土壌中の遺伝子、遺伝子情報…何ができるのか，何がわかるのか: 6．土壌微生物の群集構造解析（その2）DGGE，水田土壌への適用

摘要

DGGEの原理，一般的な利点と問題点は本講座の第5回で既に詳細に述べられている．今回ほ著者が所属する研究室でこれまでに行われたDGGE法による水日j生態系の様々な微生物群集に関する研究の中から実際の解析事例を紹介し，DGGE法により何ができ，何が分かるのかについて，さらには問題点，すなわち，DGGE法でほできないことと分からないことも含めて具体的に述べてみたい．なお，表題では水田土壌とあるが，ここでほ田面水，水稲根，土壌中に施用された稲わらや稲わら堆肥，堆肥化過程の稲わらなど，土壌だけでなく水田生態系を構成する関連した種々の部位、環境を対象に含めて，紹介する．