分析生物基因组基因表达、拷贝数变异的可视化方法

摘要

本发明公开了一种分析生物基因组基因表达、拷贝数变异的可视化方法，每个染色体的所有基因，按照每个基因的起始位置作为横坐标，用matlab软件中的独立样本检验函数ttest2，每个基因会得到一个P值，然后对P值进行处理，然后规定两组样本的颜色，确定Y轴朝向，用matlab中的line函数绘制线，确定百分比值。本发明的可视化方法，在两种癌症类型下进行基因表达量或者拷贝数变异对比的时候，或者在同一个癌症类型下正常类型样本和肿瘤类型样本的基因表达量或者拷贝数变异对比的时候可以直观的反映哪种类型的癌症或者哪种类型样本的值大；对于基因表达量，高级曼哈顿图可以直观显示出基因是过表达呢还是表达不足；对于拷贝数变异，高级曼哈顿图可以直观显示出基因是扩增还是丢失。