采用生物信息学方法筛选与肺腺癌患者预后相关的LncRNAs

摘要

目的 采用生物信息学的方法探讨差异表达长链非编码RNA (lncRNAs)与肺腺癌患者预后的关系.方法 从国际肿瘤数据库(TCGA)下载肺腺癌组织及癌旁组织的RNA测序数据和患者的临床信息,采用R语言程序包筛选差异表达的lncRNAs.应用Kaplan Meier生存曲线(Log Rank检验)及Cox回归模型进行预后分析.结果 筛选出差异表达lncRNAs共计168个,其中上调的lncRNAs有128个,下调的lncRNAs有40个.单因素和多因素回归分析结果显示:RP11-490M8.1(P=0.047)、RP11-132A1.4(P=0.049)、DRAIC(P=0.023)、LINC00942 (P=0.033)、TMPO-AS1 (P=0.006)、Z83851.4(P=0.032)和LINC01133 (P=0.035)是肺腺癌患者的独立预后因素.结论 该研究筛选出7个lncRNAs,可作为肺腺癌患者预后的独立标志物,为临床医生对肺腺癌患者的预后判断提供帮助.