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基于T2-MRI和DW-MRI的宫颈癌图像自动分割方法

摘要

一种基于T2加权的核磁共振成像T2-MRI和弥散加权的核磁共振成像DW-MRI的宫颈癌图像自动分割方法,包括利用非线性配准方法将DW-MR图像配准到T2-MR图像,并对配准后的DW-MR图像进行分类;采用非线性各向异性扩散滤波技术对T2-MR图像进行滤波,分割出膀胱和直肠,并利用膀胱和直肠的分割结果将感兴趣区分割出来;对T2-MR图像的感兴趣区和DW-MR图像采用联合最大后验概率CMAP的方法进行肿瘤的精确分割。本发明充分利用了T2-MR图像和DW-MR图像的有效信息,可以有效地克服T2-MR图像中的噪声、局部容积效应和强度重叠的影响,是一种精确有效的宫颈癌分割方法,对预防、诊断和治疗宫颈癌有着重要的临床意义和应用价值。

著录项

  • 公开/公告号CN102999917A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2013-03-27

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国科学院自动化研究所;

    申请/专利号CN201210554664.3

  • 发明设计人 李悟;考月英;田捷;

    申请日2012-12-19

  • 分类号G06T7/00;

  • 代理机构中科专利商标代理有限责任公司;

  • 代理人戎志敏

  • 地址 100190 北京市海淀区中关村东路95号

  • 入库时间 2024-02-19 18:28:18

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2016-08-03

    授权

    授权

  • 2013-04-24

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06T7/00 申请日:20121219

    实质审查的生效

  • 2013-03-27

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明属于图像处理领域,具体涉及一种基于T2加权的核磁共振成 像T2-MRI和弥散加权的核磁共振成像DW-MRI的宫颈癌图像自动分割方 法。

背景技术

宫颈癌是严重威胁女性生命健康的常见恶性肿瘤之一。宫颈癌的准确 分割,对预防、诊断和治疗宫颈癌有着重要的临床意义和应用价值。

随着影像学技术的发展,医学图像分割已经成为医学图像分析领域里 关键和具有挑战性的问题。而宫颈癌分割又由于复杂的人体腹部组织结构 变得尤为复杂,单一成像模式T2-MRI不能完全显示宫颈癌的有效信息。 如图1(a)和(b)分别为宫颈癌病人腹部的T2-MR图像和DW-MR图像, 宫颈位于膀胱和直肠的中间。从图1(a)可以看出,T2-MR图像具有较 高空间分辨率,肿瘤边界比较清晰,但是宫颈的正常组织、肿瘤、膀胱壁和 直肠相互之间都有较严重的强度重叠;从图1(b)可以看出在DW-MR图 像中肿瘤具有明显较高的灰度值,但是其分辨率低,肿瘤边界较模糊。因 此单一成像模式下的宫颈癌分割的自动实现是相当困难的,一些常规的方 法例如区域增长和阈值等都无法很好的分割肿瘤。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基于T2-MRI和DW-MRI的宫颈癌图像自 动分割框架以及利用联合最大后验概率(CMAP)精确分割宫颈癌肿瘤区 域的方法,从而进行准确的宫颈癌分割。

为达到上述目的,一种基于T2加权的核磁共振成像T2-MRI和弥散加 权的核磁共振成像DW-MRI的宫颈癌图像自动分割方法,包括:

步骤1:利用非线性配准方法将DW-MR图像配准到T2-MR图像,并对 配准后的DW-MR图像进行分类;

步骤2:采用非线性各向异性扩散滤波技术对T2-MR图像进行滤波, 分割出膀胱和直肠,并利用膀胱和直肠的分割结果将感兴趣区分割出来;

步骤3:对T2-MR图像的感兴趣区和DW-MR图像采用联合最大后验概 率CMAP的方法进行肿瘤的精确分割。

本发明充分利用了T2-MR图像和DW-MR图像的有效信息,可以有 效地克服T2-MR图像中的噪声、局部容积效应和强度重叠的影响,是一 种精确有效的宫颈癌分割方法,对预防、诊断和治疗宫颈癌有着重要的临 床意义和应用价值。

附图说明

图1是宫颈癌病人的解剖结构图,(a)是T2-MR图像;(b)是DW-MR 图像;

图2是基于T2-MRI和DW-MRI的自动分割框架图;

图3是最大后验概率方法(CMAP)的流程图;

图4是基于T2加权的核磁共振成像(T2-MRI)和弥散加权的核磁共 振成像(DW-MRI)的宫颈癌图像自动分割框架实验效果图,(a)是原图; (b)红色轮廓线内为包含肿瘤和正常组织的感兴趣区;(c)配准到T2-MR 图像的DW-MR图像;(d)只在T2-MR图像上采用MAP方法的宫颈癌分 割结果(即β=0时);(e)在T2-MR图像和DW-MR图像上采用CMAP 方法的宫颈癌分割结果(即β=1时);(f)专家手工分割结果。

具体实施方式

为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚明白,以下结合具体实 施例,并参照附图,对本发明进一步详细说明。

本发明的核心思想是一种基于T2加权的核磁共振成像(T2-MRI)和 弥散加权的核磁共振成像(DW-MRI)的宫颈癌图像自动分割框架以及利 用联合最大后验概率(CMAP)精确分割宫颈癌肿瘤区域的方法,具体步 骤包括:首先,利用非线性配准方法将DW-MR图像配准到T2-MR图像 (这里采用互信息配准方法作为示例),并对配准后的DW-MR图像进行 分类;然后采用非线性各向异性扩散滤波技术对T2-MR图像进行滤波(这 里采用P-M非线性各向异性扩散滤波作为示例),接着分割出膀胱和直肠, 并利用膀胱和直肠的分割结果将感兴趣区(包含正常组织和肿瘤)分割出 来;最后对T2-MR图像的感兴趣区和DW-MR图像采用联合最大后验概 率(CMAP)的方法进行肿瘤的精确分割。

以下结合具体的实施例对根据本发明提供的这种基于T2加权的核磁 共振成像(T2-MRI)和弥散加权的核磁共振成像(DW-MRI)的宫颈癌图 像自动分割框架以及利用联合最大后验概率(CMAP)精确分割宫颈癌肿 瘤区域的方法进行详细描述。如图2所示为本发明提供的基于T2加权的 核磁共振成像(T2-MRI)和弥散加权的核磁共振成像(DW-MRI)的宫颈 癌图像自动分割框架的流程图,该方法包括以下步骤:

步骤1:利用非线性配准方法(如互信息配准方法、Demons算法等) 将DW-MR图像配准到T2-MR图像,并对配准后的DW-MR图像进行分 类;

步骤2:采用非线性各向异性扩散滤波技术对T2-MR图像进行滤波, 接着分割出膀胱和直肠,并利用膀胱和直肠的分割结果将感兴趣区(包含 正常组织和肿瘤)分割出来;

步骤3:对T2-MR图像的感兴趣区和DW-MR图像采用联合最大后验 概率(CMAP)的方法进行肿瘤的精确分割。

上述步骤1包括以下两小步:1)利用非线性配准方法将DW-MR图 像配准到T2-MR图像,这里采用互信息配准方法作为示例;2)对配准后 的DW-MR图像进行分类是采用的自动阈值分类方法,实现肿瘤的初步分 割及定位。

上述步骤2包括以下四步:1)采用非线性各向异性扩散滤波技术对 T2-MR图像进行滤波,在去除噪声的同时保持边缘信息,这里采用P-M 非线性各向异性扩散滤波作为示例;2)膀胱分割;3)直肠分割;4)感 兴趣区分割。

上述第一小步中P-M非线性扩散滤波器公式如下:

I(i;t)t=div(c(I(i;t))I(i;t))I(i;0)=I0(i)

其中I0(i)为图像在i处的像素强度值,i表示图像的位置信息为 (m,n),是梯度算子,t代表时间,c(·)是扩散系数,两种形式为:

c(I)=exp(-||I||2k2)

c(I)=11+(||I||k)2

其中k是梯度门限。

上述第二小步中膀胱分割采用的方法是主动轮廓模型。该模型的建立 是基于我们已有的先验知识——膀胱是腹腔T2-MR图像中灰度值最高的 较均匀的整块区域。

上述第三小步中直肠分割利用了直肠位于宫颈的下方这一先验知识 和步骤1中的肿瘤初步分割结果,在去除膀胱的T2-MR图像上采用了模 糊C均值的算法,得到直肠分割结果。

上述第四小步中感兴趣区分割,在去除膀胱和直肠的T2-MR图像上, 利用步骤1中肿瘤的初步分割结果,采用模糊C均值的算法,分割出包含 肿瘤和正常组织的感兴趣区,结果如图4(b)。

上述步骤3为对T2-MR图像的感兴趣区和DW-MR图像采用联合最 大后验概率(CMAP)的方法进行肿瘤的精确分割,结果如图4(e)。

下面具体介绍上述联合最大后验概率(CMAP)方法具体实施过程。

设y表示图像,yi,i=1,2,…N,表示图像在i处的灰度值,N表示图像的 像素的总个数。假定图像要被分为K类,以xi=k,k=1,2,…,K代表像素i被归 为第k类。联合最大后验概率(CMAP)方法的流程图如图3所示,其具 体步骤如下:1)计算T2-MR图像的能量函数UT2(x);2)计算DW-MR图 像的能量函数UDW(x);3)计算T2-MR图像和DW-MR图像的联合能量函 数UT2(x)+βUDW(x);4)判断是否满足终止条件,若满足,根据能量最小原 则判定肿瘤和正常组织的类别,从而输出精确分割的肿瘤区域;若不满足 终止条件返回步骤1)。每一小步中对应的计算公式在如下的讲述中会展示 出。

传统的MAP分割算法是求取分割结果使得后验概率P(x|y)最 大。即:

xΛMAP=argmaxxXP(x|y)

根据贝叶斯公式,P(x|y)可以表示为:

P(x|y)=P(y|x)P(x)P(y)P(y|x)P(x)

从上式可以看出,图像分割的目标转化为并求取分割结果x,使得 P(y|x)P(x)最大,即:

xΛMAP=argmaxxX{P(y|x)P(x)}

其中P(y|x)和P(x)分别为在给定分割x条件下的概率密度和先验概率。 下面计算P(y|x)和P(x)。

假定图像中噪声是高斯白噪声,则图像模型为:

yi=μik+nik

其中,μik是第k类组织在像素i处的灰度均值,nik第k类组织在像素i处 对应的高斯白噪声,它的分布服从正态分布故P(y|x)可以表示 为:

P(y|x)=Πk=1KΠiRkPk(yi|x)=Πk=1KΠiRk12πσikexp[-12(yi-μikσik)2]

=1(2π)1/2exp{-Σk=1KΣiRK[ln(σik)+12(yi-μikσik)2]}

P(x)由吉布斯分布表示为:

P(x)=1aexp{-UG(x)}

其中,a是归一化常数,UG(x)为能量函数:

UG(x)=Σk=1KUGk(x)=Σk=1KΣiRkΣjNib·Vk(xi,xj)

其中,Ni为第i位置的邻域,V(xi,xj)为势函数,b为常数。

最终将后验概率公式转化为:

P(x|y)∝exp{-U(x)}

分割目标进一步转化为求取分割结果x,使得能量函数最小,即

xΛMAP=argmaxxXU(x)

U(x)=Σk=1KΣiRk[12(yi-μikσik)2+ln(σik)]+Σk=1KΣiRkΣjNib·Vk(xi,xj)

上述第一小步中的T2-MR图像的能量函数UT2(x)可以根据U(x)的计算 公式计算出。

上述第二小步中的DW-MR图像的能量函数UDW(x)可以根据U(x)的计 算公式计算出。

由于T2-MR图像的后验概率PT2(x|yT2)和DW-MR图像的后验概率 PDW(x|yDW)是独立的,因此CMAP的分割方法就是求取分割结果使 得联合后验概率最大,即:

xΛCMAP=argmaxxX(PT2(x|yT2)PDW(x|yDW))

根据MAP算法中转化为能量函数的公式,将上式转化为

PT2(x|yT2)PDW(x|yDW)∝exp{-(UT2(x)+βUDW(x))}

其中β是权重系数,用来平衡T2-MR图像和DW-MR图像对分割结果的 影响程度。最后CMAP分割算法的问题就转化为了求取能量函数最小问题:

xΛCMAP=argmaxxX(UT2(x)+βUDW(x))

上述第三小步的T2-MR图像和DW-MR图像的联合能量函数 UT2(x)+βUDW(x)就可以根据上述公式计算出来。

当β=0时,CMAP方法就成为了MAP方法,此时的实验分割结果如 图4(d);当β取不同的值时,T2-MR图像和DW-MR图像对分割结果的 影响程度也就不同。

运行结果

为了验证本发明方法,我们采用手动分割宫颈癌作为标准参考。

图4给出了本发明给出的这种基于T2加权的核磁共振成像(T2-MRI) 和弥散加权的核磁共振成像(DW-MRI)的宫颈癌图像自动分割框架实验 效果图。(a)原图;(b)红色轮廓线内为包含肿瘤和正常组织的感兴趣区; (c)配准到T2-MR图像的DW-MR图像;(d)只在T2-MR图像上采用 MAP方法的宫颈癌分割结果(即β=0时);(e)在T2-MR图像和DW-MR 图像上采用CMAP方法的宫颈癌分割结果(即β=1时);(f)专家手工分 割结果。

实验表明,本发明方法-一种基于T2加权的核磁共振成像(T2-MRI) 和弥散加权的核磁共振成像(DW-MRI)的宫颈癌图像自动分割框架以及 利用联合最大后验概率(CMAP)精确分割宫颈癌肿瘤区域的方法-准确 的分割出了宫颈癌图像的肿瘤区域,达到了分割肿瘤的目的。

以上所述,仅为本发明中的具体实施方式,但本发明的保护范围并不 局限于此,任何熟悉该技术的人在本发明所揭露的技术范围内,可理解想 到的变换或替换,都应涵盖在本发明的包含范围之内,因此,本发明的保 护范围应该以权利要求书的保护范围为准。

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