COMT_L146fs和APOE4ε4状态与时间的相互作用是显著变量。未经调整的度量证实了这些结果；在148周内，具有阳性反应生物标志物的患者比没有所述生物标志物的患者或接受标准护理的参考群体具有更好的ΔADCS-ADL(图5和表9)。在纵向研究(148周的时期)期间，两名患者显示出异常的治疗反应。两个受试者具有SIGMAR1野生型，血浆中ANAVEX2-73的平均浓度高，且基线MMSE≥20(图6)。报告的临床有益效果包含情绪和警觉性的改善以及独立活动的增加。

表6A

ΔADCS-ADL结果的MMRM-LME模型输出

表7.

ΔMMSE结果的MMRM-LME模型输出

表8.

ΔADCS-ADL结果的MMRM-LME模型输出

表9.不同患者组在14个时间点(第0周、第5周、第12周、第26周、第36周、第48周、第57周、第83周、第96周、第109周、第122周、第135周和第148周)ADCS-ADL得分的未调整变化的均值和标准差的总结。根据纳入标准，ANAVEX2-73研究中的所有患者与每名患者子组一起呈现。从文献中获得的ADCS-ADL得分相对于基线的标准护理均值变化在一年内有-6.7点变化42，且在18个月/70周内有-10.5点变化43。

示例1-3的讨论

据我们所知，本研究是第一次报道的全基因组搜索与AD药品反应相关联的生物标志物。我们使用的方法不同于标准分类或搜索“基因信号”。基于KEM框架的FCA被用作通过与临床研究数据一致的关联规则来鉴定和排序反应的预测因子的方法。如本文所示，FCA机器学习方法能够探索非常大的组合空间，通常为10

围绕AD的“淀粉样蛋白假说”(Amyloid Hypothesis)生成的阴性结果促使AD研究人员设定Aβ斑块可能出现在疾病的晚期，这可能超出了现有的抗BACE或抗τ干预措施的范围。然而，在早期表征疾病也具有挑战性，因为可能预示由AD引起的MCI发作的可靠基因组标志物尚未被鉴定。仅APOE状态没有足够的预测能力，因为只有约25％的群体携带APOE4基因型。研究已经鉴定了可用于早期检测轻度认知障碍(MCI)的基因变体TOMM40。这个假设在未来研究中得到测试。然而，包含3,494名患者(出自筛查的24,136名)的未来研究未能达到其生物标志物资格的主要目标。在这种情况下，搜索AD的替代药品靶标正成为一个优先考虑的问题，且ANAVEX 2-73靶向的SIGMAR1可能是维持细胞内稳态的重要药品靶标，并且可能潜在地延迟或停止神经退行性性变，甚至可能(与其他AD靶向)产生互补性协同反应。

本文对两项临床研究的数据进行了数据驱动的无偏分析，这使得能够鉴定与改善结果相关联的参数。通过搜索和选择在多个时间点和多个端点与临床反应一致相关的生物标志物，可对患者选择标志物进行可靠的鉴定和排序。值得注意的是，本研究中描述的方法在没有任何先验假设的情况下，除了COMT变体(rs113895332/rs61143203)之外，还鉴定了ANAVEX2-73平均浓度、基线MMSE和SIGMAR1基因的特定变体(rs1800866)作为>3百万个保留规则子集中临床反应的前20个驱动因素。低基线MMSE被认为与进展超出许多治疗方法范围的AD阶段相关联。SIGMAR1是ANAVEX2-73的确认体内靶标。COMT是以前曾被描述为与记忆和其他神经行为功能有关的基因。

中期第148周的MMRM-LME分析显示出与经调整的平均ΔADCS-ADL(88％)和经调整的平均ΔMMSE(78％)相关的2个浓度支臂之间的反应存在显著差异。注意到这些差异是显著的且非常大。对于例如在72周之后在CTAD 2018for BAN2401中呈现的数据，这些值与最近在其他研究中获得的结果相媲美：ADAS-Cog相对于基线的经调整平均变化为47％，ADCOMS54的经调整平均变化为30％，其中约18％的变化可能是由于各个支臂中APOE4状态的不平衡造成的。

对39,974个DNA变体的分析(表10)显示出SIGMAR1_Q2P和COMT_L146fs保留在高的关联中。由于可用数据有限，从文献中获得的ΔMMSE和ΔADCS-ADL的计算效应量的标准护理度量对应于52周，而不是本研究中使用的实际时间点57周。最后，由于收集时间(109-135周)，RNA分析受限制，并且没有基线转录组度量可用于比较。然而，探索性分析发现，高SIGMAR1表达与更好的结果相关联(表11)。

表10.

表11.在第57周至第148周之间，将SIGMAR1 RNA表达与MMSE和ADCS-ADL端点联系的关联规则。蓝色突出显示的是收集血液进行RNA表达分析的时间点。

n

n

派生：用于派生端点描述符的计算

这项工作中描述的方法为在药品开发的早期使用数据驱动的无偏生物标志物确定开创了可能性。形式概念分析的“白盒”和系统方法可能是早期数据分析的理想匹配，其中机器学习平台可解释每个发现，并且对于鉴定和排序治疗反应的患者选择生物标志物至关重要。这些数据分析方法可能成为精确医疗药品研发的基石。

(a)研究设计

本研究整合并分析来自两个连续临床试验的数据和样品：57周研究和208周研究。57周研究是多中心阶段2a药品ANAVEX2-73的临床试验，其招募了32个轻中度AD受试者作为样品。它由两部分组成：部分A是持续时间长达5周的简单随机化、开放标签、两阶段、交叉、适应性试验。每个时期包括一个特定施用途径和两个可能的剂量水平：在一个时期施用口服剂量(30mg或50mg)，且在另一个时期施用静脉内(IV)形式(3mg或5mg)，使部分A中具有总共8个可能的剂量施用方案(详情见图2a)。这两个时期由12天的洗脱期分开，在此期间不给予任何剂量。

紧接在部分A之后的部分B是口服每日剂量的开放标签延长52周。57周研究的主要端点是建立所述药品的安全性和耐受性。次要端点旨在建立给药方案和药代动力学之间的关系-认知和功能的探索性疗效结果。认知由细微精神状态检查(MMSE)评估，而功能能力由阿尔茨海默病合作研究-日常生活活动清单(ADCS-ADL)评估。额外的认知度量包含Cogstate简易量表(CBB)，以及脑电图和事件相关电位(EEG及ERP)的功能度量。部分B继续适应性口服施用方案。表12总结57周研究期间的平均口服剂量施用。

表12.在三个不同时期以mg为单位的ANAVEX2-73平均剂量施用的概括统计量和分箱阈值：部分A1(第1天-第2天：第一次口服剂量的2天内)、部分A2(第3天-第12天：第一次口服剂量的前两天之后和部分B开始之前)和部分B(第5周至第57周)。(N＝32名患者)。

平均剂量(mg)

由于57周的研究取得了良好安全性和耐受性(表1和表2)，且响应来自于患者和护理人员的请求，在完成57周研究部分B后，立即进行了208周的开放标签延长研究(208周研究)。208周研究登记完成了部分B并类似地应用了适应性每日口服施用方案的24个受试者。ANAVEX2-73-003涉及由MMSE和ADCS-ADL测量的安全性和疗效的持续评估。在第148周(分析的中间时间点)，对研究中剩余的受试者(n＝21)的数据进行疗效结果分析。此报告是使用第148周的可用数据起草的，而ANAVEX2-73-003仍在进行中。

(b)受试者

从2014年12月至2015年9月，共有32个年龄在50岁至85岁之间的轻度至中度AD的受试者在澳大利亚的三个地点被登记。他们的诊断符合精神障碍诊断和统计手册第4版(DSM-IV)和国家神经和沟通障碍研究所以及中风/阿尔茨海默病和相关障碍协会的标准，并包含MRI和/或CT脑扫描的评估。表3总结了32个参与者的人口统计资料和基线特征，以及在方案修订和患者同意后收集的基因组数据的参与受试者群组(N＝21)。表1呈现患者的部署。在57周研究中，七名患者中断，其中六名患者撤回同意，且一名患者因不良事件(AE)中断。并且在208周研究中，至正在进行的延长研究的累积148个中间周，共有三名患者中断。

在基线和每次就诊时记录以下评估得分和准则：MMSE、ADCS-ADL、汉密尔顿抑郁量表(HAM-D)评估、罗森改良哈金斯基缺血得分(RmHis)、CBB和EEG/ERP。CBB子测试包括六个不同的子得分：检测(DET；处理速度)、鉴定(IDN；注意/警惕)、一卡通学习(OCL；视觉识别记忆)、一阶(OBK；工作记忆)、国际购物清单(ISLT；语言学习)，以及国际购物清单延迟回忆(ISRL；语言记忆)。

研究端点

A.

通过评估不良事件的发生率和严重程度(表2)、生命体征、体检、临床实验室参数(血液学、血清化学和尿液分析)和心电图(数据未显示)来评估安全性。

B.

本研究中的探索性临床疗效被定义为每名患者的认知(MMSE)和功能能力(ADCS-ADL)得分相对于基线的变化。MMSE57是临床AD研究中广泛使用和验证的工具，包含作为药品试验中的认知结果度量。量表的范围从0至30，得分越高指示认知功能越高。ADCS-ADL58采用结构化护理人员访谈形式，且评估AD患者日常生活活动的表现。量表从0至78，得分越高指示功能越大。ADCS-ADL表明具有良好的重测信度59。在57周研究(第0周和第5周在部分A中；第17周、第31周、第41周、第53周和第57周在部分B中)和208周研究(第70周、第83周、第96周、第109周、第122周、第135周和第148周)两个研究期间，在预先指定的临床现场访问期间在14个不同的时间点对MMSE和ADCS-ADL进行评估。

使用每次就诊时的值与每名患者基线时的值之间的差值计算相应的Δ得分，集中于第57周。此外，为了降低噪音对MMSE和ADCS-ADL得分的影响，对每名患者的所有可用时间点使用线性回归来估计斜率。导出的得分描述在几个特定时间点(Δ)和一段设定时期(斜率)内相对于基线的探索性疗效数据的进展。包括子得分和从同一测试得分得出的度量对本研究中应用的分析方法没有影响，因为它独立地处理和描述每种关系。

表13总结MMSE和ADCS-ADL在57周研究(第5周、第12周、第26周、第36周、第48周和第57周)和ANAVEX2-73-003(第70周、第83周、第96周、第109周、第122周、第135周和第148周)中在13个时间点相对于基线的Δ得分。表13示出MMSE和ADCS-ADL的斜率概括统计量。

表13

C.

仅在部分A期间进行药代动力学分析。分别在部分A的第一时期和第二时期期间在第一次口服或静脉内施用后的12和11个时间点抽取血样。分析中包含的药代动力学参数包括最大血浆药品浓度(C

通过在预先指定的时间点(第12周、第26周、第36周和第48周)收集血样，在部分B中评估ANAVEX2-73及其代谢物ANAVEX19-144的稳态血浆水平。然后将每名患者的以ng/mL为单位的平均浓度值求平均。表14示出在57周研究中ANAVEX2-73及其代谢物ANAVEX19-144的平均血浆浓度。

表14.ANAVEX2-73及其代谢物ANAVEX 19-144在三个时期的血浆浓度的概括统计量和分箱阈值：部分A1(第1天-第2天：第一次口服剂量的2天内)、部分A2(第3天-第12天：第一次口服剂量的前两天之后和部分B开始之前)和部分B(第5周至第57周)。(N＝32名患者)。

在阶段1研究

D.

在第103周-第135周期间，从所有仍参与的21个受试者中收集血样，这取决于方案修订和批准后的就诊日期以及ANAVEX2-73-003延长研究期间患者的同意。这些样品使DNA(全外显子组)和RNA下一代测序(NGS)数据分析成为可能。在队列中确定了408,551个DNA变体。其中，保留了39,974个驱动蛋白中的氨基酸修饰的高或中等影响变体；RNA表达值被归一化为每千碱基百万转录物(TPM)。

E.

243个基因是从27,155个由上文所引入NGS分析获得的映射序列中选出的(补充图1a、b、c)。102个基因是根据它们介入神经退行性疾病来选择的(补充图1a)。根据从STRING数据库(2018年1月)获得的置信度得分0.150，选择20个基因作为SIGMAR1功能相互作用组的一部分(补充图1c和d)。此外，还添加了细胞色素P450s基因家族的113个基因和甲基转移酶基因家族的10个基因(补充图1b)。

补充图1.

F.

使用基于关联规则的FCA进行数据分析，以鉴定第57周治疗反应的标志物。在随后的步骤中，使用线性混合效应对148周时已鉴定的反应标志物进行确认性分析。图1b示出在分析中使用的不同类型的数据，而图1c展示用于鉴定和验证药品反应标志物的两种不同类型的分析。

(d)关联规则与

使用

关联规则是一种暗示，例如X→Y，X是规则的前件(或前件的组合；也称为左侧)且Y是规则的后件(或后件的组合；也称为右侧)，所述规则允许推断X作为Y的解释。考虑由N名患者组成的数据集，n

使用六个主要的质量度量来描述关联规则并对其进行排序，即：支持度、置信度、提升度、两个显著性的P值度量和科恩的d(一种效应量度量)。

i.

支持度被定义为观察到关联的受试者数量：

支持度(X→Y)＝n

置信度被定义为验证规则的表征患者的百分比：

提升度(相对概率)是如果X和Y是独立的，观察到的支持度与预期支持度的比率。其测量规则的性能，以从更大的群体中鉴定子群：

ii.

为每个关联规则计算两个统计测试的P值。右侧的费希尔精确测试解释针对分类数据和适用于小样品量的规则的关系。并且双侧曼-惠特尼U测试用于比较每个描述符组的连续结果度量。在0.05的水平上判断两个测试的统计显著性。

iii.

科恩的d指数是为每个关联计算的以量化效应量，从中可计算出要包含的患者数量，以确定未来研究中的重要关系。科恩的d指示两个群体均值之间的标准化差值。

在本研究中，结果由MMSE和ADCS-ADL的Δ和斜率值确定。计算效应量的对照组值是结合接受标准护理的AD文献中可用的试验结果获得的：对照组在52周时的平均ΔMMSE被定义为-3.7，标准差为3.5，而在52周时的平均ΔADCS-ADL为-6.7，标准差为8.0。

诸如年龄等连续变量使用分布来离散化(见表13中的阈值的总结)。例如，基线处的MMSE离散化为两组，‘低’(被定义为基线MMSE<20)和“高”(被定义为基线MMSE≥20)。注意值“20”不是预定义的限制：MMSE基线得分阈值“<20”对应于所有所包含患者的观察值的中值。

(e)线性混合效应模型

应用重复度量混合效应模型(MMRM)对纵向临床试验中的连续主要端点进行建模,这种方法特别适用于分析AD临床研究的结果，并已成为习惯作法。

通过根据部分B中的ANAVEX2-73平均血液浓度将受试者分配至两个支臂(高对低/中)中的一个支臂，在第57周确定的生物标志物的纵向相关性在第148周使用MMRM进行评估。由于队列规模小，时间在分析中被视为一个连续变量，以避免过度参数化并提高稳健性。因此，选用混合效应模型的线性分量(LME)对于时间建模。在R统计软件中实现的MMRM-LME被用来对ΔMMSE和ΔADCS-ADL得分建模，这些得分具有随时间变化的ANAVEX2-73浓度水平以及其他已鉴定的反应描述符。

示例4.DNA和RNA提取和分析

在AD患者序列中，共确定出27,155个与基因相对应的注释基因组位置，包含616个途径。定义初始小组243个基因。所述小组包括102个与神经退行性疾病有关的基因、20个与SIGMAR1功能性相互作用组连接的基因、12个甲基转移酶基因和111个与药品代谢联系的CYP基因(表15)。

使用每个RNA基因表达的TPM(每千碱基百万转录物)值进行分布分析，定义个容量相同的箱，标记为：低、中、高。

此计算如下：

注意X

l

就COMT而言，COMT TPM(COMTt)水平为10.1或以下被视为低，10.1>COMTt>＝15.2为中，且COMTt>15.2为高。

就KANSL1而言，KANSL1 TPM(KANSL1t)水平为16.9或以下被视为低，16.9>KANSL1t>＝27.5为中，且KANSL1t>27.5为高。

就SIGMAR1而言，SIGMAR1 TPM(SIGMAR1t)水平为12.7或以下被视为低，12.7>SIGMAR1t>＝19为中，且SIGMAR1t>19为高。

分析集中于初始小组的243个基因，在蛋白水平上的185个RNA基因表达和837个DNA改变，在总共21个受试者中，至少有一个受试者表现出不同。接着对受试者的另外一组212个非基因组特征(包括病史、伴随用药和其他基线特征)进行进一步表征。共有40个端点定义如下：

-ΔADCS-ADL：高(≥-1)和低(≤-2)；

-ΔMMSE：高(≥-1)和低(≤-2)。

中箱和低箱组合在一起定义新的低箱。高箱对应于最高的第三瓦片值。MMSE和ADCS-ADL两者分别在基线和第57周之间的斜率被认为是一个二进制端点。反应者被定义为具有正斜率或零斜率。无反应者被定义为展示出负斜率。

本研究含有每名患者总共2,481个特征。使用

-支持度(n)应指观察到关联的受试者数量。

-提升度(相对概率)应指关联频率除以条件频率。这种参数测量由所述条件提供的富集。

-置信度应指条件为真时关联的概率

-科恩的d是用来表示两种手段之间的标准化差值的效应量。从关联规则中，我们鉴定了一些与改善或恶化结果联系的基因特征(ΔMMSE或ΔADCSADL)。对于每个特征，我们将群组1定义为具有期望特征的患者(如果其与改善的结果联系)，或没有所述特征的患者(如果其与恶化的结果联系)。M

表16.科恩和萨维洛夫斯基对效应量的解释。

-P-值(费希尔精确测试，较大单尾)评估2x2列联表中差异的统计显著性。

-曼-惠特尼-威尔克森(MWWilc.)是两个群体中分布相等的零假设的非参数测试。MWWilc测试对两个群体的联合值进行排序，并比较所述两个群体之间的排序总和。我们比较具有所述特征的患者和不具有所述特征的患者之间的(治疗)结果分布。

-MAF(次要等位基因频率)：指来自1000个基因组数据库的一般群体中突变发生的频率。

关系的筛选分2步进行：语义筛选(1)和数字筛选(2)。在语义筛选步骤中，排除了编码不存在DNA突变、中等RNA表达箱以及斜率MMSE和斜率ADCS-ADL的参数。在数字筛选步骤中，仅保留满足基于支持度(n>3)、置信度(>50％)、相对概率(提升度>＝1.2)和p值(费希尔或曼-惠特尼-威尔克森<0.05)的度量标准的关系。

筛选步骤(1)和(2)产生将基线临床和基因组患者特征和RNA表达与多个时间点的反应联系在一起的509个关联规则的子集。

仅集中于第57周的反应，这一集合被进一步减少至联系DNA突变、27个RNA表达和其他9个基线参数的42个关联关系。

将DNA突变的存在与反应联系在一起的42个关联规则对应于表15中定义的基因小组中的22个CYP蛋白和20个非CYP蛋白。这20个非CYP关系对应于12个与第57周的反应恶化相关联的非冗余SNP(表18)和2个与第57周的反应改善相关联的非冗余SNP(表17)。

表17数据是从基因组数据(185个基因小组和837个突变)的系统分析中提取的。它鉴定了2个与由ΔMMSE或ΔADCS-ADL在第57周测量的改善结果显著联系的SNP变体：这些是HLA-DRB1_p.LysThr134LysAsp及DPYD_p.I543V(re1801159)。规则：n>3名患者，置信度>0.5，提升度>＝1.2，p-值(费希尔测试或MWWilc.)<0.05。

表17.HLA-DRB1-P.LysThr134LysAsp或DPYD V 543(DPYD_p.I543V)突变的存在与第57周相对于基线改善的ADCS-ADL或MMSEΔ(高)相关联。

表18.10个与由ΔMMSE或ΔADCS-ADL在第57周测量的恶化结果显著联系的SNP变体。规则：n>3名患者；置信度>0.5；提升度>＝1.2；p-值(费希尔测试或MWWilc.)<0.05。

改变的COMT(在L146之后停止)或DHCR7 T220(DHCR7_p.M220T)或HLA-DRB1 T244或T66或S89(HLA-DRB1_p.A244T或S66Y或Y89S)或KANSL1 Pro304/946/1010(KANSL1_p.P1010L/P304L/P946L)或MS4A6E T59(MS4A6E.p.M59T)或RIN3 R 215(RIN3_p.H215R)或SIGMAR1 Pro2(SIGMAR1_p.Q2P)突变的存在与在第57周相对于基线的ADCS-ADL或MMSEΔ低相关联。

表19呈现关于与第57周的MMSEΔ及ADCS-ADLΔ两者相关联的三个突变(SIGMAR1Q2P；COMT_p.L146fs；KANSL1_p.P1010L/P304L/P946L)的数据。基因组数据的系统分析(185个基因小组和837个突变)鉴定SIGMAR1 Pro2突变和不存在反应之间的显著强的关系，如使用MMSE和ADCS-ADL两者测量的。

表19.

表20是一个关联规则的表示，其示出在SIGMA1R中的Pro2突变的存在暗示MMSE的低Δ以及从表18所示的数据中提取的规则度量标准的细节。

表20.

SIGMAR1 Gln(谷氨酰胺)2突变为Pro(脯氨酸)2(SIGMAR1_p.Q2P)的，可能对SIGMAR1蛋白的3维结构的3维构象产生结构影响，这继而可能改变其功能和/或相互作用。SIGMAR1的晶体结构显示为三聚体。每种单体展示N末端跨膜α螺旋。蛋白的N末端被认为面向胞质溶胶，并被认为与其他配体相互作用。Pro2改变可通过延伸其来改变螺旋的N末端的构象，与功能的一些改变一致。

Gln(Q)至Pro(P)的改变可能影响侧链的长度(在Gln中延伸)，且可能影响氨基酸形成α螺旋的能力。脯氨酸被认为是“螺旋破坏剂”，在某些情况下，它被归因于螺旋结构的解除。

表19中示出将SIGMAR1 Pro2突变的存在与认知和功能端点联系的

鉴于57周阶段2a ANAVEX2-73-002研究不包含安慰剂支臂，

重要的是，由于阿尔茨海默病被认为是一种进行性退行性疾病，在轻度至中度阿尔茨海默病的57周内，MMSE(正Δ)和ADCS-ADL(正Δ)的增加是一种罕见的阳性事件。值得注意的是，在出现MMSE(Δ，n＝9)和ADCS-ADL(Δ，n＝8)改善的所有患者中，100％的没有SIGMAR1突变。此外，100％的SIGMAR1 Pro2突变患者(n＝5)不具有改善的MMSEΔ或ADCS-ADLΔ。上述基因数据来自所有(100％)被测试的患者(n＝21)。

COMT变体COMT_p.L146fs(rs113895332/rs61143203)也得到了类似的结果。100％表现出改善的MMSE(Δ和斜率)和ADCS-ADL(Δ和斜率)的所有患者(n＝6)没有COMT_p.L146fs突变。此外，100％的COMT_p.L146fs突变患者(n＝5)并未改善MMSE或ADCS-ADL斜率。COMT_p.L146fs突变也与低ΔMMSE和ΔADCS-ADL相关联。可用基因数据来自所有(100％)患者(n＝21)。

因此，确立这些突变的存在/不存在可用于决策SIGMAR1激动剂治疗。这些突变的不存在预示SIGMAR1激动剂疗法(诸如A2-73疗法)的会有增强效力。这些突变中的一种或两种的存在则指征应使用其他(非SIGMAR1)药物作为神经退行性障碍的一线治疗。

表21呈现MMSE和ADCS-ADL的第57周至基线的SIGMAR1 Pro2与Δ端点之间的曼-惠特尼U测试(也称为曼-惠特尼-威尔克森测试或MWWilc)的p值结果。

SIGMAR1 Pro2突变导致ADCS-ADL和MMSEΔ的数值Δ差异显著(图8c和f)。MWWilc测试评估两个群体中连续变量的中位数是否有显著差异(即，此处的两个群体：SIGMAR1Pro2突变与SIGMAR1 Gln2突变)。SIGMAR1 Pro2突变的不存在与相对于BL的高ADCS-ADLΔ强烈联系在一起(改善)。对于COMT Leu146突变(图8a和d)及KANSL1 Pro304/946/1010突变(图8b和e)发现了类似的结果。

如上所述，27个RNA表达与第57周相对于基线改善或恶化的反应相关联。进一步选择非CYP蛋白和仅高水平的RNA表达(排除低和中表达水平)显示出DHCR7、GAMT、IL10、KANSL1、MTUS1、PPARG和SIGMAR1的高表达水平与第57周相对于基线改善的ADCS-ADLΔ或MMSEΔ相关联(表22)。

表22

集中于DNA和RNA分析之间的交叉以及通过DNA分析并影响由MMSE和ADCS-ADL两者测量的结果而鉴定的基因子集，表23示出3种基因标志物(SIGMAR1；COMT；KANSL1)的较高RNA表达与由MMSE或ADCS-ADL测量的反应相关联。

表23

值得注意的是，如表24和图9所示，SIGMAR1的高RNA表达与高

表24

100％的SIGMAR1 RNA表达为低的患者在ADCS-ADL斜率方面没有改善。可用基因数据来自所有(100％)患者。(N＝21)。提升度≥1.2；置信度≥50％；支持度≥3。

DNA和RNA分析提供关于SIGMAR1、KANSL1和COMT作为SIGMAR1疗法在第57周的由MMSE和ADCS-ADL的变化测量的结果预测因子的作用的趋同证据。

表25示出对CYP基因组数据(111个基因小组，来自表15)的系统分析鉴定11个与由ΔMMSE或ΔADCS-ADL在第57周测量的结果显著联系的SNP。与MMSE和/或ADCS-ADL得分改善的相关性包含变体CYP4V2、CYP27B1、CYP26C1。与基于MMSE和/或ADCS-ADL得分下降的排除的相关性是变体CYP39A1、CYP2D6、CYP2C8。

表25

规则：n>3名患者，置信度>0.5，提升度>＝1.2，p-值(费希尔测试或MWWilc.)<0.05。

表26示出与由MMSE或ADCS-ADL测量的反应相关联的CYP4F2、CYP26A1和CYP2D6的RNA表达。

表26

规则：n>3名患者，置信度>0.5，提升度>＝1.2，p-值(费希尔测试或MWWilc.)<0.05。

示例5.σ-1激动剂反应者/非反应者确定

对十二个年龄在57岁至71岁之间的阿尔茨海默病受试者进行了SIGMAR1基因的Q2P多态性测试。确定两个受试者在SIGMAR1蛋白的2位携带氨基酸脯氨酸。进一步确定其余10个受试者在受体蛋白的所述位置处携带谷氨酰胺。在SIGMAR1蛋白的2位具有氨基酸脯氨酸的群组被确定为不适用于σ-1激动剂疗法。在SIGMAR1蛋白的2位具有氨基酸谷氨酰胺的群组被确定为适用于σ-1激动剂疗法。

示例6.σ-1激动剂反应者的确定和疗法

一个74岁男性诊断患有阿尔茨海默病。对他的SIGMAR1基因进行分析，确定他在SIGMAR1基因的2位携带谷氨酰胺。这是野生型。他每天用A2-73来治疗，口服剂量为30mg。持续6个月。他的疾病被认为是稳定的，且在此期间没有恶化。

示例7.σ-1激动剂反应者的确定和疗法

一个74岁男性诊断患有阿尔茨海默病。取面颊拭子，且进行基因型测定以确定SIGMAR1 2P基因型的存在。通过这种分析，确定受试者在SigmaR1基因受体(蛋白)的2位携带谷氨酰胺。他每天用ANAVEX2-73来治疗，口服剂量为30mg。持续6个月。他的疾病被认为是稳定的，且在此期间没有恶化。

示例8.σ-1激动剂反应者的确定和疗法

一个66岁女性诊断患有痴呆。对她的SIGMAR1基因进行分析，确定她在SIGMAR1基因的2位携带脯氨酸。拒绝对她使用σ-1激动剂来治疗。她被推荐其他治疗方法。

示例9.σ-1激动剂反应者的确定和疗法

一个60岁女性诊断患有痴呆。对她的SIGMAR1基因进行分析，确定她在SIGMAR1基因的2位携带脯氨酸。她每天用ANAVEX2-73来治疗，口服剂量为80mg，同时口服1.5mg卡巴拉汀，每天两次，持续6个月。她的疾病被认为是稳定的，且在此期间没有恶化。

示例10.σ-1激动剂反应者的确定和疗法

一个64岁男性诊断患有阿尔茨海默病。对他的COMT基因进行分析，确定他没有携带COMT dbsnp ID rs113895332/rs61143203突变。他每天用A2-73来治疗，口服剂量为30mg。持续6个月。他的疾病被认为是稳定的，且在此期间没有恶化。

示例11.σ-1激动剂反应者的确定和疗法

一个71岁女性诊断患有阿尔茨海默病。对她的SIGMAR1基因进行分析，确定她没有携带SIGMAR1 rs1800866。她每天用A2-73来治疗，口服剂量为30mg。持续6个月。她的疾病被认为是稳定的，且在此期间没有恶化。

示例12.σ-1激动剂反应者的确定和疗法

一个81岁男性诊断患有痴呆。确定他携带KANSL1_p.P1010L/P304L/P946L突变。拒绝对他使用σ-1激动剂来治疗，且推荐其他疗法。

示例13.σ-1激动剂反应者的确定和疗法

一个78岁男性诊断患有痴呆。他在SIGMAR1基因的2位携带谷氨酰胺。确定他携带KANSL1_p.P1010L/P304L/P946L突变。他每天用ANAVEX2-73来治疗，口服剂量为70mg，同时每天口服7mg美金刚胺，持续6个月。他的疾病被认为是稳定的，且在此期间没有恶化。