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基于血液循环肿瘤DNA的单核苷酸变异检测方法、装置和存储介质

摘要

一种基于血液循环肿瘤DNA的单核苷酸变异检测方法、装置和存储介质,该方法包括:获取测试样本的血液循环肿瘤DNA各位点的突变数据,该突变数据包括位点突变频率;获取训练样本的每个位点背景突变频率的置信范围,该置信范围是通过对每一例训练样本中的所有三碱基突变频率和位点突变频率进行学习建模,并使用原地更新的列表对模型进行训练而得到;对测试样本的各位点的位点突变频率和模型中每个位点的背景突变频率的置信范围进行比较,输出测试样本的位点突变频率未在置信范围内的单核苷酸变异作为检测结果。本发明在大幅优化计算资源需求和检测速度的同时,提升了检测ctDNA单核苷酸突变的敏感性和准确性,满足肿瘤临床检测ctDNA单核苷酸突变可靠性需求。

著录项

  • 公开/公告号CN110010197A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-07-12

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 深圳裕策生物科技有限公司;

    申请/专利号CN201910255969.6

  • 申请日2019-03-29

  • 分类号G16B20/50(20190101);

  • 代理机构44281 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司;

  • 代理人孙银行;彭家恩

  • 地址 518081 广东省深圳市盐田区深盐路2002号大百汇高新技术工业园A栋913

  • 入库时间 2024-02-19 12:18:13

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-08-06

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B20/50 申请日:20190329

    实质审查的生效

  • 2019-07-12

    公开

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