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针对不平衡样本上基因关联分析的误差提升方法

摘要

本发明提出一种针对不平衡样本上基因关联分析的误差提升方法,包括以下步骤:将健康样本随机划分为L个子集,每个子集的样本数目与患病样本的数目相同;将每个健康样本子集与患病样本进行结对,得到L个样本组合,并在每一个样本组合中,挑选出子集所对应的关键基因位点;根据各个关键基因位点在不同样本组合下发现的次数,对每一个样本组合的重要程度进行得分评估;计算每个健康个体被分配到相应样本组合的得分的均值,将均值作为个体级别的置信分数;对每个健康个体的置信分数进行归一化,并将归一化之后得到的分数通过加权逻辑斯特回归进行分析,以检验每一个关键基因位点的统计显著性。本发明的方法能够显著提高在不平衡数据下的分析能力。

著录项

  • 公开/公告号CN107247889A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-10-13

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 清华大学;

    申请/专利号CN201710334884.8

  • 发明设计人 戴琼海;鲍峰;索津莉;

    申请日2017-05-12

  • 分类号

  • 代理机构北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人张润

  • 地址 100084 北京市海淀区清华园

  • 入库时间 2023-06-19 03:28:47

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-11-10

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/18 申请日:20170512

    实质审查的生效

  • 2017-10-13

    公开

    公开

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