一种基于蛋白质家族聚类的PPI知识图谱表示学习方法

摘要

本发明的基于蛋白质家族聚类的PPI知识图谱表示学习方法，通过以下步骤来实现：a).PPI知识图谱中实体分类；b).预表示学习；c).构建子父类损失函数；c‑1).距离误差平方和的计算；c‑2).距离误差平方和的归一化处理；d).进行总体训练；d‑1).通用模型的训练；d‑2).基于子父类损失函数的训练；e).通过步骤d)多次训练。本发明的PPI知识图谱表示学习方法，将基于子父类损失函数的表示学习模型应用于蛋白质相互作用知识图谱，通过同源蛋白和蛋白质家族的子父类关系进行表示学习训练，在蛋白质功能和互作用推理中具有更好的准确率、可靠性和可解释性。