一种基于RP-SAX-RP平台的蛋白质组序列分析方法

摘要

本发明公开了一种基于RP‑SAX‑RP平台的蛋白质组序列分析方法，其展示了基于高PH反相‑强阴离子交换‑低PH反相的自动化纳升级流速3DLC‑MS/MS平台的分离手段来分析复杂蛋白质组；在分析来自大肠杆菌的胰蛋白酶肽时，RP‑SAX‑RP优于RP‑RP技术，而且实现了对每个酿酒酵母细胞出现50个拷贝水平蛋白质的鉴定，相应于在低分辨率的3‑D离子阱质谱仪上来自40μg总裂解物的500amol的检测极限；在LTQ‑Orbitrap上进行了相似的研究，在单个101fractionRP‑SAX‑RPLC‑MS/MS吸收分析下，从5μg总酵母裂解物中产生超过4000个特异性蛋白质，为每个细胞50拷贝数的蛋白质表达提供了约65amol的检测上限。