一种基于转录组测序获得青篱柴SSR引物的方法

摘要

本发明公开了一种基于转录组测序获得青篱柴SSR引物的方法。本发明通过对青篱柴进行转录组测序及序列分析，开发了大量的分子标记，从中筛选出了8对多态性引物，其步骤如下：（1）转录组测序；（2）SSR特性分析（3）筛选SSR位点；（4）SSR引物设计；（5）DNA提取；（6）SSR引物合成；（7）SSR引物筛选；（8）6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选多态性引物。本发明通过对20个来自不同地理位置的青篱柴样品进行DNA扩增及检测，发现上述8对多态性引物，其多态性丰富，重复性好，可应用于青篱柴遗传资源评价、引种栽培、种质资源多样性评价、亲缘关系鉴定，遗传连锁图谱构建和分子标记辅助育种。