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一种快速鉴定野生草菇Vn单孢分离株同核体与异核体的方法

摘要

本发明涉及一种快速鉴定野生草菇Vn单孢分离株同核体与异核体的方法,包括:(1)野生草菇Vn菌株孢子的收集;(2)单孢分离株的获取;(3)单孢分离株同核体与异核体的鉴定。本发明与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验等方法相比,具有操作简便、检测时间短、准确性高等优点,可以用于草菇杂交工作中亲本菌株的同核体与异核体判断,从而大幅度提高草菇育种效率,加快草菇新品种的研发,具有良好的应用前景。

著录项

  • 公开/公告号CN105256026A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2016-01-20

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海市农业科学院;

    申请/专利号CN201510673891.1

  • 申请日2015-10-16

  • 分类号C12Q1/68;C12Q1/04;C12N1/14;C12R1/645;

  • 代理机构上海泰能知识产权代理事务所;

  • 代理人黄志达

  • 地址 201106 上海市闵行区北翟路2901号

  • 入库时间 2023-12-18 13:38:27

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2018-07-24

    授权

    授权

  • 2016-02-17

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/68 申请日:20151016

    实质审查的生效

  • 2016-01-20

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明属于草菇菌株标记及检测领域,特别涉及一种快速鉴定野生草菇Vn单孢分离株 同核体与异核体的方法。

背景技术

草菇(Volvariellavolvacea(BullexFr.)Sing)又名稻草菇、中国菇,属担子菌纲,伞菌目, 光柄菇科,小包脚菇属。草菇味道鲜美,营养丰富,鲜品中含蛋白质2.66%,脂肪2.24%,还 原糖1.66%,转化糖0.95%,灰分0.91%。在草菇蛋白质中含有18种氨基酸,包含人体不能够 合成的8种必需氨基酸。除食用价值外,草菇还具有提高人体免疫力、抑制癌细胞生长、解毒 等功效。在草菇栽培出菇中,完全使用天然原料(如稻草、玉米芯、棉籽壳等),符合现代 人对绿色食品的要求。因此草菇一直深受人们的喜爱,是我国传统的出口创汇产品,远销至 美国、加拿大、英国、日本、新加坡、马来西亚等国家和地区。

由于草菇被认为是一种初级同宗结合的真菌,其菌丝细胞多核且无锁状联合,使得育种 者无法从形态上区分同核体与异核体,导致草菇遗传育种研究进展十分缓慢,只能借助传统 的驯化、组织分离、孢子分离等自然选择方法育种,造成草菇生产用种单一,严重阻碍了产 业的快速发展。面对这种情况,迫切需要开发一种快速鉴定草菇单孢分离株同核体与异核体 的检测方法,从而大大缩短草菇杂交育种进程,加快草菇新品种的研发。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是提供一种快速鉴定野生草菇Vn单孢分离株同核体与异核 体的方法,该方法与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验等方法相比,具有操作简便、检 测时间短、准确性高等优点;该方法可用于草菇杂交工作中亲本菌株同核体与异核体的判断, 从而大幅度提高草菇育种效率,促进草菇新品种的研发。

本发明的一种快速鉴定野生草菇Vn单孢分离株同核体与异核体的方法,包括:

(1)采用常规方法进行栽培出菇,待草菇Vn菌株的子实体进入成熟期后,将子实体置于孢 子收集器中,孢子收集器置于30-32℃培养箱中收集Vn菌株的孢子;

(2)挑取收集到的孢子,用无菌水稀释,血球计数板计数,然后进行梯度稀释,在加有氨苄 青霉素的PDA平板上涂布,置于30-32℃培养箱中培养;待孢子刚萌发时,挑取单个菌落于 新的PDA平板上培养,获得Vn单孢分离株;

(3)提取Vn单孢分离株的基因组DNA,然后以特异性检测标记引物为扩增引物,进行PCR 扩增,所得PCR产物经电泳检测后,即可区分Vn单孢分离株为同核体或异核体;其中,特 异性检测标记引物为A3F:GGAATGGTGCCCGACACGATACAG;

A3R:GGGTGTTGTTGAGGTTCGGTTGC;

A4F:TTGGTGCGGTCATCAACATTAG;

A4R:GTGAGCGGGTGATGTTGACGAT。

所述步骤(1)中的孢子收集器内放有灭菌好的滤纸。

所述步骤(3)中的PCR扩增反应体系为:总体积25μL,12.5μL扩增混合液,待扩增基 因特异性引物对各0.5μL,50ng/μLDNA模板0.5μL,ddH2O11μL(选用北京天恩泽基因科技 有限公司的即用型PCR试剂盒)。

所述步骤(3)中的PCR扩增反应条件为:94℃预变性3min;94℃变性30s,55℃退火 30s,72℃延伸1min,共35个循环;72℃补平10min。

所述步骤(3)中的电泳检测具体为:将PCR扩增产物与等体积的6×溴酚蓝上样缓冲液 充分混匀,取5μL混合液在1.5%的琼脂糖凝胶上进行电泳;电压设为100V,电泳时间为0.5h, 待电泳结束后使用EB染色,并在紫外凝胶成像系统上进行拍照。

所述步骤(3)中的区分同核体或异核体的标准为:同核体扩增出其中一条条带,异核体 扩增出两条条带。

本发明通过克隆野生草菇Vn菌株的交配型基因序列,并分析序列的保守性,建立以交 配型基因为分子标记的快速鉴定野生草菇Vn单孢分离株同核体与异核体的方法。A3F/A3R、 A4F/A4R引物扩增出的DNA序列如SEQIDNO.5和SEQIDNO.6所示。

有益效果

(1)本发明的鉴定方法与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验等方法相比,具有操作简便、 检测时间短、准确性高等优点;

(2)利用本发明可以鉴定野生草菇Vn单孢分离菌株的同核体与异核体,应用于草菇单孢杂 交工作中亲本的筛选,从而大大缩短育种周期,加快草菇新品种的研发。

附图说明

图1为野生草菇Vn单孢分离菌株为同核体,其中1、2、3单孢分离株为A3类型的同核体, 4、5、6单孢分离株为A4类型的同核体;

图2为野生草菇Vn单孢分离菌株为异核体,其中1、2单孢分离株为A3/A4类型的异核体。

具体实施方式

下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不 用于限制本发明的范围。此外应理解,在阅读了本发明讲授的内容之后,本领域技术人员可 以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。

实施例1

野生草菇Vn菌株孢子的收集

制备野生草菇Vn菌株的栽培种,采用常规方法进行栽培出菇,待Vn菌株的子实体进入 成熟期后,将子实体置于孢子收集器中,孢子收集器内放有灭菌好的滤纸,置于32℃恒温培 养箱中收集Vn菌株的孢子。

草菇Vn菌株常规栽培出菇的操作步骤如下:

(1)将棉籽壳和生石灰按照95:5(W)的比例混匀,润湿后堆制发酵3d作为培养料;

(2)将发酵好的培养料移至实验菇房的床架上,巴氏灭菌9h,冷却至31℃接种Vn菌 株;

(3)在草菇Vn菌株子实体生长期间,实验菇房的温度保持在30-32℃。

野生草菇Vn单孢分离株的获取

用灭菌的枪头挑取少量收集到的孢子,用无菌水稀释,血球计数板计数,并进行梯度稀 释,在加有氨苄青霉素的PDA平板上涂布,置于32℃恒温培养箱中培养。待孢子刚萌发时, 挑取单个菌落于新的PDA平板上培养,获得Vn的单孢分离株。

单孢分离株同核体的鉴定

提取Vn单孢分离株的基因组DNA,并以下述的特异性检测标记引物为扩增引物,引物 的序列如下:

A3F:GGAATGGTGCCCGACACGATACAG;

A3R:GGGTGTTGTTGAGGTTCGGTTGC;

A4F:TTGGTGCGGTCATCAACATTAG;

A4R:GTGAGCGGGTGATGTTGACGAT。

进行PCR扩增,其中PCR扩增反应体系(25μL):北京天恩泽基因科技有限公司的即用 型PCR试剂盒扩增混合液12.5μL,待扩增特异性检测标记引物对各0.5μL,DNA模板 (50ng/μL)0.5μL,ddH2O11μL。PCR反应条件:94℃预变性3min;94℃变性30s,55℃退 火30s,72℃延伸1min,共35个循环;72℃补平10min。

将PCR扩增产物与等体积的6×溴酚蓝上样缓冲液充分混匀,取5μL混合液在1.5%的琼 脂糖凝胶上进行电泳;电压设为100V,电泳时间为0.5h,待电泳结束后使用EB染色,并在 紫外凝胶成像系统上拍照。若凝胶图像上显示只扩增出其中一条条带,即可鉴定Vn的单孢 分离株为同核体,如图1所示。

实施例2

野生草菇Vn菌株孢子的收集

制备野生草菇Vn菌株的栽培种,采用常规方法进行栽培出菇,待Vn菌株的子实体进入 成熟期后,将子实体置于孢子收集器中,孢子收集器内放有灭菌好的滤纸,置于32℃恒温培 养箱中收集Vn菌株的孢子。

草菇Vn菌株常规栽培出菇的操作步骤如下:

(1)将棉籽壳和生石灰按照95:5(W)的比例混匀,润湿后堆制发酵2d作为培养料;

(2)将发酵好的培养料移至实验菇房的床架上,巴氏灭菌10h,冷却至32℃接种Vn菌 株;

(3)在草菇Vn菌株子实体生长期间,实验菇房的温度保持在30-32℃。

野生草菇Vn单孢分离株的获取

用灭菌的枪头挑取收集到的孢子少量,用无菌水稀释,血球计数板计数,并进行梯度稀 释,在加有氨苄青霉素的PDA平板上涂布,置于32℃恒温培养箱中培养。待孢子刚萌发时, 挑取单个菌落于新的PDA平板上培养,获得Vn的单孢分离株。

单孢分离株异核体的鉴定

提取Vn单孢分离株的基因组DNA,并以下述的特异性检测标记引物为扩增引物,引物 的序列如下:

A3F:GGAATGGTGCCCGACACGATACAG;

A3R:GGGTGTTGTTGAGGTTCGGTTGC;

A4F:TTGGTGCGGTCATCAACATTAG;

A4R:GTGAGCGGGTGATGTTGACGAT。

进行PCR扩增,其中PCR扩增反应体系(25μL):北京天恩泽基因科技有限公司的即用 型PCR试剂盒扩增混合液12.5μL,待扩增特异性检测标记引物对各0.5μL,DNA模板 (50ng/μL)0.5μL,ddH2O11μL。PCR反应条件:94℃预变性3min;94℃变性30s,55℃退 火30s,72℃延伸1min,共35个循环;72℃补平10min。

将PCR扩增产物与等体积的6×溴酚蓝上样缓冲液充分混匀,取5μL混合液在1.5%的 琼脂糖凝胶上进行电泳;电压设为100V,电泳时间为0.5h,待电泳结束后使用EB染色,并 在紫外凝胶成像系统上拍照。若凝胶图像上显示扩增出两条条带,即可鉴定Vn的单孢分离 株为异核体,如图2所示。

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