一种基于相似性和双随机游走的微生物‑疾病关系预测方法

摘要

本发明公开了一种基于相似性和双随机游走的微生物‑疾病关系预测方法，首先利用疾病基因关系和基因功能相似性信息构建疾病功能相似性；再根据已知的微生物疾病关系构建疾病高斯核相似性；在疾病功能相似性和高斯核相似性的基础上集成疾病最终相似性。微生物的相似性来源于已知微生物疾病关系的高斯核相似性。再将微生物相似性信息，疾病相似性信息，已知的微生物疾病关系信息集成到一个双层异构网络中。利用双随机游走方法在异构网络中进行微生物疾病关系预测。本发明能够对微生物疾病之间的关系进行预测，为生物实验提供基础依据，节省其人力物力成本。