АВТОМАТИЧЕСКАЯ ГЕНЕРАЦИЯ СХЕМ ГЕННЫХ СЕТЕЙ НА ОСНОВЕ ИХ ФОРМАЛИЗОВАННОГО ОПИСАНИЯ В БАЗЕ ДАННЫХ GeneNet

摘要

Создана база данных по генным сетям GeneNet. На примерах регуляции противовирусного ответа и гематопоэза разработаны основные принципы формализованного описания генных сетей. Создана программа Java для автоматического графического представления диаграмм генных сетей на основе их формализованного описания. Разработана система фильтров, позволяющая отобрать для графического представления отдельные компонентысети. Отбор можно проводить по определенному типу воздействия, виду организма и/или типу клеток. База данных GeneNet доступна через Internet по адресу: http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/systems /MGL/GeneNet/.