抗体互补决定区构象指纹数据库

摘要

本发明涉及抗体互补决定区构象指纹数据库，属于生物信息学领域。对于每个抗体蛋白，包括名称，氨基酸序列，互补决定区片段范围，全信息构象指纹共四组数据，所述的氨基酸序列和互补决定区片段范围，从蛋白知识数据库获得，所述的全信息构象指纹，分两种情况处理：对于已知三维结构的抗体蛋白，从蛋白数据库里获得全部结构数据，并用蛋白折叠形状码表示；对于未知结构的抗体蛋白，对抗体互补决定区的三维空间构象进行预测得到构象谱带。本发明不仅包含了抗体蛋白序列的一级结构和有规则的二级结构，而且扩展涵盖了无规则的三级结构。可以采用构象指纹的相似性分数标记抗体互补决定区构象特征，为抗体互补决定区的分类提供新的参数。