一种直接从全基因组重测序数据中得到微单体型及其分型的方法

摘要

本发明公开了一种直接从全基因组重测序数据中获取微单体型及其分型的方法，包括以下步骤：获取待测个体的全部SNP位点信息，根据测序深度筛选SNP位点，获得全基因组范围的微单体型及其信息，针对待测个体上有两种及以上分型情况的二倍体类SNP，依据该SNP位点的分型情况的二项分布概率计算其属于测序误差的概率P，由此剔除潜在的重复序列，组装过程中若两个SNP之间有超过两种的连接方式，则同样依据上述方法计算是否为测序误差导致，最后根据信息熵从高到低的顺序依次对微单体型排列，即得到信息含量较高的微单体型标记。本方法可以直接从个体测序结果中获得单体型的情况，解决了非模式生物因测序误差及组装造成的影响，结果可靠。