マクロファージの転写?卜ランスクリプ卜一ム?ェピゲノム解析

摘要

近年，次世代シークェンサ一によるChIP-seq 法（クロマチン免疫沈降-高速シークェンス法）の 進歩により，転写因子とDNAの相互作用ゃェピ ゲノム修飾を全ゲノムスケールで観察することが 比較的容易に行うことができるようになった.クロマチン免疫沈降法(ChIP)は，転写因子な どのDNAとの相互作用を定量的に評価しうる分 子生物学的手法である（図1).ホルムアルデヒド 水溶液(ホルマリン液）などを用いてDN A-蛋白 をクロスリンクした後に核のみを抽出し，ソニケ一ションを行ってDNAを200?300 bp程度ま で断片化した後，目的の蛋白に対する特異的な抗 体で免疫沈降を行う.