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一种基于基因组分析的癌症分期预测系统

摘要

本发明涉及一种基于基因组分析的癌症分期预测系统,包括依次连接的原始数据采集单元、组合特征预处理单元、联合基因选择单元、分类模型创建单元、预测单元;原始数据采集单元用于:获取癌症基因组图谱TCGA项目对应癌症亚型样本的RNAseq表达数据及临床信息,获取其中基因表达的RSEM值;组合特征预处理单元用于:离散化遗传特征;或者,添加1.0之后,使用log2转换RSEM值,并标准化log2转换后的RSEM值;联合基因选择单元用于:依次进行FCBF搜索、联合统计特征提取、logistic回归模型特征选择;分类模型创建单元用于生成分类模型,并优化其性能;本发明预测表现上面更稳定、更准确。

著录项

  • 公开/公告号CN111180009A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-05-19

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 山东大学;

    申请/专利号CN202010003411.1

  • 发明设计人 张海霞;李芳君;袁东风;

    申请日2020-01-03

  • 分类号

  • 代理机构济南金迪知识产权代理有限公司;

  • 代理人许德山

  • 地址 250199 山东省济南市历城区山大南路27号

  • 入库时间 2023-12-17 11:41:09

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-06-12

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B20/00 申请日:20200103

    实质审查的生效

  • 2020-05-19

    公开

    公开

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