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基于宏基因组16S高可变区V3的分类方法和装置

摘要

本发明公开一种基于宏基因组16S高可变区V3的分类方法和装置。该方法包括:提取微生物样品中的DNA;对宏基因组16S rDNA的高可变区V3进行扩增,对扩增产物进行Solexa建库,同时在建库过程中通过加上带有标签序列的接头,对每个样品进行标记;将带有标签序列的不同样品进行混合,混合后使用Solexa测序工具进行测序,得到按照标签区分的原始的测序序列reads;利用reads的重叠关系组装得到高可变区V3的全长序列unique reads;对unique reads进行分类分析,以实现对微生物群体的分类。本发明的方法和装置,对微生物群体的分类准确,且大大降低了测序成本。

著录项

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2015-02-04

    发明专利申请公布后的驳回 IPC(主分类):C12Q1/68 申请公布日:20120627 申请日:20111226

    发明专利申请公布后的驳回

  • 2012-09-05

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/68 申请日:20111226

    实质审查的生效

  • 2012-06-27

    公开

    公开

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