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用于再生毛细胞和/或支持细胞的方法及组合物

摘要

本发明提供了用于诱导内耳的细胞(例如,耳蜗毛细胞和椭圆囊毛细胞)重新进入细胞周期并增殖的方法和组合物。更具体地,本发明涉及使用增加c‑myc的活性和/或Notch活性的药剂,用于诱导耳蜗毛细胞或椭圆囊毛细胞和/或耳蜗支持细胞或椭圆囊支持细胞重新进入细胞周期并增殖。本发明的方法和组合物可以用于促进毛细胞和/或支持细胞的增殖,以治疗有听力损失风险或患有此病的对象,或有前庭功能障碍风险或患有此病的对象。

著录项

  • 公开/公告号CN112359018A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-02-12

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 麻省眼耳医院;

    申请/专利号CN202010988981.0

  • 发明设计人 陈正义;

    申请日2013-09-06

  • 分类号C12N5/0793(20100101);A61K48/00(20060101);A61K38/17(20060101);A61K38/16(20060101);A61K35/30(20150101);A61K31/65(20060101);

  • 代理机构11464 北京奉思知识产权代理有限公司;

  • 代理人邹轶鲛;石红艳

  • 地址 美国马萨诸塞州

  • 入库时间 2023-06-19 09:52:39

说明书

本申请是基于2013年9月6日提交的申请号为201380058368.7 的名为“用于再生毛细胞和/或支持细胞的方法及组合物”的申请的分 案申请。

相关申请的交叉参考

本申请要求于2012年9月7日提交的美国临时专利申请号 61/698,246的优先权和权益,在此以参考的方式并入其全部内容。

技术领域

本发明的领域一般涉及诱导内耳细胞重新进入细胞周期并增殖的 方法和组合物。更具体地,本发明涉及增加细胞内c-myc(原癌基因) 活性和/或Notch活性以诱导内耳的毛细胞和/或支持细胞重新进入细胞 周期并增殖。

背景技术

一种最普通类型的听力损失是由毛细胞或毛细胞功能的损失引起 的感觉神经性聋。毛细胞是耳蜗的感觉细胞,耳蜗负责将声音转换成 电信号。在出生时,人类内耳每个耳蜗仅有约15000个毛细胞,并且尽 管各种遗传或环境因素(例如,曝噪,耳毒性药物中毒、病毒性感染、 老化以及遗传缺陷)导致这些细胞损失,但不能更替这些损失或者受 损的细胞。还发现毛细胞也存在于前庭的椭圆囊中,前庭是调节平衡 的器官。因此,毛细胞再生是恢复听力和前庭功能的重要途径。

迄今为止,对成熟哺乳动物内耳中的毛细胞的再生的研究集中在 对现有支持细胞进行转分化。支持细胞在内耳内的感觉毛细胞之下, 至少部分地包围并物理地支持感觉毛细胞。支持细胞的实施例包括内 杆(柱细胞)、外杆(柱细胞)、内指细胞、(Deiters)外指细胞, Held细胞、Hensen细胞、Claudius细胞、Boettcher细胞、齿间细胞以 及(Huschke)听牙。通过支持细胞中的无调同元蛋白质1(Protein Atonal Homolog 1)(Atoh1)的过表达或激活,或通过将支持细胞暴露于Atoh1 激动剂,支持细胞向毛细胞的转分化是生成新的毛细胞的一个此类途 径。然而,此途径的一个局限性是,支持细胞向毛细胞的转分化减少 了支持细胞的现存种群,这会损害内耳功能。此外,Atoh1在缺少支持 细胞的老化的内耳或扁平上皮中的过表达,不足以诱导毛细胞。另外, 仍不清楚是否所有类型的支持细胞可以基于Atoh1的过表达转分化成 毛细胞。

毛细胞再生的其他研究已经通过例如阻断Rb1和p27kip1的途径 检测了胚胎小鼠或新生小鼠中的毛细胞重新进入细胞周期的情况。然 而,在成年小鼠内耳中的类似处理未曾诱导使其重新进入细胞周期。 此外,胚胎小鼠和新生小鼠的重新进入细胞周期的毛细胞一般随后死 亡。

超过150种遗传学耳聋是由于影响毛细胞和支持细胞二者的基因 突变。例如,肌球蛋白VIIA(Myo7a)中的突变引起毛细胞的静纤毛 异常,这会导致永久性耳聋。GJB2(连接蛋白26)突变造成对支持细 胞的损害,这导致最常见形式的遗传学耳聋。已开发出各种途径(例 如,基因疗法和反义寡核苷酸疗法)作为遗传性聋的可能的治疗途径。 然而,大部分的这些缺陷在胚胎发育期间发生。到出生时,受影响的 毛细胞和支持细胞已经死亡或严重退化,变得难以干预。因此,为治 疗遗传学耳聋,在子宫内和出生后都一直需要再生毛细胞和/或支持细 胞,这可以与其他途径结合,以纠正此疾病根本的基因缺陷。

此外,内耳非感觉细胞(例如在韧带中的纤维细胞)在听力中起 重要作用。诸如噪声和老化的因素可以损害内耳非感觉细胞,这造成 听力损失。这些细胞类型,类似于内耳中的很多细胞,缺乏损伤后自 发再生的能力。

因为自发再生不在哺乳动物的内耳中发生,恢复听力损失需要介 入以更替损失或退化的内耳细胞类型。因此,一直需要再生哺乳动物 耳内的毛细胞和/或支持细胞,特别是内耳中的那些细胞,以更替例如 由于遗传或环境因素而损失的那些细胞。再生的毛细胞和/或支持细胞 可用来减缓听力和/或前庭功能的损失,和/或部分或完全地恢复听力和 /或前庭功能的损失。

发明内容

本发明部分地基于以下发现:增加例如内耳细胞的耳细胞中c-myc 活性、Notch活性或c-myc和Notch二者的活性,会促进细胞重新进入 细胞周期并增殖。当细胞例如是毛细胞或支持细胞时,可以预期,细 胞增殖和随后分化成毛细胞和/或支持细胞可以恢复或改善听力和/或 前庭功能。

在一个方面,本发明涉及一种诱导分化的耳蜗细胞或椭圆囊细胞 增殖或重新进入细胞周期的方法。该方法包括提高细胞内c-myc和 Notch二者的活性,使之足以诱导耳蜗细胞或椭圆囊细胞增殖或重新进 入细胞周期。一旦进入到细胞周期,细胞可分化但保留其分化状态的 样子。在某些实施方式中,耳蜗细胞或椭圆囊细胞可以例如是毛细胞 或支持细胞。该方法还可包括下述步骤:在耳蜗细胞或椭圆囊毛细胞 或支持细胞增殖后,抑制c-myc和/或Notch的活性,以诱导细胞和/或 其子细胞的至少一者分化或转分化成毛细胞。增殖后对c-myc和/或 Notch活性的抑制在提高细胞存活率方面可以说是非常重要的。

在另一个方面,本发明涉及一种用于再生耳蜗毛细胞或椭圆囊毛 细胞的方法。该方法包括增加毛细胞内c-myc和Notch二者的活性,从 而诱导细胞增殖以生成一种、两种或更多种子代毛细胞,并且,在细 胞增殖后,降低c-myc和/或Notch活性以诱导和/或维持子代毛细胞的 分化。在某些实施例中,耳蜗细胞或椭圆囊细胞例如可以是毛细胞或 支持细胞。这些步骤可以在体内(例如,在哺乳动物内耳中,特别是 耳蜗或椭圆囊中)进行,或离体进行,离体进行中,将所得到的细胞 进行培养并且/或引入到受试者的内耳中。

在另一方面,本发明涉及一种用于降低对象听力损失、维持或促 进其听力的方法。该方法包括增加内耳的毛细胞和/或其支持细胞内 c-myc和Notch二者的活性,从而诱导细胞增殖以生成子代细胞,并且, 在细胞增殖后,降低c-myc和/或Notch活性,并允许毛细胞源的子代 细胞分化成毛细胞,或允许支持细胞源的子代细胞转分化成毛细胞, 从而降低对象听力损失,维持或促进其听力。通过激活Atoh1活性(例 如通过基因表达、通过施用有效量的Atoh1或Atoh1激动剂)可以诱 导支持细胞源的子代细胞转分化成毛细胞。这些步骤可以在体内(例 如,在哺乳动物内耳中,特别是耳蜗)进行,或离体进行,在离体过 程中,将所得到的细胞进行培养和/或引入到对象的内耳中。

在另一个方面,本发明涉及一种用于降低对象前庭功能损失、维 持或促进其前庭功能的方法。该方法包括增加内耳的毛细胞和/或支持 细胞内c-myc和Notch二者的活性,从而诱导细胞增殖以生成子代细胞, 并且,在细胞增殖后,降低c-myc和/或Notch活性,并允许毛细胞源 的子代细胞分化成毛细胞,或允许支持细胞源的子代细胞转分化成毛 细胞,从而降低对象前庭功能的损失、维持或促进其前庭功能。通过 激活Atoh1活性(例如通过基因表达、通过施用有效量的Atoh1或Atoh1 激动剂)可以诱导支持细胞源的子代细胞转分化成毛细胞。这些步骤 可以在体内(例如,在哺乳动物内耳中,特别是椭圆囊中)进行,或离体进行,在离体过程中,将所得到的细胞进行培养和/或引入到对象 的内耳中。

在本发明的上述各方面中,通过使细胞与有效量的c-myc蛋白质 或c-myc激活剂接触可增加c-myc活性。在c-myc活性增加后,可以 抑制c-myc活性以限制耳蜗细胞或椭圆囊细胞的增殖和/或以促进耳蜗 细胞或椭圆囊细胞的存活。类似地,在本发明的上述各方面中,通过 使细胞与有效量的Notch蛋白质、Notch胞内域(NICD)蛋白质或Notch 激活剂接触,可增加Notch活性。通过使细胞与有效量的Notch抑制剂 接触,可以抑制Notch活性。

在某些实施方式中,可对对象的内耳施用c-myc蛋白质或c-myc 激活剂。在某些实施方式中,可为对象的内耳施用Notch蛋白质、NICD 蛋白质、Notch激活剂和/或Notch抑制剂。在其他实施方式中,可为对 象的内耳共同施用c-myc蛋白质或c-myc激活剂连同Notch蛋白质、 NICD蛋白质、Notch激活剂和/或Notch抑制剂。

通过参考以下附图、详细说明书和权利要求书,可更完全地理解 本发明的前述方面和实施方式。

附图说明

通过参考在此描述的附图可更完全地理解本发明的主题和特征。

图1(A)示出人类c-myc的全长蛋白质序列(NP_002458.2;SEQ ID NO:1),并且图(B)示出c-myc蛋白质共有蛋白质序列(SEQ ID NO:9)。

图2(A)示出人类Notch全长蛋白质序列(NP_060087.3;SEQ ID NO:2),图(B)示出人类Notch胞内域的蛋白质序列(NP_060087.3残 基1754-2555;SEQ ID NO:7),并且图(C)示出Notch胞内域的共 有蛋白质序列(SEQ ID NO:10)。

图3(A)示出人类Atoh1的全长蛋白质序列(NP_005163.1;SEQ ID NO:3),并且图(B)示出Atoh1共有蛋白质序列(SEQ ID NO:11)。

图4示出人类c-myc mRNA(信使核糖核酸)的核酸序列 (NM_002467.4;SEQ ID NO:4)。

图5(A)示出人类Notch mRNA的核酸序列(NM_017617.3;SEQ ID NO:5),并且图(B)示出人类Notch胞内域的核苷酸序列(NM_017617.3核苷酸位置5260-7665;SEQ ID NO:8)。

图6示出人类Atoh1 mRNA的核酸序列(NM_005172.1;SEQ ID NO:6)。

图7示出在将Ad-Cre-GFP病毒和Ad-Myc病毒注射到45日龄的 NICDflox/flox小鼠的耳蜗后4天(A-E)、8天(K-O)或12天(P-T) 后,细胞类型特异性和BrdU双重标记的耳蜗毛细胞和支持细胞这些细 胞。实线箭头表示BrdU标记的毛细胞,并且空心箭头表示标有BrdU的支持细胞。图7(F-J)示出未注射的对照耳蜗,其中没有发现具有 细胞类型特异性标记和BrdU双重标记的毛细胞和支持细胞。图7(A、 F、K和P)示出BrdU标记。图7(B、G、L和Q)示出毛细胞的Myo7a 标记。图7(C、H、M和R)示出支持细胞的Sox2标记。图7(D、I、 N和S)示出细胞核的DAPI标记。图7(E、J、O和T)示出合并的 图像。

图8示出在注射Ad-Cre-GFP/Ad-Myc混合物35天后,随后每天 施用BrdU持续5天后,NICDflox/flox小鼠耳蜗上皮中细胞类型特异性 和BrdU双重标记的耳蜗毛细胞和支持细胞。图8(A、F和K)示出 BrdU标记。图8(B、G和L)示出毛细胞的Myo7a标记。图8(C、 H和M)示出支持细胞的Sox2标记。图8(D、I和N)示出细胞核的 DAPI标记。图8(E、J和O)示出合并的图像。图8(A-E)示出BrdU 和Myo7a标记,表明注射35天后增殖毛细胞是存活的(图8A、图8B、图8C和图8E的实线箭头)。图8(F-J)示出来源于一个母代毛细胞 的分裂的两个毛细胞的放大图像,此子代毛细胞显示出静纤毛(图8J 的实线无尾箭头)。图8(K-0)示出BrdU和Sox2标记的细胞(图8K、 图8M和图8O的空心箭头),表明注射35天后增殖支持细胞是存活 的。图8(K、L、M和O)中的实心箭头示出Myo7a+/BrdU+毛细胞。 图8(K、L、M和O)中的无尾箭头示出Myo7a+/Sox2+/BrdU+毛细胞。

图9示出具有细胞类型特异性和BrdU双重标记的老龄 NICDflox/flox小鼠耳蜗上皮耳蜗毛细胞和支持细胞,其中所述小鼠在 15天的过程中注射有Ad-Cre-GFP/Ad-Myc混合物。图9(A、F和K) 示出毛细胞的Myo7a标记。图9(B、G和L)示出分裂细胞的BrdU 标记。图9(C、H和M)示出支持细胞的Sox2标记。图9(D、I和N) 示出细胞核的DAPI标记。图9(E、J和O)示出合并的图像。图9(A-J) 示出用Ad-Myc和Ad-Cre-GFP腺病毒注射后Myo7a+/BrdU+毛细胞(A、 B和E;箭头)和Sox2+/BrdU+支持细胞(B、C、E、G、H和J;无尾 箭头)。图9(K-O)示出在单独注射Ad-Cre-GFP病毒的17个月大小 的NICDflox/flox小鼠中的相同染色。后一组中没有发现BrdU标记的 毛细胞或支持细胞。比例尺:10μM。

图10示出在用Ad-Myc/Ad-NICD转导10天的培养的成年人类耳 蜗组织(图10A-E)和椭圆囊(图10F-J)组织中的BrdU(图10A和 图10F)、Myo7a(图10B和图10G)和Sox2(图10C和图10H)标 记的毛细胞和支持细胞。空心箭头(图10A、图10C、图10D、图10E、 图10F、图10H、图10I和图10J)表示增殖的支持细胞(Sox2+/BrdU+), 并且实线箭头(F-J)表示增殖的毛细胞(Myo7a+/BrdU+)。细胞核由 DAPI(D和I)染色示出。

图11示出在成年猴类耳蜗培养物中的Myo7+毛细胞(A和F)和 Sox2+支持细胞(C和H)。分裂细胞(B和G)由EdU标记。图11 (A-E)示出Ad-GFP感染的对照猴类耳蜗,其中没有识别出EdU+。 图11(G、H和J)示出暴露于Ad-Myc/Ad-NICD病毒的猴类耳蜗培养 物中的EdU+/Sox2+支持细胞(无尾箭头)。在对照培养物和 Ad-Myc/Ad-NICD病毒感染的培养物中,都没有观察到毛细胞重新进入 细胞周期(A、E、F和J;箭头)。比例尺:20μM。

图12示出对rtTa/tet-on-Myc/tet-on-NICD小鼠的支持细胞(箭头; B、C和E)而不是内毛细胞(无尾箭头;A、C和E)增殖的选择性诱 导,其中该小鼠暴露于由植入式渗透泵持续施用9天的多西环素以诱 导NICD和Myc的表达。重新进入细胞周期的细胞在相同的周期中经 由每天的EdU(图12B)给药标记。细胞核用DAPI(图12D)染色。 内毛细胞用小清蛋白(Parvalbumin)(Parv;图12A)染色。支持细胞 用Sox2(图12C)染色。由于Notch激活(图12A、图12C和图12E 中最右边的无尾箭头),示出还表达Sox2的单Parv+毛细胞。没有示 出外毛细胞,因为它们在渗透泵的手术植入期间丢失了。比例尺:20μM。

图13示出在体内暴露于升高的c-myc和Notch二者的活性后选择 性诱导外部毛细胞以重新进入细胞周期。使 rtTa/tet-on-Myc/tet-on-NICD小鼠暴露于通过植入式渗透泵持续施用的 多西环素12天,以诱导NICD和Myc的表达,然后收获小鼠组织用于 染色。在暴露于多西环素期间,通过每天的EdU(图13B)给药标记 重新进入细胞周期的细胞。细胞核用DAPI染色(图13D)。内外毛细 胞用Espin(Esp;图13A)染色。支持细胞用Sox2(图13C)染色。注意,与图12中所示的实验相比,在本实验中外毛细胞在渗透泵的植 入期间是备用的。图13(B和E;箭头)中示出Esp+/EdU+外毛细胞, 表明在升高的c-myc和Notch活性的暴露水平下外毛细胞增殖的选择性 诱导。

图14示出用FM-143FX(FM1)标记的Espin-阳性(Esp+)毛细 胞,以展示具有功能性膜通道的细胞。45日龄NICDflox/flox小鼠的耳 蜗暴露于Ad-Myc/Ad-Cre-GFP病毒,并且在病毒注射后每天注射一次 EdU,持续5天,以标记分裂细胞。注射病毒35天后,收获耳蜗,短暂地暴露于FM1,固定并染色。图14(A-E)示出未重新进入细胞周 期的Esp+/FM1+/EdU-的对照毛细胞,但其表达Esp且摄取FM1。图 14(F-J)示出在暴露于Ad-Myc/Ad-NICD病毒的耳蜗中 Esp+/FM1+/EdU+毛细胞,表明在经历了重新进入细胞周期的细胞中存 在功能性膜通道。无尾箭头(图14H)表示EdU标记;箭头(图14F) 表示存在Esp+发束。比例尺:10μM。

图15示出Myo7a+毛细胞的生成过程伴随有神经丝-阳性(NF+; 图15B)神经纤维的生成过程,其中Myo7a+毛细胞暴露于升高水平的 c-myc和Notch活性后受诱导以经历细胞增殖。45日龄NICDflox/flox 小鼠的耳蜗暴露于Ad-Myc/Ad-Cre-GFP病毒,并且在注射病毒后,每 天注射一次BrdU,持续15天,以标记分裂细胞(图15C)。注射病毒 20天后收获组织并且染色。图15(A)示出Myo7+毛细胞。细胞核使 用DAPI染色(图15D)。图15(E)示出在分图中最右边的箭头指示 的方形区域的放大图和所有染色的合并图。箭头(图15A、图15C和 图15E)表示与NF+神经节神经元神经纤维接触的Myo7a+/BrdU+毛细 胞。比例尺:10μM。

图16(A-E)示出内毛细胞的实施例,其中内毛细胞通过暴露于 升高水平的c-myc和Notch活性受到诱导以进行增殖,并且表达内毛细 胞特异性标记(Vglut3;图16B和图16G)和功能性突触的标记(CtBP2; 图16A和图16F;方括号)。45日龄NICDflox/flox小鼠的耳蜗经由单 次注射病毒暴露于Ad-Myc/Ad-Cre-GFP(图16A-E)或Ad-GFP(图 16F-J)病毒,并且在病毒注射后,每天注射一次BrdU,持续15天, 以标记分裂细胞(图16C和图16H)。然后收获组织并染色。细胞核 用DAPI(图16D和图16I)染色。图16(A-E)示出在暴露于升高的 c-myc和Notch二者的活性后受诱导而增殖的CtBP2+/VGlut3+/BrdU+ 内毛细胞(图16B;箭头),以及不经历重新进入细胞周期的 CtBP2+/Vglut3+/BrdU-内毛细胞(图16B;无尾箭头)。(图16F-J) 示出暴露于Ad-GFP的内毛细胞,其不是对BrdU染色呈阳性,而是对 表达的内毛细胞特异性标记Vglut3和突触前标记CtBP2染色呈阳性。 IHC=内毛细胞层。

图17示出培养的来自多西环素可诱导的 rtTa/tet-on-Myc/tet-on-Notch小鼠的耳蜗支持细胞,其中,该耳蜗支持 细胞在暴露于单独Atoh1-表达腺病毒(图17F-J)或多西环素和Atoh1- 表达腺病毒(Ad-Atoh1;图17A-E和图17K-O)后诱导而转分化或增 殖和转分化成功能性毛细胞。解剖来自成年 rtTa/tet-on-Myc/tet-on-Notch小鼠的耳蜗,并在多西环素存在(图17A-E 和K-O)或不存在(图17的F-J)的条件下培养5天,然后感染Ad-Atoh1 并额外培养14天。每天添加EdU以标记分裂细胞(图17A、图17F和 图17M)。用DAPI对细胞核染色(图17D、图17I和图17N)。图17 (A-E)示出暴露于多西环素然后暴露于Ad-Atoh1并用EdU标记的支 持细胞重新进入细胞周期和/或转分化成Myo7a+/Parv+毛细胞(在图 17A、图17B、图17C和图17E中的实心箭头)。图17(B、C和E) 中空心箭头表示存在已分化成毛细胞但没有经厉重新进入细胞周期过 程的Myo7a+/Parv+支持细胞。图17(A和E)中的无尾箭头表示EdU+ 支持细胞。图17(F-J)示出暴露于Ad-Atoh1而不是多西环素的支持 细胞转分化成Myo7a+/Parv+毛细胞。图17(G、H和J)中的箭头表示 已转分化成Myo7a+/Parv+毛细胞但没有经历重新进入细胞周期过程的 支持细胞。图17(K-O)示出暴露于多西环素然后暴露于Ad-Atoh1并 用FM1(图17L)和Edu(图17M)标记的支持细胞,该支持细胞具 有Esp+发束(图17K)并摄取FM1染料。图17(K和O)中的箭头表 示显示出静纤毛的Esp+/FM1+/EdU+毛细胞,该毛细胞源自经历过重新 进入细胞周期的转分化的支持细胞。图17(K,O)中的无尾箭头表示 Esp+/FM1+/EdU-毛细胞,该毛细胞源自未经历重新进入细胞周期的转 分化的支持细胞。比例尺:10μM。

图18示出在对照耳蜗细胞中和暴露于升高的c-Myc和NICD水平 后的耳蜗细胞中生成的几组mRNA转录本的半定量RT-PCR分析结果。 成年NICDflox/flox小鼠耳蜗暴露于Ad-Myc/Ad-Cre-GFP(Myc+Nicd) 或Ad-GFP(Ctr)并培养4天,提取mRNA,并进行半定量RT-PCR。 检查干细胞基因(Nanog、ALPL和SSEA)和耳祖细胞基因/Notch基 因(Eyal、DLX5、Sixl、Pax2、p27kip1、Islet-1、Sox2、Math1、NICD、 Prox1和Hes5)的表达变化。GAPDH表达用于内部对照。

图19(A)示出人类N-myc的全长蛋白质序列(NP_005369.2;SEQ ID NO:12),并且图19(B)示出人类N-myc的核酸序列(NM_005378.4; SEQ ID NO:13)。

图20(A)示出人类Notch2的全长蛋白质序列(NP_077719.2;SEQ ID NO:14),并且图20(B)示出人类Notch2的核酸序列(NM_024408.3; SEQ ID NO:15)。

图21(A)示出人类Notch3的全长蛋白质序列(NP_000426.2;SEQ ID NO:16),并且图21(B)示出人类Notch3的核酸序列(NM_000435.2; SEQ ID NO:17)。

图22(A)示出人类Notch4的全长蛋白质序列(NP_004548.3;SEQ ID NO:18);并且图22(B)示出人类Notch4的核酸序列(NM_004557.3; SEQ ID NO:19)。

图23(A)示出人类Atoh1的全长蛋白质序列(NP 660161.1;SEQ ID NO:20),并且图(B)示出人类Atoh1的核酸序列(NM_145178.3;SEQ ID NO:21)。

图24示出控制毛细胞中表达的Atoh1增强子的核酸序列(SEQ ID NO:22)。

图25示出控制毛细胞中表达的Pou4f3启动子的核酸序列(SEQ ID NO:23)。

图26示出控制毛细胞中表达的Myo7a启动子的核酸序列(SEQ ID NO:24)。

图27示出控制前庭支持细胞和耳蜗内指细胞、Deiters细胞和Pillar 细胞中的表达的Hes5启动子的核酸序列(SEQ ID NO:25)。

图28示出控制前庭支持细胞和耳蜗内指细胞、Deiters细胞和Pillar 细胞中的表达的GFAP启动子的核酸序列(SEQ ID NO:26)。

具体实施方式

本发明涉及一种用于诱导耳(特别是内耳)中的毛细胞和/或支持 细胞重新进入细胞周期并增殖的方法和组合物。本发明的方法和组合 物可以用于增加由于环境或遗传因素减少的毛细胞和/或支持细胞的种 群。使用在此所描述的方法和组合物,有可能维持或改善内耳的听力 和/或前庭功能。

如在此所证实,同时增加c-myc和Notch二者的活性似乎是诱导 内耳细胞重新进入细胞周期并增殖的重要步骤。如在下面的实施例中 所示,在哺乳动物内耳中的c-myc和Notch的过表达会使毛细胞和支持 细胞重新进入细胞周期并增殖。毛细胞的增殖(或支持细胞的增殖, 随后这些细胞转分化成毛细胞)可改善对象的听力和/或前庭功能。

定义

为方便起见,将说明书、实施例和所附权利要求书的某些术语收 集在此部分。

在此所用的术语“有效量”应理解为活性剂(例如,c-myc或Notch 激活剂)的量,即足以诱导内耳细胞(例如,毛细胞或支持细胞)重 新进入细胞周期和/或增殖。这些细胞与有效诱导重新进入细胞周期和/ 或增殖的一定量的活性剂相接触。

如在此所用,“药学可接受”或“药理学可接受”意为当视情况施用 到对动物或人类时,不产生不利的、过敏的或其他不良反应的分子实 体和组合物。术语“药学可接受的载体”包括任何和所有的溶剂、分散介 质、包衣、抗菌药剂和抗真菌药剂、等渗和吸收延迟剂等。这类药学 活性物质的介质和药剂的用途是本领域众所周知的。除了任何常规介 质或试剂与药效成分不相容之外,会考虑其在治疗组合物中的应用。 也可以将补充的活性成分掺入到组合物中。

在整个说明书中术语“对象”用于描述根据本发明的方法对其进行 治疗的动物、人类或非人类。可以预期涉及兽医和非兽医方面的应用。 该术语包括但不限于禽类和哺乳动物,例如人类、其他灵长目动物、 猪、诸如小鼠和大鼠的啮齿动物、兔、豚鼠、仓鼠、牛、马、猫、狗、 绵羊和山羊。典型的受试者包括人类、农场动物和诸如猫和狗的家用 宠物。

在此所用的一种或多种“靶细胞”是能够重新进入细胞周期的细胞 和/或增殖和/或转分化成为或到具有或产生具有听觉毛细胞或前庭毛 细胞的特性的细胞。靶细胞包括但不限于例如毛细胞(例如内耳毛细 胞),毛细胞包括听觉毛细胞(内毛细胞和外毛细胞)和前庭毛细胞 (例如位于椭圆囊、小囊和三个半圆管道中的细胞)、祖细胞(例如 内耳祖细胞)、支持细胞(例如,Deiters细胞、柱细胞、内指细胞、 顶盖细胞和Hensen细胞)、表达p27kiP、p75、S100A、Jagged-1、prox1 的一种或多种的支持细胞和/或生殖细胞。“内毛细胞”是指解剖学上位 于柯蒂氏器官中在基底膜的上方的内耳的感觉细胞。“外毛细胞”是指在 解剖学上位于的柯蒂氏器官中在顶盖膜下靠近基底膜中心的内耳的感 觉细胞。靶细胞的实施例还包括纤维细胞、边缘细胞或表达Gjb2、Slc26a4和Gjb6的一种或多种的齿间细胞。如在此所述,在用在此所 述的方法、化合物和组合物处理之前,可以使用对靶细胞而言是唯一 的一个限定组的一种或多种标记(例如,细胞表面标记)识别这些靶 细胞的每一个。不同组的一种或多种标记(例如,细胞表面标记)也 可以用来识别靶细胞具有听觉毛细胞或支持细胞特征。

如在此所用,术语“宿主细胞”是指在体内、离体或体外用重组载 体或多核苷酸转染、感染或转导的细胞。宿主细胞包括包装细胞、生 产细胞和用病毒载体感染的细胞。在特定实施方式中,将本发明的病 毒载体感染的宿主细胞施用给需要治疗的对象。在某些实施方式中, 术语“靶细胞”与宿主细胞中可互换使用,并用于指受转染、感染或转导 的期望细胞类型的细胞。

在此所用的术语“载体”是指能够传送或运送另一核酸分子的核酸 分子。被转移的核酸通常连接到(例如插入)载体核酸分子中。载体 可包括引导细胞中自主复制的序列,或者可包括足以允许整合到宿主 细胞DNA(脱氧核糖核酸)中的序列。有用的载体包括例如质粒(例如 DNA质粒或RNA质粒)、转座子、粘粒、细菌或酵母人工染色体和 病毒载体。有用的病毒载体例如包括腺病毒、复制缺陷型逆转录病毒 和慢病毒。

如在此所用,术语“病毒载体”是指包括病毒-来源的核酸因子的核 酸分子,病毒-来源的核酸因子通常有利于核酸分子转移或整合到细胞 的基因组中或是指介导核酸转移的病毒颗粒。病毒颗粒典型地包括多 种病毒成分,并且有时还包括除一种或多种核酸之外宿主细胞成分。 术语“病毒载体”还可指能够将核酸转移到细胞或到被转移的核酸自身 中的病毒或病毒颗粒。病毒载体和转移质粒含有主要源自病毒的结构 遗传因子和/或功能性遗传因子。

术语“逆转录病毒载体”是指含有主要源自逆转录病毒的结构遗传 因子和功能性遗传因子或其部分的病毒载体或质粒。

术语“慢病毒载体”是指含有主要源自慢病毒的结构遗传因子和功 能性遗传因子或其部分的病毒载体或质粒。

术语“慢病毒载体”或“慢病毒表达载体”可用于指慢病毒转移质粒 和/或传染性慢病毒颗粒。应当理解,诸如克隆位点、启动子、调节因 子、异源核酸等的核酸序列因子,以RNA形式存在于本发明的慢病毒 颗粒中,并以DNA形式存在于本发明的DNA质粒中。

术语“杂合体”是指含有逆转录病毒(例如,慢病毒)序列和非慢 病毒序列两者的载体、LTR或其他核酸。杂合载体可指包括用于逆转 录、复制、整合和/或包装的逆转录病毒(例如,慢病毒)序列的载体 或转移质粒。在本发明的一些实施方式中,杂合载体可用于实施在此 描述的本发明。

术语“转导”是指使用逆转录病毒载体或慢病毒载体借助病毒性感 染而不是转染的途径递送一种或多种基因或其他多核苷酸序列。在某 些实施方式中,如果细胞包括通过用病毒(例如,腺病毒)或逆转录 病毒载体感染而递送到此细胞的基因或其他多核苷酸序列,则该细胞 (例如靶细胞)被“转导”。在特定实施方式中,转导的细胞包括由其细 胞基因组中的逆转录病毒载体或慢病毒载体递送的一种或多种基因或 其他多核苷酸序列。

在此所用的术语“c-myc”是指在细胞周期进程、细胞凋亡和细胞转 化中起作用和/或具有在下面第1(i)章节列出的氨基酸序列或共有氨 基酸序列的多功能核磷蛋白质。人类c-myc的全长序列出现在例如登 记号NP_002458.2下的NCBI蛋白质数据库中(参见ncbi.nlm.nih.gov 和SEQ ID NO:1)。SEQ ID NO:9列出用于使用ClustalW建自人类、 大鼠、小鼠和黑猩猩的比对的c-myc的共有序列。C-myc用作调节特 定靶基因转录的转录因子。此基因的突变、过表达、重排和易位已与 多种造血肿瘤、白血病和包括伯基特淋巴瘤的淋巴瘤相关联。C-myc 在本领域中也是众所周知的以作为以下各项,如MYC、v-myc髓细胞组织增生病毒肿瘤基因同系物(鸟类)、转录因子p64、bHLHe39、 MRTL、鸟类髓细胞组织增生病毒肿瘤基因同系物、v-myc鸟类髓细胞 组织增生病毒肿瘤基因同系物、myc原癌基因蛋白质、E类碱性螺旋- 环-螺旋蛋白质39、myc-相关转译/定位调节因子以及原癌基因c-Myc 和BHLHE39。

在此所用的术语“Notch”是指信号蛋白质的Notch家族,包括 Notch1、Notch2、Notch3和Notch4、NICD、和/或具有下面第(1)(i) 章节列出的氨基酸序列或共有氨基酸序列的蛋白质。人类Notch1的全 长序列出现在例如登记号NP_060087.3下的NCBI蛋白质数据库中(参 见ncbi.nlm.nih.gov和SEQ ID NO:2)。该I型跨膜蛋白质家族的成员 共享包括多个表皮生长因子-状(EGF)重复元组成的胞外域和多个不 同域类型组成的胞内域的结构特征。Notch家族成员通过控制细胞命运 决定过程而在多种发育过程中起作用。

Notch1在高尔基体外侧网络中裂解,并且在细胞表面上呈现为异 质二聚体。Notch1用作膜结合配体Jagged 1、Jagged2和Delta1的受体, 以调节细胞命运确定过程。一旦通过释放的notch胞内域(NICD)激 活配体,就形成了与RBPJ/RBPSUH复合的转录激活剂,并激活分裂基 因座增强子的基因。Notch1对细胞分化、增殖和凋亡程序的实现产生 影响。

在此公开诱导分化的耳蜗细胞或椭圆囊细胞增殖或重新进入细胞 周期的方法。该方法包括增加细胞内c-myc活性、Notch活性或c-myc 和Notch二者的活性,使其足以诱导耳蜗细胞或椭圆囊细胞增殖或重新 进入细胞周期。

在某些实施方式中,该方法包括当Notch活性已增加时,例如, 当响应于内耳的损害已上调Notch1时,增加细胞内c-myc活性。在某 些实施方式中,本发明涉及一种诱导分化的耳蜗细胞或椭圆囊细胞增 殖或重新进入细胞周期的方法,其中响应于对耳蜗细胞或椭圆囊细胞 的损害,相比在未损坏的耳蜗细胞或椭圆囊细胞中的Notch活性水平, 分别增加Notch活性。该方法包括增加耳蜗细胞或椭圆囊细胞内c-myc 活性,使其足以诱导耳蜗细胞或椭圆囊细胞增殖或重新进入细胞周期。

在其他实施方式中,该方法包括当已增加c-myc活性时,增加细 胞内的Notch活性。(参见,例如,Lee et al.(2008)ASSOC.RES. OTOLARYNGOL.ABS.:762.)具体地,本发明涉及一种诱导分化的耳 蜗细胞或椭圆囊细胞增殖或重新进入细胞周期的方法,其中响应于耳 蜗细胞或椭圆囊细胞的损害,相比于未损坏的耳蜗细胞或椭圆囊细胞 内的c-myc活性水平,分别增加细胞内的c-myc活性。该方法包括增 加耳蜗细胞或椭圆囊细胞内的Notch活性,使其足以诱导耳蜗细胞或椭 圆囊细胞增殖或重新进入细胞周期。

视情况,在c-myc活性、Notch活性或c-myc和Notch二者的活性 增加后,根据本领域已知和/或如在此所述的方法,可抑制Notch以使 增殖的支持细胞转分化成毛细胞。可选地或附加地,视情况,在c-myc 活性、Notch活性或c-myc和Notch二者的活性增加后,可以增加Atoh1 活性,以使增殖的支持细胞转分化成毛细胞。增加Atoh1活性的方法 (包括使用Atoh1激动剂)在本领域中是已知的(参见,例如,美国 专利号8,188,131;美国专利公开号20110305674;美国专利公开号 20090232780;Kwan et al.(2009)INT’L SYMPOSIUM ONOLFACTION AND TASTE:ANN.N.Y.ACAD.SCI.1170:28-33;Daudet et al.(2009)DEV.BIO.326:86-100;Takebayashi et al.(2007)DEV.BIO. 307:165-178;和Ahmed etal.(2012)DEV.CELL 22(2):377-390)。

还公开了一种再生耳蜗毛细胞或椭圆囊毛细胞的方法。该方法包 括(a)视情况,增加毛细胞内c-myc活性、Notch活性或c-myc和Notch 二者的活性,从而诱导细胞增殖以生成一种、两种或更多种子代细胞, 以及(b)在细胞增殖后,降低Notch活性以诱导细胞和子代细胞的至 少一者分化,以生成分化的耳蜗毛细胞或椭圆囊毛细胞。该过程可以 在体内或离体进行。在一个实施方式中,降低源自于支持细胞的细胞 内的Notch活性,以使支持细胞转分化成毛细胞。在另一个实施方式中, 增加源自于支持细胞的细胞内的Atoh1活性,以使支持细胞转分化成 毛细胞。

在某些实施方式中,在c-myc和Notch诱导毛细胞或支持细胞内 的增殖后,降低c-myc活性,以诱导细胞和子代细胞的至少一者分化, 以生成分化的耳蜗毛细胞或椭圆囊毛细胞。增殖后降低c-myc活性可 以促进增殖细胞的存活。

还公开了一种用于降低对象听力损失、维持或促进其听力的方法。 该方法包括视情况,增加内耳的毛细胞和/或支持细胞内c-myc活性、 Notch活性或c-myc和Notch二者的活性,从而诱导细胞增殖以生成子 代细胞,并且在细胞增殖后,降低c-myc和/或Notch活性,并且允许 来源于毛细胞的子代细胞分化成毛细胞,或允许来源于支持细胞的子 代细胞转分化成毛细胞,从而降低对象听力损失、维持或促进其听力。 因此,通过激活Atoh1活性(例如通过基因表达、通过施用有效量的 Atoh1或Atoh1激动剂)可诱导来源于支持细胞的子代细胞转分化成毛 细胞。这些步骤可以在体内(例如,在哺乳动物的内耳,特别是在耳蜗中)进行,或离体进行,在离体过程中,将所得到的细胞进行培养 和/或引入到对象的内耳中。

还公开了一种用于减少对象前庭功能损失、维持或促进前庭功能 的方法。该方法包括视情况,增加在内耳的毛细胞和/或支持细胞内 c-myc活性、Notch活性或c-myc和Notch二者的活性,从而诱导细胞 增殖以生成子代细胞,并且在细胞增殖后,降低c-myc和/或Notch活 性,并且允许来源于毛细胞的子代细胞分化成毛细胞,或允许来源于 支持细胞的子代细胞转分化成毛细胞,从而降低对象前庭功能损失、 维持或促进其前庭功能。通过激活Atoh1活性(例如通过基因表达、 通过施用有效量的Atoh1或Atoh1激动剂)可诱导来源于支持细胞的 子代细胞转分化成毛细胞。这些步骤可以体内(例如,在哺乳动物的 内耳,特别是在耳蜗中)进行,或离体进行,在离休过程中,将所得 到的细胞培养和/或引入到对象的内耳中。

在此描述的方法和组合物可用于治疗具有听觉障碍或将有患听觉 障碍风险的对象,听觉障碍由诸如感觉神经毛细胞的听毛细胞的损失 引起。可采用本领域已知的标准听力测试鉴定患有听觉障碍的病人。 该方法可以包括:(a)视情况,增加受试者毛细胞内c-myc活性、Notch 活性或c-myc和Notch二者的活性,从而诱导细胞增殖以生成子代细胞, 和(b)在细胞增殖后,降低Notch活性以诱导细胞和子代细胞的至少 一者分化,以生成分化的耳蜗毛细胞或椭圆囊毛细胞。这可以通过将 一种或多种药剂施用给对象以调节c-myc活性和Notch活性来完成。可 选地,该过程可以在离体的细胞(例如,耳蜗细胞和/或椭圆囊细胞) 发生,然后将得到的细胞移植到对象的内耳中。在某些实施方式中, 在此所述的方法和组合物可以用于促进神经突从内耳中的神经节神经 元生长。例如,毛细胞的再生可促进新的神经突从神经节神经元生长 并且形成具有再生毛细胞的新突触,以将声音信号和平衡信号从毛细 胞发送给大脑。

在某些实施方式中,在此所述的方法和组合物可以用于促进神经 突从内耳中的神经节神经元生长。例如,毛细胞的再生可促进新的神 经突从神经节神经元生长并且形成具有再生毛细胞的新突触,以将声 音信号和平衡信号从毛细胞发送给大脑。在一些实施方式中,在此所 述的方法和组合物可以用于重新恢复毛细胞和听觉神经元之间正确的 突触连接以治疗例如听觉神经病。

感觉神经毛细胞损失的对象经历耳蜗毛细胞的退化,从而频繁导 致毛细胞损失区域中螺旋神经节神经元的损失。这类对象也可经历柯 蒂氏器官中支持细胞的损失,以及颞骨材料中角膜缘、螺旋韧带和血 管纹的退化。

在某些实施方式中,本发明可用于例如,通过促进一种或多种细 胞分化(例如,完全地或部分地分化)成能够用作例如毛细胞的耳感 觉细胞的一种或多种细胞,治疗由于耳中细胞损失引起的毛细胞损失 和任何异常,比如听力损失、耳聋、前庭失常、耳鸣(参见Kaltenbachei et al.(2002)J NEUROPHYSIOL.88(2):699-714s)和听觉过敏(Kujawa etal.(2009)J.NEUROSCI.29(45):14077-14085)。

在某些实施方式中,对象可以患有感觉神经性听力损失或传导性 听力损失,所述感觉神经性听力损失因耳的感觉部分(耳蜗)或非感 觉部分(角膜缘、螺旋韧带和血管纹)或神经部分(听觉神经)的损 伤或失效而引起,所述传导性听力损失是因为外耳和/或中耳的堵塞或 损伤而引起。可选地或附加地,对象可以患有传导路径(外耳或中耳 中)和神经路径(内耳)二者兼有的问题而引起的混合性听力损失。 混合性听力损失的实施例是与由于老化相关联的损伤引起的感觉神经 损失结合的由于中耳感染引起的传导损失。

在某些实施方式中,对象可以是聋的或患有由于任何原因或任何 类型事件造成的听力损失。例如,对象可以是因遗传或先天不足的致 聋的对象;例如,患者可以是自出生就是的耳聋患者,或可以是由于 遗传或先天不足逐渐丧失听力的耳聋患者或耳背患者。在另一实施例 中,患者可以是由于创伤事件(比如物理损伤耳结构,或突然的大噪 声,或长时间暴露在很响的噪声中)引起的耳聋或耳背患者。例如, 长期暴露于音乐会、机场跑道和施工区域可引起内耳损伤并且随后造 成听力损失。

在某些实施方式中,对象可以经历化学-诱导的耳毒性,其中耳毒 性物质包括治疗药物,治疗药物包括抗肿瘤药、水杨酸盐、奎宁和氨 基苷抗生素、食物或药物中的污染物以及环境或工业污染物。

在某些实施方式中,对象可以患有由老化引起的听力障碍。可选 地或附加地,对象可以患有耳鸣(特征为耳朵中的振铃)或听觉过敏 (对声音有较高的灵敏度)。

另外,在此所述的方法和组合物可用于治疗患有前庭功能障碍的 对象,前庭功能障碍包括双侧和单侧前庭功能障碍。前庭功能障碍是 内耳功能障碍,特征为具有包括头晕、不平衡、眩晕、恶心和视力模 糊的症状,并且可伴随听觉问题、疲劳和认知机能的变化。前庭功能 障碍可由于以下原因引起:遗传或先天不足、诸如病毒或细菌感染的 感染,或诸如外伤或非外伤损伤的损伤。最常通过测量疾病的各个症 状(例如,眩晕、恶心和视力模糊)来测试前庭功能障碍。

可选地或附加地,在此所述的方法和组合物可预防性地使用,例如 用于防止、减少或延迟与内耳功能损失相关联的听力损失、耳聋或其 他听觉障碍的恶化。例如,含有一种或多种药剂的组合物可与诸如可 能影响听力损失的激活剂的第二组合物一起施用(例如,之前、之后 或与之同时)。这样的耳毒性药物包括抗生素新霉素、卡那霉素、氨 丁卡霉素、紫霉素、庆大霉素、妥布霉素、红霉素、万古霉素和链霉 素;化疗剂,例如顺铂;非甾体抗炎药(NSAID),例如水杨酸胆碱 镁、双氯芬酸、二氟尼柳、非诺洛芬、氟比洛芬、布洛芬、吲哚美锌、 优布芬、甲氯芬那酸、萘丁美酮、奈普生、奥沙普秦、保太松、比罗 苷康,双水杨酸酯、舒林酸和托美丁;利尿剂;水杨酸酯如阿司匹林; 和某些抗疟治疗剂,如奎宁和氯喹。例如,可以使用在此所述的化合 物和方法治疗接受化疗的患者。例如,已知化疗药物顺铂可造成听力 损失。因此,含有一种或多种增加c-myc和Notch二者的活性的试剂的 组合物可以与顺铂一起施用(例如,之前、之后或与之同时),以防 止或降低顺铂副作用的严重程度。这样的组合物可在施用第二治疗剂 之前、之后和/或与之同时施用。这两种药物可以通过不同的给药途径 施用。

在某些实施方式中,可以使用本文描述的方法和组合物以增加细 胞(例如,内耳细胞)中c-myc和Notch的水平(例如蛋白质水平)和 /或活性(例如生物活性)。示例性方法和组合物包括但不限于用于增 加细胞中c-myc或Notch的表达(例如,转录和/或转译)或水平(例 如浓度)的方法和组合物。可以设想,可以在体内和离体的毛细胞和/ 或支持细胞中实现这样的调节。

1.用于增加C-myc、Notch和Atohl活性的方法和组合物

(i)C-myc、Notch或Atohl多肽

可以设想的是,使用本领域已知的技术可以将c-myc、Notch和 Atohl蛋白质,包括全长蛋白质、生物活性片段以及c-myc和Notch的 同系物导入靶细胞。

示例性的c-myc多肽包括,例如,正如NCBI蛋白质数据库中所 引用的NP002458.2(SEQ ID NO:1)。示例性Notch多肽包括,例如, 正如NCBI蛋白质数据库中所引用的NP060087.3(SEQ ID NO:2)。示 例性的Atohl多肽包括,例如,正如NCBI蛋白质数据库中所引用的 NP005163.1(SEQ ID NO:3)。

在某些实施方式中,编码c-myc、Notch和Atohl家族成员的核酸 序列可以按照本文所描述的方法使用。示例性的c-my家族成员包括 N-myc,在NCBI蛋白质数据库中引用为NP_005369.2(SEQ ID NO:12)。 示例性的Notch家族成员包括Notch2,在NCBI蛋白质数据库中引用 为NP_077719.2(SEQ ID NO:14);示例性的Notch家族成员包括 Notch3,在NCBI蛋白质数据库中引用为NP_000426.2(SEQ ID NO:16); 示例性的Notch家族成员包括Notch4,在NCBI蛋白质数据库中引用 为NP_004548.3(SEQ ID NO:18)。示例性的Atohl家族成员包括Atoh7, 在NCBI蛋白质数据库中引用为NP 660161.1(SEQ ID NO:20)。

在某些实施方式中,本发明的蛋白质序列可包括共有蛋白质序列 或编码共有蛋白质序列的核苷酸序列。本发明的c-myc、Notch胞内结 构域和Atohl的共有蛋白质序列将在下文阐述。

使用ClustalW从人、小鼠、大鼠和黑猩猩序列构建的c-myc共有 蛋白质序列如下:

MPLNVX1FX2NRNYDLDYDSVQPYFX3CDEEENFYX4QQQQSE LQPPAPSEDIWKKFELLPTPPLSPSRRSGLCSPSYVAVX5X6X7FSX8R X9DX10DGGGGX11FSTADQLEMX12TELLGGDMVNQSFICDPDDET FIKNIIIQDCMWSGFSAAAKLVSEKLASYQAARKDSX13SX14X15PA RGHSVCSTSSLYLQDLX16AAASECIDPSVVFPYPLNDSSSPKSCX17S X18DSX19AFSX20SSDSLLSSX21ESSPX22X23X24PEPLVLHEETPPT TSSDSEEEQX25DEEEIDVVSVEKRQX26PX27KRSESGSX28X29X30G GHSKPPHSPLVLKRCHVSTHQHNYAAPPSTRKDYPAAKRX31KLDS X32RVLX33QISNNRKCX34SPRSSDTEENX35KRRTHNVLERQRRNE LKRSFFALRDQIPELENNEKAPKVVILKKATAYILSX36QAX37EX38K LX39SEX40DLLRKRREQLKHKLEQLRNSX41A(SEQ ID NO:9),其中 X1是S或N;X2是T或A;X3是Y或I;X4是Q或H;X5是T或 A;X6是P或T;X7是S或化学键;X8是L或P;X9是G或E;X10 是N或D;X11是S或N;X12是V或M;X13是G或T;X14是P或L;X15是N或S;X16是S或T;X17是P或A或T;X18是Q 或S;X19是S或T;X20是P或S;X21是T或化学键;X22是Q或 R;X23是A或G;X24是S或T;X25是E或D;X26是A或T或P; X27是G或A;X28是P或S;X29是P或S;X30是A或S;X31是 V或A;X32是V或G;X33是K或R;X34是T或S;X35是D或 V;X36是V或I;X37是E或D;X38是Q或H;X39是T或I;X40 是E或K;以及X41是C或G。

使用ClustalW从人、大鼠和小鼠序列构建的Notch胞内结构域的 共有蛋白质序列如下:

VLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVSEASKKKRREPLGEDSVGLKP LKNASDGALMDDNQNEWGDEDLETKKFRFEEPVVLPDLX1DQTDH RQWTQQHLDAADLRX2SAMAPTPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTP LMIASCSGGGLETGNSEEEEDAPAVISDFIYQGASLHNQTDRTGETA LHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVSADAQGV FQILX3RNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADV NAVDDLGKSALHWAAAVNNVDAAVVLLKNGANKDMQNNX4EETP LFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDIAQERMHHDIV RLLDEYNLVRSPQLHGX5X6LGGTPTLSPX7LCSPNGYLGX8LKX9X1 0X11QGKKX12RKPSX13KGLACX14SKEAKDLKARRKKSQDGKGCL LDSSX15MLSPVDSLESPHGYLSDVASPPLLPSPFQQSPSX16PLX17H LPGMPDTHLGIX18HLNVAAKPEMAALX19GGX20RLAFEX21X22PP RLSHLPVASX23X24STVLX25X26X27X28X29GAX30NFTVGX31X32 X33SLNGQCEWLX34RLQX35GMVPX36QYNPLRX37X38VX39PGX4 0LSTQAX41X42LQHX43MX44GPX45HSSLX46X47X48X49LSX50X51 X52X53YQGLPX54TRLATQPHLVQTQQVQPQNLQX55QX56QNLQX 57X58X59X60X61X62X63X64X65X66X67X68X69X70PPX71QPHLX72 VSSAAX73GHLGRSFLSGEPSQADVQPLGPSSLX74VHTILPQESX75A LPTSLPSSX76VPPX77TX78X79QFLTPPSQHSYSSX80PVDNTPSHQL QVPEHPFLTPSPESPDQWSSSSX81HSNX82SDWSEGX83SSPPTX84MX85SQIX86X87IPEAFK(SEQ ID NO:10),其中X1是D或S;X2是M 或V;X3是L或I;X4是K或R;X5是T或A;X6是A或P;X7 是T或P;X8是S或N;X9是S或P;X10是A或G;X11是T或V; X12是A或V;X13是T或5;X14是G或5;X15是G或S;X16是 M或V;X17是S或N;X18是S或G;X19是A或G;X20是S或 G;X21是P或T;X22是P或G;X23是S或G;X24是A或T;X25 是S或G;X26是T或S;X27是N或S;X28是G或S;X29是T 或G;X30是M或L;X31是A或G;X32是P或S;X33是A或T; X34是P或S;X35是N或S;X36是S或N;X37是P或G;X38是 G或S;X39是T或A;X40是T或P;X41是A或P;X42是G或S;X43是G或S;X44是M或V;X45是L或I;X46是S或A;X47 是T或A;X48是N或S;X49是T或A;X50是P或Q;X51是M 或I;X52是M或I;X53是S或化学键;X54是S或N;X55是L或 I或M;X56是Q或P;X57是化学键或P;X58是化学键或A;X59 是化学键或N;X60是化学键或I;X61是化学键或Q;X62是化学键 或Q;X63是化学键或Q;X64是化学键或Q;X65是化学键或S;X66 是化学键或L;X67是化学键或Q;X68是化学键或P;X69是化学键 或P;X70是化学键或P;X71是P或S;X72是S或G;X73是N或 S;X74是P或A;X75是Q或P;X76是M或L;X77是M或V; X78是T或A;X79是T或A;X80是S或化学键;X81是P或R; X82是I或V;X83是I或V;X84是T或S;X85是P或Q;X86是 T或A;X87是H或R。

使用ClustalW从人、小鼠和黑猩猩序列构建的Atohl的共有蛋白 质序列如下:

MSRLLHAEEWAEVKELGDHHRX1PQPHHX2PX3X4PPX5X6QP PATLQARX7X8PVYPX9ELSLLDSTDPRAWLX10PTLQGX11CTARAA QYLLHSPELX12ASEAAAPRDEX13DX14X15GELVRRSX16X17GX18 X19X20SKSPGPVKVREQLCKLKGGVVVDELGCSRQRAPSSKQVNG VQKQRRLAANARERRRMHGLNHAFDQLRNVIPSFNNDKKLSKYET LQMAQIYINALSELLQTPX21X22GEQPPPPX23ASCKX24DHHHLRTA X25SYEGGAGX26X27X28X29AGAQX30AX31GGX32X33RPTPPGX3 4CRTRFSX35PASX36GGYSVQLDALHFX37X38FEDX39ALTAMMAQ KX40LSPSLPGX41ILQPVQEX42NSKTSPRSHRSDGEFSPHSITYSDSD EAS(SEQ IDNO:11),其中X1是Q或H;X2是L或V;X3是Q或化 学键;X4是P或化学键;X5是P或化学键;X6是P或化学键;X7 是E或D;X8是H或L;X9是P或A;X10是A或T;X11是I或L;X12是S或G;X13是V或A;X14是G或S;X15是R或Q;X16 是S或G;X17是G或C;X18是A或G;X19是S或化学键;X20 是S或L;X21是S或N;X22是G或V;X23是P或T;X24是S 或N;X25是A或S;X26是A或N;X27是A或S;X28是T或A; X29是A或V;X30是Q或P;X31是S或P;X32是S或G;X33 是Q或P;X34是S或P;X35是A或G;X36是A或S;X37是S 或P;X38是T或A;X39是S或R;X40是N或D;X41是S或G; 以及X42是E或D。

正如本文所使用的,术语“Atohl”是指属于转录因子的碱性螺旋 -环-螺旋(BHLH)家族的一种蛋白质(其参与形成哺乳动物内耳中的 毛细胞),和/或是具有本文所述的氨基序列或共有序列的蛋白质。

c-myc、Notch或Atohl多肽可以与组合物组合使用,以增强生物 细胞摄取多肽。在某些实施方式中,Atohl、c-myc或Notch多肽可进 行突变以包括增强生物细胞摄取多肽的氨基酸序列。在某些实施方式 中,Atohl、c-myc或Notch多肽可以经改变或突变而增加多肽(例如 c-myc、Notch或Atoh-1点突变体)的稳定性和/或活性。在某些实施方 式中,c-myc、Notch或Atohl多肽可以被改变,以增加多肽的核转位。 在某些实施方式中,改变的c-myc、Notch或Atohl多肽或c-myc、Notch 或Atohl的生物活性片段保留了该物种中全长野生型各自的myc、Notch 或Atohl蛋白质的生物活性的至少50%、60%、70%、80%、90%或95%, 该物种与由或将由本发明的方法和组合物处理的对象相同。

在某些实施方式中,c-myc多肽序列与NP002458.2(SEQ ID NO:1) 可以50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99%或100% 相同。在某些实施方式中,Notch多肽序列与NP060087.3(SEQ ID NO:2) 可以50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99%或100% 相同。在某些实施方式中,Atohl多肽序列与NP005163.1(SEQ ID NO:3) 可以50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99%或100% 相同。在某些实施方式中,由改性Atohl、c-myc或Notch核酸序列和 Atohl、c-myc或Notch多肽序列编码的介质具有至少部分的分子活性 (例如,生物活性),该分子由相应的例如未修饰的、全长Atohl、c-myc 或Notch核酸序列和Atohl、c-myc或Notch多肽序列编码。例如,修 饰的Atohl、c-myc或Notch核酸序列和修饰的Atohl、c-myc或Notch 多肽编码的分子保留了50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、 98%、99%、或100%的由相应的例如未修饰的Atohl、c-myc、或Notch 核酸序列和/或全长Atohl、c-myc或Notch多肽序列编码的分子活性(例 如生物学活性)。

在某些实施方式中,本发明的c-myc蛋白质包含功能结构域,该 功能结构域与包括SEQ ID NO:1中第16-360位氨基酸残基的Myc-N结 构域、包括SEQ ID NO:1中第370-426位氨基酸残基的螺旋-环-螺旋结 构域、包括SEQ ID NO:1中第423-454位氨基酸残基的Myc亮氨酸拉 链和/或SEQ ID NO:1中周围和/或间插序列至少50%、60%、70%、80%、 85%、90%、95%、98%、99%或100%相同。在某些实施方式中,本发 明的Notch蛋白质包含功能结构域,该功能结构域与包括SEQ ID NO:2 中第1754-2555位氨基酸残基的Notch胞内结构域至少50%、60%、70%、 80%、85%、90%、95%、98%、99%或100%相同。在某些实施方式中, 本发明的Atohl蛋白质包括功能结构域,该功能结构域与包括SEQ ID NO:3中第158-214位氨基酸的碱性螺旋-环-螺旋结构域、包括SEQ ID NO:3中第172-216位氨基酸的螺旋-环-螺旋结构域和/或SEQ ID NO:3 中周围和/或间插序列至少50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、 98%、99%或100%相同。

在某些实施方式中,本发明的c-myc和Notch蛋白质可以作为含 有c-myc和Notch(或其活性结构域)的单一蛋白质施用于细胞,优选 地通过可裂解连接肽分离。示例性的可裂解连接肽是本领域已知的(例 如,参见美国专利号5,258,498和美国专利号6,083,486)。

在靶细胞和/或靶细胞的细胞核中对C-myc、Notch或Atohl水平(例 如蛋白质水平)和/或活性(例如生物活性)可以用标准方法例如蛋白 质印迹、原位杂交、逆转录聚合酶链式反应、免疫细胞化学、病毒滴 度检测以及基因报道分析进行评估。通过比较第一细胞样品或标准品 中c-myc、Notch或Atohl的水平和/或活性与第二细胞样品中c-myc、 Notch或Atohl的水平和/或活性,可以评估靶细胞和/或靶细胞的细胞 核中c-myc、Notch或Atohl水平(例如蛋白质水平)和/或活性(例如 生物活性)的增加,例如,将细胞样品与一种预期药剂接触,以增加 c-myc、Notch或Atohl的水平和/或活性。

在本领域的技术范围之内,可通过各种方式来确定序列的同一性, 例如,使用诸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR) 软件等可公开获得的计算机软件进行序列比对并计算序列的同一性。 美国国家生物技术信息中心(NCBI)(网站ncbi.nlm.nih.gov)可用的 示例性软件程序包括blastp、blastn、blastx、tblastn和tblastx。本领域 技术人员可以决定用于测量序列比对的合适参数,包括在被比较的全 长序列上获得最大比对所需要的任何算法。柱形图、说明、序列对比、 预期值(即,用于报告针对数据库序列的匹配的统计显著性阈值)、截止 值、矩阵和筛选的搜索参数均使用默认设置。blastp、blastx、tblastn和 tblastx使用的默认打分矩阵是BLOSUM62矩阵(Henikoff et al.,(1992)Proc.Natl.Acad.Sci.USA89:10915-10919)。在一个方法中,同 一性百分比可以使用blastp(可从NCBI获得的2.2.26版本)的默认参 数确定。

(ii)编码Atohl、c-myc或Notch的DNA

使用本领域已知的一个或多个表达构建体,可以在靶细胞中表达 Atohl、c-myc或Notch。这种表达构建体包括但不限于裸DNA、病毒 和非病毒表达载体。可以在靶细胞中表达的示例性的c-myc核酸序列 包括,例如,NCBI基因数据库中所引用的NM_002467.4(SEQID NO:4)。可以在靶细胞中表达的示例性Notch核酸序列包括,例如, 正如NCBI基因数据库中所引用的NM_017617.3(SEQ ID NO:5)。可 以在靶细胞中表达的示例性的Atohl核酸序列包括,例如,正如NCBI 基因数据库中所引用的NM_005172.1(SEQ ID NO:6)。

在某些实施方式中,可以使用c-myc、Notch和Atohl家族成员。 示例性的c-myc家族成员包括N-myc,在NCBI基因数据库中引用为 NM_005378.4(SEQ ID NO:13)。示例性的Notch家族成员包括Notch2, 在NCBI基因数据库中引用为NM_024408.3(SEQ ID NO:15);Notch3, 在NCBI基因数据库中引用为NM_000435.2的(SEQ ID NO:17);和 Notch4,在NCBI基因数据库引用为NM_004557.3(SEQ ID NO:19)。 示例性的Atohl家族成员包括Atoh7,在NCBI基因数据库中引用为 NM_145178.3(SEQ ID NO:21)。

在某些实施方式中,编码c-myc、Notch或Atohl的DNA可以是 未修饰过的野生型序列。或者,编码c-myc、Notch或Atohl的DNA可 以用标准技术修饰。例如,编码c-myc、Notch或Atohl的DNA可以被 修饰或突变,例如,以提高DNA或所产生的多肽的稳定性。这类改变 的DNA所产生的多肽应保持野生型c-myc、Notch或Atohl的生物活性。 在某些实施方式中,编码Atohl、c-myc或Notch的DNA可被改变以增 加所产生的多肽的核转位。在某些实施方式中,编码c-myc、Notch或 Atohl的DNA可以使用标准分子生物学技术修饰以包括额外的DNA序 列,该额外的DNA序列可以编码,例如,可检测的多肽、信号肽和蛋 白酶切割位点中的一个或多个。

在某些实施方式中,c-myc核酸序列与NM_002467.4(SEQ ID NO:4) 可以50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99%或100% 相同。在某些实施方式中,Notch核酸序列与NM_017617.3(SEQ ID NO:5)是50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99%或100% 相同。在某些实施方式中,Atohl核酸序列与NM_005172.1(SEQ ID NO:6)是50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99%或100%相同。

在某些实施方式中,本发明的c-myc核酸序列包括功能域,该功 能域与编码Myc-N结构域(含SEQ ID NO:1中第16-360位氨基酸残基) 和螺旋-环-螺旋结构域(含SEQ ID NO:1中第370-426位氨基酸残基) 的DNA、编码Myc亮氨酸拉链结构域(含SEQ ID NO:1中第423-454 位氨基酸残基)的DNA、和/或编码SEQ ID NO:1的周围和/或间插序 列的DNA至少50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、98%、99% 或100%相同。在某些实施方式中,本发明的Notch核酸序列包括功能 域,该功能域与编码Notch胞内结构域(含SEQ ID NO:2中第1754-2555 位氨基酸残基)的DNA至少50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、 98%、99%或100%相同。在某些实施方式中,本发明的Atoh 1核酸序 列包括功能域,该功能域与编码碱性螺旋-环-螺旋结构域(含SEQ ID NO:3中第158-214位氨基酸残基)的DNA、编码螺旋-环-螺旋结构域 (含SEQ ID NO:3中第172-216位氨基酸残基)的DNA、和/或编码 SEQ ID NO:3的周围和/或间插序列的DNA至少50%、60%、70%、80%、 85%、90%、95%、98%、99%或100%相同。

(iii)C-myc、Notch或Atohl途径调节剂

在某些实施方式中,可以使用靶向c-myc或Notch、或c-myc或 Notch途径的一个或多个组分的化合物或组合物增加或减少c-myc或 Notch的水平(例如蛋白质水平)和/或活性(例如,生物学活性)。 类似地,可以使用靶向Atohl或Atohl途径的一个或多个组分的化合物 增加Atohl的水平(例如蛋白质水平)和/或活性(例如生物活性)。

示例性的c-myc激活剂包括靶向FBXW-7的微小RNA(Ishikawa Y et al.,Oncogene2012Jun 4;doi:10.1038/onc.2012.213)和增加c-myc表 达水平或活性的激活剂,例如去甲二氢愈创木酸(NDGA)(Park S et al.(2004)J.CELL BIOCHEM.91(5):973-86)、CD19(Chung et a.l,(2012)J.CLIN.INVEST.122(6):2257-2266)、黏连蛋白质(McEwan et al.,(2012)PLoS ONE 7(11):e49160)、苔藓抑素1(Hu et al.(1993)LEUK. LYMPHOMA 10(1-2):135-42)、2'-3-二甲基-4-氨基偶氮苯(邻-氨基偶 氮甲苯,OAT)(Smetanina et al.(2011)TOXICOL.APPL.PHARMACOL.255(1):76-85)、2-氨基-1-甲基-6- 苯基咪唑[4,5-b]吡啶(PhIP)(Lauber et al.(2004)CARCINOGENESIS 25(12):2509-17)、β-雌二醇(美国专利号7,544,511B2)、RU38486 (美国专利号7,544,511B2)、地塞米松(美国专利号7,544,511B2)、 甲状腺激素(美国专利号7,544,511B2)、类维生素A(美国专利号 7,544,511B2)、和蜕皮激素(美国专利号7,544,511B2)。

示例性的c-myc抑制剂包括7-硝基-N-(2-苯基苯基)-2,1,3-苯并二 唑-4-胺(10074-G5)(Clausen DM et al.,(2010) J.PHARMACOL.EXP.THER.335(3):715-27)、硫代噻唑烷酮[Z-E]-5-[4- 乙基苯亚甲基]-2-硫代-1,3-噻唑烷-4-酮(10058-F4)(Clausen etal. (2010)J.PHARMACOL.EXP.THER.335(3):715-27;Lin CP et al. (2007)ANTICANCERDRUGS.18(2):161-70;Huang et al. (2006)EXP.HEMATOL.34(11):1480-9)、4-苯基丁酸(丁酸苯酯) (Engelhard et al.(1998)J.Neurooncol.37(2):97-108)、化合物0012(Hurley et al.(2010)J.VASC.RES.47(1):80-90)、姜黄素(Aggarwal et al. (2005)CLIN.CANCER RES.11(20):7490-8)、氢氧化镁(Mori et al. (1997)J.CELLBIOCHEM.SUPPL.27:35-41)、BP-1-102(Zhang et al. (2012)PROC.NATL.ACAD.SCI.U.S.A.109(24):9623-8)、WP1193(Sai et al.(2012)J.NEUROONCOL.107(3):487-501)、BP-1-107(Page et al. (2012)J.MED.CHEM.55(3):1047-55)、BP-1-108(Page et al. (2012)J.MED.CHEM.55(3):1047-55)、SF-1-087(Pageet al. (2012)J.MED.CHEM.55(3):1047-55)、SF-1-088(Page et al. (2012)J.MED.CHEM.55(3):1047-55)、STX-0119(Ashizawa et al. (2011)INT.J.ONCOL.38(5):1245-52)、取代噻唑-4酮化合物(美国专 利号7,872,027)、(Z,E)-5-(4-乙基亚苄基)-2-硫代噻唑烷-4-酮(10058-F4) (美国专利号7,026,343)、S2T1-6 OTD(美国公开号20120107317A1)、 喹氟拉辛(Quarfloxin)(CX-3543)(美国公开号20120107317A1)、 苯甲酰邻胺苯甲酸(美国公开号20120107317A1)、阳离子卟啉TMPyP4 (美国公开号20120107317A1)、酪氨酸磷酸化抑制剂和酪氨酸磷酸 化抑制剂类化合物(欧洲专利号EP2487156A1)、AG490(欧洲专利 号EP2487156A1)、FBXW-7表达载体(Ishikawa Y et al.,同上)以 及小干扰RNA(siRNA)靶向c-Myc转录本(Id.)。

示例性的Notch激活剂包括:微小RNA(miRNA),其靶向FBXW-7 (Ishikawa Y etal.,同上)、AG-370,5(美国专利号8,114,422)、AG-1296 (6,7-二甲氧基-3-苯基喹喔啉)(Id.)、尼日利亚菌素钠盐(Id.)、 细胞松弛素D(Id.)和FCCP(羰酰氰-4-(三氟甲氧基)-苯腙)(Id.) 和SP60012(Id.);以及载体,其产生Jagged-1、Jagged-2、Jagged-3、 Serrate、Jagged/Serrate蛋白质家族的任意成员、Delta、Delta-like-1、 Delta-like-3、Delta-like-4、Delta-like homolog-1(DLK1)和Delta蛋 白质家族的任意成员的蛋白质或分离蛋白质、以及这些蛋白中任一种 的任意部分(PCT公布WO2004090110A3)。示例性的Notch激活剂 还可包括如丙戊酸(VPA,参见美国专利号8,114,422)、白梨芦醇和 苯乙基异硫氰酸酯等化学激活剂。

示例性的Notch抑制剂包括γ-分泌酶抑制剂,如芳基磺酰胺、苯 并二氮杂卓、L-685,458(美国专利公开号2001/0305674)、MK-0752 (Purow B.(2012)ADV.EXP.MED.BIOL.727:305-19;Imbimbo BP(2008)CURR.TOP.MED.CHEM.8(1):54-61)、DAPT([N-(3,5-二氟苯 乙酰基)-L-丙氨酰基]-S-苯基甘氨酸叔丁酯)(Id.;Ishikawa Y etal.,同 上;PCT公布WO2011149762A3)、LY-374973(N-[N-(3,5-二氟苯乙 酰基)-L-丙氨酰基]-S-苯基甘氨酸叔丁酯)(PCT公布 WO2011149762A3)、N-[(3,5-二氟苯基)乙酰基]-L-丙氨酰基-2-苯基] 甘氨酸-1,1-二甲基乙酯(Id.);LillyGSIL685,458(Purow B,同上)、 化合物E((2S)-2-{[(3,5-二氟苯基)乙酰基]氨基}-N-[(3S)-1-甲基-2-氧代 -5-苯基-2,3-二氢-1H-1,4-苯并二氮杂-3-基]丙酰胺)(Purow B,同上)、DBZ(苯并二氮杂卓)(Purow B,同上)、异香豆素(Purow B,同 上)、JLK6(7-氨基-4-氯-3-甲氧基异香豆素)(Purow B(2012) ADV.EXP.MED.BIOL.727:305-19)、化合物18([11-内]-N-(5,6,7,8,9,10- 六氢-6,9-亚甲基苯并[9][8]轮烯-11-基)-噻吩-2-磺酰胺)(Purow B,同 上)、E2012(Imbimbo BP,同上;PCT公布WO2009005688A3)、 MRK560(Imbimbo15BP,同上)、LY-411575(Imbimbo BP,同上)、 LY-450139(Imbimbo BP,同上;PCT公布WO2009005688A3)、γ- 分泌酶的抑制剂XII(PCT公布WO2011149762A3;PCT公布 WO2009005688A3)、2,2-二甲基-N-((S)-6-氧代-6,7-二氢-5H-二苯并(b,d) 氮杂-7-基)-N'-(2,2,3,3,3-五氟-丙基)-丙二酰胺(美国专利公开号 20090181944A1)、GSI-IX(EP1949916B1)、GSI-X(EP1949916B1)、 生育酚衍生物(PCT公布WO2009040423A1)、[(2S)-2-{[(3,5-二氟苯 基)乙酰基]氨基}-N-[(3S)1-甲基-2-氧代-5-苯基-2,3-二氢-1H-l,4-苯并二 氮杂卓-3-基]丙酰胺](PCT公布WO2009005688A3)、N-[N-(3,5-二 氟苯乙酰基)-L-丙氨酰基]-S-苯基甘氨酸叔丁酯(Id.)、[1,1'-联苯]-4- 乙酸(Id.)、2-氟-α-甲基(Id.),NGX-555(Id.)、LY-411575(Id.)、 Cellzome(Id.)、2-噻吩磺酰胺(Id.)、5-氯-N-[(1S)-3,3,3-三氟-1-(羟 甲基)-2-(三氟甲基)丙基](Id.)、NICS-15(Id.)、BMS(Id.)、CHF-5074 (Id.)、BMS-299897(Imbimbo BP,同上)、R04929097;L-685458((5S)-(叔丁氧羰基氨基)-6-苯基-(4R)羟基-(2R)苄基己酰)-L-亮氨酰-L- 苯丙氨酰胺);BMS-708163(阿加司他);BMS-299897(2-[(lR)-l-[[(4- 氯苯基)磺酰基](2,5-二氟苯基)氨基]乙基-5-氟苯丁酸);MK-0752; Y0-01027;MDL28170(Sigma);LY411575(N2((2S)-2-(3,5-二氟苯 基)-2-羟基乙酰基)-N1-((7S)-5-甲基-6-氧代-6,7-二氢-5H-二苯并[b,d]氮 杂-7-基)-1-丙氨酰胺,参见美国专利号6,541,466);LY411575的 ELN-46719(2-羟基-戊酸酰胺类似物(其中LY411575是3,5-二氟-扁桃 酸酰胺)(美国专利号6,541,466));PF-03084014((S)-2-((S)-5,7- 二氟-1,2,3,4-四氢萘-3-基氨基)-N-(1-(2-甲基-l-(新戊基氨基)丙烷-2- 基)-1H-咪唑-4-基)戊酰胺(Samon et al.,MOL CANCER THER 2012;11:1565-1575);以及化合物E((2S)-2-{[(3,5-二氟苯基)乙酰基] 氨基}-N-[(3S)-1-甲基-2-氧代-5-苯基-2,3-二氢-1H-1,4-苯并二氮杂卓-3- 基]丙酰胺;参见WO 98/28268andSamon et al.,MOL CANCER THER 2012;11:1565-1575;购自Alexis Biochemicals)),或其药学上可接受 的盐。在某些实施方式中,合适的γ-分泌酶抑制剂包括:司马西特(Semagacestat)(又称LY450139,(2S)-2-羟基-3-甲基-N-[(lS)-1-甲基 -2-氧代-2-[[(1S)-2,3,4,5-四氢-3-甲基-2-氧代-1H-3-苯并二氮杂卓-l-基] 氨基]乙基]丁酰胺,购自Eli Lilly;WO 02/47671和美国专利号 7,468,365);LY411575(N-2((2S)-2-(3,5-二氟苯基)-2-羟基乙酰 基)-N1-((7S)-5-甲基-6-氧代-6,7-二氢-SH-二苯并[b,d]氮杂-7-基)-L-丙氨 酰胺,购自Eli Lilly,Fauq et al.,(2007)BIOORG MED CHEM LETT 17:6392-5);贝加司他(begacestat)(又称GSI-953,美国专利号 7,300,951);芳基磺酰胺(AS,Fuwaet al.,(2006)BIOORG MED CHEM LETT.16(16):4184-4189);N-[N-(3,5-二氟苯乙酰基)-L-丙氨酰]-(S)-苯 甘氨酸叔丁酯(DAPT,Shih et al.,(2007)CANCER RES.67:1879-1882); N-[N-3,5-二氟苯乙酰基]-L-丙氨酰-S-苯基甘氨酸甲酯(又称DAPM, γ-分泌酶抑制剂XVI,购自EMD Millipore);化合物W(3,5-二(4- 硝基苯氧基)苯甲酸,购自TocrisBioscience);L-685,458((5S)-(叔丁 基氧羰基氨基)-6-苯基-(4R)-羟基-(2R)-苄基己酰)-L-亮氨酰-L-苯丙氨 酰胺,购自Sigma-Aldrich,Shearmen et al.,(2000)BIOCHEMISTRY 39,8698-8704);BMS-289948(4-氯-N-(2,5-二氟苯基)-N-((1R)-{4-氟 -2-[3-(1H-咪唑-1-基)丙基]苯基}乙基)苯磺酰胺盐酸盐,购自Bristol Myers Squibb);BMS-299897(4-[2-((1R)-1-{[(4-氯苯基)磺酰基]-2,5- 二氟苯胺基}乙基)-5-氟苯基]丁酸,购自Bristol Myers Squibb,参见 Zheng et al.,(2009)XENOBIOTICA 39(7):544-55);阿加司他 (avagacestat)(又称BMS-708163,(R)-2-(4-氯-N-(2-氟-4-(1,2,4-恶二 唑-3-基)苄基)苯磺酰氨基)-5,5,5-三氟戊酰胺,购自Bristol Myers Squibb,Albright etal.,(2013)JPHARMACOL.EXP.THER. 344(3):686-695);MK-0752(3-(4-((4-氯苯基)磺酰基)-4-(2,5-二氟苯基) 环己基)丙酸,购自Merck);MRK-003((3'R,6R,9R)-5'-(2,2,2-三氟乙 基)-2-((E)-3-(4-(三氟甲基)哌啶-1-基)1-丙烯-l-基)-5,6,7,8,9,10-六氢螺[6,9-甲桥苯并[8]轮烯-11,3'-[1,2,5]噻二唑烷]1',1'-二氧,购自Merck, Mizuma et al.,(2012)MOL CANCER THER.11(9):1999-2009); MRK-560(N-[顺式-4-[(4-氯苯基)磺酰基]-4-(2,5-二氟苯基)环己 基]-1,1,1-三氟-甲基磺酰胺,Best et.al.,(2006)J PHARMACOLEXP Ther.317(2):786-90);RO-4929097(又称R4733,(S)-2,2-二甲基-N1-(6- 氧代-6,7-二氢-5H-二苯并[b,d]氮杂-7-基)-N3-(2,2,3,3,3-五氟丙基)丙二 酰胺,购自Hoffman-LaRoche Inc.,Tolcher et al.,(2012)J CLIN.ONCOL.30(19):2348-2353);JLK6(又称7-氨基-4-氯-3-甲氧基 异香豆素,购自Santa Cruz Biotechnology,Inc.,Petit et al.,(2001)NAT.CELL.BIOL.3:507-511);他氟比尔(Tarenflurbil)(又称 (R)-氟联苯丙酸,(2R)-2-(3-氟-4-苯基苯基)丙酸);ALX-260-127(又 称化合物11,如Wolfe et al.,(1998)J.MED.CHEM.41:6中所述);硫 化舒林酸(SSide,et al.,(2003)J BIOL CHEM.278(20):18664-70);1,1,1- 三氟-N-(4-[5-氟-2-(三氟甲基)苯基]-4-{[4(三氟甲基)苯基]磺酰基}环己 基)甲基磺酰胺(美国专利公开号20110275719);N-[反式-3-[(4-氯苯 基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基]-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利 公开号20110263580);N-[顺式-3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基) 环丁基]-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利公开号20110263580);N-[顺 式-3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2-氰基-5-氟苯基)环丁基]-1,1,1-三氟甲基磺 酰胺(美国专利公开号专利公开号20110263580);N-[顺式-3-[(4-氯苯 基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基]-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利 公开号20110263580);N-(顺式-3-(2,5-二氟苯基)-3-{[4-(三氟甲基)苯 基]磺酰基}环丁基)-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利公开号 20110263580);N-{顺式-3-(5-氯-2-氟苯基)-3-[(4-氯苯基)磺酰基]环丁 基}-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利公开号20110263580);N-{顺式 -3-(2,5-二氟苯基)-3-[(4-氟苯基)磺酰基]环丁基}-1,1,1-三氟甲基磺酰胺 (美国专利公开号20110263580);N-{顺式-3-(2,5-二氟苯基)-3-[(3,4- 二氟苯基)磺酰基]环丁基}-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利公开号 20110263580);N-[顺式-3-[(4-氰基苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁 基]-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利公开号20110263580);4-{[顺 式-3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基][三氟甲基)磺酰基]氨 基}丁酸(美国专利公开号20110263580);N-[顺式-3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基]-1,1,1-三氟-N-[2-(四氢-2-吡喃-2-基氧基) 乙基]甲基磺酰胺(美国专利公开号20110263580);甲基{[顺式-3-[(4- 氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基][(三氟甲基)磺酰基]氨基}乙酸 酯(美国专利公开号20110263580);N-[3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5- 二氟苯基)环丁基]-1,1,1-三氟-N-甲基甲基磺酰胺(美国专利公开号 20110263580);N-[3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基]-1,1,1- 三氟-N-甲基甲基磺酰胺(美国专利公开号20110263580);甲基4-{[顺 式-3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基][(三氟-甲基)磺酰基] 氨基}丁酸酯(美国专利公开号20110263580);N-[顺式-3-[(4-氯苯基) 磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基]-N-[(三氟甲基)磺酰基]甘氨酸(美国专 利公开号20110263580);N-[顺式-3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯 基)-1-甲基环丁基]-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利公开号20110263580);N-(顺式-3-(2,5-二氟苯基)-1-甲基-3-{[4-(三氟甲基)苯 基]磺酰基}环丁基)-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利公开号 20110263580);N-[顺式-3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁 基]-1,1,1-三氟-N-[(三氟甲基)磺酰基]甲基磺酰胺(美国专利公开号 20110263580);顺式-3-[(4-氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基][(三 氟甲基)磺酰基]亚胺钠(美国专利公开号20110263580);[顺式-3-[(4- 氯苯基)磺酰基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基][(三氟甲基)磺酰基]亚胺钾(美 国专利公开号20110263580);N-[顺式-3-[(4-三氟甲氧基苯基)磺酰 基]-3-(2,5-二氟苯基)环丁基]-1,1,1-三氟甲基磺酰胺(美国专利公开号 20110263580);1,1,1-三氟-N-(4-[5-氟-2-(三氟甲基)苯基]-4-{[4-(三氟 甲基)苯基]磺酰基}环己基)甲基磺酰胺(美国专利公开号20110263580);γ-分泌酶抑制剂I(又称Z-Leu-Leu-Nle-CHO,苄氧 羰基-亮氨酰-亮氨酰-正亮氨醛,购自Calbiochem);γ-分泌酶抑制剂 II:

(MOL)(CDX)(购自Calbiochem);γ分泌酶抑制剂III,(N- 苄氧羰基-亮氨酰-亮氨醛,购自Calbiochem);γ分泌酶抑制剂IV,(N-(2- 萘酰)-缬氨酰-苯基丙氨酰,购自Calbiochem);γ-分泌酶抑制剂V(又 称Z-LF-CHO,N-苄氧羰基-亮氨酰-苯基丙氨酰,购自EMD Millipore); γ-分泌酶抑制剂VI(1-(S)-内-N-(1,3,3)-三甲基二环[2.2.1]庚-2-基)-4-氟 苯基磺酰胺,购自EMD Millipore);γ分泌酶抑制剂VII,(又称化合 物A,MOC-LL-CHO,薄荷氧羰基-LL-CHO,购自Calbiochem);γ 分泌酶抑制剂X,({1S-苄基-4R-[1-(1S-氨基甲酰-2-苯乙基氨基甲 酰)-1S-3-甲基丁基氨基甲酰]-2R-羟基-5-苯基苯基}氨基甲酸叔丁基酯, 购自Calbiochem);γ分泌酶抑制剂XI,(7-氨基-4-氯-3-甲氧基异香 豆素,购自Calbiochem);γ分泌酶抑制剂XII,(又称Z-Ile-Leu-CHO, Shih and Wang,(2007)CANCER RES.67:1879-1882);γ分泌酶抑制剂 XIII,(Z-Tyr-Ile-Leu-CHO,购自Calbiochem);γ分泌酶抑制剂XIV, (Z-Cys(t-Bu)-Ile-Leu-CHO,购自Calbiochem);γ分泌酶抑制剂XVII, (又称WPE-III-31C)、

(MOL)(CDX)(购自Calbiochem);γ分泌酶抑制剂XIX, (又称苯并二氮杂卓,(2S,3R)-3-(3,4二氟苯基)-2-(4-氟苯基)-4-羟基 -N-((3S)-2-氧代-5-苯基-2,3-二氢-1H-苯并[e][1,4]二氮杂卓-3-基)-丁酰 胺,Churcher et al.,(2003)J MED CHEM.46(12):2275-8);γ分泌酶抑制 剂XX,(又称苯并二氮杂卓,(S,S)-2-[2-(3,5-二氟苯基)乙酰氨基]-N-(5- 甲基-6-氧代-6,7-二氢-5H-二苯并[b,d]氮杂-7-基)丙酰胺,

(MOL)(CDX)(Weihofen et al.,Science 296:2215-2218,2002, 购自Calbiochem);γ分泌酶抑制剂XXI,((S,S)-2-[2-(3,5-二氟苯基)- 乙酰氨基]-N-(1-甲基-2-氧代-5-苯基-2,3-二氢-1H-苯并[e][1,4]二氮杂卓 -3-基)-丙酰胺,购自Calbiochem);5-甲基-2-丙-2-基环己基)N-[4-甲基 -l-[(4-甲基-l-氧代戊烷-2-基)氨基]-1-氧代戊烷-2-基]氨基甲酸酯(购自 HDH Pharma Inc.);N-反式-3,5-二甲氧基肉桂酰-Ile-亮氨醛(购自 Calbiochem);N-叔丁氧羰基-甘氨酰-缬氨酰-缬氨酰;异戊酰基-VV-Sta-A-Sta-OCH3(购自Calbiochem);二乙基-(5-苯基-3H-氮杂-2- 基)-胺(美国专利号8188069);二乙基-(5-异丙基-3H-氮杂-2-基)-胺(专 利号8188069);二乙基-(4-苯基-3H-氮杂-2-基)-胺(美国专利号 8188069);二乙基-(6-苯基-3H-氮杂-2-基)-胺(美国专利号8188069); 5-苯基-1,3-二氢-氮杂-2-酮(美国专利号8188069);5-异丙基-l,3-二氢 -氮杂-2-酮(美国专利号8188069);4-苯基-1,3-二氢-氮杂-2-酮(美国 专利号8188069);6-苯基-l,3-二氢-氮杂-2-酮(美国专利号8188069); 2-丁氧基-5-苯基-3H-氮杂卓(美国专利号8188069);1-甲基-5-苯基-1,3- 二氢-氮杂-2-酮(美国专利号8188069);5-异丙基-l-甲基-1,3-二氢-氮 杂-2-酮(美国专利号8188069);1-甲基-4-苯基-l,3-二氢-氮杂-2-酮(美国专利号8188069);1-甲基-6-苯基-l,3-二氢-氮杂-2-酮(美国专利号 8188069);1-甲基-5-苯基-1H-氮杂卓-2,3-二酮-3-肟(美国专利号 8188069);5-异丙基-1-甲基-1H-氮杂卓-2,3-二酮-3-肟(美国专利号 8188069);1-甲基-6-苯基-1H-氮杂卓-2,3-二酮-3-肟(美国专利号 8188069);1-甲基-4-苯基-1H-氮杂卓-2,3-二酮-3-肟(美国专利号 8188069);3-氨基-l-甲基-5-苯基-1,3-二氢-氮杂-2-酮(美国专利号 8188069);3-氨基-5-异丙基-l-甲基-1,3-二氢-氮杂-2-酮(美国专利号8188069);3-氨基-l-甲基-4-苯基-1,3-二氢-氮杂-2-酮(美国专利号 8188069);3-氨基-l-甲基-6-苯基-1,3-二氢-氮杂-2-酮(美国专利号 8188069);(S)-[1-(1-甲基-2-氧代-5-苯基-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基氨基甲 酰)-乙基]-氨基甲酸叔丁酯(美国专利号8188069);[(S)-1-(5-异丙基-l- 甲基-2-氧代-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基氨基甲酰)-乙基]氨基甲酸叔丁酯 (美国专利号8188069);[(S)-1-(1-甲基-2-氧代-4-苯基-2,3-二氢-1H- 氮杂-3-基氨基甲酰)-乙基]氨基甲酸叔丁酯(美国专利号8188069); [(S)-1-(1-甲基-2-氧代-6-苯基-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基氨基甲酰)-乙基]- 氨基甲酸叔丁酯(美国专利号8188069);(S)-2-氨基-N-(1-甲基-2-氧代 -5-苯基-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基)-丙酰胺(美国专利号8188069);(S)-2- 氨基-N-(5-异丙基-l-甲基-2-氧代-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基)丙酰胺(美国 专利号8188069);(S)-2-氨基-N-(I-甲基-2-氧代-6-苯基-2,3-二氢-1H- 氮杂-3-基)丙酰胺盐酸盐(美国专利号8188069);(S)-2-氨基-N-(1-甲 基-2-氧代-4-苯基-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基)丙酰胺盐酸盐(美国专利号8188069);(S)-2-氟-3-甲基-丁酸(美国专利号8188069);(S)-2-羟基 -3-甲基-N-[(S)-1-((S)-1-甲基-2-氧代-5-苯基-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基氨 基甲酰)-乙基]-丁酰胺(美国专利号8188069);(S)-2-氟-3-甲基 -N-[(S)-1-(1-甲基-2-氧代-5-苯基-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基氨基甲酰)-乙 基]-丁酰胺(美国专利号8188069);(S)-2-羟基-N-[(S)-1-(5-异丙基-l- 甲基-2-氧代-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基氨基甲酰)乙基]-3-甲基-丁酰胺(美 国专利号8188069);(S)-2-羟基-3-甲基-N-[(S)-1-(1-甲基-2-氧代-4-苯 基-2,3-二氢-lH-氮杂-3-基氨基甲酰)-乙基]-丁酰胺(美国专利号 8188069);(S)-2-羟基-3-甲基-N-[(S)-1-(1-甲基-2-氧代-6-苯基-2,3-二氢 -1H-氮杂-3-基氨基甲酰)-乙基]-丁酰胺(美国专利号8188069);以及 (S)-2-氟-3-甲基-N-[(S)-1-(1-甲基-2-氧代-6-苯基-2,3-二氢-1H-氮杂-3-基 氨基甲酰)-乙基]-丁酰胺(美国专利号8188069)及其药学上可接受的 盐。

美国专利申请公开号2004/0029862、2004/0049038、2004/0186147、 2005/0215602、2005/0182111、2005/0182109、2005/0143369、2005/0119293、2007/0190046、2008/008316、2010/0197660和 2011/0020232;美国专利号6,756,511、6,890,956、6,98,626、7,049,296、 7,101,895、7,138,400、7,144,910、7,183,303、8,188,069;以及国际公开号WO1998/28268、WO2001/70677、WO2002/049038、 WO2004/186147、WO2003/093253、WO2003/093251、WO2003/093252、 WO2003/093264、WO2005/030731、WO2005/014553、WO2004/039800、 WO2004/039370、WO 2009/023453、EP 1720909、EP 2178844、 EP2244713中公开了γ-分泌酶抑制剂的其他实施方式。

其他示例性的Notch抑制剂包括非甾体抗炎药(NSAID),如氟 比洛芬(Purow B,同上)、MPC-7869(Imbimbo BP,同上)、布洛 芬(Id.)、硫化舒林酸、吲哚美辛、α-分泌酶抑制剂(ASIs)(Purow B,同上)、Na+/H+逆向转运莫能菌素(Id.);阻止Notch与诸如Jagged、 Numb、Numb-like、CBF1转录因子和mastermind-like(MAML)等互 作蛋白质结合的小分子(Id.;Ishikawa Y et al.,同上);与Notch蛋白 质或诸如Delta-Like-4等Notch配体结合的抗体(Purow B,同上); 与诸如SAHM1等Notch蛋白质结合的订书肽(Id.);显性失活形式的 基因,例如MAML(Id;Ishikawa Y et al.,同上)、Numb/Numb-Like (Purow B,同上)和FBXW-7(Id.);增加如FBXW-7等Notch调节 剂水平的表达载体(Id.;Ishikawa Y et al.,同上);靶向Notch转录本 的siRNA(Purow B,同上);微小RNA,例如m1R-326、miR-34a、 microRNA-206和m1R-124(Id.);以及Notch抗体(美国专利号 58,226,943,美国公开号20090258026A2,PCT公布WO2012080926A2)。

示例性的Atohl激活剂包括,例如,β-连环蛋白质或β-连环蛋白质 途径激动剂,例如Wnt配体、DSH/DVL1、2、3、LRP68N、WNT3A、 WNT5A、和WNT3A、5A。本领域综述了其他Wnt/β-连环蛋白质途径 激活剂和抑制剂(Moon et al.,Nature Reviews Genetics,5:689-699,2004)。在一些实施方式中,合适的Wnt/β-连环蛋白质途径激动剂可 包括抗体及其抗原结合片段、和特异性结合受体的卷曲蛋白质(Fzd) 家族的的肽。

激酶抑制剂,例如,酪蛋白激酶1(CK1)和糖元合酶激酶3β (GSK3β)抑制剂也可以作为β-连环蛋白质或β-连环蛋白质途径激动 剂,以激活Atohl。GSK3β抑制剂包括,但不限于,氯化锂(L1C1)、 Purvalanol A、奥罗莫星、阿特波龙、kenpaullone、苄基-2-甲基-1,2,4-噻二唑烷-3,5-二酮(TDZD-8)、2-硫代(3-碘苄基)-5-(1-吡啶基 1)-[1,3,4]-二唑(GSK3抑制剂II)、2,4-二苄基-5-氧代噻二唑烷-3-硫酮 (OTDZT)、(2′Z,3′E)-6-溴靛玉红-3′-肟(BIO)、二溴苯乙酮-4(即, Tau蛋白激酶1(TPK1)抑制剂)、2-氯-1-(4,5-二溴-噻吩-2-基)-乙酮、 N-(4-甲氧苄基)-N-(5-硝基-1,3-噻唑-2-基)脲(AR-A014418)和靛玉红(indirubins)(例如靛玉红-5-磺酰胺;靛玉红-5-磺酸(2-羟基乙基)-酰 胺靛玉红-3′-单肟;5-碘-靛玉红-3′-单肟;5-氟代靛玉红;5,5′-二氟代靛 玉红;5-硝基靛玉红;5-氯代靛玉红;5-甲基靛玉红,5-溴靛玉红)、4- 苄基-2-甲基-1,2,4-噻二唑烷-3,5-二酮(TDZD-8)、2-硫代(3-碘苄 基)-5-(1-吡啶基)-[1,3,4]-二唑(GSK3抑制剂II)、2,4-二苄基-5-氧代噻二唑烷-3-硫酮(OTDZT),(2'Z,3'E)-6-溴靛玉红-3'-肟(BIO)、α-4-(4- 二溴苯乙酮(即,Tau蛋白激酶1(TPK1)抑制剂)、2-氯-1-(4,5-二溴- 噻吩-2-基)-乙酮、(vi)N-(4-甲氧苄基)-N-(5-硝基-1,3-噻唑-2-基)脲 (AR-A014418)和H-KEAPPAPPQSpP-NH2(L803)或其细胞渗透衍 生物Myr-N-GKEAPPAPPQSpP-NH2(L803-mts)。美国专利号 256,417,185;6,489,344;和6,608,063公开了其他的GSK3β抑制剂。 在一些实施方式中,合适的激酶抑制剂可包括被设计成降低GSK3β和 /或CK1蛋白质水平的RNAi和siRNA。在一些实施方式中,有用的激酶抑制剂包括FGF途径抑制剂。在一些实施方式中,FGF途径抑制剂 包括,例如,SU5402。

如Ahmed et al.(2012)Dev.Cell 22(2):377-390中所述,其他的 Atohl激活剂包括γ分泌酶抑制剂(例如,除了以上列出的Notch抑制 剂之外,芳基磺酰胺、二苯并氮杂类、苯并二氮杂、N-[N-(3,5-二氟苯 乙酰基)-L-丙氨酰基]-(S)-苯基甘氨酸叔丁酯(DAPT;EMDBiosciences, San Diego,CA,USA)、L-685,458或MK0752ho)、庆大霉素以及转录 因子Eyal和Sixl(任选Sox2)的组合。

美国专利号8,188,131中描述了其他Atohl激活剂,包括;式I代 表的化合物:

其中:

R118、R119、R120和R121中的每一个独立地选自H、卤素、OH、 CN、NO2、C1-C3烷基、C1-C3卤代烷基、C1-C3烷氧基和C1-C3卤 代烷氧基;

R122是氢或-Z-Ra;其中:

Z为O或化学键;和

Ra是:

(i)C1-C6烷基或C1-C6卤代烷基,它们中的每一个均任选被 1-3Rb取代;或

(ii)C3-C10环烷基、C3-C10环烯基,它们中的每一个任选被1-5Rc 取代基取代;或

(iii)C7-C11芳烷基、或含有6-11个原子的杂芳烷基,它们中的 每一个任选被1-5Rc取代;

(iv)C6-C10芳基或含有5-10个原子的杂芳基,它们中的每一个 均任选被1-5Rd取代;

R123是:

(i)氢;或

(ii)C1-C6烷基或

C1-C6卤代烷基,它们中的每一个均任选被1-3Rb取代;或

(iii)C6-C10芳基或含有5-10个原子的杂芳基,它们中的每一个 均任选被1-5Rd取代;或

(iv)C7-C11芳烷基、或含有6-11个原子的杂芳烷基,它们中的 每一个任选被1-5Rc取代;或

(v)-(C1-C6烷基-Z1-(C6-C10芳基),其中Z1是O、S、NH或 N(CH3);烷基部分任选地被1-3Rb取代;且芳基部分任选地被1-5Rd 取代;或

(vi)-(C1-C6烷基)-Z2-(含有5-10个原子的杂芳基),其中Z2 是O、S、NH或N(CH3);烷基部分任选地被1-3Rb取代;以及杂芳 基部分任选地被1-5Rd取代;或

(vii)-(C1-C6烷基)-Z3-(C3-C10环烷基),其中Z3是O、S、NH 或N(CH3);烷基部分任选地被1-3Rb取代;且环烷基部分任选地被 1-5Rc取代;

在每一种情况下,Rb独立地为:

(i)NH2;NH(C1-C3烷基);N(C1-C3烷基)2;羟基;C1-C6烷 氧基或C1-C6卤素烷氧基;或

(ii)C3-C7环烷基任选地被独立地选自C1-C6烷基的1-3个取代 基取代,NH2;NH(C1-C3烷基);N(C1-C3烷基)2;羟基;C1-C6烷氧 基或C1-C6卤素烷氧基;

在每一种情况下,Rc独立地为:

(i)卤素;NH2;NH(C1-C3烷基);N(C1-C3烷基)2;羟基;C1-C6 烷氧基;C1-C6卤素烷氧基;或氧代基;或

(ii)C1-C6烷基或C1-C6卤素烷基;以及

在每一种情况下,Rd独立地为:

(i)卤素;NH2;NH(C1-C3烷基);N(C1-C3烷基)2;羟基;C1-C6 烷氧基或C1-C6卤素烷氧基;硝基;-NHC(O)(C1-C3烷基);或氰基; 或

(ii)C1-C6烷基或C1-C6卤素烷基;或其药学上可接受的盐。

美国专利号8,188,131描述的其他示例性Atohl激活剂包括4-(4- 氯苯基)-1-(5H-嘧啶并[5,4-b]吲哚-4-基)-1H-吡唑-3-胺;6-氯-l-(2-氯苄氧 基)-2-苯基-lH-苯并[d]咪唑;6-氯-l-(2-氯苄氧基)-2-(4-甲氧基苯基)-1H- 苯并[d]咪唑;6-氯-2-(4-甲氧基苯基)-1-(4-甲基苄氧基)-1H-苯并[d]咪 唑;6-氯-l-(3,5-二甲基苄氧基)-2-(4-甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑;6- 氯-l-(4-甲氧基苄氧基)-2-(4-甲氧基苯基)-1H-苯并[d]咪唑;1-(4-甲基苄 氧基)-6-硝基-2-苯基-1H-苯并[d]咪唑;4-(1H-苯并[d]咪唑-2-基)苯酚; 2,5-二氯-N-((1-甲基-lH-苯并[d]咪唑-2-基)甲基)苯胺;4-(2-(1-甲基-lH- 苯并[d]咪唑-2-基)乙基)苯胺;2-((2-甲氧基苯氧基)甲基)-1H-苯并[d]咪 唑;2-((4-氟苯氧基)甲基)-1-甲基-lH-苯并[d]咪唑;2-(苯硫甲基)-1H-苯 并[d]咪唑;3-(6-甲基-lH-苯并[d]咪唑-2-基)-2H-苯并吡喃-2-亚胺; N-(2-(1H-苯并[d]咪唑-2-基)苯基)异丁酰胺;2-(邻-甲苯氧基甲基)-1H- 苯并[d]咪唑;2-(4-甲氧基苯基)-1-苯乙基-lH-苯并[d]咪唑;N-(6-溴苯并 [d]噻唑-2-基)噻吩-2-甲酰胺;N-(苯并[d]噻唑-2-基)-1-甲基-lH-吡唑-5-甲酰胺;2-(4-氟苄基硫代)苯并[d]噻唑;5-氯-N-甲基苯并[d]噻唑-2-胺; N-(6-乙酰胺基苯并[d]噻唑-2-基)呋喃-2-甲酰胺;N-(6-氟苯并[d]噻唑-2- 基)-3-甲氧基苯甲酰胺;2-(苯并[d]恶唑-2-基硫代)-N-(2-氯苯基)乙酰胺; 5-氯-2-苯基苯并[d]恶唑;5-甲基-2-间-甲苯基苯并[d]恶唑;2-(4-异丁氧 基苯基)-3-(萘-2-基)-2,3-二氢喹啉-4(1H)-酮;N-(2-(2-(4-氟苯基)-2-氧代 乙硫基)-4-氧代喹唑啉-3(4H)-基)苯甲酰胺;2-(4-氯苯基)-4-(4-甲氧基苯 基)-1,4-二氢苯并[4,5]咪唑并[1,2-a]嘧啶;2-(3-吡啶基)-4-(4-溴苯基)-1,4-二氢苯并[4,5]咪唑并[1,2-a]嘧啶;N-仲丁基-1,7,7-三甲基-9-氧代 -8,9-二氢-7H-氟[3,2-f]苯并吡喃-2-甲酰胺;N-(3-氨基甲酰-5,6-二氢-4H- 环戊醇[b]噻吩-2-基)苯并呋喃-2-甲酰胺;3-氯-N-(5-氯吡啶-2-基)苯并[b] 噻吩-2-甲酰胺;3-氯-N-((四氢呋喃-2-基)甲基)苯并[b]噻吩-2-甲酰胺; N-(3-(5-氯-3-甲基苯并[b]噻吩-2-基)-1H-吡唑-5-基)乙酰胺;2-(萘-2- 基)-1H-吲哚;2-(吡啶-2-基)-1H-吲哚;N-(2-氯苯基)-2-(1H-吲哚-3-基)-2- 氧代乙酰胺;2-间-甲苯基喹啉;2-(4-(2-甲氧基苯基)哌嗪-l-基)喹诺酮; 2-(1H-苯并[d][1,2,3]三唑-l-基)-N-(2,3-二氢-1H-茚-2-基)乙酰胺;1-苯乙 基-lH-苯并[d][1,2,3]三唑;7-(4-氟苄氧基)-2H-苯并吡喃-2-酮;N-(2,4- 二氯苯基)-8-甲氧基-2H-苯并吡喃-3-甲酰胺;N-(3-氯苯基)-8-甲基-3,4- 二氢喹啉-1(2H)-甲硫代酰胺;7-甲氧基-5-甲基-2-苯基-4H-苯并吡喃-4- 酮;2-(3,4-二甲基苯基)喹喔啉;4-溴-N-(5-氯吡啶-2-基)苯甲酰胺;3- 氨基-6,7,8,9-四氢-5H-环庚[e]噻吩并[2,3-b]吡啶-2-甲酰胺;(Z)-3-甲基 -N'-(烟酰氧基)苯甲酰胺;N,N-二乙基-6-甲氧基噻吩并[2,3-b]喹啉-2-甲 酰胺;6-(4-甲氧基苯基)-1,2,3,4-四氢-1,5-萘啶;5-溴-N-(2-(苯基硫代) 乙基)烟酰胺;N-(6-甲基吡啶-2-基)-2,3-二氢苯并[b][1,4]二恶英-6-甲酰 胺;2-(4-甲基苄基巯基)恶唑并[4,5-b]吡啶;N-(2-甲氧基乙基)-5-p-甲苯 基嘧啶-2-胺;4-(5-(苯并[b]噻吩-2-基)嘧啶-2-基)吗啉;4-(5-(4-氟苯基) 嘧啶-2-基)吗啉;N-(4-溴-3-甲基苯基)喹唑啉-4-胺;N-(4-甲氧基苯基) 喹唑啉-4-胺;N-(3-甲氧基苯基)-9H-嘌呤-6-胺;N,N-二乙基-l-间-甲苯 基-lH-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺;(5-(4-溴苯基)呋喃-2-基)(吗啉)甲酮; (Z)-4-溴-N'-(呋喃-2-羰氧基)苯甲酰胺;N-(4-碘代苯基)呋喃-2-甲酰胺; 5-(5-(2,4-二氟苯基)呋喃-2-基)-1-(甲基磺酰)-1H-吡唑;1-(3-氨基-5-(4- 叔丁苯基)噻吩-2-基)乙酮;N-(3-氰基-4,5,6,7-四氢苯并[b]噻吩-2-基)-2- 氟苯甲酰胺;N-(5-氯吡啶-2-基)噻吩-2-甲酰胺;N-(2-(4-氟苯氧基)乙基) 噻吩-2-甲酰胺;2,5-二甲基-N-苯基-l-(噻吩-2-基甲基)-1H-吡咯-3-甲酰 胺;N-(3-氰基噻吩-2-基)-4-异丙氧基苯甲酰胺;2-(4-甲氧基苯氧基)-N-(噻唑-2-基)乙酰胺;4-(4-甲氧基苯基)-N-(3-甲基吡啶-2-基)噻唑 -2-胺;4-(bi苯基-4-基)噻唑-2-胺;4-(4-(4-甲氧基苯基)噻唑-2-基)-3-甲 基异恶唑-5-胺;N-(2-甲氧基苯基)-4-苯基噻唑-2-胺;1-(4-氨基-2-(间- 甲苯基氨基)噻唑-5-基)-2-甲基丙烷-l-酮;4-(4-氯苯基)-1-(5H-嘧啶并 [5,4-b]吲哚-4-基)-1H-吡唑-3-胺;2-(4-氯苯基)-6-乙基-5-甲基吡唑并 [1,5-a]嘧啶-7(4H)-酮;5-甲氧基-2-(5-苯基-1H-吡唑-3-基)苯酚;(3-(4- 溴苯基)-1-苯基-1H-吡唑-4-基)甲醇;N-(2,5-二氯苯基)-1-乙基-1H-吡唑 -3-甲酰胺;4-氯-l-甲基-N-(2-氧代-2-苯基乙基)-1H-吡唑-3-甲酰胺; N-(3-(5-叔丁基-2-甲基呋喃-3-基)-lH-吡唑-5-基)苯甲酰胺;N-(5-甲基异 恶唑-3-基)苯并[d][1,3]二氧杂环戊烯-5-甲酰胺;(5-(4-溴苯基)异恶唑-3- 基)(吗啉)甲酮;N-(4-溴苯基)-5-异丙基异恶唑-3-甲酰胺;5-((4-氯-2-甲 基苯氧基)甲基)-3-(吡啶-4-基)-1,2,4-恶二唑;5-(2-甲氧基苯基)-3-p-甲苯 基-1,2,4-恶二唑;5-(苯氧基甲基)-3-(吡啶-3-基)-1,2,4-恶二唑;5-(2-氯-4- 甲基苯基)-3-(吡啶-3-基)-1,2,4-恶二唑;3-(2-氯苯基)-5-p-甲苯基-1,2,4-恶二唑;5-(哌啶-1-基甲基)-3-对甲苯-1,2,4-恶二唑;5-(4-溴苯基)-3-(吡 啶-3-基)-1,2,4-恶二唑;5-(2-溴苯基)-3-(4-溴苯基)-1,2,4-恶二唑;5-(2- 溴-5-甲氧基苯基)-3-(硫代苯基-2-基)-1,2,4-恶二唑;3-(2-氟苯 基)-N-(3-(哌啶-l-基)丙基)-1,2,4-恶二唑-5-胺;2-(2-氯苯并基)-N-(4-氟苯 基)肼基硫代甲酰胺;2-(甲基氨基)-N-苯乙基苯甲酰胺;4-叔丁基-N-((四 氢呋喃-2-基)甲基)苯甲酰胺;2-苯基-5-邻-甲苯基-1,3,4-恶二唑;4-(3-(4- 氯苯基)-4,5-二氢-1H-1,2,4-三唑-5-基)-N,N-二甲基苯胺;7-甲氧基-2-(4- 甲氧基苯基)-1,10b-二氢螺[苯并[e]吡唑并[1,5-c][1,3]恶嗪-5,1'-环己烷]; 6-氧代-2-(4-(3-(三氟甲基)苯氧基)苯基)-1,4,5,6-四氢吡啶-3-甲腈;6-(4- 甲氧基苯基)咪唑并[2,1-b]噻唑;2-(2-溴苯氧基)-N-(4H-1,2,4-三唑-3-基) 乙酰胺;1-(吲哚-1-基)-2-苯氧基乙酮;2-(4-氯苯基)-6,7,8,9-四氢苯并[e] 咪唑并[1,2-b][1,2,4]三嗪;及其药学上可接受的盐。

2.用于调节c-myc、Notch和Atohl的药剂的递送

蛋白质、激活剂和抑制剂的递送

c-myc、Notch或Atohl活性调节剂的递送方法部分依赖于毛细胞 或支持细胞是否在体内或离体情况下与所关注的药剂接触。在体内方 法中,药剂被递送至哺乳动物的内耳中。在离体方法中,药剂与离体 细胞接触。最终使用本领域已知和使用过的技术,可以将毛细胞移植 入受试者的内耳。

在某些实施方式中,通过在受试者的内耳施用c-myc蛋白质或 c-myc激活剂增加c-myc活性,以得出,例如,最终浓度为大于约30μM, 例如,范围为约30μM至约1000μM。在某些实施方式中,c-myc蛋白 质或c-myc激活剂可以施用足够的量以得出最终浓度为大于约30μM。 例如,c-myc蛋白质或c-myc激活剂可以施用足够的量以得出最终浓度 为约30μM至约1000μM,50μM至约1000μM、80μM至约1000μM、 约100μM至约1000μM、约150μM至约1000μM、约200μM至约800μM 或约200μM至约600μM。

在其他实施方式中,可向哺乳动物的内耳局部施用的c-myc蛋白 质或c-myc激活剂的施用剂量约0.025mg至约4mg、约0.035mg至约 2mg、约0.05mg至约2mg、约0.1mg至约2mg、约0.2mg至约1mg、 或者约0.2至约0.8mg。在一个实施方式中,局部施用0.5mg的c-myc蛋白质或c-myc激活剂至内耳。在某些其他实施方式中,可以局部施 用约0.05mg至约2mg、约0.2mg至约2mg、约0.05mg至约1.5mg、约 0.15mg至约1.5mg、约0.4mg至约1mg或约0.5mg至约0.8mg的c-myc 蛋白质或c-myc激活剂至哺乳动物内的内耳。

在某些实施方式中,通过施用Notch蛋白质、NICD蛋白质或Notch 激活剂至受试者的内耳增加Notch的活性,以得出最终浓度为大于约 30μM,例如,范围为约30μM至约1000μM。在某些实施方式中,可 以施用足够量的Notch蛋白质、NICD蛋白质或Notch激活剂以得出最 终浓度为大于约30μM。例如,可以施用足够量的Notch蛋白质、NICD 蛋白质或Notch激活剂以得出最终浓度为约30μM至约1000μM、5μM 至约1000μM、80μM至约1000μM、约100μM至约1000μM、约150 至约1000μM、约200μM至约800μM、或约200μM至约600μM。

在其他实施方式中,可向哺乳动物的内耳局部施用的Notch蛋白 质、NICD蛋白质或Notch蛋白质激活剂的施用剂量约0.025mg至约 4mg、约0.035mg至约2mg、约0.05mg至约2mg、约0.1mg至约2mg、 约0.2mg至约1mg、或者约0.2mg至约0.8mg。在一个实施方式中,局部施用0.5mgNotch蛋白质、NICD蛋白质或Notch激活剂到哺乳动物 内耳。在某些其他实施方式中,可以局部施用约0.05mg至约2mg、约 0.2mg至约2mg、约0.05mg至约1.5mg、约0.15mg至约1.5mg、约0.4mg 至约1mg、或约0.5mg至约0.8mg的Notch蛋白质、NICD30蛋白质或Notch激活剂到哺乳动物的内耳。

在某些实施方式中,在进行细胞增殖之后,通过施用Notch抑制 剂抑制Notch活性。可以施用一种Notch抑制剂以得出最终浓度为大于 约30μM,例如,范围为30μM至约1000μM。在某些实施方式中,可 以施用足够量的Notch抑制剂以得出最终浓度为大于约30μM。例如, 可以施用足够量的Notch抑制剂以得出最终浓度为约30μM至约 1000μM、50μM至约1000μM、80μM至约1000μM、约100μM至约 1000μM、约150至约1000μM、约200μM至1000μM、或约200μM至 约600μM。在某些实施方式中,施用足够量的Notch抑制剂以得出最 终浓度为约400μM。

在其他实施方式中,可向哺乳动物的内耳局部施用的Notch抑制 剂的施用剂量为约0.025至约4mg、约0.035至约2mg、约0.05mg至 约2mg、约0.1mg至约2mg、约0.2mg至约1mg、或约0.2mg至约0.8mg。 在一个实施方式中,局部施用0.5mg的Notch抑制剂到哺乳动物的内耳。在某些其他实施方式中,可以局部施用约0.05mg至约2mg、约0.2mg 至约2mg、约0.05mg至约1.5mg、约0.15mg至约1.5mg、约0.4mg至 约1mg、或约0.5mg至约0.8mg的Notch抑制剂到哺乳动物的内耳。 在一些实施方式中,局部施用约0.7mgNotch抑制剂到哺乳动物的内耳。

在某些实施方式中,通过在受试者的内耳中施用Atohl蛋白质或 Atohl激活剂增加Atohl活性,以得出,例如,最终浓度为大于约30μM, 例如,范围为约30μM至约1000μM。在某些实施方式中,可以施用足 够量的Atohl蛋白质或Atohl激活剂以得出最终浓度为大于约30μM。 例如,可以施用足够量的Atohl蛋白质或Atohl激活剂以得出最终浓度 为约30μM至约1000μM、50μM至约1000μM、80μM至约1000μM、 约100μM至约1000μM、约150μM至约1000μM、约200μM至约800μM、 或约200μM至约600μM。

在其他实施方式中,可向哺乳动物的内耳局部施用的Atohl蛋白 质或Atohl激活剂的施用剂量为约0.025mg至约4mg、约0.035mg至约 2mg、约0.05mg至约2mg、约0.1mg至约1mg、约0.2mg至约1mg、 或约0.2至约0.8mg。在一个实施方式中,局部施用0.5mgAtohl蛋白质 或Atohl激活剂到哺乳动物的内耳。在某些其他实施方式中,可以局部 施用约0.05mg至约2mg、约0.2mg至约2mg、约0.05mg至约1.5mg、 约0.15mg至约1.5mg、约0.4mg至约1mg或约0.5mg至约0.8mg的 Atohl蛋白质或Atohl激活剂到哺乳动物的内耳。

DNA的递送

在一些方面,使用本领域已知的表达构建体(例如,裸DNA构建 体、基于DNA载体的构建体和/或病毒载体和/或基于病毒的构建体) 以表达编码所需c-myc、Notch或Atohl蛋白质的核酸,可以提高靶细 胞中c-myc、Notch或Atohl的活性。在某些实施方式中,表达c-myc 和Notch或NICD为两个分离的基因的单个DNA构建体可以被递送到 所述对象的内耳。在某些实施方式中,表达c-myc和Notch或NICD和 Atohl作为三个分离的基因的单个DNA构建体可被递送进入对象的内 耳。

示例性的表达构建物可被配制为药物组合物,例如,用于施用于 对象。

DNA构建体和这些构建体的治疗用途为本领域的技术人员所熟 知(参见,例如,Chiarella et al.(2008)Recent Patents Anti-Infect.Drug Disc.3:93-101;Gray etal.(2008)Expert Opin.Biol.Ther.8:911-922;Melman et al.(2008)Hum.Gene Ther.17:1165-1176)裸DNA构建体通常包括一 种或多种治疗性核酸(例如,编码c-myc和/或Notch的DNA)和启动 子序列。一种裸DNA构建体可以是通常称为pDNA的DNA载体。裸 DNA通常并不整合到染色体DNA中。通常,裸DNA构建体不需要脂 质、聚合物、或病毒蛋白质的存在或不用于结合存在的脂质、聚合物 或病毒蛋白质。这些构建体也可以包括在此所描述的一个或多个非治 疗组分。

DNA载体在本领域中是已知的,并且通常是环状双链DNA分子。 DNA载体的大小的范围通常为3-5千碱基对(例如,包括插入的治疗 性核酸)。与裸DNA类似,DNA载体可用来在靶细胞中递送和表达 一种或多种治疗性蛋白质。DNA载体并不整合到染色体DNA中。

一般地,DNA载体包括允许在靶细胞中复制的至少一种启动子序 列。通过结合DNA载体与,例如,阳离子脂质,并形成DNA复合体 可促进DNA载体的摄取。通常,病毒载体是来源于病毒的双链环状 DNA分子。病毒载体通常在大小方面大于裸DNA和DNA载体构建体 并具有更大的用于导入外源(即,非病毒编码)基因的容量。与裸DNA 和DNA载体类似,病毒载体可用来在靶细胞内递送和表达一种或多种 治疗性核酸。不同于裸DNA和DNA载体,某些病毒载体稳定地融入 染色体DNA中。通常,病毒载体包括至少一种启动子序列,其允许在 宿主细胞中复制的一个或多个载体编码的核酸,例如,治疗性核酸。 病毒载体可以任选地包括在此所描述的一种或多种非治疗组分。有利 的是,病毒载体到靶细胞的摄取不需要额外的组分,例如阳离子脂质。 相反,病毒载体在与靶细胞直接接触时转染或感染细胞。

本文所描述的方法包括使用逆转录病毒载体、腺病毒衍生载体和/ 或腺伴随病毒载体作为重组基因递送系统以在体内尤其是人体内转移 外源基因。用这种病毒在体外或体内产生重组逆转录病毒并感染细胞 的方案可以参见《现代分子生物学实验技术》(Ausubel,F.M.et al.(eds.)Greene Publishing Associates,(1989),Sections 9.10-9.14)以及其 他标准实验室手册。

用作DNA载体和病毒载体(如腺病毒、逆转录病毒和慢病毒)的转 导药剂的病毒可以用于实施本发明。示例性的逆转录病毒包括,但不 限于:莫洛尼氏鼠白血病病毒(M-MULV)、莫洛尼鼠类肉瘤病毒 (MoMSV)、哈维鼠肉瘤病毒(HaMuSV)、鼠乳腺肿瘤病毒(MuMTV)、 长臂猿白血病病毒(GaLV)、猫白血病抗病毒(FLV)、泡沫病毒、 弗云德小鼠白血病病毒、鼠干细胞病毒(MSCV)和鲁斯氏肉瘤病毒 (RSV)和慢病毒。如本文所用,术语“慢病毒”是指一种复合物逆转 录病毒的病毒组(属)。示例性慢病毒包括但不限于:HIV(人类免疫 缺陷性抗病毒;包括HIV型1和HIV型2);绵羊脱髓鞘性脑白质炎- 羊慢性进行性肺炎病毒(VMV);山羊关节炎-脑炎病毒(CAEV); 马传染性贫血病病毒(EIAV);猫免疫缺陷抗病毒(FIV);牛免疫 虚病毒(BIV);以及猿免疫缺陷病毒(SIV)。

在某些实施方式中,可根据本文所述方法来使用腺病毒。可以操 作腺病毒的基因组使得它编码并表达目的基因产物,但是所述产物在 正常裂解病毒生活周期中复制能力方面是失活的。合适的腺病毒载体 来源于腺病毒株Ad型5dl324或腺病毒的其他株(例如Ad2、Ad3、Ad7 等)是本领域技术人员已知的。重组腺病毒在某些情况下可以是有利 的,因为它们没有能力感染非分裂细胞并且可以用于感染各种各样的 包括上皮细胞的细胞类型。此外,病毒颗粒相对稳定,易于纯化和浓 缩,并且如上所述,可被修饰以影响感染谱。另外,导入的腺病毒脱 DNA(和其中包含的外源DNA)不会整合到宿主细胞的基因组中,但 保持附加体形式,从而避免因原位插入诱变而导致的潜在的问题,在 原位处,导入的DNA逐渐整合进宿主基因组(例如逆转录病毒DNA)。 此外,相对于其他基因递送载体,腺病毒基因组携带外源DNA的能力 较强(可达8千碱基对)。

腺伴随病毒是天然存在的缺陷型病毒,它需要额外的病毒(如腺 病毒或疱疹病毒)作为辅助病毒以实现有效复制和生产性生命周期。 还可以是少数可以将其DNA整合到非分裂细胞并表现出高频率稳定整 合的病毒之一。

在各种实施方式中,通过直接注射将一种或多种病毒载体施用到 对象体内的细胞、组织或器官,所述病毒载体表达编码本发明的一种 或多种多肽的一种或多种治疗性转基因(例如,Atohl、Notch、c-myc)。

在各种其他的实施方式中,使用包封在病毒中的此类载体在体外 或离体情况下转导细胞,并且任选地离体扩增。然后,然后将经转导 的细胞施用到对象的内耳。适合于转导的细胞,包括但不限于干细胞、 祖细胞及分化细胞。在某些实施方式中,转导的细胞是胚胎干细胞、 骨髓干细胞、脐带干细胞、胎盘干细胞、间充质干细胞、神经干细胞、 肝脏干细胞、胰腺干细胞,心脏干细胞、肾脏干细胞、造血干细胞、 内耳毛细胞、iPS细胞、内耳支持细胞、耳蜗细胞或椭圆囊细胞。

在特定实施方式中,把使用表达一种或多种多肽的本发明的病毒 载体转导的宿主细胞施用到对象以治疗和/或预防听力病症、紊乱或病 况。涉及可根据本发明的某些实施方式使用的病毒载体的用途的其他 方法,可参见,例如Kay(1997)CHEST 111(6Supp.):138S-142S;Ferry et al.(1998)HUM.GENE THER.9:1975-81;Shiratory et al(1999)LIVER 19:265-74;Oka et al(2000)CURR.OPIN.LIPIDOL.11:179-86;Thule et al(2000)Gene Ther.7:1744-52;Yang(1992)CRIT.REV. BIOTECHNOL.12:335-56;Alt(1995)J.HEPATOL.23:746-58;Brody et al(1994)ANN.N.Y.ACAD.SCI.716:90-101;Strayer.(1999)EXPERT OPIN.INVETIG.DRUGS8:2159-2172;Smith-Arica et al.(2001)CURR.CARDIOL.REP.3:43-49;和Lee et al.(2000)NATURE 408:483-8。

在本发明的一些实施方式中,可能会希望使用细胞特异性表达控 制序列、细胞类型特异性表达控制序列、细胞谱系特异性表达控制序 列或组织特异性表达控制序列来实现所需的多核苷酸序列的细胞类型 特异性表达、谱系特异性表达或组织特异性表达,例如,以表达仅按 照细胞类型的子集、细胞谱系或组织或在发育的特定阶段中编码多肽 的特定核酸。细胞特异性表达控制序列、细胞类型特异性表达控制序 列、细胞谱系特异性表达控制序列或组织特异性表达控制序列的示例 性实施例包括但不限于所有毛细胞的Atohl增强子(例如,参见图24); 所有毛细胞的Pou4f3启动子(例如,参见图25);所有毛细胞的Myo7a 启动子(例如,参见图26);前庭支持细胞和耳蜗内指骨细胞、Deiters 细胞和Pillar细胞的Hes5启动子(参见,例如图27);以及前庭支持 细胞和耳蜗内指骨细胞、Deiters细胞和Pillar细胞的GFAP启动子(参 见,例如图28)。

本发明的特定实施方式提供了所关注的多核苷酸的条件表达。例 如,通过对细胞、组织、生物体等进行处理或放于某种条件下来控制 表达,所述处理或某种条件使多核苷酸被表达或增加或减少由所关注 的多核苷酸编码的多核苷酸的表达。诱导型启动子/系统的示例性实施 例包括但不限于,类固醇-诱导型启动子例如编码糖皮质激素或雌激素受体的基因的启动子(可通过相应激素处理诱导)、金属硫蛋白启动 子(可通过各种重金属处理诱导)、MX-1启动子(可由干扰素诱导)、 “基因开关”米非司酮可调控系统(Sirin etal 2003,Gene,323:67)、 cumate-诱导型基因开关(WO2002/088346)、四环素-依赖型调控系统 等。

还可通过使用位点特异性DNA重组酶实现条件表达。根据本发明 的某些实施方式,载体包括至少一个(通常两个)位点以用于由位点 特异性重组酶介导的重组。如本文所用,术语“重组酶”或“位点特 异性重组酶”包括参与涉及一个或多个重组位点(例如,两个、三个、 四个、五个、七个、十个、十二个、十五个、二十个、三十个、五十 个等)的重组反应的切除式或整合式的蛋白质、酶、辅因子或相关联 的蛋白质,这些可以是野生型蛋白质(参见Landy(1993)CURFENT OPINIONIN BIOTECHNOLOGY 3:699-707)或它们的突变体、衍生 物(例如,含有重组蛋白质序列或其片段的融合蛋白质)、片段和变 体。适用于本发明特定实施方式的重组酶的示例性实施例包括但不限 于Cre、Int、IHF、Xis、Flp、Fis、Hin、Gin、OC31、Cin、Tn3解离 酶、TndX、XerC、XerD,TnpX、Hjc、Gin、SpCCEl.和ParA。

载体可以包括用于很多种位点特异性重组酶中的任何一种的一个 或多个重组位点。应当理解的是,位点特异性重组酶的目标位点是除 了载体(例如,逆转录病毒载体或慢病毒载体)整合所需的(多个) 任何位点之外的位点。

在某些实施方式中,载体包含也称为选择性标记的选择基因。典 型的筛选基因可编码蛋白质,例如,编码杆菌的D-丙氨酸消旋酶的基 因,所述蛋白质能够(a)赋予对抗生素或其他毒素(例如,氨苄青霉 素、新霉素、潮霉素、甲氨碟呤、博莱霉素、杀稻瘟素或四环素)的 抗性;(b)弥补营养缺陷;或(c)提供复合培养基没有的关键营养成 分。可以使用任何数量的选择系统来恢复转化细胞系。这些基因包括 但不限于,单纯疱疹病毒胸苷激酶(Wigler et al.,(1977)CELL 11: 223-232)基因和腺嘌呤磷酸核糖转移酶(Lowy et al.,(1990)CELL 22: 817-823)基因,所述基因可以分别用于tk-或aprt-细胞中。

产生本文所述表达构建体需要的所有分子生物学技术都是本领域 的技术人员所理解的标准技术。

在某些实施方式中,例如正如在美国专利号5,543,158;5,641,515; 和5,399,363(明确地将每个专利整体地并入以作为参考)中所描述的 在耳内、肠胃外、静脉内、肌肉内或甚至腹膜内可能会发生DNA递送。 可以在适当地混有表面活性剂(例如羟丙基纤维素)的水中制备诸如 游离碱或药理学上可接受的盐的活性化合物的溶液。还可在甘油、液 体聚乙二醇及它们的混合物中以及在油中制备分散体。在正常的储藏 和使用条件下,这些制剂含有防腐剂以防止微生物的生长。

在某些实施方式中,通过使用任选地与细胞穿透多肽混合的脂质 体、纳米胶囊、微粒、微球体、脂质颗粒、囊泡等实现DNA递送,以 将本发明的组合物中引入到合适的宿主细胞中。具体地,为了输送可 将本发明的组合物配制成包封于脂质颗粒、脂质体、囊泡、纳米球体、 纳米颗粒或其他形式。可以使用已知常规技术对此类递送载体进行配 制和使用。

离体DNA递送的示例性配制方法还可包括使用本领域已知的各 种转染药剂(例如磷酸钙)、电穿孔、热激和各种脂质体配制方法(即, 脂质-介导的转染)。本发明的特定实施方式可包含其他配制方法,例 如制药领域中是众所周知的配制方法,并且在例如,Remington:The Science and Practice of Pharmacy,20th Edition.Baltimore,MD:Lippincott Williams&Wilkins,2000中进行描述。

递送的持续时间

可以改变c-myc、Notch和Atohl激活的持续时间以实现所需的结 果。例如,可有利地将靶细胞暴露于c-myc蛋白质或c-myc激活剂与 Notch蛋白质、NICD蛋白质或Notch激活剂1-6天、1周、2周、3周、 1个月、3个月、6个月、9个月、1年、2年或更长时间。或者,当通 过组成性激活(例如,使用腺病毒来过度表达c-myc)使c-myc增加时, 通过在施用myc蛋白质或myc激活剂之后施用c-myc抑制剂可控制提 高的c-myc活性的持续时间。在提高的c-myc活性一段时间之后抑制 c-myc活性,这可以用于控制增殖,促进细胞存活率,并避免肿瘤发生。

类似地,如上面所讨论的,在施用Notch蛋白质、NICD蛋白质或 Notch激活剂之后施用Notch抑制剂可以控制提高的Notch活性的持续 时间。

给药和配制途径

给药途径会取决于所治疗的病症而变化。可采用全身给药和/或局 部给药的直接疗法治疗毛细胞损失、感觉神经听力损失和前庭障碍。 在某些实施方式中,可由对象健康护理人员或医生例如在对对象进行 评估后确定给药的途径。

本发明提供了(i)一种组合物,该组合物用于增殖或再生耳蜗毛 细胞或椭圆囊毛细胞;(ii)一种组合物,该组合物用于增殖或再生耳 蜗支持细胞或椭圆囊支持细胞;(iii)一种组合物,该组合物用于减少 对象的听力损失、维持对象的听力或促进对象的听力;以及(iv)一种 组合物,该组合物用于减少对象前庭功能的损失、维持对象前庭功能 或促进对象前庭功能。因此,本发明提供了第一组合物,所述第一组 合物包括例如上述药剂的每一种药剂,例如,使用前述方法的每一种 单独地或与药物上可接受的载体结合的在毛细胞或支持细胞中增加 c-myc活性的药剂和/或增加Notch活性的药剂。此外,本发明提供第 二组合物,所述第二组合物包括上述药剂的每一种药剂,例如,使用 前述方法的每一种单独地或与药物上可接受的载体结合的在毛细胞或 支持细胞中减少或抑制c-myc活性的药剂和/或降低或抑制Notch活性 的药剂。当对支持细胞进行再生时,本发明提供了第三组合物,所述 第三组合物包括诸如提高Atohl活性的药剂的药剂以诱导将增殖的支 持细胞转分化成毛细胞。

在某些实施方式中,可将c-myc蛋白质或c-myc激活剂和Notch 蛋白质、NICD蛋白质或Notch激活剂配制成含有适当的载体和/或赋形 剂的药物组合物。

可将c-myc蛋白质或激活剂和/或Notch蛋白质、NICD蛋白质或 Notch激活剂和/或Atohl蛋白质或激活剂溶解在诸如粘弹性载体的载体 中,将所述载体局部导入到内耳中。在其他实施方式中,可将c-myc 蛋白质或激活剂和/或Notch蛋白质、NICD蛋白质或Notch激活剂和/ 或Atohl蛋白质或激活剂溶解在脂质体或微球中。将药物或药物组合递 送到脂质体和/或微球中的方法是本领域中公知的。

此外,可以想到的是,可以配制c-myc蛋白质或激活剂和/或Notch 蛋白质、NICD蛋白质或Notch激活剂和/或Atohl蛋白质或激活剂,从 而使得在长时间段释放一种或多种蛋白质和/或激活剂。释放系统可以 包括生物可降解材料或释放出掺入的活性剂的材料的基质。可均匀地 或不均匀地将活性剂分布在释放系统中。各种释放系统可用于实施本 发明的过程中,然而,选择适当系统会取决于特定药物给药方案所需 的释放速率。可以使用不可降解的释放系统和可降解的释放系统。合 适的释放系统包括聚合物和聚合物基质、非聚合物基质或无机和有机 赋形剂和稀释剂,例如但不局限于,碳酸钙和糖(例如海藻糖)。释放系统可以是天然的或人工合成的。

在某些实施方式中,可使用全身给药途径将所述药剂施用给对象, 例如诊断为需要进行毛细胞损失治疗的对象。全身给药途径可以包括 但不限于,肠胃外给药途径,例如静脉注射、肌肉注射和腹腔内注射 液;肠内给药途径,例如通过口服途径、糖锭、压缩片、丸剂、片剂、 胶囊、滴剂(例如,滴耳剂)、糖浆、悬浮液和乳液给药;直肠给药, 如直肠栓剂或灌肠剂;阴道栓剂;尿道栓剂;透皮给药途径;以及吸 入剂(例如,鼻喷雾剂)。

可替换地或另外地,可使用局部给药途径将所述药剂施用于对象, 例如诊断为需要进行毛细胞损失治疗的对象。这种局部给药途径包括 例如通过注射和/或使用泵将一种或多种化合物给药到对象的耳中和/ 或对象的内耳中。

在某些实施方式中,可将所述药剂注射到耳中(例如,耳给药), 例如注射到耳蜗的网眼(luminae)(例如,蜗管、前庭阶(Scala vestibulae) 和鼓阶)。例如,所述药剂可以通过鼓室内注射(例如,进入中耳) 给药,和/或通过注射到外耳、中耳和/或内耳中给药。例如,对于把类 固醇和抗生素给药到人耳中而言,这些方法是本领域常规使用的方法。 可以例如通过耳的圆窗或通过耳蜗胶囊进行注射。

在其他实施方式中,可以通过纳米颗粒(例如蛋白质包被的纳米 颗粒)传递所述药剂。基于包被纳米颗粒的配体的细胞类型特异性受 体亲合力,可将纳米颗粒靶向到所关注的细胞。通过调控每剂量给药 的纳米颗粒的量可调节所述药剂的剂量。

可替换地,可使用导管或泵将所述药剂给药到内耳中。例如,导 管或泵可将药剂导入到耳蜗网眼或耳的圆窗。在美国专利公开号 2006/0030837和美国专利号7,206,639中说明了适于将一种或多种化合 物施用到耳(例如,人耳)中的示例性药物递送系统。在某些实施方式中, 在外科手术期间,导管或泵可位于例如对象的耳(例如,外耳、中耳 和/或内耳)中。

可替换地或另外地,可以结合机械装置(例如耳蜗植入物或助听 器)递送所述药剂,对象可将所述机械装置戴在外耳中。在美国专利 公开号2007/0093878中描述了适用于本发明使用的示例性的耳蜗植入 物。

在某些实施方式中,上述给药的方式可以以任何顺序组合并且可 同时的或交替的。例如,可以同时地或顺序地将所述药剂给药到对象。 应理解的是,当同时给药时,药剂可以在同样的药学上可接受的载体 (例如,溶解在导入内耳中的相同粘弹性载体中)中或两种药剂可以 溶解或分散在分开的药物载体中,所述两种药剂被同时施用。可选择 地,可以以分开剂量的形式提供所述药剂并顺序地给药。

可替换地或另外地,可根据例如正如CDER数据标准手册,版本 号004(参见fda.give/cder/dsm/DRG/drg00301.htm)描述的食品和药品 管理局批准方法中的任一项方法施用所述药剂。

3.药剂到离体毛细胞和支持细胞的递送

已经认识到,将所关注的药剂递送到体内的毛细胞和支持细胞的 概念还可适用于将所关注的药剂递送到离体的毛细胞和支持细胞。可 以使用本领域已知和常用的技术获得和培养毛细胞和支持细胞。然后 可将药剂(蛋白质表达载体)、激活剂和抑制剂(例如,如上所述的 抑制剂)与培养的毛细胞或支持细胞接触以诱导细胞重新进入细胞周 期,并且增殖。此后,一旦细胞已经增殖,可以使用适当的抑制剂(例 如上面讨论的抑制剂)对c-myc和Notch活性进行抑制。然后可在培养 中维持所得毛细胞以用于各种应用(包括,例如用于研究毛细胞和/或 支持细胞的生物特性、生物物理特性、生理和药理特性)。可选地,然后使用标准外科手术可将所得毛细胞植入到受试者的内耳中。

在某些实施方式中,合适细胞可来自哺乳动物,例如人、小鼠、 大鼠、猪、绵羊、山羊或非人灵长类动物。在某些实施方式中,可从 对象的内耳中获得此类细胞,并且可从以下来源获得此类细胞,所述 来源包括柯蒂氏耳蜗器官、耳蜗的耳蜗轴(中心)、耳蜗的螺旋神经 节,囊状斑的前庭感觉上皮、椭圆囊斑或半规管的体嵴。可替换地或 另外地,所述方法包括从动物的内耳获得组织,其中所述组织包括椭 圆囊斑的至少一部分。

可将从对象分离的组织悬浮在中性缓冲液,例如磷酸盐缓冲盐水 (PBS)中,并且随后组织消化酶(例如胰蛋白酶、亮肽素和胰凝乳蛋 白酶等)或酶的组合,或机械(例如,物理)力,例如研碎进行处理, 以将组织分成较小的片。可替换地或另外地,可以使用两种机制的组 织裂解。例如,可在约0.05%的酶(例如,约0.001%、0.01%、0.03%、 0.07%或1.0%的酶)下培养约5分钟、10分钟、15分钟、20分钟或30 分钟,并且在培养后,可将细胞机械裂解。经裂解的组织可以通过装 置(例如过滤器或口移液管),所述装置从分化的细胞或细胞碎屑分 离出干细胞或祖细胞。细胞的分离可以包括使细胞通过具有逐渐变小 孔径的一系列过滤器。例如,过滤孔径的范围可以约为80μm或更小、 约70μm或更小、约60μm或更小、约50μm或更小,约40μm或更小, 约30μm或更小、约35μm或更少,或者约20μm或更小。

可在培养中保持部分分化细胞和/或完全分化的细胞(例如,通过 上述方法产生的细胞)以用于各种用途,包括例如用于研究毛细胞和/ 或支持细胞的生物特性、生物物理特性、生理和药理特性。可使用患 有听力损失和/或前庭功能损失的对象的内耳细胞建立细胞培养来开发 潜在治疗方法(例如,筛选治疗听力损失和/或前庭功能损失有效的药物)。另外,可结合多能干细胞(iPS)技术使用本发明的方法以建立 细胞系(例如,毛细胞系和/或支持细胞系)。例如,使用已知技术(参 见,例如Oshima et al.(2010)CELL 141(4):704-716)可诱导听力损失 对象的成纤维细胞以生成iPS细胞。然而,因为使用iPS细胞技术生成 细胞的数目是有限的,所以可结合iPS细胞技术使用本文提供的方法以 产生足够数量的细胞,从而建立细胞系(例如,毛细胞系和/或支持细 胞系)。

可将部分分化的细胞和/或完全分化的细胞(例如,通过上述方法 产生的细胞)通过注射例如以细胞悬浮液的形式移植或植入到内耳中, 例如移植或植入到耳蜗的网眼中。例如,可通过耳的圆窗或通过围绕 耳蜗的骨胶囊进行注射。通过圆窗可将细胞注射到内耳道中的听力神 经干中或鼓阶中。在某些实施方式中,本文所述的细胞可用于例如, 如美国专利公开号2007/0093878所描述的耳蜗植入物中。

为了改善移植细胞或植入细胞的移入能力,可在分化之前对细胞 进行修饰。例如,可对细胞进行改造以过表达一种或多种抗凋亡基因。 Fak酪氨酸激酶或Akt基因是可用于此目的的候选抗凋亡基因;FAK 或Akt的过表达可防止螺旋神经节细胞的死亡并且当螺旋神经节细胞 被移植到另一器官(例如柯蒂氏器官(参见,例如Mangi et al.,(2003)NAT.MED.9:1195-201))中时,提高移入成活率。过量表达αvβ3 整联蛋白的神经祖细胞可增强神经突延伸到组织外植体中,原因在于 已示出整联蛋白可介导神经突从层粘蛋白底物上的螺旋神经节神经元 的延伸(Aletsee et al,(2001)AUDIOLNEUROOTOL6:57-65)。在 另一个实施例中,例如,可通过使用RNAi沉默或使用外源性表达的 cDNA的过表达可以改变肝配蛋白B2和肝配蛋白B3的表达,从而修 饰EphA4信号传导事件。已经显示出由来自EphA4的信号引导螺旋神 经节神经元,通过肝配蛋白B2和B3(Brors et al.,(2003)J.COMP.NEUROL.462:90-100)的细胞表面表达对EphA4进行介导。 引导信号的失效可提高达到在成年内耳中的目标的神经元的数目。可 以将诸如神经营养因子BDNF和NT3及LIF的外源因子添加到组织移 植物中以增强在体内和离体组织培养中神经突朝向目标组织的延伸及 其生长。可以通过添加神经营养因子(BDNF、NT3)和LIF(Gillespie et al.,(2010)NEUROREPORT 12:275-279)来增强感觉神经元的神 经突延伸。

4.靶细胞中c-myc、Notch或Atohl活性的测定

这里所描述的方法和组合物可以用于诱导细胞(例如成年哺乳动 物内耳细胞),从而使其重新进入细胞周期并且增殖。例如,相比于 治疗前毛细胞的数量,毛细胞的数量可增加大约2倍、3倍、4倍、6 倍、8倍或10倍或更多倍。可在体内或体外诱导毛细胞以使其重新进 入细胞进入细胞周期。能够预期到,使用这些方法可以改善受试者的 听力。例如,使用本文所述方法和组合物可以将受试者的听力,相对 于治疗前的听力提高至少约5%、10%、15%、20%、40%、60%、80% 或90%。还可进行听力或前庭功能的测试以测量听力改善的状况。

可以对接触过(i)c-myc蛋白质或c-myc激活剂和/或(ii)Notch 蛋白质、NICD蛋白质或Notch激活剂的细胞进行指示重新进入细胞进 入细胞周期的和增殖的标记的测定。在一个实施例中,可以通过使用 例如抗-EdU抗体和抗-BrdU抗体测定细胞是否掺入EdU(5-乙炔基-2’- 脱氧尿苷)之后依次掺入BrdU(5-溴-2’-脱氧尿苷)。由EdU和/或BrdU 进行的标记可指示细胞增殖。另外,可使用EdU和BrdU的双重标记 以说明细胞经历了至少两次分裂。可替换的或另外地,可以测定细胞 是否存在磷酸化的组蛋白H3(Ph3)或极光激酶B,这些指示细胞重新 进入细胞周期并且经历分裂中期和胞质分裂。

细胞标记还可以用于确定靶细胞(例如毛细胞或支持细胞)是否 已经进入细胞进入细胞周期的。指示毛细胞的示例性标记包括Myo7a、 Myo6、Prestin、Lhx3、Dner、espin、小清蛋白和钙网膜蛋白。指示支 持细胞的示例性标记包括Sox2、S100al、Proxl、Rps6和Jagl。细胞周 期标记和/或增殖标记以及细胞型分子的双重标记可用于确定哪些细胞 已重新进入细胞周期并且正在增殖。

此外,神经元标记(例如,乙酰化微管蛋白、神经丝和CtBP2) 可用于检测神经元结构,从而确定正在增殖的毛细胞是否与神经元相 接触。存在邻近或接触毛细胞的神经元标记表明新生成的毛细胞已经 与神经元(例如,神经节神经元)形成突触并且表明毛细胞已发生分 化。

如果合适,在治疗之后,可检测对象(例如患者)的听力或其他 与内耳疾病相关的症状是否得到改善。测定听力的方法是众所周知的, 并且包括纯音测听、空气传导、听力脑干反应(ABR)和骨导测试。 这些检查测量人能够听到响度(强度)和音调(频率)的范围。人类 的听力测试包括行为观察测听(对于至7个月的婴儿)、视觉强化取 向测听(对于7个月至3岁的儿童)以及游戏测听(对于3岁以上的 儿童)。Oto-声发射测试可用于测试耳蜗毛细胞的功能,并且耳蜗电图 描记术提供关于耳蜗和通到大脑的神经通路的第一部分的功能的信 息。在某些实施方式中,在修饰或没有修饰的情况下可继续治疗或可 停止治疗。

在整个说明书中,其中将组合物描述为具有、包括或包含特定组 分,或将过程阐述为具有、包括或包含特定过程步骤,可以想到本发 明的组合物还由或基本由所述组分组成,并且本发明的过程还由或基 本由所述的处理步骤组成。此外,应当理解的是,步骤的顺序或进行 某些操作的次序并不重要,只要本发明仍能操作即可。此外,可同时 进行两个或更多步骤或操作。

实施例

通过下列实施例对本发明做进一步说明,提供这些实施例只是用 于说明的目的,而不应解释为以任意方式对本发明的范围或内容做出 限制。

实施例1:通过C-Myc和Notch使成年耳蜗细胞重新进入细胞周 期的体内诱导

本实施例将说明,把c-myc和Notch供给到成年动物的内耳细胞 可以诱导使分化的耳蜗毛细胞和支持细胞重新进入细胞周期并且进行 细胞增殖。

鼠龄在1至15个月的成年小鼠可用于研究c-myc和Notch在诱导 耳蜗毛细胞和支持细胞重新进入细胞周期、增殖、分化和存活方面的 潜能。在单独的实验中,使用的小鼠是野生型(WT)背景的小鼠或带 有LoxP侧接的NICD盒(NICDflox/flox)的小鼠,所述NICD盒易于 发生能够激活NICD表达的Cre介导的重组。NICD盒编码(5'-3')小 鼠Notch1的细胞内片段(氨基酸1749-2293,缺少C-末端PEST域, 参见Murthaugh et al.(2003)PROC.NATL.ACAD.SCI.U.S.A.100(25): 14920-14925)。麻醉小鼠并进行耳蜗造口术,从而能够注射腺病毒。 通过蜗管注射病毒,便于感染耳蜗感觉上皮中的毛细胞和支持细胞。 分别将带有人的c-myc(Ad-Myc)和CRE-GFP(Ad-Cre-GFP)表达盒 或c-myc和NICD(Ad-NICD)表达盒的结合体的腺病毒的混合物注射 到NICDflox/flox或WT小鼠的耳蜗中。对每只小鼠的一只耳进行注射, 而另一只耳作为未注射的对照。另外的对照用于耳蜗仅注射有 Ad-Cre-GFP的情况。Ad-Myc诱导myc过量表达;Ad-NICD诱导NICD 过表达;并且Ad-CRE-GFP诱导CRE-GFP的过表达,在LoxP序列侧 接的位点的重组,以及在NICDflox/flox小鼠情况下NICD的过表达。 等份混合2x1012噬斑形成单位(pfU)效价的病毒,并且对每只动物 注射总共0.6μL的病毒。在病毒注射后,在1-5天内每天注射5-溴-2- 脱氧尿苷(BrdU)。

在病毒注射后4、8、12、35或60天时处死小鼠,并且获得耳蜗。 并且在整体装片免疫染色之前对耳蜗进行解剖、固定及脱钙。通过使 用抗Myo7a和espin的抗体来标记以标识毛细胞。通过使用抗Sox2的 抗体来标记以标识支持细胞。通过使用抗BrdU的抗体来标记以评估重 新进入细胞周期及增殖。通过暴露于DAPI来实现细胞核标记。

分析通过病毒注射而暴露于c-myc和NICD的耳蜗上皮细胞以确 定是否出现了重新进入细胞周期和增殖的现象。在病毒注射后4、8或 12天获得注射有Ad-Cre-GFP和Ad-Myc和之后BrdU给药的 NICDflox/flox小鼠的耳蜗并且进行免疫染色(图7)。在所有分析的 时间点上,免疫染色的切片显示出存在有如BrdU+/Myo7a+(图7A、B、 E、K、L、O、P、Q、T,实心箭头)染色所确定的进入细胞周期的毛 细胞。在注射后4天,BrdU+/Sox2+(图7A、B、E,空心箭头)染色 显示,该种群中的支持细胞也重新进入细胞周期。这些发现证明,在 暴露于c-myc和NICD后可以诱导耳蜗毛细胞和支持细胞重新进入细胞 进入细胞周期的。在注射病毒12天时观察BrdU-标记的毛细胞对(假 设为衍生自相同细胞分裂的子代细胞),证明在c-Myc和NICD暴露 后诱导重新进入细胞周期的细胞可以在随后进行增殖(图7,P-T,箭 头)。此外,在任何时间点(图7,F-J,显示4天的时间点)上,在 未注射的对照耳中没有观察到耳蜗细胞中的BrdU染色现象。这些观察 表明,将分化的耳蜗毛细胞和支持细胞暴露于提高水平的c-myc和 Notch活性能够诱导这些种群重新进入细胞周期。

对在病毒注射后更远的时间点时诱导重新进入细胞周期的毛细胞 和支持细胞的体内细胞存活率进行评估。在注射病毒后35天时获得感 染Ad-Cre-GFP和Ad-Myc病毒并且随后进行BrdU注射的 NICDflox/flox小鼠的耳蜗组织,并且进行免疫染色以评估进入细胞周 期的毛细胞和支持细胞的重新进入细胞周期的情况以及存活率。对该 时间点处染色耳蜗的分析再次表明,存在毛细胞和支持细胞的增殖(图8)。观察到在进行BrdU标记的耳蜗上皮中BrdU阳性染色的并且在病 毒注射后35天时获得的Myo7a阳性毛细胞(图8,A-E,箭头)。在 相同动物中,可观察到BrdU标记的Sox2阳性支持细胞(图8,K-0, 空心箭头)。还显出其中由Notch激活Sox2的正在分裂的毛细胞(图 8M,箭头)。这些观察结果表明,在暴露于提升水平的c-myc和Notch 活性后诱导重新进入细胞周期的支持细胞和毛细胞可以在体内存活至 少35天。还能观察到在c-Myc和NICD病毒暴露之后于这个时间点显 示出静纤毛的BrdU-标记的毛细胞(图8,F-J,J分图中的箭头)。这 个发现表明,诱导重新进入细胞周期的毛细胞或它们的后代保持了分 化的毛细胞的外形特性。

在一组相似的实验中,将Ad-Myc和Ad-NICD的混合物注射到 WT小鼠的蜗管中,之后1-5天内每天对其施用BrdU。在病毒注射后 2-35天的时间点获得耳蜗并且进行免疫染色。使用抗BrdU、Myo7a和 Sox2抗原的抗体进行的免疫染色显示出在获得的耳蜗中存在双重标记 的毛细胞(BrdU+/Myo7a+)和支持细胞(BrdU+/Sox2+)。(数据未 示出)。因此,将WT背景的分化的毛细胞和支持细胞暴露于提升水 平的c-myc和Notch活性中也能诱导使其重新进入细胞周期以及进行增 殖。

实施例2:通过C-Myc和Notch体内诱导老龄小鼠的耳蜗细胞重 新进入细胞周期

下面的实施例表明,将c-myc和Notch提供到内耳细胞还可以诱 导老年动物对象的分化的耳蜗毛细胞和支持细胞重新进入细胞周期并 且进行细胞增殖。

通过耳蜗造口术将Ad-Myc和Ad-Cre-GFP一次注射到17月龄 NICDflox/flox小鼠的耳蜗蜗管中,并且在15天后获得动物。注射0.3μ l等量的效价为2xl012的Ad-GFP和Ad-Cre-Myc的混合物。还每天注 射一次BrdU(50μg/g体重),共15天以标记进入细胞周期的细胞。 使用相同的方案作为对照,其中仅将Ad-Cre注射到耳蜗中。在BrdU 和病毒注射后获得的耳蜗组织表明,老龄小鼠的细胞经历重新进入细 胞周期的过程,这由存在的双标记的毛细胞(BrdU+/Myo7a+)和支持 细胞(BrdU+/Sox2+;图9,A-J;箭头表示双重标记的毛细胞;无尾箭 头表示双重标记的支持细胞)所证实。相反,在仅注射有Ad-Cre并且 经受相同的BrdU标记时程(图9K-O)的17个月大小的NICDflox/flox 对照动物的Sox2+支持细胞或Myo7a+毛细胞中没有观察到BrdU标记。

这些结果表明,老龄小鼠内耳的毛细胞和支持细胞可实现增殖, 这说明老龄人类内耳能够得到相似的效果。

实施例3:对从各种哺乳动物的内耳组织获得的培养的成年细胞重 新进入细胞周期的诱导

下面的实施例表明,暴露于提升水平的c-myc和Notch活性中利 于成年小鼠、猴类和人类内耳的毛细胞和支持细胞重新进入细胞周期 并且进行增殖。

为了研究提升水平的c-myc和Notch活性是否能诱导人类细胞重 新进入细胞周期并且进行增殖,对成年人类耳蜗和椭圆囊组织进行收 集。样品来源于外科手术,在外科手术期间丢弃此类组织。将细胞培 养在补充有N2和B27(培养基和补充物均来自Invitrogen/GIBCO/BRL, Carlsbad,CA)的高葡萄糖Dulbecco修饰的Eagle培养基和F12培养 基中,然后加入1%FBS。

把108的工作病毒效价用于5mL的培养物。使收集的组织和经转 导培养细胞的培养物与Ad-Myc和Ad-NICD的混合物接触,从而提高 细胞水平的c-myc和NICD。在暴露于病毒后,通过将3μg/mlBrdU施 用到培养物,进入细胞周期的细胞被标记。如同在转导小鼠组织的体 内研究中一样,对在培养的人类组织(图10)中的BrdU-标记的支持 细胞(Sox2+)和至少一种BrdU-标记的毛细胞(Myo7a+)进行标识。

在耳蜗培养物(图10A、C、D、E)和椭圆囊培养物(图10F、H、 I、J;所有分图,空心箭头)标识出BrdU+/Sox2+支持细胞。实际上耳 蜗细胞培养物不含有毛细胞,因此没有标识到BrdU-标记的耳蜗毛细 胞。暴露于病毒会在椭圆囊培养物中产生很少标记的毛细胞,这可能 是腺病毒对毛细胞低传染率的结果。然而,在人类椭圆囊培养物中标 识出至少一种BrdU+/Myo7a+毛细胞(图10F、G、I、J;实心箭头)。

利用获得的小鼠椭圆囊作为培养组织进行相似的基于培养的实 验。在之后的实验中,从NICDflox/flox或WT小鼠得到组织并且将所 述组织分别感染Ad-Myc/Ad-Cre-GFP或Ad-Myc/Ad-NICD的混合物。 在病毒转导后,将细胞暴露于BrdU来标记进入细胞周期的细胞。加入 BrdU使其最终浓度为3μg/ml。如同在基于人类椭圆囊培养物的实验中, 在小鼠培养物中观察到BrdU-标记的毛细胞和支持细胞,这表明这些细 胞在暴露于提升水平的Notch和c-myc活性下能够重新进入细胞周期。 在这些培养物中观察到BrdU-标记的毛细胞和支持细胞的实施例,尽管 多数BrdU-标记的细胞是支持细胞。基于这些发现,看来提升的c-myc 和Notch活性会诱导培养的内耳毛细胞和支持细胞重新进入细胞周期 并且进行增殖。

另外,对从成年猴类获得的培养的耳蜗进行实验。培养基包含供 有N2和B27而无血清的DMEM/F12。培养的耳蜗暴露于 Ad-Myc/Ad-NICD混合物(最终效价为109)16小时,并且使用新鲜培 养基取代培养基持续4天。加入EdU使其最终浓度是10μM。通过EdU 给药另外地标记进入细胞周期的细胞。将培养的耳蜗固定和染色以具 有毛细胞标记和支持细胞标记,及EdU。在暴露于提升水平的c-Myc 和NICD(图11G、H、J;无尾箭头)后观察到进入细胞周期的Sox2+/EdU+ 支持细胞。因此,该实施例表明,在暴露于提升水平的c-Myc和Notch 活性下,猴类内耳的细胞也可以受到诱导而进行增殖,这表明所公开 的方法能够适用于小鼠以外的哺乳动物,例如,灵长类。在EdU存在 下Ad-Cre感染的培养的猴类耳蜗对照中,没有看到EdU标记的细胞(图 11A-E),证明没有细胞进行增殖。通常在培养的小鼠耳蜗和猴类的耳蜗中观察到的是,与体内的小鼠耳蜗相比,存活的内毛细胞很少重新 进入细胞周期,在体内的小鼠耳蜗中,通过c-Myc和NICD的组合内 毛细胞可以容易地受诱导而增殖。可能的是,内毛细胞需要更高浓度 的Myc和NICD和更多的时间来增殖,因为培养中使用的效价不像体内效价(109相比于1012)那么高并且在感染后很短的时间内(4天) 获得组织。

实施例4:耳蜗细胞亚种群的细胞增殖的剂量依赖性诱导

以下实施例说明,在不同程度的暴露于c-myc和Notch活性时耳 蜗毛细胞的不同种群受诱导而增殖。

将渗透泵(Alzet)植入到多西环素可诱导的成年(45日龄)小鼠 (rtTa/tet-on-Myc/tet-on-NICD)的背部中,渗透泵的管道插入到圆窗龛 以在9天内以每小时1μl的速率连续地分配多西环素(DMSO中 150mg/ml),并通过腹膜内注射每天一次同时进行EdU给药(200μg/g 体重)来标记增殖细胞。用这一过程中,在包括支持细胞和毛细胞(数 据未显示)的所有耳蜗细胞类型中激活c-Myc和NICD。由于手术过程, 该样品中的耳蜗丢失了所有外部毛细胞,仅存在支持细胞和一些内毛 细胞。将耳蜗细胞暴露于这种水平的c-myc和NICD使Sox2+支持细胞 增殖(图12B、C、E;箭头)。通过对比,在暴露于这些水平的c-myc 和NICD时Parv+内毛细胞未显示出分裂(图12A、E;无尾箭头)。

另外,rTta/Tet-on-myc/Tet-on-NICD小鼠模型用于检查外部毛细胞 增殖的诱导情况。在图12描述的相同的过程之后,将 rTta/Tet-on-myc/Tet-on-NICD小鼠暴露于多西环素12天,伴随的是在 这12天内每天一次进行EdU给药以标记进入细胞周期的细胞。然后获 得组织并且对其染色以标记毛细胞(Esp)和支持细胞(Sox2)。在这 种情况下,在组织获得和染色后,能观察到EdU+/Esp+增殖的外部毛 细胞(图13A、B、E;箭头)。在内毛细胞中没有观察到细胞的增殖。 由于该方法能在所有耳蜗细胞类型中激活c-Myc和NICD,该实施例表 明将外部毛细胞暴露于提升水平的c-Myc和Notch活性中可以选择性 地诱发外部听毛重新进入细胞周期并且进行增殖。在相同的耳蜗中, 还发现标记有EdU的较少的支持细胞(相对于外部毛细胞)(数据未 显示),这与如下观察结果一致,即在c-Myc和NICD激活之后外部 毛细胞具有更强的强力重新进入细胞周期。该样品(图13)与图12中 所示的样品形成对比,区别在于大部分的外部毛细胞能够存活并显示 出增强的增殖能力。这还表明在外部毛细胞损失之后,在c-Myc和NICD 激活时(图12)支持细胞可受到诱导而增殖。

总之,这些结果表明,虽然耳蜗毛细胞和支持细胞的所有种群在 暴露于提升水平的c-myc和Notch活性时可以受到诱导而分化,但耳蜗 内的不同亚种群对不同水平的c-myc和Notch暴露会做出不同的响应。 例如,与支持细胞和内毛细胞相比,外部毛细胞会对较低水平的c-myc 和Notch刺激做出响应。与内毛细胞相比,支持细胞会对较低水平的 c-myc和Notch刺激做出响应,但需要比外部毛细胞更高水平的c-myc 和Notch刺激。与支持细胞和外部毛细胞相比,内毛细胞表现出需要更 高水平的c-myc和Notch刺激以促进细胞增殖。

实施例5:Myc和Notch暴露生成的毛细胞的功能特性

下列实施例说明,通过应用本文所述方法生成的毛细胞具有功能 性毛细胞的特性。

在提升的Myc和Notch暴露程度所生成的毛细胞中评估是否存在 毛细胞功能所必需的信号转导通道。使用耳蜗造口术将Ad-Cre-GFP和 Ad-Myc混合物注射到45日龄NICDflox/flox小鼠的蜗管中。在腺病毒 注射后的5天内每天进行EdU注射以标记增殖的毛细胞。在病毒注射 后35天时,解剖小鼠的耳蜗并与荧光染料FM1-43FX培养30秒,之 后洗涤并固定耳蜗。将固定的组织脱钙,并且用Espin(Esp)染色以 标记毛细胞。通过EdU对经历增殖的细胞进行标记。图14示出,在 EdU暴露后(EdU-)之后未重新进入细胞周期的对照Esp+毛细胞摄取 FM1-43FX(图14,A-E)。值得注意的是,在Ad-Myc/Ad-NICD病毒 注射和EdU暴露(EdU+)后重新进入细胞周期的Esp+毛细胞也摄取 FM1-43FX(图14,F-J)。当FM1-43FX通过功能性转导通道迅速进 入毛细胞时,FM1-43FX的标记说明在与类似于非增殖毛细胞的增殖毛 细胞中存在功能性转导通道。该结果表明,暴露于提升的Myc和Notch 活性生成的毛细胞具有毛细胞功能所必需的功能性膜通道。

评估暴露于体内提升水平的c-Myc和Notch活性的细胞中突出形 成的情况。使用Ad-Myc/Ad-Cre病毒混合物转导成年(45日龄) NICDflox/flox小鼠,并对其进行BrdU给药,分析如图9所述的功能性 突触形成的证明。在病毒注射后20天时获得组织并用染色神经丝(NF) 来识别神经节神经元的神经纤维。对染色切片进行的分析显示存在与 NF+神经纤维(图15A、C、E;箭头)相接触的增殖的毛细胞 (Myo7a+/BrdU+)。这种结果表明,通过本文所公开的方法生成毛细 胞的过程伴有神经纤维的再生长过程以及对于毛细胞功能至关重要的功能性突触的形成过程。

实施例6:诱导在体内增殖的毛细胞保持特定毛细胞的同一性

以下实施例说明,通过对现有内毛细胞进行诱导增殖在体内生成 的内毛细胞保持内毛细胞特有的性质。

使用Ad-Myc/Ad-Cre病毒混合物体内转导成年NICDflox/flox小鼠 的耳蜗15天,在前5天内每天注射BrdU。所使用的方法与图9所描 述的那些方法相同。获得耳蜗组织并对其分析内毛细胞-特异性标记。 经历重新进入细胞周期(图16A-E;箭头)的内毛细胞以及未重新进入 细胞周期(图16A-E;无尾箭头)的内毛细胞对水泡性谷氨酸转运蛋白 -3(Vglut3),即内毛细胞特异性标记染色呈阳性。此外,相同的细胞 对作为突触前标记的C-末端结合蛋白质2(CtBP2)(方括号)也染色 呈阳性,表明存在功能性突触。相反,在暴露于Ad-GFP的对照动物中 未观察到BrdU标记,尽管检测到Vglut3+/CtBP2+内毛细胞(图16F-J,方括号)。结果表明,通过暴露于提升水平的c-myc和Notch活性对内 毛细胞进行诱导增殖能生成具有功能性突触的标记的内毛细胞。

实施例7:增殖支持细胞在培养物中的转分化

下面的实施例表明,本文所述方法的应用可用于诱导内耳支 持细胞的增殖并且转分化到毛细胞的命运。

使用在多西环素诱导(rTta/Tet-on-Myc/Tet-on-NICD)之后能 够表达提升水平的myc和Notch的小鼠模型进行实验。将成年小鼠 (rTta/Tet-on-Myc/Tet-on-NICD)耳蜗切开,在骨上钻出三个孔以有效 地暴露于培养基中并且在供有N2和B27而无血清的DMEM/F12进行 培养。将多西环素(1mg/ml)加入到培养基,培养5天,以激活 c-Myc/NICD,随后进行16小时的Ad-Atohl(2x1012,1:100稀释度) 感染。在另外的14天内把培养基换成新鲜培养基,每3天更换培养基。 在整个时期内把EdU(最终浓度10μM)加入到培养物中。观察到通 过暴露于多西环素而诱导以表达提升的NICD和myc水平的支持细胞 进行细胞增殖,这由EdU标记(图17A-E,无尾箭头和实心箭头)所 证实。此外,暴露于Ad-Atohl造成进入细胞周期的支持细胞(图17A、 C、E,实心箭头)和未进入细胞周期的支持细胞(图17B、C、E,开 放箭头)转分化到毛细胞命运,这可以由Myo7a和小清蛋白(Parv) 色所证实。对照——暴露于Ad-Atohl(而不是多西环素)培养的 rTta/Tet-on-Myc/Tet-on-NICD支持细胞进行分化,但未能重新进入细胞 周期(图17F-J,箭头),这由Myo7a+/Parv+/EdU-细胞的存在所证实。 在类似的实验中,将从rTta/Tet-on-Myc/Tet-on-NICD小鼠获得的培养 出的耳蜗支持细胞暴露于多西环素和Ad-Atohl病毒,并且之后暴露于 FM1-43FX(3μM)30秒以研究由该方法生成的毛细胞是否具有功能性 毛细胞的特性。对该方案处理的细胞进行Esp染色揭示出在转分化支 持细胞中发束的存在,将转分化支持细胞对FM1摄取染色呈阳性,这 显示存在功能性膜通道(图17K、O;箭头)。用FM1标记其他转分 化的细胞,但这些细胞没有显示出重新进行细胞周期的迹象,因为它 们是EdU阴性的(图17K、O;箭头)。因此,培养的耳蜗支持细胞 暴露于提升水平的myc和Notch,然后Atohl诱导支持细胞增殖并使其 转分化成毛细胞命运,其中所生成的细胞具有功能性毛细胞的特性。

实施例8:内耳组基因表达的诱导

为了理解提升的c-myc和Notch活性如何影响细胞命运,研究在 暴露于c-Myc和NICD后表达的mRNA转录本。

培养成年NICDflox/flox小鼠耳蜗并且使其感染 Ad-Myc/Ad-Cre-GFP一夜(2x1012 1:100稀释度)。从第二天开始,在 接下的4天内每天更换培养基。把Ad-Cre-GFP感染的NICDflox/flox 小鼠耳蜗作为对照。使用QIAGENmRNA分离试剂盒获得感染的耳蜗 以进行mRNA分离。用Life ScienceTechnology SuperScript III逆转录 酶试剂盒合成cDNAs。使用标准方案进行半定量RT-PCR。不同组的 转录本的分析表明,在c-myc和NICD暴露之后,干细胞基因转录本(例 如,Nanog、ALPL、SSEA)未被显著上调。相反,在c-myc和NICD暴 露之后大部分对耳祖细胞(例如,Eyal、DLX5、Sixl、Pax2、P27kip1、 NICD、Prox1、Hes5)具有特异性的所分析转录本被上调(图18)。 将GAPDH用作正常化信号强度的内部对照。这些结果显示出与使用胚 胎干细胞相比,使用本文公开的方法具有固有的决定性优势。具体地, 这些结果证明暴露于提升的c-Myc和Notch活性使祖细胞水平提升, 而不是提升干细胞水平,这很可能使得内耳细胞重新进入细胞周期并 保持所期望的细胞命运。

引入作为参考

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