一种快速精确的蛋白质绑定口袋结构对齐方法

摘要

一种快速精确的蛋白质绑定口袋结构对齐方法，首先，通过计算蛋白质绑定口袋内部每个残基与其它残基在三维空间中的位置关系信息，组成该残基的特征向量；其次，通过比较两个来自不同蛋白质绑定口袋的残基的特征向量之间的相似性，构建蛋白质绑定口袋之间的打分矩阵；最后，使用贪心算法迭代地搜索蛋白质绑定口袋间的对齐信息。本发明提供一种计算代价低、对齐精确性高的蛋白质绑定口袋结构对齐方法。