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确定lncRNA是否来源于假基因的方法

摘要

本发明公开了确定lncRNA是否来源于假基因的方法,其包括以下步骤:分别获得待测lncRNA的基础生物信息和所述待测lncRNA所属物种的所有假基因的基础生物信息;基于所述待测lncRNA与各假基因在染色体上的物理位置关系,进行第一来源确定处理,其中,当不存在与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因时,判定所述待测lncRNA不是假基因来源;当存在与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因时,选择与所述待测lncRNA具有序列重合情形的假基因作为所述待测lncRNA的候选假基因,并按照如下步骤进行第二来源确定处理:计算待测lncRNA与候选假基因的序列重合度I;以及基于序列重合度I,确定待测lncRNA是否来源于所述候选假基因。利用该方法可在全基因组水平批量检测假基因来源的lncRNA。

著录项

  • 公开/公告号CN108509766A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-09-07

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 北京林业大学;

    申请/专利号CN201710621910.5

  • 发明设计人 张德强;李英;谢剑波;

    申请日2017-07-27

  • 分类号

  • 代理机构北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人赵天月

  • 地址 100083 北京市海淀区清华东路35号

  • 入库时间 2023-06-19 06:27:06

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-10-09

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/18 申请日:20170727

    实质审查的生效

  • 2018-09-07

    公开

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