论文说明
声明
摘要
符号说明
第1章文献综述
1.1内源性反转录病毒的简述
1.1.1内源性反转录病毒基因组的结构
1.1.2内源性反转录病毒与天然免疫
1.2胶原样结构巨噬细胞受体Marco的研究进展
1.2.1Marco的结构与功能
1.2.2Marco与病毒
1.3巨噬细胞极化的简述
1.3.1巨噬细胞极化的分型、功能与调控其的分子机制
1.3.2巨噬细胞极化与病毒感染
1.4研究目的与意义
第2章鸡内源性反转录病毒ALVEl敲除对巨噬细胞基因表达谱的影响
前言
2.1材料
2.1.1细胞系
2.1.2主要试剂
2.1.3主要仪器
2.1.4主要试剂的配制
2.2实验方法
2.2.1转录组测序样品准备
2.2.2转录组测序结果分析
2.2.3转录组测序结果验证
2.3结果与分析
2.3.1RNA-seq相关性
2.3.2差异表达基因筛选
2.3.3差异表达基因聚类分析
2.3.4差异基因GO富集分析
2.3.5差异基因KEGG通路富集分析
2.3.6炎症反应相关基因GSEA分析
2.3.7差异基因RT-qPCR验证
2.4讨论
2.5小结
第3章env序列与Marco之间存在正向调控关系
前言
3.1材料
3.1.1细胞系及质粒载体
3.1.2主要试剂
3.1.3主要仪器
3.1.4主要试剂的配制
3.2实验方法
3.2.1env过表达载体pcDNA3.1-env1/2-ALVE1的构建
3.2.2ALVE1 env干扰序列合成
3.2.3HD11细胞瞬时转染
3.2.4env序列过表达和干扰后检测env和Marco转录水平变化
3.2.5慢病毒质粒构建
3.2.6慢病毒的包装
3.2.7慢病毒感染HDll细胞后通过嘌呤霉素药筛获得阳性过表达细胞
3.2.8Marco过表达载体pcDNA3.1-Marco的构建
3.2.9Marco基因敲除细胞系的建立
3.2.10Marco过表达和敲除后env和Marco转录水平变化的检测
3.2.11统计分析
3.3结果与分析
3.3.1成功构建本文所需载体
3.3.2收获pLV-env1-ALVE1和pLV-env2-ALVE1慢病毒
3.3.3成功构建env1和env2序列稳定表达的HD11细胞系
3.3.4gRNA靶点效率检测结果
3.3.5成功构建Marco基因去表达的HD11细胞系
3.3.6env序列与Marco之间存在正向调控关系
3.4讨论
3.5小结
第4章env序列通过Marco基因介导巨噬细胞产生抗病毒天然免疫作用
前言
4.1材料
4.1.1细胞、质粒、病毒和抗体
4.1.2主要试剂
4.1.3主要仪器
4.2实验方法
4.2.1细胞转染
4.2.3提取总RNA、逆转录和荧光定量PCR
4.2.4提取总蛋白及Western blot
4.2.5统计分析
4.3结果与分析
4.3.1ALV-Jenv基因过表达抑制Marco转录
4.3.2过表达Marco抑制ALV-J复制
4.3.3过表达Marco诱导病毒dsRNA识别受体基因转录
4.3.4过表达Marco诱导抗病毒天然免疫基因转录
4.4讨论
4.5小结
全文总结
创新性
研究展望
参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
扬州大学;