一种基于协同矩阵分解的药物靶点相互作用关系预测方法

摘要

本发明公开了一种基于协同矩阵分解的药物靶点相互作用关系预测方法，不仅考虑药物属性相似性和靶点属性相似性，同时结合药物拓扑结构相似性和靶点拓扑结构相似性，提高药物靶点相互作用关系预测准确率。包括：获取药物属性相似度和靶点属性相似度数据、药物靶点相互作用关系数据；构建药物属性特征相似度矩阵、靶点属性特征相似度矩阵、药物拓扑相似矩阵和靶点拓扑相似矩阵；对药物靶点关联矩阵进行基于图正则的协同矩阵分解，并整合药物和靶点的属性特征相似度和拓扑结构相似度信息，得到最终目标函数；用牛顿方法迭代更新得到药物和靶点的特征表示，重构药物‑靶点相互作用关系矩阵，进行药物靶点相互作用关系的预测。