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一种细菌中sRNA与其靶标mRNA相互作用的预测方法

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本发明公开了一种细菌中sRNA与其靶标mRNA相互作用的预测方法，包括如下步骤：1）数据收集和整理；2）特征提取，将数据集转换为矩阵；3）F‑score特征优化；4）训练构建SVM模型并进行预测得出预测结果。这种方法能有效表征RNA序列信息、提高sRNA‑靶标mRNA相互作用预测精度，同时，这种方法还具有成本低、耗时少、预测速度快的优点。

著录项

公开/公告号CN109859798A

专利类型发明专利
公开/公告日2019-06-07

原文格式PDF
申请/专利权人桂林电子科技大学;
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申请/专利号CN201910053867.6
发明设计人樊永显;崔娟;张龙;张向文;
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申请日2019-01-21
分类号
代理机构桂林市华杰专利商标事务所有限责任公司;
代理人刘梅芳
地址 541004 广西壮族自治区桂林市七星区金鸡路1号
入库时间 2024-02-19 11:04:53

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2019-07-02

实质审查的生效 IPC(主分类):G16B40/00 申请日:20190121

实质审查的生效
2019-06-07

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1. 一种细菌中sRNA与其靶标mRNA相互作用的预测方法 [P] . 中国专利： CN109859798A . 2019-06-07
2. 一种基于图与序列的深度嵌入学习的药物-靶标相互作用预测方法 [P] . 中国专利： CN113327644A . 2021-08-31
3. Control primer annealing to improve the specificity of annealing in nucleic acid amplification kit.Methods for amplifying a nucleic acid sequence of a DNA or a mixture of nucleic acids.And for selectively amplifying a nucleic acid sequence of a target DNA or a mixture of nucleic acids, and a sequence of the target nucleic acid from a mRNA.Method for detecting the complementarity of DNA to mRNA differentially expressed in two or more samples of nucleic acid, methods for amplifying a fragment of the cDNA and DNA quickly target.And to amplify a population of cDNAs of filament double full-length complementary to mRNAs cDNAs, and filament double fortified with 5 'complementary to mRNAs,Method to amplify rather than a sequence of nucleotu00ecdeo target at the same time, methods for producing a digital printing gDNA DNA, and RNA in a sample of mRNA.Method for identifying segments of homology is conserved in a family of multigene from a sample of mRNA, a method for the mutagenesis in a target [P] . BR0214741A . 2004-11-23

机译：控制引物退火，以提高核酸扩增试剂盒中退火的特异性。扩增DNA或核酸混合物的核酸序列的方法以及选择性扩增靶DNA或核酸混合物的核酸序列的方法用于检测DNA与两个或多个核酸样品中差异表达的mRNA的互补性的方法，扩增cDNA和DNA片段的方法可快速靶向。全长与mRNA cDNA互补的双细丝cDNA的cDNA群体，以及与mRNA互补的5'增强双细丝的cDNA，同时扩增而不是核苷酸靶序列的方法，产生数字印刷gDNA DNA的方法mRNA样品中的RNA和RNA.mRNA样品的多基因家族中用于鉴定同源片段的方法是保守的，这是一种在靶标中诱变的方法
4. Control primer annealing to improve the specificity of annealing in nucleic acid amplification, kit, methods for amplifying nucleic acid sequences of DNA and sequence of target nucleic acid or a mixture of nucleic acids, to detect the complementari Dade of DNA to mRNA differentially expressed in two or more samples of nucleic acid.To amplify a fragment of the cDNA target quickly, to amplify a population of cDNAs of filament double full-length complementary to mRNAs cDNAs, and filament double fortified with 5 'complementary to mRNAs to amplify rather than a sequence of nucleotide al VO at the same time, to produce a digital printing gDNA DNA, and RNA in a sample of mRNA.To identify segments of homology is conserved in a multigene family from a sample of mRNA, to identify a variation of nucleotide in a target nucleic acid, for mutagenesis in a target nucleic acid, and use of the initiator [P] . BRPI0214741B1 . 2015-05-12

机译：控制引物退火以改善核酸扩增中退火的特异性，试剂盒，扩增DNA核酸序列和靶核酸序列或核酸混合物的方法，检测DNA与mRNA互补表达的互补性（两种）或更多核酸样品。要快速扩增cDNA靶标的片段，以扩增与mRNA cDNA互补的长丝两倍全长的cDNA群体，并用与mRNA互补的5'双重修饰的长丝进行扩增而不是序列同时鉴定一个核苷酸的VO片段，以产生一个数字印刷的gDNA DNA和一个mRNA样品中的RNA。从一个mRNA样品中鉴定一个多基因家族中的同源片段是保守的，以鉴定一个核苷酸中一个核苷酸的变异。靶核酸，用于在靶核酸中诱变，以及引发剂的用途
5. Provision in which different types of biosubstu00e1ncias obtained from an organism of interest or synthetic substu00e1ncias interacting with these substu00e1ncias are arranged and fixed in a supposedYou, in an orderly fashion, a process for the production of a disposal method of identification of genotype, gene diagnostic method to identify human genotypes.Screening method for selecting a variety of transport of trace target of hu00ecbridos obtained, system analysis and display of genotype, system of quantitative analysis of local.The system of analysis of interaction of genes, screening method to select a variety of transport of trace target of hu00ecbridos obtained by crossing of bodies.The system of quantitative analysis of sites, method of quantitative analysis of trace to analyze a quantitative trait of an organism.Method of searching for a gene linked to the gene for expression of a trait of interest, improvement method of variety for bodies, system analysis of the interacti [P] . BRPI0410511A . 2006-06-20

机译：规定将从假定的生物或与这些物质相互作用的合成物质获得的不同类型的生物物质按照假定的方式有序地排列和固定，以一种有序方式生产识别方法基因型鉴定，基因诊断方法，鉴定人类基因型。筛选获得多种人类h虫痕量靶标的筛选方法，系统分析和显示基因型，局部定量分析系统，基因相互作用分析系统，筛选方法以选择通过人体交叉获得的h u00ecbridos的痕量靶标的各种转运方法。位点定量分析系统，痕量定量分析方法以分析生物的定量特征。与表达目的性状的基因相关的基因，机体多样性改良方法，相互作用系统分析