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Complete mitochondrial genome of Gracilaria changii (Rhodophyta: Gracilariaceae)

机译:Gracilaria Changii完全线粒体基因组(肾甲膜:Gracilariaceae)

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摘要

Gracilaria changii is an agarophyte that has been used for agar extraction and as salads. Currently, there are only three complete mitochondrial genomes of Gracilaria species available in GenBank. We report here the complete mitogenome of G. changii from Peninsular Malaysia using next-generation sequencing. It had a total length of 25,729 bp, comprising 50 genes (25 protein-coding genes - PCGs, 2 rRNA genes, and 23 tRNA genes). The gene synteny of G. changii was similar to G. salicornia from Peninsular Malaysia with three additional tRNA genes (trnY, trnR, trnS1) in comparison to G. salicornia from Hawaii. G. changii had similar start codons (ATG) for all the PCGs, but three (rps3, rpl20, and secY) had incomplete T-stop codons. Genomic data of G. changii is useful to build a more complete dataset for phylogenetic analyses in Gracilariaceae.
机译:Gracilaria changii是一种用于琼脂提取和沙拉的伞形物节。 目前,Genbank只有三种Gracilaria种类的三种完整的线粒体基因组。 我们在此报告使用下一代测序的半岛马来西亚的G. changii的完全促型促型促型促型。 它的总长度为25,729bp,包含50个基因(25个蛋白质编码基因 - PCG,2 rRNA基因和23个TRNA基因)。 G. vendii的基因同步与来自半岛马来西亚的G. Salicornia类似于来自夏威夷的G. Salicornia的三种额外的TRNA基因(TRNR,TRNS1)。 G. vengii对所有PCG有类似的起始密码子(ATG),但是三个(RPS3,RPL20和SECY)具有不完整的T-STOP密码子。 G.常龄基的基因组数据可用于建立一个更完整的数据集在Gracilariaceae中的系统发育分析。

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