La taxonomie bactérienne moderne : revue des techniques - application à la caractérisation des bactéries nodulant les légumineuses (BNL)

摘要

La taxonomie est la science qui étudie les relations entre les organismes. Elle englobe la classification, la nomenclature et l'identification. La taxonomie bactérienne moderne se base sur plusieurs techniques moléculaires, chacune puisant l'information à des niveaux cellulaires différents (protéines, acides gras, ADN...). Elle est de ce fait appelée taxonomie polyphasique. Les résultats obtenus de différents niveaux cellulaires permettent une classification (consensus ) du microorganisme. Jusque dans les années 1970, les microbiologistes ne disposaient pas de beaucoup de techniques pour la classification, ils se basaient essentiellement sur des critères phénotypiques (capacité à noduler une espèce de légumineuse pour un Rhizobium par exemple), mais la généralisation des techniques de caractérisation basées sur la réaction de polymérisation en chaine a révolutionné la taxonomie bactérienne. Les bactéries nodulant les légumineuses ont vu leur classification sans cesse remaniée, surtout ces dernières années, grace aux techniques de la taxonomie polyphasique. Nous présentons ici un apercu des principales techniques moléculaires actuellement employées pour la caractérisation bactérienne, avec des exemples d'application de ces techniques puisés dans les bactéries nodulant les légumineuses.