公开/公告号CN105073197A
专利类型发明专利
公开/公告日2015-11-18
原文格式PDF
申请/专利权人 TG疗法有限公司;理森制药股份公司;分馏及生物技术法国实验室;
申请/专利号CN201380069143.1
申请日2013-11-01
分类号A61P35/00(20060101);A61K39/395(20060101);A61K45/06(20060101);A61K31/519(20060101);A61P37/00(20060101);
代理机构11240 北京康信知识产权代理有限责任公司;
代理人张英;宫传芝
地址 美国纽约
入库时间 2023-12-18 12:06:53
法律状态公告日
法律状态信息
法律状态
2019-06-28
授权
授权
2015-12-16
实质审查的生效 IPC(主分类):A61P35/00 申请日:20131101
实质审查的生效
2015-11-18
公开
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本申请要求于2013年3月2日提交的临时申请美国序列号61/771,812 的优先权,在此通过引用将其全部内容结合于此。
技术领域
在本文中提供了式A的化合物(PI3Kδ选择性抑制剂)与抗CD20 抗体的高度有效的组合用于治疗和改善PI3Kδ和/或CD20介导的疾病和 失调。特别是,该组合可以用于治疗癌症和自身免疫性疾病。更特别地, 本发明提供了式A的化合物或其立体异构体和ublituximab的组合用于治 疗和/或改善血液系统恶性肿瘤如白血病和淋巴瘤。
背景技术
有大量的证据表明,在多种人类癌症、特别是在血液系统恶性肿瘤中, PI3Kδ酶和CD20均单独地促成肿瘤发生。磷酸肌醇3-激酶(PI3K)是一 类酶家族,该类酶在所有细胞类型中通过产生磷酸肌醇第二信使分子调节 多种生物学功能。由于这些磷酸肌醇第二信使的活性是由它们的磷酸化状 态决定,起到修饰这些脂质的作用的激酶和磷酸酶对于细胞内信号转导事 件的正确执行是极为重要的。PI3K在肌醇环的3-羟基残基处磷酸化脂质 (Whitmanetal.,Nature332:664(1988))以产生磷酸化的磷脂(PIP3), 其起到招募(recruiting)具有脂质结合结构域(包括plekstrin同源(PH) 区)的激酶如Akt和磷酸肌醇依赖性激酶-1(PDK1)的第二信使的作用。 使Akt与膜PIP3的结合引起Akt移位(translocation)至质膜,使Akt与 PDK1(其负责活化Akt)接触。肿瘤抑制子磷酸酶PTEN(在染色体10 上缺失的磷酸酶和张力蛋白同源物)去磷酸化PIP3并且因此起到Akt活 化的负调节物的作用。PI3-激酶Akt和PDK1在许多细胞过程(包括细胞 周期调节、增殖、存活、凋亡和运动性)的调节中是重要的,并且是疾病 (如癌症、糖尿病和免疫炎症)的分子机制的重要组成部分(Vivancoetal., NatureRev.Cancer2:489(2002);Phillipsetal.,Cancer83:41(1998))。
PI3K家族是由四种不同的类组成:I类、II类、III类和IV类。I类-III 类是脂质激酶而IV类是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。
PI3K的I类家族的成员是调节和催化亚基的二聚体。I类家族由四种 同种型组成,这四种同种型是由110kDa的催化亚基(α、β、γ和δ)决 定的。参见EngelmanJ.A.,NatRevGenet7:606-619(2006);CarneroA.,Curr CancerDrugTargets8:187-198(2008);和VanhaesebroeckB.,Trends BiochemSci30:194-204(2005)。I类可分为两个亚类:Ia类,由pl10α、β 和δ和调节亚基(p85、p55或p50)的组合形成);和Ib类,由p110γ 和p101调节亚基形成。
由各研究小组已经公开了关于PI3K和相关蛋白激酶途径的研究,包 括:Liuetal.,NatureReviewsDrugDiscovery8:627-644(2009);Nathanetal, Mol.CancerTher.8(1)(2009);和Maroneetal.,BiochimicaetBiophysica Acta1784:159-185(2008)。两种已知PI3K抑制剂LY294002和渥曼青霉素 (Wortmannin)是非特异性PI3K抑制剂,因为它们不能区分I类PI3K的 四个成员:α、β、γ和δ。大量PI3K抑制剂已进入临床试验用于治疗癌症, 并且各种类型的癌(包括乳癌、非小细胞肺癌(NSCLC)和血液系统癌) 被认为是治疗感兴趣的区域。
CD20是具有35-37kDa分子量的疏水性跨膜蛋白,它存在于成熟B 淋巴细胞的表面上。在B淋巴细胞的发育期间,从早期B前体阶段时起 直到分化至浆细胞(在此阶段该表达消失)表达CD20。CD20存在于正常 B淋巴细胞和恶性B细胞,包括大多数非霍奇金氏B细胞淋巴瘤(NHL) 和B型慢性淋巴细胞性白血病(B-CLL)。CD20抗原不在造血干细胞或 浆细胞上表达。
抗CD20抗体已经被开发、并且持续的被开发用于B细胞疾病的治疗。 已经报道了抗CD20抗体利妥昔单抗的成功。然而,存在相当数量的患者, 这些患者用利妥昔单抗是难以治愈的或这些患者在利妥昔单抗(作为单一 药剂使用或者甚至与化疗方案联用)的长期治疗过程中发生抵抗。
因此,需要更有效的疗法用于治疗和/或改善与PI3Kδ酶和/或CD20 蛋白质的调节有关的疾病或失调,特别是用于治疗和或改善B细胞疾病。
发明内容
本发明涉及一种组合,该组合包含:式(A)的化合物,其是PI3Kδ 选择性抑制剂,
和其立体异构体、其互变异构体、其药学上可接受的盐、溶剂化物和前药, 以及至少一种抗CD20抗体。
该组合适合于在与PI3Kδ酶相关的和/或CD20蛋白相关的疾病、失调 或病况(condition)例如增生性疾病如癌症的治疗中使用。特别是,该组 合适用于治疗和/或改善B细胞疾病(例如,血液系统恶性肿瘤)。
因此,在一些实施方式中,提供了抑制细胞群体的增殖的方法。在一 些实施方式中,该方法包括使群体与包含以下的组合接触:(i)式A的 化合物、其立体异构体、其互变异构体或其药学上可接受的盐、溶剂化物 或前药,(ii)和抗CD20抗体或其抗原结合片段,其中,该抗CD20抗 体或片段结合于与ublituximab相同的表位(抗原决定基,epitope)。
在一些实施方式中,方法包括使细胞群体与包含以下的组合接触:(i) 式A的化合物、其立体异构体、其互变异构体或其药学上可接受的盐、溶 剂化物或前药,以及(ii)抗CD20抗体或其抗原结合片段,其中,该抗 CD20抗体或片段表现出对Fc-γRIII(CD16)的高亲和力。
在一些实施方式中,方法包括使细胞群体与包含以下的组合接触:(i) 式A的化合物、其立体异构体、其互变异构体或其药学上可接受的盐、溶 剂化物或前药,以及(ii)抗CD20抗体或其抗原结合片段,其中,该抗 体或片段的岩藻糖含量是小于65%。
在一些实施方式中,方法包括使细胞群体与包含以下的组合接触:(i) 式A的化合物、其立体异构体、其互变异构体或其药学上可接受的盐、溶 剂化物或前药,以及(ii)抗CD20抗体或其抗原结合片段,其中,该抗 体或片段包括序列SEQIDNO:1、2和3的VHCDR1、CDR2和CDR3 区和序列SEQIDNO:6、7和8的VLCDR1、CDR2和CDR3区。在一 些实施方式中,抗CD20抗体或其抗原结合片段包含SEQIDNO:4的VH 和SEQIDNO:9的VL。在一些实施方式中,抗CD20抗体是ublituximab。
在一些实施方式中,式A的化合物是
(RS)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1- 基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;或
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮。
在一些实施方式中,式A的化合物是(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙 氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4- 酮。
在一些实施方式中,抑制细胞群体增殖的方法包括使群体与包含以下 的组合接触:(i)至少一种选自由以下所组成的组中的化合物:2-(1-(4- 氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟 -3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H- 吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和 (R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及(ii)至少一种抗CD20抗体或 其抗原结合片段。
在一些实施方式中,抑制细胞群体增殖的方法包括使群体与包含以下 的组合接触:(i)选自由以下所组成的组中的化合物:2-(1-(4-氨基-3-(3- 氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯 基)-4H-色烯-4-酮;(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并 [3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和(R)-2-(1-(4-氨 基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3- 氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及(ii)至少一种抗CD20抗体或其抗原结合片 段,其中,该抗CD20抗体或其片段是选自由结合于与以下相同的表位的 抗体及其片段组成的组:ublituximab、利妥昔单抗、奥法木单抗、奥瑞珠 单抗(ocrelizumab)、维妥珠单抗、GA101、AME-133v、PRO131921、 托西莫单抗、hA20和PRO70769。
在一些实施方式中,使群体与包含以下的组合物接触:(i)选自由以 下所组成的组中的化合物:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及
(ii)抗CD20抗体。
在一些实施方式中,使群体与以下接触:(i)第一组合物,该第一组 合物包含选自由以下所组成的组中的化合物:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和
1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及
(ii)包含抗CD20抗体的第二组合物。
在一些实施方式中,群体包括B细胞。
在一些实施方式中,群体是在人受试者中。
在一些实施方式中,受试者患有与B细胞过度增殖相关的疾病或失 调。
在一些实施方式中,受试者患有癌症。在一些实施方式中,癌症是血 液系统恶性肿瘤。在一些实施方式中,血液系统恶性肿瘤是淋巴瘤或白血 病。在一些实施方式中,血液系统恶性肿瘤选自由以下所组成的组:急性 淋巴细胞性白血病(ALL)、急性粒细胞白血病(AML)、慢性淋巴细胞 性白血病(CLL)、小淋巴细胞性淋巴瘤(SLL)、多发性骨髓瘤(MM)、 非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)、套细胞淋巴瘤(MCL),滤泡性淋巴瘤、瓦 尔登斯特伦氏巨球蛋白血症(WM)、B细胞淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋 巴瘤(DLBCL)。在一些实施方式中,该癌症过量表达CD20。在一些实 施方式中,该癌症是化疗难治的。
在一些实施方式中,受试者患有自身免疫性疾病或失调。在一些实施 方式中,自身免疫性疾病或失调是过敏性鼻炎、哮喘、慢性阻塞性肺病 (COPD)或类风湿性关节炎。
在一些实施方式中,该受试者是利妥昔单抗难治的。
在一些实施方式中,受试者先前已使用化疗、利妥昔单抗或它们组合 治疗。
在一些实施方式中,顺序给予(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯 基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮和抗 CD20抗体或片段。
在一些实施方式中,同时给予(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯 基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮和抗 CD20抗体或片段。在一些实施方式中,(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧 基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮 和抗CD20抗体或片段包含于同一药物组合物中。在一些实施方式中, (S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮和抗CD20抗体或片段是在分离的药 物组合物中。
在一些实施方式中,方法进一步包括向受试者给予至少一种另外的治 疗剂。在一些实施方式中,至少一种另外的治疗剂选自由以下所组成的组: 蛋白酶体抑制剂、硼替佐米(),卡非佐米(PR-171)、 PR-047、双硫仑、乳胞素、PS-519、eponemycin、环氧霉素(epoxomycin)、 阿克拉霉素、CEP-1612、MG-132、CVT-63417、PS-341、乙烯砜三肽抑 制剂、利托那韦、PI-083,(+/-)-7-methylomuralide、(-)-7-methylomuralide、 来那度胺和它们的组合。
在一些实施方式中,方法进一步包括向受试者给予至少两种另外的治 疗剂,其中,至少两种另外的治疗剂选自由以下所组成的组:a)CHOP (环磷酰胺、多柔比星、长春新碱、泼尼松);b)R-CHOP(利妥昔单抗 -CHOP);c)超CVAD(超分割环磷酰胺、长春新碱、多柔比星、地塞 米松、甲氨喋呤、阿糖胞苷);d)R-超CVAD(利妥昔单抗-超CVAD); e)FCM(氟达拉滨、环磷酰胺、米托蒽醌);f)R-FCM(利妥昔单抗、 氟达拉滨、环磷酰胺、米托蒽醌);g)硼替佐米和利妥昔单抗;h)坦西 莫司和利妥昔单抗;i)坦西莫司和;j)碘-131托西莫单抗(百克 沙(Bexxar).RTM.)和CHOP;k)CVP(环磷酰胺、长春新碱、波尼松); 1)R-CVP(利妥昔单抗-CVP);m)ICE(异环磷酰胺、卡铂、依托泊苷); n)R-ICE(利妥昔单抗-ICE);o)FCR(氟达拉滨、环磷酰胺、利妥昔 单抗);p)FR(氟达拉滨,利妥昔单抗);和q)D.T.PACE(地塞米松、 沙利度胺、顺铂、阿霉素、环磷酰胺、依托泊苷)。
在一些实施方式中,提供了用于耗竭B细胞的方法。在一些实施方式 中,方法包括使包含B细胞的组合物与以下接触:(i)至少一种选自由 以下所组成的组的式A的化合物:2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯 基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮; (S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧 基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4- 酮,以及(ii)至少一种抗CD20抗体或其抗原结合片段。
在一些实施方式中,提供了用于促进细胞凋亡的方法。在一些实施方 式中,方法包括使B细胞与以下接触:(i)至少一种式A的化合物,该 化合物选自由以下所组成的组:2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H- 吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;(S)-2-(1-(4- 氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟 -3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯 基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以 及(ii)至少一种抗CD20抗体或其抗原结合片段。
在一些实施方式中,提供了用于促进细胞周期阻滞的方法。在一些实 施方式中,方法包括使细胞与以下接触:(i)至少一种式A的化合物, 该化合物选自由以下所组成的组:2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯 基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮; (S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧 基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4- 酮,以及(ii)至少一种抗CD20抗体或其抗原结合片段。
在一些实施方式中,顺序递送式A的化合物和抗CD20抗体或片段。
在一些实施方式中,同时递送式A的化合物和抗CD20抗体或片段。 在一些实施方式中,在同一组合物中递送式A的化合物和抗CD20抗体或 片段。在一些实施方式中,在分离的组合物中递送式A的化合物和抗CD20 抗体或片段。
在本文中还提供了试剂盒。在一些实施方式中,试剂盒包括(i)式A 的化合物、其立体异构体、其互变异构体或其药学上可接受的盐、溶剂化 物或前药,以及(ii)使用与抗CD20抗体或其抗原结合片段组合的化合 物的说明书,其中,该抗CD20抗体或片段(a)结合于与ublituximab相 同的表位,(b)表现出对Fc-γRIII(CD16)的高亲和力或(c)或具有小于 65%的岩藻糖含量。
在一些实施方式中,试剂盒包含(i)至少一种选自由以下所组成的组 中的化合物:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及
(ii)使用与抗CD20抗体或其抗原结合片段组合的化合物的说明书。
在一些实施方式中,试剂盒进一步包括抗CD20抗体或片段。
在一些实施方式中,试剂盒包括(i)至少一种抗CD20抗体或其抗原 结合片段和(ii)使用与至少一种选自由以下所组成的组的化合物组合的 抗CD20抗体或片段的说明书:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,
其中,该抗CD20抗体或其片段(a)结合于与ublituximab相同的表位, (b)表现出对Fc-γRIII(CD16)的高亲和力或(c)具有小于65%的岩藻糖。
在一些实施方式中,该试剂盒包括(i)至少一种抗CD20抗体或其抗 原结合片段和(ii)使用与选自由以下所组成的组的至少一种化合物组合 的抗CD20抗体或片段的说明书:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和,
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮。
在一些实施方式中,试剂盒包括(i)选自由以下所组成的组中的化合 物:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及
(ii)抗CD20抗体或其抗原结合片段,其中,该抗CD20抗体或片段(a) 结合于与ublituximab相同的表位,(b)表现出对Fc-γRIII(CD16)的高亲 和力或(c)具有小于65%的岩藻糖含量。
在一些实施方式中,试剂盒包括(i)选自由以下所组成的组中的化合 物:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及
(ii)抗CD20抗体或其抗原结合片段。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其片段与化合物包含在同一组合 物中。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或片段和化合物是在分离的组合物 中。
在一些实施方式中,试剂盒另外包括一种或多种另外的活性剂。
在本文中还提供了药物组合物。在一些实施方式中,药物组合物包含 (i)选自由以下所组成的组中的化合物:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及
(ii)抗CD20抗体或其抗原结合片段。
在一些实施方式中,药物组合物包含(i)选自由以下所组成的组中的 化合物:
2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙 基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮;和
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基) 乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮,以及
(ii)抗CD20抗体或其抗原结合片段,其中,该抗CD20抗体或片段(a) 结合于与ublituximab相同的表位,(b)表现出对Fc-γRIII(CD16)的高亲 和力或(c)具有小于65%的岩藻糖含量。
附图说明
图1:示出式A的化合物的S-异构体和Ublituximab对于来自于人全 血的CD19-阳性细胞耗竭(左)和CD20-阳性细胞耗竭(右)的影响的条 形图。
图2:示出式A的化合物的S-异构体和Ublituximab对LPS诱导的 CD19-阳性细胞增殖的影响的条形图。
图3:示出式A的化合物的S-异构体和Ublituximab对LPS诱导的 CD20-阳性细胞增殖的影响的条形图。
图4:示出式A的化合物的S-异构体和Ublituximab在Daudi、 RPMI-8226、Raji和U266B1细胞中对凋亡的影响的条形图。
图5:示出式A的化合物的S-异构体在U226B1细胞中对细胞周期的 影响的柱状图。
图6:示出抗CD20抗体ublituximab在U226B1细胞中对细胞周期的 影响的柱状图。
图7:示出式A的化合物的S-异构体和抗CD20抗体ublituximab在 U226B1细胞中对细胞周期的影响的柱状图。
图8:示出式A的化合物的S-异构体在Raji细胞中对细胞周期的影响 的柱状图。
图9:示出抗CD20抗体ublituximab在Raji细胞中对细胞周期的影响 的柱状图。
图10:示出式A的化合物的S-异构体和抗CD20抗体ublituximab在 Raji细胞中对细胞周期的影响的柱状图。
图11:示出式A的化合物的S-异构体和Ublituximab在LY1细胞中 对凋亡的影响的半胱天冬酶3活性示图。
图12:示出式A的化合物的S-异构体和Ublituximab在Raji细胞中 对凋亡的影响的半胱天冬酶3活性示图。。
具体实施方式
I.限定
为了便于理解本发明,如下限定许多术语和短语。
除非另外指出,术语“CD20”(也被称为B淋巴细胞CD20抗原、 MS4A1、B淋巴细胞表面抗原B1、Bp35、白细胞表面抗原Leu-16)是指 任何天然的CD20。术语“CD20”包括由细胞内加工产生的“全长”、未 加工的CD20以及任何形式的CD20。该术语还包括天然存在的CD20的 变体,例如剪接变体、等位基因变体和同种型。在本文中描述的CD20多 肽可以从各种来源如从人组织类型或从其他来源分离或通过重组或合成 方法制备。CD20序列的实例包括但不限于NCBI参考号NP068769.2和 NP690605.1。
术语“抗体”指免疫球蛋白分子,该分子通过免疫球蛋白分子的可变 区内的至少一个抗原识别位点识别并特异性结合于靶,如蛋白质、多肽、 肽、糖、多核苷酸、脂质或上述的组合。如在本文中使用的,术语“抗体” 包括完整的多克隆抗体、完整的单克隆抗体、抗体片段(如Fab、Fab′、 F(ab')2和Fv片段)、单链Fv(scFv)突变体、多特异性抗体如由至少两 种完整抗体产生的双特异性抗体、嵌合抗体、人源化抗体、人抗体、包含 抗体的抗原决定部分的融合蛋白和包含抗原识别位点的任何其他修饰的 免疫球蛋白分子,只要该抗体表现出希望的生物学活性。分别基于被称为 α、δ、ε、γ和μ的抗体的重链恒定结构域,抗体可以是所有的5类主要的 免疫球蛋白:IgA、D、IgE、IgG和IgM或其亚类(同种型)(例如,IgG1、 IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)的抗体。不同类的免疫球蛋白具有不 同的和众所周知的亚基结构和三维构型。抗体可以是裸的或结合到其他分 子如毒素、放射性同位素、蛋白质,等等。
“阻断(blocking)”抗体或“拮抗剂”抗体是一种这样的抗体,其 抑制或降低其结合的抗原如CD20的生物学活性。在一些实施方式中,阻 断抗体或拮抗剂抗体基本上或完全抑制抗原的生物学活性。期望地,生物 学活性降低了10%、20%、30%、50%、70%、80%、90%、95%或甚至100%。
术语“抗CD20抗体”或“与CD20结合的抗体”是指能够以足够的亲 和力结合CD20的抗体,使得该抗体在靶向CD20方面可用作诊断和/或治 疗剂。如所测量的例如,通过放射免疫测定(RIA)抗CD20抗体与不相 关的,非CD20蛋白质的结合程度比该抗体与CD20的结合小约10%。在 一些实施方式中,与CD20结合的抗体具有≤1μM、≤100nM、≤10nM、≤1 nM或≤0.1nM的解离常数(Kd)。
术语“抗体片段”是指完整抗体的一部分,并且是指完整抗体的抗原 决定可变区。抗体片段的实例包括但不限于Fab、Fab′、F(ab')2和Fv片段、 线性抗体、单链抗体和由抗体片段形成的多特异性抗体。
“单克隆抗体”是指在单个抗原决定簇或者表位的高度特异性识别和 结合中所涉及的均一抗体群体。与之形成对比的是多克隆抗体,其通常包 括不同抗原决定簇针对的不同抗体。术语“单克隆抗体”包括完整的和全 长单克隆抗体以及抗体片段(如Fab、Fab′、F(ab')2、Fv)、单链(scFv) 突变体、包括抗体部分的融合蛋白质和包含抗原识别位点的任何其他修饰 的免疫球蛋白分子。此外,“单克隆抗体”是指以许多方式(包括但不限 于通过杂交瘤、噬菌体选择、重组表达和转基因动物)制造的这样的抗体。
术语“人源化抗体”是指非人(例如,鼠科动物)抗体的形式,该抗 体是特异的免疫球蛋白链、嵌合免疫球蛋白或其片段,其包含最小的非人 (例如,鼠科动物)序列。典型地,人源化抗体是人免疫球蛋白,其中, 由具有期望的特异性、亲和力和能力的非人物种(例如,小鼠、大鼠、兔、 仓鼠)的CDR的残基取代来自互补决定区(CDR)的残基(Jonesetal., Nature,321:522-525(1986);Riechmannetal.,Nature,332:323-327(1988); Verhoeyenetal.,Science,239:1534-1536(1988))。在一些实例中,用具有 期望的特异性、亲和力和能力的来自于非人物种的抗体中的相应残基取代 人免疫球蛋白的Fv框架区(FR)残基。可以通过取代在Fv框架区和/或 在置换的非人残基内的另外的残基进一步修饰人源化抗体以改进和优化 抗体特异性、亲和力和/或能力。总体上,人源化抗体将包括基本上所有的 至少一种、典型是两种或三种可变区,该可变区包括所有或基本上所有的 CDR区,该CDR区对应于非人免疫球蛋白,而所有的或基本上所有的FR 区是人免疫球蛋白共有序列的FR区。人源化抗体也可以包括至少一部分 免疫球蛋白(通常是人免疫球蛋白)的恒定区或结构域(Fc)。在美国专 利US5,225,539或US5,639,641中描述了用于产生人源化抗体的方法的实 例。
抗体的“可变区”是指抗体轻链的可变区或抗体重链的可变区,单独 地或组合地。重链和轻链的可变区各自由4个框架区(FR)组成,这4 个框架区是由也称为高变区的三个互补决定区(CDR)连接的。在各链中 的CDR由FR非常接近地(closeproximity)保持在一起,并且连同另一 条链的CDR一起,促使抗体的抗原结合位点的形成。有至少两种技术用 于确定CDR:(1)基于跨物种序列变异性的方法(即,Kabatetal.Sequences ofProteinsofImmunologicalInterest,(5thed.,1991,NationalInstitutesof Health,BethesdaMd.));和(2)基于抗原-抗体复合物的晶体学研究的方 法(Al-lazikanietalJ.Molec.Biol.273:927-948(1997))。另外,在本领域 中有时使用这两种方法的组合以确定CDR。
当涉及在可变区中(大约轻链的残基1-107和重链的残基1-113)的 残基时,通常使用Kabat编号系统(例如,Kabatetal.,Sequencesof ImmunologicalInterest.5thEd.PublicHealthService,NationalInstitutesof Health,Bethesda,Md.(1991))。
如在Kabat中,氨基酸位置编号是指在Kabatetal.,Sequencesof ProteinsofImmunologicalInterest,5thEd.PublicHealthService,National InstitutesofHealth,Bethesda,Md.(1991)中,用于抗体的编辑的重链可变区 或轻链可变区的编号系统。使用此编号系统,实际的线性氨基酸序列可包 含较少或另外的氨基酸,该氨基酸相应于可变区的FR或CDR的缩短或插 入。例如,重链可变区可以包括在H2的残基52后单个氨基酸插入(根据 Kabat的残基52a)以及在重链FR残基82后插入的残基(例如,根据Kabat 的残基82a、82b和82c,等等)。对于给定的抗体,用“标准”Kabat编 号序列通过对准抗体的同源序列区域可以确定残基的Kabat编号。Chothia 指的不是结构环的位置(Chothia和Lesk,分子生物学杂志(J.Mol.:901-917 (1987))。当使用Kabat编号惯例编号时,取决于该环的长度,Chothia CDR-H1环的末端在H32和H34之间变化(这是因为Kabat编号方案在 H35A和H35B处放置插入;如果35A和35B都不存在时,则环终止于32; 如果仅存在35A,则环终止于33;如果35A和35B均存在,则环终止于 34)。AbM高变区代表在KabatCDR和Chothia结构环之间的折衷,并且 由OxfordMolecular的AbM抗体建模软件使用该AbM高变区。
术语“人抗体”是指由人产生的抗体或者使用本领域已知的任何技术 制造的具有对应于由人产生的抗体的氨基酸序列的抗体。人抗体的这种限 定包括完整抗体或全长抗体、其片段和/或包括至少一种人重和/或轻链多 肽的抗体,如,例如,包括鼠科动物轻链和人重链多肽的抗体。
术语“嵌合抗体”是指其中免疫球蛋白分子的氨基酸序列来源于两种 或更多种物种的抗体。通常,轻链和重链的可变区均对应于衍生自哺乳动 物(例如,小鼠、大鼠、兔,等等)的一个物种的具有希望的特异性、亲 和力和能力的抗体的可变区,而恒定区同源于衍生自另一物种(通常是人) 的抗体中的序列以避免在该物种中引发免疫应答。
术语“表位”或“抗原决定簇”在本文中可替交地使用并且是指能够 由特定抗体识别并且特异性结合的抗原的部分。当抗原是多肽时,通过蛋 白的三级折叠,可以由并列的连续氨基酸和不连续的氨基酸形成表位。由 连续氨基酸形成的表位通常在蛋白变性时保留,而由三级折叠形成的表位 在蛋白质变性时通常丢失。在独特空间构象中,表位通常包括至少3和更 常见的,至少5个或8-10个氨基酸。
“结合亲和力”通常是指分子(例如,抗体)的单个结合位点和其结 合伴侣(例如,抗原)之间非共价相互作用之和的强度。除非另有说明, 如在本文中使用的,“结合亲和力”是指本征结合亲和力,这反映了结合 对(例如,抗体和抗原)的成员之间的1:1相互作用。分子X对其伴侣 Y的亲和力通常可以由解离常数(Kd)表示。可以通过本领域已知的常用 方法、包括本文中所描述的那些方法来测量亲和力。低亲和力抗体通常缓 慢结合抗原并且倾向于容易解离,而高亲和力抗体通常更快地结合抗原并 且倾向于保持更长久的结合。测量结合亲和力的多种方法在本领域中是已 知的,其中任何一种方法均可用于本发明的目的。在本文中描述了具体示 例性的实施方式。
当在本文中使用“或者更好”是指结合亲和力时指的是在分子和其结 合伴侣之间更强的结合。当在本文中使用时“或者更好”是指更强的结合, 其由较小的数值Kd值代表。例如,抗体针对抗原具有“0.6nM或更好的” 的亲和力,则抗体针对该抗原的亲和力是<0.6nM,即0.59nM、0.58nM、 0.57nM等等或小于0.6nM的任何值。
如在本文中使用的短语“基本上相似的”或“基本上相同的”,表示 在两个数值(通常一个与本发明的抗体相关并且另一个与参考/比较抗体相 关)之间足够高程度的相似性,使得本领域的技术人员将两个值之间的差 异认为由所述值(例如,Kd值)测量的生物学特性的范围内几乎没有(little orno)生物学和/或统计学显著性。在所述两个值之间的差异是小于约 50%、小于约40%、小于约30%、小于约20%或小于约10%,作为参考/ 比较抗体值的函数。
“分离的”多肽、抗体、多核苷酸、载体、细胞或组合物是在自然界 中未发现形式的多肽、抗体、多核苷酸、载体、细胞或组合物。分离的多 肽、抗体、多核苷酸、载体、细胞或组合物包括已经纯化到一定程度的那 些,它们不再存在于在自然界中发现的形式中。在一些实施方式中,分离 的抗体、多核苷酸、载体、细胞或组合物基本上是纯的。
如在本文中使用的,“基本上纯的”是指材料至少50%纯(即不含污 染物)、至少90%纯、至少95%纯、至少98%纯或至少99%纯。
术语“癌症”和“癌性的”是指或描述哺乳动物中的生理病况,其中, 一群细胞的特征在于不受控制的细胞生长。癌症的实例包括但不限于癌 (carcinoma)、淋巴瘤、母细胞瘤(blastoma)、肉瘤和白血病。这样的 癌症更特别的实例包括鳞状细胞癌、小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺的腺 癌、肺的鳞状癌、腹膜癌、肝细胞癌、胃肠癌、胰腺癌、胶质母细胞瘤 (glioblastoma)、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝细胞瘤、乳癌、结 肠癌、结直肠癌、子宫内膜癌或子宫癌、唾液腺癌、肾癌、肝癌、前列腺 癌、外阴癌、甲状腺癌、肝癌和各种类型的头颈部癌。
“肿瘤”及“赘生物”是指任何组织块,其起因于细胞过度生长或增 殖,是或者良性(非癌性的)或恶性的(癌性的),包括癌前病变。
术语“癌细胞”、“肿瘤细胞”和语法上的等价词是指来源于肿瘤或 癌前病变的细胞的总群体,包括非致瘤性细胞,其包括大量(bulk)的肿 瘤细胞群体,和致瘤性干细胞(癌症干细胞)。如在本文中使用的,当仅 仅涉及那些缺乏更新和分化的能力的那些肿瘤细胞时,术语“肿瘤细胞” 将由术语“非致瘤性”修饰以将那些肿瘤细胞与癌症干细胞区分开来。
术语“受试者”是指任何动物(例如,哺乳动物),包括,但不限于 人、非人灵长类、啮齿动物,等等,其将会是特定治疗的接受者。通常, 涉及人受试者,术语“受试者”和“患者”在本文中可交替地使用。
细胞“群体”可指单个细胞或多个细胞。单个细胞或多个细胞可以是 在培养物中的细胞或在生物体中的细胞。例如,细胞群体可以是在受试者 或患者中。
术语“药物制剂”是指这样的制备品,其是这样的形式以允许活性成 分的生物学活性是有效的,并且其不含另外的成分,该成分对于该制剂将 给予的受试者而言是不可接受的毒性的。这样的制剂可以是无菌的。
如在本文中公开的,抗体的“有效量”是足以进行特定说明的目的量。 与说明的目的有关,可以凭经验和通常方法确定“有效量”。
术语“治疗有效量”是指在受试者或哺乳动物中抗体或其他药物有效 “治疗”疾病或失调的量。在癌症的情况下,治疗有效量的药物可以减少 癌细胞的数量;降低肿瘤的尺寸;抑制(即,一定程度地减缓并且在一些 实施方式中,终止)癌细胞浸润至周围器官中;抑制(即,一定程度地减 缓并且在一些实施方式中,终止)肿瘤转移;一定程度地抑制肿瘤生长; 和/或一定程度地减轻与癌症相关的病症中的一种或多种。参见“治疗”在 本文中的限定。药物可以一定程度地阻止生长和/或杀死存在的癌细胞,它 可以是抑制细胞生长的和/或细胞毒性的。“预防有效量”是指在剂量上和 在必需的时间阶段内有效达到希望的预防效果的量。通常但不是必须地, 由于在疾病之前或在疾病的早期阶段在受试者中使用预防剂量,预防有效 量将小于治疗有效量。
术语如“治疗(treating)”或“治疗(treatment)”或“治疗(totreat)” 或“缓解(alleviating)”或“缓解(toalleviate)”是指1)治疗措施, 该措施治愈、减缓、减少诊断的病理病况或失调的症状和/或停止诊断的病 理病况或失调的进展和2)预防或预防性措施,该措施防止和/或减缓目标 病理状态或失调的发展。因此,需要治疗的那些包括已患失调的那些;倾 向于发生失调的那些;和待防止失调的那些。在一些实施方式中,如果患 者表现出以下一种或多种,那么根据本发明的方法,受试者的癌症被成功 “治疗”:恶病质降低、存活时间增加、肿瘤进展时间的延长、肿瘤块减 小、肿瘤负荷减小和/或肿瘤转移时间的延长、肿瘤复发的时间、肿瘤反应、 完全反应、部分反应、稳定疾病、进展的疾病、无进展生存率(PFS)、 总生存率(OS),由美国国家癌研究所(NationalCancerInstitute)和美 国食品和药品管理局(U.S.FoodandDrugAdministration)设置的用于批 准新药的标准测量每一个。参见Johnsonetal,J.Clin.Oncol. 21(7):1404-1411(2003)。
抗CD20抗体和PI3Kδ选择性抑制剂的“组合”是指抗CD20抗体或 其片段和如在本文中限定的化合物A,打算将它们同时地、顺序地、或同 时并且顺序地给予细胞的相同群体或相同受试者。因此,通过实例的方式, 在给予化合物A之前或之后(例如,经过小时、天、周或月)给予抗CD20 抗体或其片段构成给予抗CD20抗体或其片段和化合物A的组合。另外, 同时给予抗CD20抗体或其片段与化合物A也构成给予抗CD20抗体或其 片段与化合物A的组合,不拘于是否在单一药物制剂中一起给予抗CD20 抗体或其片段和化合物A或通过相同或不同的给予途径在单独的药物制 剂中同时给予抗CD20抗体或其片段和化合物A。
一种肿瘤,该肿瘤对于用抗CD20抗体的治疗“不响应”、“响应很 差”或是“难治的”,在公认的动物模型或人临床试验中,与未治疗或用 安慰剂治疗相比,在该肿瘤对于抗CD20抗体治疗的响应方面未显示统计 上显著的改善,或者该肿瘤响应用抗CD20抗体的初始治疗,但是随着治 疗持续继续生长。
使用实验室细胞系如Raji或Wil2-S或患者供体细胞系可以测试肿瘤 或细胞类型响应抗CD20抗体的能力。另外,例如,在来自于患者的全血 中,可以使用B细胞耗竭测定测量活性。
在本文中可互换使用的“多核苷酸”或“核酸”是指任何长度的核苷 酸的聚合物,并且包括DNA和RNA。该核苷酸可以是脱氧核糖核苷酸、 核糖核苷酸、修饰的核苷酸或碱基和/或它们的类似物或由DNA或RNA 聚合酶可以合并入聚合物的任何取代基。多核苷酸可以包括修饰的核苷 酸,如甲基化的核苷酸和它们的类似物。如果存在,可以在聚合物装配之 前或之后赋予对核苷酸结构的修饰。核苷酸的序列可以被非核苷酸组分中 断。可以在聚合后进一步修饰多核苷酸,诸如通过与标记组分的结合。其 他类型的修饰包括例如“帽”,用类似物、核苷酸间修饰取代一个或多个 天然存在的核苷酸,类似物、核苷酸间修饰如,例如具有不带电荷的连接 (例如,甲基膦酸酯、磷酸三酯、磷酰胺、氨基甲酸酯等)和具有带电荷 的连接(例如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯等)的那些、包含侧链部分的那 些,如,例如蛋白质(例如核酸酶、毒素、抗体、信号肽、聚-L-赖氨酸 (ply-L-lysine)等)、具有插入剂(例如吖啶、补骨脂素等)的那些、包 含螯合剂(例如金属、放射性金属、硼、氧化性金属等)的那些、包含烷 化剂的那些、具有修饰的连接(例如,α异头核酸等)的那些以及未修饰 形式的一个或多个多核苷酸。此外,通常存在于糖中的任何羟基基团可以 被替换(例如,由膦酸酯基团,磷酸酯基团),被保护(由标准保护基团) 或被活化以制备与另外核苷酸的另外连接,或者可以被结合至固体支撑物 (载体,support)。可以磷酸化或用胺或1至20个碳原子的有机封端基 团部分取代5′和3′末端OH。其他羟基也可衍生成标准保护基团。多核苷 酸还可以包括核糖或脱氧核糖的糖的类似物形式,它们通常是本领域已知 的,包括,例如,2′-O-甲基-、2′-O-烯丙基、2′-氟-或2′-叠氮基-核糖、碳 环糖类似物、α-异头糖、差向异构糖(如阿拉伯糖、木糖或来苏糖、吡喃 糖、呋喃糖、景天庚糖)、无环类似物和脱碱基核苷类似物(如甲基核苷)。 一个或多个磷酸二酯键可由可替代的连接基团替代。这些可替代的连接基 团包括但不限于这样的实施方式:其中,磷酸酯由P(O)S(“硫代酯 (thioate)”),P(S)S(“二硫代(dithioate)”)、(O)NR2(“酰胺化 物(amidate)”)、P(O)R、P(O)OR′、CO或CH2(“甲缩醛(formacetal)”) 代替,其中,每个R或R′独立地是H或取代或未取代的烷基(1-20C), 该烷基可选地包含醚(-O-)键、芳基、烯基、环烷基、环烯基或芳烷基 (araldyl)。并非所有多核苷酸中的连接都需要是相同的。前述的描述应 用于在本文中涉及的所有多核苷酸,包括RNA和DNA。
术语“载体”是指一种构建体,其能够在宿主细胞中递送并且表达感 兴趣的一种或多种基因或序列。载体的实例包括但不限于病毒载体、裸 DNA或RNA表达载体、质粒、粘粒或噬菌体载体、与阳离子缩合剂相关 的DNA或RNA表达载体、包封在脂质体和某些真核细胞(如产生细胞) 中的DNA或RNA表达载体。
在本文中可互换使用的术语“多肽”、“肽“和“蛋白质”是指任何 长度的氨基酸聚合物。所述聚合物可以是直链的或支链的,它可以包括修 饰的氨基酸,并且可以被非氨基酸中断。该术语还包括已经被天然地或通 过干预修饰的氨基酸聚合物;修饰例如,二硫键形成、糖基化、脂化、乙 酰化、磷酸化或任何其他操作或修饰,如与标记组分结合。在该限定内还 包括的是,例如,包含一种或多种氨基酸类似物(包括,例如,非天然氨 基酸等),以及本领域已知的其他修饰的多肽。应当理解,因为本发明的 多肽是基于抗体,在某些实施例中,多肽可以以单链或相关链的形式出现。
在两个或更多个核酸或多肽的情况下,术语“同一的”或百分比“同 一性”是指两个或更多个序列或子序列,它们是相同的或具有特定百分比 的核苷酸或氨基酸残基,当比较和对齐(引入缺口,如果需要)用于最大 一致性时,不考虑任何保守氨基酸取代作为序列同一性的一部分,该核苷 酸或氨基酸残基是相同的。可以使用序列比较软件或算法或通过目测测量 百分比同一性。各种算法和软件在本领域中是已知的,其可用于获得氨基 酸或核苷酸序列的对齐。序列对齐算法的一种这样的非限制性实例是在 Karlinetal,Proc.Natl.Acad.Sci.,87:2264-2268(1990)中描述的,如在 Karlinetal.,Proc.Natl.Acad.Sci.,90:5873-5877(1993)修改的和被合并至 NBLAST和XBLAST程序(Altschuletal.,NucleicAcidsRes.,25:3389-3402 (1991))的算法。在一些实施方式中,可以使用GappedBLAST,如在 Altschuletal.,NucleicAcidsRes.,25:3389-3402(1997)中所描述的。 BLAST-2、WU-BLAST-2(Altschuletal.,MethodsinEnzymology, 266:460-480(1996))、ALIGN、ALIGN-2(Genentech,SouthSanFrancisco, California)或Megalign(DNASTAR)是可用于对齐序列的另外的公众可 获得的软件程序。在一些实施方式中,使用GCG软件中的GAP程序(例 如,使用NWSgapdna.CMP矩阵,以及40、50、60、70或90的缺口权重 和1、2、3、4、5或6的长度权重)测定两个核苷酸序列间的百分比同一 性。在一些可替代的实施方式中,在GCG软件包中的GAP程序(其合并 了Needleman和Wunsch的算法(J.Mol.Biol.(48):444-453(1970))可用 于确定两个氨基酸序列之间的百分比同一性(例如,使用Blossum62矩阵 或PAM250矩阵,以及16、14、12、10、8、6或4的缺口权重和1、2、 3、4、5的长度权重)。可替代地,在一些实施方式中,核苷酸或氨基酸 序列之间的百分比同一性是使用Myers和Miller的算法(CABIOS,4:11-17 (1989))确定的。例如,可以使用ALIGN程序(版本2.0)并且使用 PAM120(具有残基表,缺口长度惩罚(penalty)为12,缺口惩罚为4) 确定百分比同一性。可以由本领域技术人员确定通过特定对齐软件的最大 对齐的适当参数。在某些实施方式中,使用对齐软件的默认参数。在一些 实施方式中,第一氨基酸序列对第二序列的氨基酸的百分比同一性“X” 被计算为100×(Y/Z),其中Y是在第一和第二序列的对齐(如通过目测或 特定序列对齐程序对齐的)中被评分为相同匹配的氨基酸残基的数量并且 Z是第二序列中的残基总数。如果第一序列的长度是长于第二序列,那么 第一序列对第二序列的百分比同一性将长于第二序列对第一序列的百分 比同一性。
作为非限制性的实施例,在一些实施方式中,可以使用Bestfit程序确 定(WisconsinSequenceAnalysisPackage,Version8forUnix,Genetics ComputerGroup,UniversityResearchPark,575ScienceDrive,Madison,WI 53711)任何特定的多核苷酸对参照序列是否具有一定百分比的序列同一 性(例如,至少80%相同、至少85%相同、至少90%相同,并且在一些实 施方式中,至少95%、96%、97%、98%或99%相同)。Bestfit使用Smith 和Waterman的局部同源性算法,AdvancesinAppliedMathematics2:482 489(1981),以发现两个序列之间的最佳的同源区段。当使用Bestfit或任 何其他序列对齐程序来确定特定序列是否例如,95%同一于根据本发明的 参考序列时,设置参数使得在参考核苷酸序列的全长上计算同一性百分 数,并且最高达参考序列中核苷酸总数的5%的同源性中的缺口是允许的。
在一些实施方式中,如使用序列比较算法或通过目测测量的,当比较 或对齐最大对应性时,本发明的两种核酸或多肽是基本相同的,意味着它 们具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%,并且在 一些实施方式中至少95%、96%、97%、98%、99%的核苷酸或氨基酸残 基同一性。在一些实施方式中,同一性存在于序列的至少约10、约20、 约40-60个残基的长度或其间的任何整数值的区域,或比60-80残基更长 的、至少约90-100个残基区域,或序列与正在比较的序列的全长如例如 核苷酸序列的编码区基本上相同。
“保守的氨基酸取代”是指其中一个氨基酸残基由另一种具有相似侧 链的氨基酸残基替代。具有相似侧链的氨基酸残基的家族在本领域中已经 限定,包括碱性侧链氨基酸(例如,赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧 链氨基酸(例如,天冬氨酸、谷氨酸)、不带电荷的极性侧链氨基酸(例 如,天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非极 性侧链氨基酸(例如,甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯 氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、β-支链的侧链氨基酸(例如,苏 氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)和芳香族侧链氨基酸(例如,酪氨酸、苯丙氨 酸、色氨酸、组氨酸)。例如,苯丙氨酸取代酪氨酸是保守取代。在一些 实施方式中,在本发明的多肽和抗体的序列中的保守取代无法取消 (abrogate)包含氨基酸序列的多肽或抗体与抗原(即,FOLR1,多肽或 抗体与其结合)的结合。识别核苷酸和氨基酸保守取代(该保守取代无法 消除抗原结合)的方法在本领域中是众所周知的(参见,例如,Brummell etal.,Biochem.32:1180-1187(1993);Kobayashietal.ProteinEng. 12(10):879-884(1999);和Burksetal.Proc.Natl.Acad.Sci.USA94:.412-417 (1997))。
除非另外明确指出,否则在本公开中表明材料的数量、比率,材料的 物理性质和/或应用的所有数应理解为由“约”这个字修饰。当涉及数或数 值范围时,术语“约”指的是该数或数值范围所涉及的是实验变异性内(或 统计学实验误差内)的近似值,并且因此该数或数值范围可以在例如所阐 明的数或数值范围的1%至15%之间变化。
本发明的化合物可以包含一个或多个不对称中心(手性中心)并且可 以因此引起对映异构体、非对映异构体和其他立体异构形式,依据绝对立 体化学可以将它们限定为(R)-或(S)-。本公开旨在包括所有这些可能的形式 以及它们的外消旋和拆分形式以及它们的混合物。考虑到本公开,根据在 本领域中已知的方法可以分离各对映异构体。
如在本文中使用的,术语“立体异构体”是单个分子的所有异构体的 泛称,该单个分子的差别仅在于在空间中的它们的原子的取向。它包括对 映异构体和具有一个以上手性中心的化合物的同分异构体,它们彼此不互 呈镜像(非对映异构体)。
术语“手性中心”是指四个不同基团与其相连的碳原子。
术语“对映异构体”和“对映异构体的”是指在其镜像上不能重叠的 分子,因此是旋光性的,其中,对映异构体使偏振光的平面朝一个方向旋 转,而其镜像化合物使偏振光的平面朝相反的方向旋转。
术语“外消旋的”是指对映异构体的等份混合物并且该混合物是不旋 光的。
术语“拆分”是指分离、富集或除去分子的两种对映异构体形式中的 一种。
本公开包括本发明的化合物的溶剂化物。溶剂化物通常不显著地改变 化合物的生理学活性或毒性,因此可以作为药理学等价物发挥功能。如在 本文中所用的术语“溶剂化物”是本公开的化合物与溶剂分子的组合、物 理缔合和/或溶剂化,例如二溶剂化物、一溶剂化物或半溶剂化物,其中, 溶剂分子与本公开的化合物的比率分别是约2:1,约1:1或约1:2。这种物 理缔合涉及不同程度的离子和共价键合,包括氢键键合。在某些情况中, 溶剂化物可以被分离,如当一种或多种溶剂分子被合并至结晶固体的晶格 中时。因此,“溶剂化物”包括溶液相和可分离的溶剂化物。本发明的化 合物可以作为具有药学上可接受的溶剂,如水、甲醇、乙醇等的溶剂化形 式存在,并且本公开意在包括本发明的化合物的溶剂化的和非溶剂化的形 式。一种类型的溶剂化物是水合物。“水合物”涉及特定子群的溶剂化物, 其中溶剂分子是水。溶剂化物通常可作为药理学等价物发挥功能。溶剂化 物的制备在本领域是已知的。参见,例如,M.Cairaetal.,J.Pharmaceut.Sci., 93(3):601-611(2004);E.C.vanTonderetal.,AAPSPharm.Sci.Tech. 5(1):Article12(2004);和A.L.Binghametal.,Chem.Commun.603-604 (2001)。典型的非限制性的制备溶剂化物的方法将包括,在约20℃至约 25℃的温度在希望的溶剂(有机溶剂、水或它们的混合物)中溶解本发 明的化合物,随后以足以形成晶体的速度冷却该溶液,并且通过已知的方 法例如,过滤分离该晶体。分析技术如红外光谱法可用于证实在溶剂化物 的晶体中溶剂的存在。
术语“前体药物”是指这样的一种化合物,其是化合物的无活性的前 体,在体内通过正常的代谢过程转化为它的活性形式。在Hardma,etal. (Eds.),GoodmanandGilman'sThePharmacologicalBasisofTherapeutics, 9thed.,pp.11-16(1996)中一般性地讨论了前药设计。在Higuchi,etal., ProdrugsasNovelDeliverySystems,Vol.14,ASCDSymposiumSeries以及 在Roche(ed.),BioreversibleCarriersinDrugDesign,American PharmaceuticalAssociationandPergamonPress(1987)中提供了详细讨论。 举例说明:通过,例如,酯或酰胺键的水解,前药可以转化至药理学上的 活性形式,从而引入或暴露在所得到的产物上的官能团。可以设计前药以 与内源性化合物反应以形成水溶性结合物,该结合物进一步增强该化合物 的药理学特性,例如提高的循环半衰期。可替代地,可以设计前药以在具 有例如葡萄糖醛酸、硫酸盐或酯、谷胱甘肽、氨基酸或乙酸盐或酯的官能 团上经历共价修饰。所得到的结合物可以是无活性的并从尿中排出或者与 母体化合物相比赋予更多效力(活性,potent)。高分子量结合物还可以 被排泄至胆汁中,经历酶促裂解,并释放回到循环,从而有效地增加最初 给予的化合物的生物半衰期。本发明化合物的前体药物意在涵盖在本发明 的范围内的。
本发明也包括这样的化合物,它们的区别仅在于存在一种或多种同位 素富集的原子,例如,由氘或氚置换氢或由13C-或14C-富集的碳置换碳。 在构成这些化合物的一种或多种原子处,本发明的化合物还可以包括非天 然比例的原子同位素。例如,可用放射性同位素如例如,氚(3H)、碘-125 (125I)或碳-14(14C)放射性标记化合物。本发明的化合物的所有同位素 变体,无论是放射性的还是非放射性的,均包括在本发明的范围内。
本公开内容进一步包括本发明化合物的盐,包括无毒的药学可接受的 盐。药学上可接受的加成盐(additionsalts)的实例包括无机和有机酸加 成盐和碱性盐。药学上可接受的盐包括但不限于金属盐如钠盐、钾盐、铯 盐等;碱土金属如钙盐、镁盐等;有机胺盐如三乙胺盐、吡啶盐、甲基吡 啶盐、乙醇胺盐、三乙醇胺盐、二环己胺盐、N,N′-联苄基乙二胺盐等;无 机酸盐如盐酸盐、氢溴酸盐、磷酸盐、硫酸盐等;有机酸盐如柠檬酸盐、 乳酸盐、酒石酸盐、马来酸盐、富马酸盐、扁桃酸盐、醋酸盐、二氯乙酸 盐、三氟乙酸盐、草酸盐、甲酸盐、琥珀酸盐、棕榈酸盐、苯甲酸盐、水 杨酸盐、抗坏血酸盐、甘油磷酸盐、酮戊二酸盐等;磺酸盐如甲磺酸盐、 苯磺酸盐、对-甲苯磺酸盐等;天然氨基酸(如甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、 亮氨酸、异亮氨酸、正亮氨酸、酪氨酸、胱氨酸、半胱氨酸、甲硫氨酸、 脯氨酸、羟脯氨酸、组氨酸、鸟氨酸、赖氨酸、精氨酸和丝氨酸)的盐; 和非天然氨基酸(如D-异构体或取代的氨基酸)的盐;胍的盐;和取代 的胍的盐,其中,取代基选自硝基、氨基、烷基、烯基、炔基、铵盐或取 代的铵盐和铝盐。
当施加于生物学活性剂时,术语“选择性抑制剂”是指该剂的经由与 靶标的直接或间接相互作用,相比于脱靶信号通路,选择性地降低靶向信 号活性的能力。
术语“PI3Kδ选择性抑制剂”是指如在本文中所限定的化合物A,其 选择性地抑制PI3Kδ同种型的活性,比PI3K家族的其他同种型(α、β和 γ)更有效。例如,式A的化合物可以是这样的一种化合物,相对于δ型 PI3-激酶,该化合物表现出50%抑制浓度(IC50),相对于其他PI3K同种 型(即,α、β和γ)的其余部分,该浓度比该抑制剂的IC50至少20倍更 低。
在不同的病症的治疗中,抑制PI3Kδ可以是治疗有益的,例如,以 炎症反应为特征的病症,包括但不限于自身免疫性疾病、过敏性疾病和关 节炎疾病。重要的是,抑制PI3Kδ功能似乎并不影响生物学功能如生存 存能力和生育能力。
如在本文中所用的“炎症反应”的特征在于发红、发热、肿胀和疼痛 (即炎症)并且通常涉及组织损伤或破坏。炎性反应通常是由组织的损伤 或破坏引起的局部、保护性反应,它用于破坏、稀释或隔开(隔绝)有害 的药剂和受损的组织。炎症反应与白细胞的流入和/或白细胞(例如,嗜中 性粒细胞)的趋化性显著相关。炎症反应可以由致病生物和病毒的感染, 非感染性的方式(如心肌梗塞或中风后损伤或再灌注)、对外来抗原的免 疫应答和自身免疫性疾病引起。顺从于用根据本发明的方法和化合物治疗 的炎症反应包括与特异性防御系统反应有关的病况以及与非特异性防御 系统反应有关的病况。
本发明的治疗方法包括治疗与炎性细胞活化相关病症的方法。“炎性 细胞活化”是指通过增生性细胞反应的刺激(包括,但不限于细胞因子、 抗原或自身抗体)的诱导、可溶性中介体(mediator)(包括但不限于细 胞因子、氧自由基、酶、前列腺素类或血管活性胺)的产生或在炎性细胞 (包括,但不限于单核细胞、巨噬细胞、T淋巴细胞、B淋巴细胞、粒细 胞(多形核白细胞,包括嗜中性粒细胞、嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞)、 肥大细胞、树突状细胞、朗格汉斯细胞和内皮细胞)中新的或增加数量的 中介体(包括但不限于主要组织相容性抗原或细胞粘附分子)的细胞表面 表达。本领域中熟练的技术人员将要理解的是,在这些细胞中这些表型中 的一种或组合的活化可以有助于炎性病况的引发、永存或恶化。
如在本文中所用的术语“自身免疫性疾病”是指任何一组失调,其中, 组织损伤与体液或细胞介导的对身体自身成分的应答相关联。
如在本文中所用的术语“移植排斥”是指免疫应答直接针对移植的组 织(包括器官或细胞,例如,骨髓,以移植的组织和周围组织的功能损失、 疼痛、肿胀、白细胞增多和血小板减少为特征)。
如在本文中所用的术语“过敏性疾病”是指产生自变态反应的任何症 状、组织损伤或组织功能的丧失。
如在本文中所用的术语“关节炎疾病”是指可归因于各种病因的以关 节的炎性病变为特征的任何疾病。
如在本文中所用的术语“皮炎”是指任何一大类皮肤疾病,其以可归 因于各种病因的皮肤的炎症为特征。
如在本文中使用的术语“协同效应,”是指一种通过化合物的组合产 生的大于加和的治疗效应,其中,用组合获得的治疗效应超过加和效应, 该加和效应另外产生自单独给予单个化合物。本发明的实施方式包括在血 液系统癌症中产生协同效应的方法,其中,所述效应比相应的加和效应是 至少5%、至少10%、至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少 60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少100%、至少200%、至少 500%或至少1000%更高。
如在本文中使用的“治疗协同,”是指在治疗中,抗CD20抗体与化 合物A的组合产生治疗效果,该治疗效果大于单独使用抗CD20抗体和 PI3Kδ选择性抑制剂的加和效应。
如在本公开内容和权利要求中所使用的,单数形式“一个(a)”、 “一种(an)”和“该(the)”包括复数形式,除非上下文另外清楚地规 定。
应当理解,尽管在此用语言“包括”描述了实施方式,另外还提供了 根据“由...组成”和/或“基本上由...组成”描述的类似的实施方式。
II.PI3Kδ选择性抑制剂
如在本文中提供的,与抗CD20抗体和其抗原结合片段组合使用的 PI3Kδ选择性抑制剂是式A的化合物:
和其立体异构体,其互变异构体,其药学上可接受的盐、溶剂化物和前药。
在一种实施方式中,与抗CD20抗体和其抗原结合片段组合使用的化 合物A,是(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶 -1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮、其药学上可接受的盐、溶剂 化物和前药。这个立体异构体在本文中也称为“式A的化合物的S-异构 体,”“S-异构体,”“TGR-1202”和“RP5307.”
在另一种实施方式中,与抗CD20抗体和其抗原结合片段组合使用的 化合物A,是(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d] 嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮、其药学上可接受的盐、 溶剂化物和前药。
这些化合物的化学结构如下所示:
III.抗CD20抗体
CD20是一种四次跨膜的跨膜磷酸-蛋白,其主要在人和小鼠中的前B 细胞和成熟的外周B细胞中表达。在人中,CD20也强烈地和均一地在大 多数成熟B细胞恶性肿瘤上表达。
如在本文中提供的,抗CD20抗体和其抗原结合片段可与PI3Kδ选择 性抑制剂组合使用。
许多抗CD20抗体是已知的,包括例如,ublituximab利妥昔单抗、奥 法木单抗(HuMax;Intracel)、奥瑞珠单抗、维妥珠单抗、GA101(奥奴 珠单抗(obinutuzumab))、AME-133v(AppliedMolecularEvolution)、 ocaratuzumab(MentrikBiotech)、PRO131921、托西莫单抗、替伊莫单抗、 hA20(Immunomedics,Inc.)、BLX-301(BiolexTherapeutics)、Reditux (Dr.Reddy’sLaboratories)和PRO70769(在WO2004/056312中描述的)。
Ublituximab(UtuxinTM、LFB-R603、TG20、EMAB603)是一种单克 隆抗体,其靶向在CD20上的特异性和独特表位,并且该抗体已经被生物 工程化用于增强的临床活性和效力。
利妥昔单抗是一种针对CD20抗原的基因工程化的嵌合鼠/人单克隆 抗体。利妥昔单抗在美国专利号5,736,137中被称为“C2B8”抗体。在美 国专利号5,736,137中公开了利妥昔单抗抗体的氨基酸序列和在中国仓鼠 卵巢(CHO)细胞中经由重组表达抗体生产的示例性方法,将其全部内容 通过引用结合于此。
奥法木单抗是抗CD20IgG1κ人单克隆抗体。研究表明,与利妥昔单 抗相比,奥法木单抗以较慢的速率与CD20分离并且结合近膜的表位。 Zhangetal.,Mabs1:326-331(2009)。表位作图表明,相比于由利妥昔单抗 靶向的位置,奥法木单抗结合定位更靠近于CD20的N-末端的表位并且包 括抗原的胞外环。同前。
因此,在一些实施方式中,抗CD-20抗体或其片段选自由这样的抗体 组成的组:该抗体结合于与ublituximab利妥昔单抗、奥法木单抗、奥瑞 珠单抗、维妥珠单抗、GA101、AME-133v、PRO131921、托西莫单抗、 hA20或PRO70769相同的表位。在一些实施方式中,抗CD20抗体或其 片段是ublituximab利妥昔单抗、奥法木单抗、奥瑞珠单抗、维妥珠单抗, GA101、AME-133v、PRO131921、托西莫单抗、hA20、PRO70769或其 片段。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其片段结合于与ublituximab相同 的表位。在一些实施方式中,抗CD20抗体或其片段结合于包含CD20的 氨基酸N153-S179的序列。在一些实施方式中,抗CD20抗体或其片段结 合于在CD20的氨基酸N153-S179中的不连续表位。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其片段以特征为小于约10-7M、 小于约10-8M或小于约10-9M的解离常数KD的亲和力结合于CD20。在 一些实施方式中,抗CD20抗体或其片段以特征为10-10至10-9M的解离 常数KD的亲和力结合于CD20。在一些实施方式中,抗CD20抗体或其 片段以特征为0.7×10-9M的解离常数KD的亲和力结合于CD20。如在抗 体结合解离常数的情况下使用的,术语“约”考虑到用于测量抗体亲和力 的方法中固有变化的程度。例如,取决于使用的仪器的精确度水平,基于 所测量的样本的数量的标准误差和舍入误差,术语“约10-2M”可以包括, 例如,从0.05M至0.005M。
在一些实施方式中,抗CD20抗体对表现出Fc-γRIII(CD16)的高 亲和力。在一些实施方式中,由于抗体的Fc区对于CD16的它们的高亲 和力,这样的抗体不被IgG多克隆抗体替换,特别不被血清中存在的IgG 替换。在一些实施方式中,抗体以至少2×106M-1、至少2×107M-1、2× 108M-1或2×107M-1的亲和力结合于CD16(例如,在巨噬细胞上表达的), 亲和力是例如,如通过Scatchard分析或BIAcore技术(基于无标记表面 等离子体共振的技术)测定的。
在一些实施方式中,抗CD20抗体表现出特征为在该抗体的Fc区中 以低岩藻糖含量的糖基化模式。例如,在一些实施方式中,组合物包含抗 CD20抗体,其中,该抗体包括结合在Fc-γ糖基化位点(Asn297,EU编 号)上的N-糖苷连接的糖链,其中,在组合物的所有抗体的N-糖苷连接 的糖链中,岩藻糖含量是小于65%、小于60%、小于55%、小于50%、 小于45%或小于40%。在一些实施方式中,在组合物的所有抗体的N-糖 苷连接的糖链中,岩藻糖含量是15至45%或20至40%。
在一些实施方式中,抗CD20抗体表现出有效的体外抗体依赖性细胞 毒性(ADCC)。在一些实施方式中,使用来自于健康供体的自然杀伤(NK) 细胞以50ng/ml的浓度,抗CD20抗体产生至少约10%、至少约15%、至 少约20%、至少约25%或至少约30%的ADCC平台(plateau)。测量ADCC 的技术在本领域中是已知的,并且在例如,deRomeaufetal.,BritishJournal ofHaematology140:635-643(2008)中提供。在一些实施方式中,使用来自 于健康供体的自然杀伤(NK)细胞以50ng/ml的浓度,抗CD20抗体产 生在约35%处的ADCC平台。
在一些实施方式中,抗CD20抗体可以降低NF-κ-B活性。在一些实 施方式中,抗CD20抗体可以降低SNAIL表达。在一些实施方式中,抗 CD20抗体可以提高RKIP活性。在一些实施方式中,抗CD20抗体可以 增加PTEN活性。在一些实施方式中,抗CD20抗体可以提高细胞对于 TRAIL凋亡的致敏。
在一些实施方式中,抗CD20抗体是Fc-γ-RIIIA(CD16)优化的。已 经在例如美国专利号7,931,895中描述能够活化III型Fc受体并具有特定 的聚糖结构的抗体,将其全部内容通过引用结合于此。因此,在一些实施 方式中,如在美国专利号7,931,895中描述的,用双触角和/或寡聚甘露糖 苷型的N-糖基化作用在Asn297(EU编号)上修饰抗CD20抗体。例如, 在美国公开申请号2005/0271652中提供了制备抗体的方法,该抗体对于免 疫系统的效应细胞的受体CD16具有强的亲和性,将其全部内容通过引用 结合于此。
在一些实施方式中,抗CD20抗体具有高ADCC活性。例如,在美国 专利号7,713,524中提供了生产具有高ADCC活性的抗体方法,在此通过 引用将其全部内容结合于此。
Ublituximab包括下面提供的抗体序列:
可变重链CDR1:GlyTyrThrPheThrSerTyrAsn(SEQIDNO:1)
可变重链CDR2:IleTyrProGlyAsnGlyAspThr(SEQIDNO:2)
可变重链CDR3:AlaArgTyrAspTyrAsnTyrAlaMetAspTyr(SEQID NO:3)
可变重链:
GlnAlaTyrLeuGlnGlnSerGlyAlaGluLeuValArgProGlyAlaSerVal LysMetSerCysLysAlaSerGlyTyrThrPheThrSerTyrAsnMetHisTrp ValLysGlnThrProArgGlnGlyLeuGluTrpIleGlyGlyIleTyrProGly AsnGlyAspThrSerTyrAsnGlnLysPheLysGlyLysAlaThrLeuThrVal GlyLysSerSerSerThrAlaTyrMetGlnLeuSerSerLeuThrSerGluAsp SerAlaValTyrPheCysAlaArgTyrAspTyrAsnTyrAlaMetAspTyrTrp GlyGlnGlyThrSerValThrValSerSer(SEQIDNO:4)
恒定重链:
AlaSerThrLysGlyProSerValPheProLeuAlaProSerSerLysSerThrSer GlyGlyThrAlaAlaLeuGlyCysLeuValLysAspTyrPheProGluProVal ThrValSerTrpAsnSerGlyAlaLeuThrSerGlyValHisThrPheProAla ValLeuGlnSerSerGlyLeuTyrSerLeuSerSerValValThrValProSerSer SerLeuGlyThrGlnThrTyrIleCysAsnValAsnHisLysProSerAsnThr LysValAspLysLysValGluProLysSerCysAspLysThrHisThrCysPro ProCysProAlaProGluLeuLeuGlyGlyProSerValPheLeuPheProPro LysProLysAspThrLeuMetIleSerArgThrProGluValThrCysValVal ValAspValSerHisGluAspProGluValLysPheAsnTrpTyrValAspGly ValGluValHisAsnAlaLysThrLysProArgGluGluGlnTyrAsnSerThr TyrArgValValSerValLeuThrValLeuHisGlnAspTrpLeuAsnGlyLys GluTyrLysCysLysValSerAsnLysAlaLeuProAlaProIleGluLysThrIle SerLysAlaLysGlyGlnProArgGluProGlnValTyrThrLeuProProSer ArgAspGluLeuThrLysAsnGlnValSerLeuThrCysLeuValLysGlyPhe TyrProSerAspIleAlaValGluTrpGluSerAsnGlyGlnProGluAsnAsn TyrLysThrThrProProValLeuAspSerAspGlySerPhePheLeuTyrSer LysLeuThrValAspLysSerArgTrpGlnGlnGlyAsnValPheSerCysSer ValMetHisGluAlaLeuHisAsnHisTyrThrGlnLysSerLeuSerLeuSer ProGlyLys(SEQIDNO:5)
可变轻链CDR1:SerSerValSerTyr(SEQIDNO:6)
可变轻链CDR2:AlaThrSer(SEQIDNO:7)
可变轻链CDR3:GlnGlnTrpThrPheAsnProProThr(SEQIDNO:8)
可变轻链:
GlnIleValLeuSerGlnSerProAlaIleLeuSerAlaSerProGlyGluLysVal ThrMetThrCysArgAlaSerSerSerValSerTyrMetHisTrpTyrGlnGln LysProGlySerSerProLysProTrpIleTyrAlaThrSerAsnLeuAlaSerGly ValProAlaArgPheSerGlySerGlySerGlyThrSerTyrSerPheThrIleSer ArgValGluAlaGluAspAlaAlaThrTyrTyrCysGlnGlnTrpThrPheAsn ProProThrPheGlyGlyGlyThrArgLeuGluIleLys(SEQIDNO:9)
恒定轻链:
ThrValAlaAlaProSerValPheIlePheProProSerAspGluGlnLeuLysSer GlyThrAlaSerValValCysLeuLeuAsnAsnPheTyrProArgGluAlaLys ValGlnTrpLysValAspAsnAlaLeuGlnSerGlyAsnSerGlnGluSerVal ThrGluGlnAspSerLysAspSerThrTyrSerLeuSerSerThrLeuThrLeu SerLysAlaAspTyrGluLysHisLysValTyrAlaCysGluValThrHisGln GlyLeuSerSerProValThrLysSerPheAsnArgGlyGluCys(SEQID NO:10)
因此,在一些实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍 生物包含免疫球蛋白重链可变结构域(VH结构域)、基本上由免疫球蛋 白重链可变结构域(VH结构域)组成或由免疫球蛋白重链可变结构域(VH 结构域)组成,其中,VH结构域的CDR中的至少一个(即,一个、两个 或三个)具有这样的氨基酸序列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、 95%、96%、97%、98%、99%或同一于序列SEQIDNO:1、2或3的CDR1、 CDR2或CDR3区,其中,包含VH结构域的抗体或其抗原结合片段可以 特异地或优先地结合于CD20。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包含免疫球蛋白重链可变结构域(VH结构域)、基本上由免疫球蛋白重 链可变结构域(VH结构域)组成或由免疫球蛋白重链可变结构域(VH 结构域)组成,其中,VH结构域的CDR中的至少一个(即,一个、两个 或三个)具有同一于序列SEQIDNO:1、2或3的CDR1、CDR2或CDR3 区的氨基酸序列,除了1、2、3、4或5个保守的氨基酸取代,其中,包 含VH结构域的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以特异地或优先 地结合于CD20。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包含VH结构域、基本上由VH结构域组成或由VH结构域组成,该VH 结构域具有这样的氨基酸序列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、91%、 92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一于SEQIDNO: 4的VH氨基酸序列,其中,包含VH结构域的抗体或其抗原结合片段、 变体或衍生物可以特异地或优先地结合于CD20。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包含重链、基本上由重链组成或由重链组成,该重链具有这样的氨基酸序 列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、 96%、97%、98%、99%或100%同一于包含SEQIDNO:4和5的重链氨 基酸序列,其中,包含重链的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以 特异地或优先地结合于CD20。
在一些实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物包 含免疫球蛋白轻链可变结构域(VL结构域)、基本上由免疫球蛋白轻链 可变结构域(VL结构域)组成或由免疫球蛋白轻链可变结构域(VL结构 域)组成,其中,VL结构域的CDR中的至少一个(即,一个、两个或三 个)具有这样的氨基酸序列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、95%、 96%、97%、98%、99%或同一于序列SEQIDNO:6、7或8的CDR1、 CDR2或CDR3区,其中,包含VL结构域的抗体或其抗原结合片段可以 特异地或优先地结合于CD20。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包含免疫球蛋白轻链可变结构域(VL结构域)、基本上由免疫球蛋白轻 链可变结构域(VL结构域)组成或由免疫球蛋白轻链可变结构域(VL结 构域)组成,其中,VL结构域的CDR中的至少一个(即,一个、两个或 三个)具有与SEQIDNO:6、7或8的CDR1、CDR2或CDR3区同一的 氨基酸序列(除了1、2、3、4或5个保守的氨基酸取代),其中,包含 VL结构域的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以特异地或优先地 结合于CD20。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包含VL结构域、基本上由VL结构域组成或由VL结构域组成,该VL 结构域具有这样的氨基酸序列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、91%、 92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一于SEQIDNO: 9的VL氨基酸序列,其中,包含VL结构域的抗体或其抗原结合片段、 变体或衍生物可以特异地或优先地结合于CD20。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包含轻链、基本上由轻链组成或由轻链组成,该轻链具有这样的氨基酸序 列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、 96%、97%、98%、99%或100%同一于包括SEQIDNO:9和10的重链氨 基酸序列,其中,包含轻链的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以 特异地或优先地结合于CD20。
在一些实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物包 含以下、基本上由以下组成或由以下组成:免疫球蛋白重链可变结构域 (VH结构域)和免疫球蛋白轻链可变结构域(VL结构域),其中,VH 结构域的CDR中的至少一个(即,一个、两个或三个)具有这样的氨基 酸序列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、 99%或同一于序列SEQIDNO:1、2或3的CDR1、CDR2或CDR3区, 其中,VL结构域的CDR中的至少一个(即,一个、两个或三个)具有这 样的氨基酸序列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、 98%、99%或同一于序列SEQIDNO:6、7或8的CDR1、CDR2或CDR3 区,并且其中,包括VH结构域和VL的抗体或其抗原结合片段可以特异 地或优先地结合于CD20。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包括、基本上由以下组成或由以下组成:免疫球蛋白重链可变结构域(VH 结构域)和免疫球蛋白轻链可变结构域(VL结构域),其中,VH结构域 的CDR中的至少一个(即,一个、两个或三个)具有同一于序列SEQID NO:1、2或3的CDR1、CDR2或CDR3区的氨基酸序列(除了1、2、3、 4或5个保守的氨基酸取代),其中,VL结构域的CDR中的至少一个(即, 一个、两个或三个)具有同一于SEQIDNO:6、7或8的CDR1、CDR2 或CDR3区的氨基酸序列(除了1、2、3、4或5个保守的氨基酸取代), 并且其中,包括VH和VL的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以 特异地或优先地结合于CD20。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包括序列SEQIDNO:1、2和3的VHCDR1、CDR2和CDR3区和序列 SEQIDNO:6、7和8的VLCDR1、CDR2和CDR3区。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包含以下、基本上由以下组成或由以下组成:VH结构域和VL结构域, 其中,该VH具有这样的氨基酸序列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、 91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一于 SEQIDNO:4的VH氨基酸序列,其中,该VL具有这样的氨基酸序列, 该氨基酸序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、 97%、98%、99%或100%同一于SEQIDNO:9的VL氨基酸序列,并且 其中,包括VH和VL结构域的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可 以特异地或优先地结合于CD20。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其抗原结合片段包含SEQIDNO: 4的VH和SEQIDNO:9的VL。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其抗原结合片段结合于与包括 SEQIDNO:4的VH和SEQIDNO:9的VL的抗体相同的表位。
在另一种实施方式中,分离的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物 包含以下、基本上由以下组成或由以下组成:重链和轻链,其中,该重链 具有这样的氨基酸序列,该氨基酸序列至少80%、85%、90%、91%、92%、 93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%同一于包括SEQIDNO: 4和5的重链氨基酸序列,其中,该轻链具有这样的氨基酸序列,该氨基 酸序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、 98%、99%或100%同一于包括SEQIDNO:9和10的重链氨基酸序列, 并且其中,包括重链的抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物可以特异地 或优先地结合于CD20。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其抗原结合片段包括重链(该重 链包括SEQIDNO:4和5)和轻链(该轻链包括SEQIDNO:9和10)。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其抗原结合片段结合于与包括 SEQIDNO:4和SEQIDNO:5的抗体相同的表位。
在一些实施方式中,抗CD20抗体是ublituximab。
在一些实施方式中,抗体是EMAB603(参见WO2006/064121,将其 全部内容通过引用结合于此),由克隆R603-12D11生产该抗体,以登录 号CNCMI-3529保藏于法国微生物保藏中心(CollectionNationaledes CluturesdeMicroorganismes)。
在一些实施方式中,在大鼠杂交瘤YB2/0细胞系(细胞 YB2/3HL.P2.G11.16Ag.20,注册于美国典型培养物保藏中心,ATCC号 CRL-1662)中产生抗CD20抗体。
能够特异性结合CD20并且保留希望的活性的抗体的精确化学结构取 决于许多因素。由于在分子中存在可电离的氨基和羧基,可以以酸式盐或 碱式盐或以中性形式获得特定多肽。当在合适的环境条件中放置时保留它 们的生物学活性的所有这样的制剂包括在如在本文中使用的抗CD20抗体 的限定中。此外,通过使用糖组分衍生化(糖基化)或通过其他补充分子 如脂质、磷酸酯、乙酰基等可以增加抗体的基本氨基酸序列。还可以通过 与糖类的结合增加它。通过生产宿主的翻译后加工系统完成这种增加的某 些方面;可以在体外引入其他这种修饰。无论如何,只要不破坏抗CD20 抗体希望的性能,这种修饰就包括在本文中使用的抗CD20抗体的限定中。 希望在各种试验中,通过提高或降低该多肽的活性,这些修饰可以定量地 或定性地影响活性。此外,通过氧化、还原或者其他衍生化可以修饰链中 的单个氨基酸残基,并且可以裂解该多肽以获得保留活性的片段。这种改 变不破坏希望的性能(例如,对CD20的结合特异性),这种改变没有从 在本文中使用的感兴趣的抗CD20抗体的限定中去除该多肽序列。
本领域提供了关于多肽变体的制备和应用的基本指引。在抗CD20结 合分子(例如,抗体或其抗原结合片段、变体或衍生物)的变体制备中, 本领域的技术人员可以容易地确定,对于天然蛋白质的核苷酸或氨基酸序 列的哪些修饰将产生变体,该变体适合用作为药物组合物的治疗活性成 分。
仅在框架区或仅在抗体分子的CDR区引入突变是可能的。引入的突 变可以是沉默或中性错义突变,即,没有或者很少影响抗体结合抗原的能 力。这些类型的突变可以是有用的以优化密码子使用或提高杂交瘤的抗体 产生。可替代地,非中性错义突变可以改变抗体结合抗原的能力。大多数 沉默和中性错义突变的位置很可能是在框架区中,而大多数非中性错义突 变的位置很可能是在CDR中,尽管这不是绝对的要求。本领域的技术人 员将能够设计和测试具有希望性能的突变体分子,该希望性能如抗原结合 活性没有改变或结合活性改变(例如,抗原结合活性提高或抗体特异性改 变)。在突变形成后,可以常规地表达编码的蛋白质,并且使用在本文中 描述的技术或通过本领域已知的常规修饰技术可以确定所编码的蛋白的 功能和/或生物学活性,(例如,免疫特异性结合至少一个CD20多肽的表 位的能力)。
在一些实施方式中,抗CD20抗体包括至少一个优化的互补决定区 (CDR)。“优化的CDR”意指CDR已经被修饰并且优化的序列,基于 给予抗CD20抗体(包括最优化的CDR)的持续不变的或改进的结合亲和 力和/或抗CD20活性选择该序列。“抗CD20活性”可以包括,例如,活 性,该活性调节一种或多种与CD20有关的以下活性,例如,诱导B细胞 凋亡的能力、诱导ADCC针对B细胞(例如,CLL细胞)的能力、抑制 NF-κB活性的能力、抑制Snail表达的能力、去阻遏(de-repress)RKIP 的能力、去阻遏PTEN的能力、使肿瘤细胞对TRAIL-凋亡敏感的能力或 与CD20相关的任何其他活性。例如,在Baritakietal.,InternationalJournal ofOncology38:1683-1694(2011)中描述了这样的活性,将其全部内容通过 引用结合于此。该修饰可以包括CDR内氨基酸残基的取代,使得抗CD20 抗体保留了对CD20抗原的特异性并且具有改进的结合亲和力和/或改进 的抗CD20活性。
在某些抗CD20抗体或其抗原结合片段中,一个或多个恒定区结构域 的至少一部分已缺失或另外改变以提供希望的生物化学特征,如降低的效 应器功能、非共价二聚化的能力、提高的在肿瘤部位处定位的能力、降低 的血清半衰期或与大约相同免疫原性的完整的未改变的抗体相比增加的 血清半衰期。例如,某些抗体是结构域缺失的抗体,该抗体包括与免疫球 蛋白重链类似的多肽链,但该抗体缺少一个或多个重链结构域中的至少一 部分。例如,在某些抗体中,修饰的抗体的恒定区中的一个完整结构域将 缺失,例如,CH2结构域的全部或部分将缺失。
在某些抗CD20抗体或其抗原结合片段中,使用本领域已知的技术可 以突变Fc部分以降低效应器功能。例如,恒定区的修饰可用于修饰二硫 键或寡糖部分,其允许由于增加的抗原特异性或抗体适应性引起的增强的 定位。使用公知的免疫学技术可以容易地测量和定量该修饰的所产生的生 理学轮廓、生物用度以及其他生物化学效应而无需过多实验。
在一些实施方式中,抗CD20抗体或其抗原结合片段将不会引起待治 疗的动物(例如,人)中的有害免疫应答。在一种实施方式中,可以使用 本领域公认的技术修饰抗CD20抗体或其抗原结合片段以降低其免疫原 性。例如,抗体可以是人源化、灵长类化、去免疫化或可以制造嵌合抗体。 这些类型的抗体是来自于非人抗体,通常是小鼠或灵长类抗体,该抗体保 留或基本保留亲代抗体的抗原结合性能,但该抗体在人中的免疫原性较 低。这可以通过多种方法实现,包括(a)将整个非人可变结构域结合至 人恒定区以生成嵌合抗体;(b)将一个或多个非人互补决定区(CDR) 中的至少一部分结合至人框架区和恒定区,保留或不保留关键的框架残 基;或(c)移植整个非人可变结构域,但通过替换表面残基用人样部分 “掩护”它们。这样的方法公开于Morrisonetal.,Proc.Natl.Acad.Sci. 81:6851-6855(1984);Morrisonetal.,Adv.Immunol.44:65-92(1988); Verhoeyenetal.,Science239:1534-1536(1988);Padlan,Molec.Immun. 28:489-498(1991);Padlan,Molec.Immun.31:169-217(1994)和美国专利号 5,585,089、5,693,761、5,693,762和6,190,370,将其全部内容通过引用将 所有这些结合于此。
可以使用本领域已知的技术,由完整前体或亲本抗体制成抗体或其抗 原结合片段的修饰形式。
使用本领域已知的技术可以制造或加工抗CD20抗体或其抗原结合片 段。在一些实施方式中,抗体分子或其片段是“重组产生的”,即,是使 用重组DNA技术产生的。通过本领域已知的任何合适的方法包括多克隆 抗体的产生或单克隆抗体的制备,例如,通过杂交瘤或噬菌体展示可以产 生抗CD20抗体或其片段。
各种宿主-表达载体系统可用于表达抗体分子。可以用两个表达载体 (编码重链衍生的多肽的第一载体和编码轻链衍生的多肽的第二载体)共 -转染该宿主细胞。这两个载体可包含相同的选择标志物,该选择标志物 使得能够等量表达重链和轻链多肽。可替代地,可以使用单个载体,该载 体编码重链和轻链多肽。在这种情况下,将轻链有利地置于重链之前以避 免过量的有毒游离重链(Proudfoot,Nature322:52(1986);Kohler,Proc.Natl. Acad.Sci.USA77:2197(1980))。也可以用编码重链衍生的多肽和轻链衍 生的多肽的单一载体转染宿主细胞。重链和轻链的编码序列可包括cDNA 或基因组DNA。
可以通过常规技术将表达载体或载体转入宿主细胞并且随后通过常 规技术培养转染的细胞以产生抗体。因此,提供了包含可操作地连接至不 同的启动子的编码抗体或其重链或轻链的多核苷酸的宿主细胞。在表达双 链抗体的一些实施方式中,可以在宿主中共表达编码重链和轻链的载体以 表达整个免疫球蛋白分子。
宿主-表达系统代表这样的载体,通过该载体,可以产生并且随后纯 化感兴趣的编码序列,而且也代表这样的细胞,当用合适的编码序列的核 苷酸转化或转染时,该细胞可以原位表达CD20抗体。这些包括,但不局 限于:微生物,如用包含抗体编码序列的重组噬菌体DNA、质粒DNA或 粘粒DNA表达载体转化的细菌(例如,大肠杆菌(E.coli)、枯草芽孢杆 菌(B.subtilis));用包含抗体编码序列的重组酵母表达载体转化的酵母 (例如,酵母菌属毕赤酵母(Saccharomyces,Pichia));用包含抗体编 码序列的重组病毒表达载体(如杆状病毒)感染的昆虫细胞系统;用重组 病毒表达载体(例如,花椰菜花叶病毒、CaMV;烟草花叶病毒,TMV) 感染的或用包含抗体编码序列的重组质粒表达载体(例如Ti质粒)转化 的植物细胞系统;或带有重组表达构建体的哺乳动物细胞系统(例如, COS、CHO、BLK、293、3T3细胞),该重组表达构建体包含来自于哺 乳动物细胞的基因组的启动子(例如,金属硫蛋白启动子)或哺乳动物病 毒的启动子(例如腺病毒晚期启动子;牛痘病毒7.5K启动子)。细菌细 胞如大肠杆菌或真核细胞(例如,用于整个重组抗体分子的表达)用于重 组抗体分子的表达。例如,哺乳动物细胞如中国仓鼠卵巢细胞(CHO), 连同载体如来自于人巨细胞病毒的主要中间早期基因启动子元件是抗体 的有效表达系统(Foeckingetal.,Gene45:101(1986);Cockettetal., Bio/Technology8:2(1990))。在一些实施方式中,抗CD20抗体在不是CHO 细胞的宿主细胞中产生。
一旦抗体已经被重组地表达,可以通过领域中已知的用于纯化免疫球 蛋白分子的任何方法,例如,通过层析(例如,离子交换、亲和、特别是 通过蛋白A之后特异抗原的亲和,以及分级柱层析(sizingcolumn coromatography))、离心、差别溶解或通过用于蛋白质纯化的任何其他 标准技术纯化该抗体。
在一些实施方式中,抗CD20抗体是由大鼠杂交瘤细胞系产生的。在 一些实施方式中,抗CD20抗体是在YB2/0(ATCCCRL-1662)中产生的。
IV.药物组合物
可以以任何顺序或者任何时间间隔(由本领域技术人员测定的)给予 式A的化合物和抗CD20抗体。例如,可以顺序地(以任何顺序)、同时 或经由顺序和同时给予的任何组合给予式A的化合物和抗CD20抗体。可 以在同一药物组合物中或在单独的药物组合物中给予式A的化合物和抗 CD20抗体。
可以根据通过本领域的技术人员可以确定和测定的任何数量的希望 的间隔:分钟(例如,0-60分钟)、小时(例如,0-24小时)、天(例如, 0-7天)和/或周(例如,0-52周)进行组合的给予(无论是同时、顺序地 (以任何顺序)或两者)。剂量还可以随着时间变化,例如,开始用每周 一次的剂量一段时间(例如持续1、2、3、4、5或6周),随后剂量是每 两周一次、每三周一次、每四周一次、每五周一次或每六周一次。
可以将式A的化合物和抗CD20抗体配制为药物组合物,用于给予至 包括人在内的哺乳动物。该药物组合物包含药学上可接受的载体,该载体 包括例如离子交换剂、氧化铝、硬脂酸铝、卵磷脂、血清蛋白(如人血清 白蛋白)、缓冲物质(如磷酸盐、甘氨酸、山梨酸、山梨酸钾、饱和植物 脂肪酸的部分甘油酯混合物)、水、盐或电解质(例如硫酸鱼精蛋白、磷 酸氢二钠、磷酸氢钾、氯化钠、锌盐、硅溶胶(colloidalsilica)、三硅酸 镁、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素类物质、聚乙二醇、羧甲基纤维素钠、聚丙 烯酸酯、蜡、聚乙烯-聚氧丙烯-嵌段聚合物、聚乙二醇和羊毛脂)。
可以通过任何合适的方法,例如,肠胃外、心室内、口服、通过吸入 喷雾、局部、直肠、鼻、颊、阴道或经由植入的贮器给予该组合物。在一 些实施方式中,口服给予式A的化合物。如在本文中使用的术语“肠胃外” 包括皮下、静脉内、肌内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶 内和头颅内注射或输注技术。
肠胃外的制剂可以是单次注射剂量、输注或加载(loading)注射剂量 量,随后为维持剂量。可以以具体固定的或可变的间隔,例如,每天一次 或者在“根据需要”的基础上给予这些组合物。在一些实施方式中,静脉 内(IV)给予抗CD20抗体。
可以以可接受的剂型(包括,例如,胶囊剂、片剂、水性混悬剂或溶 液剂)口服给予某些药物组合物。也可以通过鼻气雾剂或吸入给予某些药 物组合物。采用苯甲醇或其他合适的防腐剂、提高生物用度的吸收促进剂 和/或其他常规增溶剂或分散剂,可以将这样的组合物制备成盐水溶液。
对于任何特定患者的具体剂量和治疗方案将取决于多种因素,包括使 用的特定治疗剂、患者的年龄、体重、一般健康状况、性别和饮食和给予 时间、排泄速度、药物组合和正在被治疗的特定疾病的严重性。医学护理 者对这些因素的判断是在本领域普通技术人员的范围内。该剂量也取决于 待治疗的个体患者、给予途径、制剂类型、使用的化合物的特性、疾病的 严重性和希望的效果。可以通过本领域众所周知的药理学和药物动力学原 理确定使用的量。
在一些实施方式中,以低于187.5mg/m2、75mg/m2、37.5mg/m2、15 mg/m2、7.5mg/m2,3.75mg/m2的剂量给予抗CD20抗体。在一些实施方 式中,给予的剂量可以是187.5mg/m2至75mg/m2、75mg/m2至37.5mg/m2、 75mg/m2至15mg/m2、75mg/m2至7.5mg/m2或75mg/m2至3.75mg/m2。
在一些实施方式中,以每天10至2500mg/天、10至1500mg/天、50 至1000mg/天、100至750mg/天、150至500mg/天的剂量范围给予式A 的化合物。在一些实施方式中,给予的剂量可以是200至400mg/天。在 一些实施方式中,给予的剂量可以是500、1000、1500、2000或2500mg/ 天。
增补的活性化合物也可以掺入至组合物中。例如,可以用一种或多种 另外的治疗剂如抗癌剂共同配制和/或共同给予抗CD20抗体和式A的化 合物。
V.试剂盒
本发明提供了试剂盒,该试剂盒包含式A的化合物、抗CD20抗体、 其他试剂,并且该试剂盒可用于执行在本文中描述的方法和它们的组合。 在某些实施方式中,试剂盒在一个或多个容器(container)中包含至少一 种针对CD20的纯化的抗体以及与式A的化合物组合使用该抗体的说明 书。在一些实施方式中,试剂盒包含式A的化合物以及与抗CD20抗体组 合使用抑制剂的说明书。在一些实施方式中,试剂盒包含至少一种抗CD20 抗体和式A的化合物。
在本文中还提供了包含一个或多个容器的药物试剂盒,容器填充有一 种或多种本发明的药物化合物和组合物中的组分,包括,式A的化合物和 /或一种或多种抗CD20抗体。这种试剂盒还可以包括,例如,其他化合物 和/或组合物,用于给予化合物和/或组合物的装置和以调节药品或生物制 品的制造、使用或销售的政府机构规定的形式书面的说明书。
本领域技术人员将容易认识到,本公开的抗体和在本文中描述的式A 的化合物可以容易地结合至一种现有的试剂盒形式中,该试剂盒形式在本 领域中是众所周知的。
进一步提供的是这样的试剂盒,该试剂盒包含(a)式A的化合物、 抗CD20抗体或其组合和(b)另外的抗癌剂。在一些实施方式中,另外 的抗癌剂是化疗剂。
VI.使用式A的化合物和抗CD20抗体的组合的方法
在治疗受试者中的疾病或失调的方法中可以使用式A的化合物和抗 CD20抗体的组合。
因此,提供了式A的化合物在制备用于治疗增生性失调的药物中的应 用,其中,将与抗CD20抗体组合(例如,顺序地或同时地)给予式A的 化合物。另外,还提供了抗CD20抗体在制备用于治疗增生性失调的药物 中的应用,其中,将与式A的化合物组合(例如,顺序地或同时地)给予 抗CD20抗体。
本发明进一步提供了通过给予患者有效量的本发明的组合从而在患 者中抑制PI3Kδ同种型和/或CD20的方法。
本发明进一步提供了通过给予患者有效量的本发明的组合从而在患 者中治疗、预防和/或抑制PI3Kδ介导的疾病、失调或病症和/或CD20介 导的疾病、病症或病症(如癌或其他增生性疾病或失调)的方法。
本发明进一步提供了通过给予患者有效量的本发明的组合从而在患 者中治疗PI3Kδ同种型和/或CD20相关的疾病、失调或病症的方法。在一 种实施方式中,通过选择性抑制PI3Kδ和/或CD20,在组合中给予的化合 物的量足以治疗PI3Kδ同种型和/或CD20相关的疾病、失调或病症。
本发明进一步提供了一种通过给予需要这种治疗的患者有效量的本 发明的至少式A的化合物和抗体从而治疗增生性疾病的方法。在一种实施 方式中,在组合中给予的化合物的量足以通过选择性抑制PI3Kδ和/或抑 制CD20治疗增生性疾病。
本发明进一步提供了通过给予需要这种治疗的患者有效量的本发明 的组合,与至少一种其他抗癌剂进一步组合(同时地或顺序地),从而治 疗增生性疾病的方法。在一种实施方式中,给予的化合物A的量足以通过 选择性抑制PI3Kδ治疗增生性疾病或促进增生性疾病的治疗。
本发明的组合在包括但不限于以下的各种癌症的治疗中是有用的:
·癌,包括膀胱癌、乳癌、结肠癌、肾癌、肝癌、肺癌(包括小细 胞肺癌)、食道癌、胆囊癌、子宫癌、卵巢癌、睾丸癌、喉癌、 口腔癌、胃肠道癌(例如,食道癌、胃癌、胰腺癌)、脑癌、宫 颈癌、甲状腺癌、前列腺癌、血癌和皮肤癌(包括鳞状细胞癌);
·淋巴世系的造血肿瘤,包括白血病、急性淋巴细胞白血病、急性 成淋巴细胞白血病、B细胞淋巴瘤、T-细胞淋巴瘤、霍奇金氏淋 巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、毛细胞性淋巴瘤和伯基特淋巴瘤;
·骨髓世系的造血肿瘤,包括急性和慢性粒细胞白血病、骨髓增生 异常综合征和早幼粒细胞白血病;
·起源于间充质的肿瘤,包括纤维肉瘤和横纹肌肉瘤;
·中枢和外周神经系统的肿瘤,包括星形细胞瘤、成神经细胞瘤、 神经胶质瘤和神经鞘瘤;和
·其他肿瘤,包括黑素瘤、精原细胞瘤、畸胎瘤、骨肉瘤、着色性 干皮病、角化棘皮瘤、甲状腺滤泡癌和卡波济肉瘤。
本发明的组合作为细胞凋亡的调节剂,在癌症(包括但不限于上面在 本文中提及的那些类型)的治疗、预防和抑制中是有用的。
本发明的组合在癌症的化学预防中是有用的。化学预防包括通过阻断 初始化致突变事件、阻断已经遭受损伤的前恶性细胞的进展或抑制肿瘤复 发来抑制侵入性癌症的发展。这些化合物在抑制肿瘤血管生成和转移中也 是有用的。本发明的一种实施方式是通过给予有效量的一种或多种本发明 的化合物从而在患者中抑制肿瘤血管生成或转移的方法。
本发明进一步提供了治疗免疫系统相关疾病(例如自身免疫性疾病)、 涉及炎症的疾病或失调(例如,哮喘、慢性阻塞性肺病、类风湿性关节炎、 炎性肠病、肾小球肾炎、神经炎性疾病、多发性硬化、葡萄膜炎和免疫系 统的失调)、癌或其他增生性疾病、肝脏疾病或失调或肾疾病或失调的方 法。该方法包括给予有效量的本发明的组合。
可以由本发明的化合物治疗的免疫失调的实例包括但不限于牛皮癣、 类风湿性关节炎、脉管炎、炎性肠道疾病、皮炎、骨关节炎、哮喘、炎性 肌病、过敏性鼻炎、阴道炎、间质性膀胱炎、硬皮病、骨质疏松症、湿疹、 同种异体或异种移植(器官、骨髓、干细胞和其他细胞和组织)移植排斥、 移植物抗宿主病、红斑狼疮、炎症性疾病、I型糖尿病、肺纤维化、皮肌 炎、干燥综合征、甲状腺炎(例如桥本氏和自身免疫性甲状腺炎)、重症 肌无力、自身免疫性溶血性贫血、多发性硬化、囊性纤维化、慢性复发肝 炎、原发性胆汁性肝硬化、过敏性结膜炎和特应性皮炎。
本发明进一步提供了通过给予治疗有效量的本发明的组合从而在患 者中治疗白血病的方法。例如,本发明的方法可有效用于治疗慢性淋巴细 胞性白血病(CLL)、非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)、急性粒细胞白血病(AML)、 多发性骨髓瘤(MM)、小淋巴细胞性淋巴瘤(SLL)或无痛性非霍奇金 氏淋巴瘤(I-NHL)。
在上述治疗方法中,可以连同本发明的组合给予一种或多种另外的活 性剂。例如,在与已知的抗癌治疗如放射疗法或与一种或多种细胞抑制剂、 细胞毒性剂或抗癌剂的组合(同时地或顺序地给予)中,本发明的组合是 有用的,细胞抑制剂、细胞毒性剂或抗癌剂如,例如,DNA相互作用剂, 如顺铂或多柔比星;拓扑异构酶II抑制剂,如依托泊苷;拓扑异构酶I抑 制剂如CPT-11或拓扑替康;微管蛋白相互作用剂,如紫杉醇、多西他赛 或埃博霉素(例如伊沙匹隆),天然存在的或合成的;激素剂,如他莫昔 芬;胸苷酸合成酶抑制剂,如5-氟尿嘧啶;和抗代谢物,例如甲氨蝶呤; 其他酪氨酸激酶抑制剂,例如易瑞沙和OSI-774;血管生成抑制剂;EGF 抑制剂;VEGF抑制剂;CDK抑制剂;SRC抑制剂;c-Kit抑制剂;Her1/2 抑制剂以及针对生长因子受体的单克隆抗体,例如爱必妥(EGF)和赫赛 汀(Her2);和其他蛋白激酶调节剂。另外的活性剂也可以是蛋白酶体抑 制剂,硼替佐米()、卡非佐米(PR-171)、PR-047、双硫仑、乳 胞素、PS-519、eponemycin、环氧霉素、阿克拉霉素、CEP-1612、MG-132、 CVT-63417、PS-341、乙烯基砜三肽抑制剂、利托那韦、PI-083, (+/-)-7-methylomuralide,(-)-7-methylomuralide、来那度胺() 或它们的组合。
本发明的组合在与一种或多种类固醇抗炎药、非类固醇抗炎药 (NSAID)或免疫选择性抗炎衍生物(ImSAID)的组合(同时或顺序地 给予)中也是有用的。
在一种特定的实施方式中,癌症是恶性血液病和/或实体瘤。在另一种 特定的实施方式中,恶性血液病是白血病或淋巴瘤。
在一些实施方式中,淋巴瘤是一种成熟的(外周)B细胞瘤。在具体 的实施方式中,成熟的B细胞瘤选自由以下各项组成的组:B细胞慢性淋 巴细胞性白血病/小淋巴细胞性淋巴瘤;B细胞前淋巴细胞性白血病;淋巴 浆细胞性淋巴瘤;边缘区淋巴瘤,如脾边缘区B细胞淋巴瘤(+/-绒状淋 巴细胞)、结边缘区淋巴瘤(+/-单核细胞样B细胞)和粘膜相关的淋巴 组织(MALT)类型的结外边缘区B细胞淋巴瘤;毛细胞白血病;血浆细 胞骨髓瘤/浆细胞瘤;滤泡性淋巴瘤,滤泡中心;套细胞淋巴瘤;弥散性大 细胞B细胞淋巴瘤(包括纵膈大B细胞淋巴瘤、血管内大B细胞淋巴瘤 和原发性渗出性淋巴瘤);和伯基特淋巴瘤/伯基特细胞白血病。
在一些实施方式中,淋巴瘤选自由以下组成的组:多发性骨髓瘤(MM) 和非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)、套细胞淋巴瘤(MCL)、滤泡性淋巴瘤、 瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症(WM)或B细胞淋巴瘤和弥漫性大B细胞 淋巴瘤(DLBCL)。
在进一步特定的实施方式中,白血病选自由以下各项组成的组:急性 淋巴细胞性白血病/急性成淋巴细胞白血病(ALL)、急性粒细胞白血病 (AML)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)和小淋巴细胞淋巴瘤(SLL)。 在一些实施方式中,非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)是侵略性NHL或无痛性 NHL。侵略性NHL的实例包括B细胞瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤、T-/NK 细胞瘤、间变性大细胞淋巴瘤、外周T-细胞淋巴瘤、前体B成淋巴细胞 性白血病/淋巴瘤、前体T成淋巴细胞性白血病/淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、 成人T-细胞淋巴瘤/白血病(HTLV1+)、原发性中枢神经系统(CNS)淋 巴瘤、套细胞淋巴瘤、多态性移植后淋巴增生性失调(PTLD)、AIDS- 相关的淋巴瘤、真性组织细胞性淋巴瘤和母细胞性NK-细胞淋巴瘤。侵略 性NHL最常见的类型是弥漫性大细胞淋巴瘤。无痛性NHL非限制性实例 包括滤泡性淋巴瘤、小淋巴细胞淋巴瘤、边缘区淋巴瘤(如结外边缘区淋 巴瘤(也称为粘膜相关的淋巴组织--MALT淋巴瘤)、结边缘区B细胞淋 巴瘤(单核细胞样B细胞淋巴瘤),脾边缘区域淋巴瘤)和淋巴浆细胞性 淋巴瘤(瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症)。在一些实施方式中,受试者患 有侵略性NHL或无痛性NHL。
在一些实施方式中,受试者患有选自由以下组成的组的病症:套细胞 淋巴瘤(MCL)、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、滤泡性淋巴瘤(FL)、 急性淋巴细胞性白血病(ALL)、急性粒细胞白血病(AML)、慢性淋巴 细胞性白血病(CLL)和小淋巴细胞淋巴瘤(SLL)、多发性骨髓瘤(MM) 和边缘区淋巴瘤。
在一些实施方式中,患者患有复发的或难治性的病症。在特定的实施 方式中,该受试者是化学疗法治疗难治的或在化学疗法治疗后复发。
在一些实施方式中,癌症对于利妥昔单抗的治疗有抗性。在一些实施 方式中,癌症表现出对于利妥昔单抗的治疗减弱的响应。在一些实施方式 中,该受试者先前曾用利妥昔单抗治疗。
在一种特定的实施方式中,方法包括在受试者中降低NF-κB活性的水 平、降低SNAIL表达、增加RKIP活性、增加PTEN活性、增加肿瘤对 TRAIL-细胞凋亡的敏感性、降低PI3Kδ活性的水平,或它们的组合。
在一种特定实施方式中,式A的化合物和抗CD20抗体的组合耗竭来 自于人全血的B细胞。在一些实施方式中,与式A的化合物或抗CD20 抗体单独耗竭来自于人全血的B细胞相比,式A的化合物与抗CD20抗体 的组合更大程度耗竭来自于人全血的B细胞。在一些实施方式中,式A 的化合物与抗CD20抗体的组合耗竭来自于人全血的B细胞的程度大于通 过式A的化合物的耗竭和通过抗CD20抗体的耗竭的总和。
在一些实施方式中,式A的化合物和抗CD20抗体用于治疗与B细胞 过度增殖有关的疾病或失调的方法,其中,该方法包括将式A的化合物和 抗CD20抗体给予至需要其的受试者。在一些实施方式中,式A的化合物 和抗CD20抗体用于在治疗与过度的B细胞活性有关的疾病或失调的方法 中使用,其中,该方法包括将化合物A和抗CD20抗体给予至需要其的受 试者。在一些实施方式中,式A的化合物和抗CD20抗体用于在治疗与过 量的B细胞数目有关的疾病或失调的方法中使用,其中,该方法包括将化 合物A和抗CD20抗体给予至需要其的受试者。
可以使用如在国际专利申请公开号WO2011/055215A2和美国专利申 请号2011/0118257A1中公开的通用合成方法制备式A的化合物,并且具 体的化合物制备是如在2012年7月4日提交的印度临时专利申请 2693/CHE/2012,2012年8月21提交的美国临时专利申请美国序列号 61/691,586,2013和7月2日提交的PCT/US2013/055434和2013年7月2 日提交的美国序列号13/933,856中公开的。通过引用将这些申请和出版物 中的每一个的全部内容结合于此。
实施例
式A的化合物的合成
除非另有说明,纯化意味着柱层析,该柱层析使用硅胶作为固定相并 且使用石油醚(沸点为60-80℃)和乙酸乙酯的混合物或合适极性的二氯 甲烷和甲醇作为流动相。术语“RT”是指室温(25-28℃)。
中间体1:2-(1-溴乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮
步骤-1[1-(5-氟-2-羟苯基)-2-(3-氟苯基)乙酮]:将3-氟苯基乙酸(7.33g, 47.56mmol)溶解在25ml二氯甲烷中。在0℃下向该混合物添加草酰氯 (7.54g,59.46mmol)和DMF(3滴)并搅拌30分钟。蒸发出溶剂并且 溶解溶解在25ml二氯甲烷中。向该混合物添加4-氟苯甲醚(5.00g,39.64 mmol)并冷却至0℃。在0℃下添加A1Cl3(7.95g,59.46mmol)并将反 应混合物加热至RT并搅拌12小时。该反应混合物通过添加2NHCl淬灭、 用乙酸乙酯萃取、经硫酸钠干燥并且浓缩。用乙酸乙酯:石油醚通过柱层 析纯化粗产物,得到无色固体状的标题化合物(4.5g,45%产率)。1H-NMR (δppm,DMSO-D6,400MHz):δ11.34(s,1H),7.75(dd,J=9.4,3.1Hz,1H), 7.42(m,2H),7.12(m,3H),7.05(dd,J=9.0,4.5Hz,1H),4.47(s,2H)。
步骤-2[2-乙基-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮]:将从步骤-1获得的 1-(5-氟-2-羟苯基)-2-(3-氟苯基)乙酮(3.00g,12.08mmol)置于圆底烧瓶 中,向其中添加三乙胺(25ml)和丙酸酐(4.92g,37.82mmol),随后 将该混合物回流24小时。在冷却至RT后,该反应混合物通过添加1NHCl 溶液酸化、用乙酸乙酯萃取、用碳酸氢钠溶液洗涤、用硫酸钠干燥并浓缩。 用乙酸乙酯:石油醚通过柱层析纯化粗产物,得到浅黄色固体状的标题化 合物(1.80g,52%产率)。1H-NMR(δppm,DMSO-D6,400MHz):δ7.80(m, 1H),7.76(m,2H),7.51(dd,J=8.0,6.4Hz),7.22(m,1H),7.18(m,2H),2.56 (q,J=7.6Hz,2H),1.20(t,J=7.6Hz,3H)。
步骤-3:向获得自步骤-2的2-乙基-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮 (1.80g,6.28mmol)在四氯化碳(20ml)中的溶液添加N-溴琥珀酰亚 胺(1.11g,6.28mmol)溶液,并加热至80℃。在80℃下,添加偶氮二 异丁腈(10mg)至反应混合物中。12小时后,将反应混合物冷却至RT, 用二氯甲烷稀释,并用水洗涤。经硫酸钠干燥有机层并在减压下浓缩,得 到黄色固体状的粗的标题化合物(1.25g,55%产率)。1H-NMR(δppm, DMSO-D6,400MHz):δ7.91(dd,J=9.2,4.3Hz,1H),7.81(dt,J=8.2,2.8Hz, 1H),7.74(dd,J=8.3,3.1Hz,1H),7.57(m,1H),7.32(dt,J=8.5,2.4Hz,1H), 7.19(m,2H),5.00(q,J=6.8Hz,1H),1.97(d,J=6.8Hz,3H)。
中间体2:6-氟-3-(3-氟苯基)-2-(1-羟乙基)-4H-色烯-4-酮
向中间体1(15.0g,40.84mmol)在DMSO(150ml)中的溶液添加 正丁醇(7.5ml),并将其加热至120℃持续3小时。将反应混合物冷却 至RT,用水淬灭并用乙酸乙酯萃取。经硫酸钠干燥有机层并在减压下浓 缩。用乙酸乙酯:石油醚通过柱层析纯化粗产物,得到灰白色固体状的标 题化合物(7.90g,64%)。1H-NMR(δppm,CDCl3,400MHz):7.85(dd,J =8.1,3Hz,1H),7.54(dd,J=9.2,4.2Hz,1H),7.47-7.37(m,2H),7.15-6.98 (m,3H),4.74(五重峰,J=6.8Hz,1H),2.23(d,J=7.4Hz,1H),1.54(d,J= 6.6Hz,3H)。
中间体3:2-乙酰基-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮
将DMSO(5.60ml,79.14mmol)添加至二氯甲烷(40ml)中,并 冷却至-78℃,然后添加草酰氯(3.40ml,39.57mmol)。10分钟后,逐 滴滴加二氯甲烷(54ml)中的中间体2(6.00g,19.78mmol)并且搅拌 20分钟。添加三乙胺(12ml)并搅拌1小时。将反应混合物用水淬灭并 用二氯甲烷萃取。经硫酸钠干燥有机层并在减压下浓缩。用乙酸乙酯:石 油醚通过柱层析纯化粗产物,得到黄色固体状的标题化合物(4.2g,71%), 将其原样用于下一步骤。
中间体4:(S)-6-氟-3-(3-氟苯基)-2-(1-羟乙基)-4H-色烯-4-酮
向中间体3(2.00g,6.66mmol)添加R-Alpine硼烷(0.5M在THF 中,20ml)并将其加热至60℃持续20小时。将反应混合物用2NHCl淬 灭并用乙酸乙酯萃取。经硫酸钠干燥有机层并在减压下浓缩。用乙酸乙酯: 石油醚通过柱层析纯化粗产物,得到灰白色固体状的标题化合物(1.51g, 75%)。对映异构体过量:94.2%,在快速洗脱异构体中富集(保留时间: 8.78分钟),如在手性(chiralpak)AD-H柱上通过HPLC测定的。
中间体5:(R)-4-氯苯甲酸1-(6-氟-3-(3-氟苯基)-4-氧代-4H-色烯-2-基)乙基酯((R)-1-(6-fluoro-3-(3-fluorophenyl)-4-oxo-4H-chromen-2-yl)ethyl4-chlorobenzoate)
向中间体4(1.45g,4.78mmol)在THF(15ml)中的溶液添加4- 氯苯甲酸(0.748g,4.78mmol)和三苯基膦(1.88g,7.17mmol)并且加 热至45℃,紧接着添加偶氮二甲酸二异丙酯(1.4m1,7.17mmol)。1 小时后,将反应混合物浓缩并用乙酸乙酯:石油醚洗脱通过柱层析纯化残 余物,得到灰白色固体状的标题化合物(1.81g,86%),其不经纯化用 于下一步骤。
中间体6:(R)-6-氟-3-(3-氟苯基)-2-(1-羟乙基)-4H-色烯-4-酮
方法A
将在甲醇(17ml)中的中间体5(1.75g,3.96mmol)冷却至10℃, 添加碳酸钾(0.273g,1.98mmol)并搅拌30分钟。浓缩反应混合物,用 2NHCl溶液酸化,用乙酸乙酯萃取,经硫酸钠干燥并减压浓缩该反应混 合物。用乙酸乙酯:石油醚通过柱层析纯化粗产物,得到黄色固体状的标 题化合物(1.05g,87%产率)。对映异构体过量:93.6%,在迟洗脱异构 体(保留时间:11.12分钟)中富集,如在手性AD-H柱上通过HPLC测 定的。
方法B
步骤-1[(R)-2-(1-(苄氧基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮]:向 二氯甲烷中的1-(5-氟-2-羟苯基)-2-(3-氟苯基)乙酮(11.00g,44.31mmol) 添加HATU(33.7g,88.63mmol)和R-(+)2-苄氧基丙酸(9.58g,53.17mmol) 并搅拌10分钟。逐滴滴加三乙胺(66.7ml,0.47mol)并在RT下搅拌24 小时。反应混合物用水淬灭并用二氯甲烷萃取,经硫酸钠干燥并减压浓缩。 用乙酸乙酯:石油醚通过柱层析纯化粗产物,得到黄色固体状的标题化合 物(10.5g,60%产率)。1H-NMR(δppm,CDCl3,400MHz):7.85(dd,J=8.1,3 Hz,1H),7.58(dd,J=9.1,4.1Hz,1H),7.47-7.39(m,1H),7.39-7.34(m,1H), 7.28-7.20(m,3H),7.20-7.14(m,2H),7.16-7.07(m,1H),6.99-6.89(m,2H), 4.50-4.31(m,3H),1.56(d,J=6.4Hz,3H)。
步骤-2:在二氯甲烷(110ml)中的在步骤-1中获得的(R)-2-(1-(苄氧 基)基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮(10.5g,26.69mmol)被冷却至0℃、 分批加入氯化铝(5.35g,40.03mmol)并在RT下搅拌6小时。反应混合 物用2NHCl溶液淬灭,用二氯甲烷萃取,经硫酸钠干燥并减压浓缩。用 乙酸乙酯:石油醚通过柱层析纯化粗产物,得到黄色固体的中间体6(6.1 g,76%产率)。对映异构体过量:97.7%,在迟洗脱异构体(保留时间: 11.12分钟)中富集,如在手性AD-H柱上通过HPLC测定的。
中间体7:4-溴-2-氟-1-异丙氧基苯
向4-溴-3-氟苯酚(10g,52.35mmol)在THF(100ml)中的溶液添 加异丙醇(4.8ml,62.62mmol)和三苯基膦(20.6g,78.52mmol)并加 热至45℃,随后(添加)偶氮二甲酸二异丙酯(15.4m1,78.52mmol)。 将混合物回流1小时,浓缩该混合物并用乙酸乙酯:石油醚通过柱层析纯 化残余物,得到无色液体状的标题化合物(13.1g,99%产率),其不经 纯化用于下一步骤。
中间体8:2-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷(2-(3-fluoro-4-isopropoxyphenyl)-4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolane)
向中间体7(10.52g,107.2mmol)在二氧六环(二噁烷)(125ml) 中的溶液添加醋酸钾(10.52g,107.2mmol)和双(频哪醇合)二硼(15g, 58.96mmol),并将溶液脱气30分钟。在氮气气氛下添加[1,1'-双(二苯基 膦基)二茂铁]二氯钯(II)CH2Cl2(4.4g,5.36mmol)并加热至80℃。12小 时后,经硅藻土过滤并浓缩该反应混合物。用乙酸乙酯:石油醚通过柱层 析纯化粗产物,得到黄色油状的标题化合物(13.9g,99%),其不经纯 化用于下一步骤。
中间体9:3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺
向3-碘-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺(11.0g,42.14mmol)在DMF(110 ml)中的溶液添加乙醇(55ml)和水(55ml)、中间体8(23.4g,84.28 mmol)和碳酸钠(13.3g,126.42mmol)并脱气30分钟。在氮气气氛下 添加四(三苯基膦)钯(0)(2.4g,2.10mmol)并加热至80℃。12小时后, 经硅藻土过滤,浓缩并用乙酸乙酯萃取该反应混合物。经硫酸钠干燥有机 层并在减压下浓缩。用乙醚磨碎粗产物,过滤并在真空下干燥,得到浅棕 色固体状的标题化合物(3.2g,26%产率),其原样用于下一步骤。
(RS)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮
向中间体9(0.080g,0.293mmol)在DMF(2ml)中的溶液添加碳 酸钾(0.081g,0.587mmol)并在RT下搅拌10分钟。向该混合物添加中 间体1(0.215g,0.587mmol)并搅拌12小时。将反应混合物用水稀释并 用乙酸乙酯萃取。经硫酸钠干燥有机层并在减压下浓缩。用甲醇:二氯甲 烷通过柱层析纯化粗产物,得到淡黄色固体状的标题化合物(0.045g)。 MP:175-177℃。1H-NMR(δppm,DMSO-D6,400MHz):δ8.20(s,1H),7.85 (dd,J=81,3.0Hz,1H),7.48-7.33(m,5H),7.14(t,J=8.3Hz,1H),7.02(m, 2H),6.90(m,1H),6.10(q,J=7.1Hz,1H),5.42(s,2H),4.64(五重峰,J=6.0 Hz,1H),1.99(d,J=7.1Hz,3H),1.42(d,J=6.1Hz,6H)。
(S)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮(“S-异构体”)
向中间体9(0.134g,0.494mmol)在THF(2.0ml)中的溶液添加中 间体6(0.150g,0.494mmol)和三苯基膦(0.194g,0.741mm1)并在 RT下搅拌5分钟。添加偶氮二甲酸二异丙酯(0.15ml,0.749mmol)并 加热至45℃。2小时后,用水淬灭反应混合物,并用乙酸乙酯萃取。经硫 酸钠干燥有机层并在减压下浓缩。用乙酸乙酯:石油醚通过柱层析纯化粗 产物,得到灰白色固体状的标题化合物(0.049g,20%产率)。MP: 139-142℃。质量:571.7(M+)。对映异构体过量:如在手性AD-H柱上 通过HPLC测定的89.8%,在快速洗脱异构体(保留时间=10.64分钟.)中 富集。
(R)-2-(1-(4-氨基-3-(3-氟-4-异丙氧基苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-1-基)乙基)-6-氟-3-(3-氟苯基)-4H-色烯-4-酮
向中间体8(0.284g,0.989mmol)在THF(5.0ml)中的溶液添加中 间体4(0.250g,0.824mmol)和三(4-甲氧基)苯基膦(0.435g,1.23mml) 并在RT下搅拌5分钟。添加偶氮二甲酸二异丙酯(0.25ml,1.23mmol) 并在RT下搅拌。12小时后,用水淬灭反应混合物并用乙酸乙酯萃取。经 硫酸钠干燥有机层并在减压下浓缩。用乙酸乙酯:石油醚通过柱层析纯化 粗产物,得到灰白色固体状的标题化合物(0.105g,22%产率)。MP: 145-148℃。质量:571.7(M+)。对映异构体过量:如在手性AD-H柱上 通过HPLC测定的95.4%,在迟洗脱的异构体(保留时间=14.83min)中 富集。
生物学评价
式A的化合物和抗CD20抗体的组合
实施例1:式A的化合物的S-异构体和Ublituximab的组合耗竭来自于全 血的B细胞
流式细胞仪检测用于比较式A的化合物的S-异构体、Ublituximab (Ubx)和它们的组合耗竭来自于人全血(HWB)的B细胞的能力。在该 检测中,分别用式A的化合物的S-异构体(1000nM),UBX(100μg/ml 至0.1μg/ml)或UBX与式A的化合物的S-异构体(1000nM)组合处理 50μl的HWB样品并在37℃和5%CO2下孵育24hrs。将20μl处理过的 样品放入1.5ml离心管中并用CD45FITC和CD19PE或CD20FITC抗体 标记并在RT下在暗处孵育1小时。添加1ml红血细胞(RBC)裂解溶液, 并且在3000rpm下离心试管10分钟。吸去上清,添加250μl的PBS至沉 淀(pellet)。将该试管涡旋,并且在easyCyteTM流式细胞仪上获 取5000个事件,并用Incyte软件分析它们。
对于CD19,进一步分析CD45-阳性细胞的选通的群体(gated population)。计算CD45和CD19阳性的细胞数,并且该数据表示为在群 体中的CD19阳性细胞的百分比。用荧光阳性减去未标记的细胞选通的 CD20-阳性群体,并且该数据表示为在群体中CD20-阳性细胞的百分比。 计算CD19/CD20群体由对照的减少(loss),并且将其表示为相对于对照 的%耗竭。
结果如图1所示。式A的化合物的S-异构体在最高达10μM的浓度 下对于B细胞没有细胞毒性。因此,用1μM的式A的化合物的S-异构体 没有观察到CD19-阳性或CD20-阳性HWBB细胞的降低。UBX抗CD20 抗体以1至100,000ng/ml的剂量仅仅产生B细胞的20-30%耗竭,但是它 引起了CD20+B细胞中的剂量依赖性减少。1000nM的式A的化合物的 S-异构体与10ng/ml的UBX的组合产生CD19+细胞耗竭的增强,并且 1000nM的式A的化合物的S-异构体与0.1-10ng/ml浓度的UBX的组合产 生对CD20+细胞耗竭的适度的加和效应。这些结果证明,式A的化合物 的S-异构体(1000nM)与UBX(10ng/ml)的组合显示CD19-阳性细胞 耗竭的增强和对CD20-阳性细胞耗竭适度的效应。
实施例2:式A的化合物的S-异构体和UBX组合影响LPS诱导的B细胞 增殖
流式细胞仪用于研究式A的化合物的S-异构体,Ubx及其组合对于 在HWB中LPS诱导的CD19和CD20细胞增殖的影响。在这些实验中, 分别用式A的化合物的S-异构体(10μM至0.1μM)、UBX(100μg/ml 至0.1μg/ml)或UBX与式A的化合物的S-异构体(1000nM)处理250μl 稀释的(用RPMI-HG培养基1:3.5)HWB样品15分钟,随后通过20μg/ml 的LPS诱导并且在37℃和5%CO2下培养72小时。将20μl处理过的样 品放入1.5ml离心管并用CD20FITC和CD19PE抗体标记并在RT下在 暗处培养1小时。添加1ml的RBC裂解液并在3000rpm下离心试管10 分钟。吸出上清液,并且添加250μl的PBS至沉淀。将试管涡旋,并且在 easyCyteTM流式细胞仪上获取5000个事件,并用Incyte软件分析 它们。
对于CD19和CD20,进一步分析淋巴细胞阳性细胞的选通的群体。 计算CD19和/或CD20阳性的细胞,并且数据表示为在群体中的百分比阳 性细胞。计算阳性群体由具有LPS诱导的对照的减少,并且将其表示为相 对于对照的%抑制。
结果如图2和图3所示。式A的化合物的S-异构体(1μM)引起LPS 诱导的使用HWB(~60%)的CD19+B细胞增殖的剂量依赖性抑制。由 于UBX对于CD19+细胞最小效应,将1μM的式A的化合物的S-异构体 添加至不同浓度的UBX不会增加响应超过~60%。然而,以100ng/ml浓 度的UBX注意到组合对于CD19+细胞增殖的加和效应。
与它对CD19+细胞增殖的效应相反,式A的化合物的S-异构体以1 μM显示出CD20+细胞的~40%的抑制。1μM的式A的化合物的S-异构 体与UBX的组合的加和效应是明显的,特别是对于0.1ng/ml的剂量。
实施例3:式A的化合物的S-异构体与UBX组合增加在癌细胞中的细胞 凋亡
为了确定式A的化合物的S-异构体、UBX和其组合在癌细胞中对于 细胞凋亡的影响,使用原位半胱天冬酶-3试剂盒(Millipore)。以0.5× 106细胞/ml的浓度将细胞铺于6孔板中,分别用式A的化合物的S-异构 体(1000nM)、UBX(100μg/ml至0.1μg/ml)或UBX与式A的化合物 的S-异构体(1000nM)处理并在37℃和5%CO2下孵育24小时。随后 将细胞转移至微量离心管中以接收10μl的新鲜制备的FLICATM试剂并且 在37℃和5%CO2下避光孵育1小时。在用洗涤缓冲液充分洗涤后,调整 测试样品以平衡PBS中的细胞数量。将100μl各细胞悬浮液转移至黑色 96-孔培养板,一式两份,并在酶标仪中在490nm的激发波长和520nm 的发射波长处读取荧光。从测试化合物的荧光强度中减去DMSO对照的 荧光强度。数据表示为最大响应(100%)的百分比并相应地作图。
结果如图4所示。UBX在测试的细胞系中显示出有限的诱导半胱天 冬酶-3活性的能力。通过用1μM的式A的化合物的S-异构体孵育细胞系, 半胱天冬酶-3活性增加40-75%。在Daudi细胞中,在100ng/ml的UBX 浓度处注意到组合的协同效应,而在UBX的较高浓度(10&100ng/ml) 处在RPMI-8226、Raji和U226B1细胞系中观察到加和效应。
实施例4:式A的化合物的S-异构体和UBX的组合引起细胞周期阻滞
将细胞周期检测试剂(Millipore)用于测定式A的化合物的S-异构体、 UBX、及其组合在癌细胞中对于细胞周期的影响。在这些实验中,将细胞 以0.5×106细胞/ml的浓度铺于6孔平板中,分别用式A的化合物的S-异 构体(10μM至0.1μM)、UBX(100μg/ml至0.1μg/ml)或UBX与式A 的化合物的S-异构体(1000nM)处理,并在37℃和5%CO2下孵育72小 时。将细胞转移至微量离心管中以接受50μl的细胞周期试剂并在RT下 避光孵育30分钟。随后用300-400μl的PBS稀释细胞,并且在 easyCyteTM流式细胞仪上获取最少10,000个事件。用ExpressPro 软件分析数据,并在直方图中呈现出相对于对照的细胞群体在不同的细胞 周期阶段中的百分比。
图5-图10示出用U266B1和Raji细胞获得的结果。另外,以下表1- 表12提供了使用U266B1、DB、Raji和Daudi细胞获得的定量结果。
表1:U266B1细胞-用式A的化合物孵育72h
表2:U266B1细胞-用UBX抗CD20抗体孵育72h
表3:U266B1细胞-用UBX+式A的化合物(1000nM)孵育72h
表4:DB细胞-用式A的化合物孵育72h
表5:DB细胞-用UBX抗CD20抗体孵育72h
表6:DB细胞-用UBX+式A的化合物孵育72h
表7:Raji细胞-用式A的化合物孵育72h
表8:Raji细胞-用UBX抗CD20抗体孵育72h
表9:Raji细胞-用UBX+式A的化合物(1000nM)孵育72h
表10:Daudi细胞-用式A的化合物孵育72h
表11:Daudi细胞-用UBX抗CD20抗体孵育72h
表12:Daudi细胞-用UBX+式A的化合物(1000nM)孵育72h
这些结果证明那些细胞接触式A的化合物的S-异构体,导致剂量依 赖性G2/M停滞。另外,用UBX处理72小时在弥散大B细胞淋巴瘤(DB) 和U266B1细胞中引起适度的G2/M停滞,而它在Raji和Daudi细胞中增 加了亚G0细胞的数量。与1μM的式A的化合物的S-异构体的组合跨 (across)受检细胞系加强了UBX响应。
实施例5:式A的化合物的S-异构体和UBX组合在癌细胞中协同增加细 胞凋亡
为了确定式A的化合物的S-异构体、UBX和其组合在癌细胞中对于 细胞凋亡的影响,使用原位半胱天冬酶-3试剂盒(Millipore)。以0.5× 106细胞/ml的浓度将细胞铺于6孔板中,分别用式A的化合物的S-异构 体(200-5000nM)、UBX(10,000ng/ml至10ng/ml)或UBX与式A的 化合物的S-异构体(如所示)处理,并在37℃和5%CO2下孵育24小时。 随后将细胞转移至微量离心管中以接收10μl的新鲜制备的FLICATM试剂 并且在37℃和5%CO2下避光孵育1小时。在用洗涤缓冲液充分洗涤后, 调整测试样品以平衡PBS中的细胞数量。将100μl各细胞悬浮液转移至黑 色96-孔培养板,一式两份,并在酶标仪中在490nm的激发波长和520nm 的发射波长处读取荧光。从测试化合物的荧光强度中减去DMSO对照的 荧光强度。数据表示为计算的半胱天冬酶-3活性组合指数(C.I.)。C.I. 小于1表示协同,等于1表示加和效应并且大于1表示拮抗。
在图11和表13-表15中示出DBCL细胞系LY1的结果。UBX在LY1 中诱导半胱天冬酶-3活性。在UBX(所有浓度)和式A的化合物的S-异 构体(1000nM)存在下,半胱天冬酶-3活性是协同增加的。
在图12和表16-表18中示出伯基特淋巴瘤细胞系Raji的结果。UBX 在RajiLY1中诱导半胱天冬酶-3活性。在UBX(所有浓度)和式A的化 合物的S-异构体(200nM)存在下,半胱天冬酶-3活性是协同增加的。
表13:用S-异构体孵育的LY1细胞
表14:用UBX孵育的LY1细胞
表15:用S-异构体和UBX孵育的LY1细胞
表16:用S-异构体孵育的Raji细胞
表17:用UBX孵育的Raji细胞
表18:用S-异构体和UBX孵育的Raji细胞
如上所述,针对式A的化合物的S-异构体和UBX的组合对半胱天冬 酶3活性的影响,评估三种另外的细胞系(LY10(DLBCL)、Toledo (DLBCL)和Daudi(伯基特淋巴瘤))。结果如表19-21所示。该组合 也证明了半胱天冬酶3的协同活化。
表19:用S-异构体和UBX孵育的LY10细胞(DLBCL)
表20:用S-异构体和UBX孵育的Toledo细胞(DLBCL)
表21:用S-异构体和UBX孵育的Daudi细胞(伯基特淋巴瘤)
如上所述,针对式A的化合物的S-异构体和UBX的组合对半胱天冬 酶3活性的影响,评估三种套细胞淋巴瘤(MCL)细胞系Jeko、Maver 和Rec-1。结果如表22-表24所示。该组合也证明半胱天冬酶3的协同活 化,其中在较高的S-异构体和UBX浓度处优化的协同效应。
表22:用S-异构体和UBX孵育的Jeko细胞
表23:用S-异构体和UBX孵育的Maver细胞
表24:用S-异构体和UBX孵育的Rec-1细胞
总之,这些结果示出,在B细胞淋巴瘤模型中,式A的化合物的S- 异构体和UBX在半胱天冬酶3(凋亡的标记物)的活化中发挥强有力的 协同作用。
上面借助于图示特定功能及其关系的实施的功能结构单元已经描述 了本发明。为了便于描述,已经任意地限定这些功能结构单元的界限。只 要特定功能和其关系得到适当地执行,可以限定替代的界限。
具体实施方式的前述的描述将如此充分地揭示本发明的一般性质以 至于其他人可以通过应用本领域技术内的知识容易地修改这些具体实施 方式和/或使这些具体实施方式适应各种应用,没有过度的实验、没有偏离 本发明的总体概念。因此,基于在本文中提供的教导和指导,这些改进和 修改都应属于所公开实施方式的等价物的意义和范围内。将要理解的是, 在本文中的用语或术语是为了描述的目的而不是限制的目的,使得技术人 员将根据教学和指导解释本说明书的术语或用语。在此通过引用将在本文 中引用的参考文献结合于此。
机译: 抗CD20抗体和PI3激酶选择性抑制剂的组合
机译: 抗CD20抗体和PI3激酶选择性抑制剂的组合
机译: 抗CD20抗体和PI3激酶选择性抑制剂的组合