基于基因表达数据库分析EZH2基因在乳腺癌中的表达及其临床意义

摘要

目的:采用生物信息学数据挖掘方法探讨乳腺癌EZH2基因在Oncomie,Kaplan-Meier Plotter和String数据平台中差异表达情况及其临床意义。方法:对肿瘤相关基因芯片表达谱数据库Oncomine,肿瘤生存数据库Kaplan-Meier Plotter和蛋白相互作用数据库String进行数据挖掘。首先在Oncomine数据库中比较EZH2基因在乳腺癌组织及对应正常组织中的差异,并对相关芯片数据进行荟萃分析。应用Kaplan-Meier Plotter数据分析EZH2 mRNA高低表达组乳腺癌患者总生存(OS)和无疾病进展生存(PFS)是否存在差异。同时,应用蛋白相互作用网络,分析与EZH2相互作用及共表达的相关蛋白。结果:Oncomine数据库中,有三项基因表达芯片数据关于EZH2在乳腺癌与正常组织中的差异表达分析。三项基因芯片结果包含了11个数据系列,分别对比了不同乳腺癌病理组织类型与对应的正常乳腺组织EZH2 mRNA表达结果,11个数据系列的荟萃分析显示,EZH2 mRNA在乳腺癌组织中的表达水平显著高于正常组织(P<0.05)。生存分析显示,EZH2高低表达组总生存(OS)期分别为79.2个月和120.0个月,差异有统计学意义(HR=1.3195%CI:1.05~1.62,P<0.05),而高低表达组无疾病进展生存期(PFS)分别为34.8个月和74.0个月,差异有统计学意义(HR=1.49,95%CI:1.34~1.67,P<0.05)。String数据库中分析EZH2相互作用的蛋白,节点数共11个包括SUZ12,EED,AEBP2等,作用评分均大于0.9。上述相互作用蛋白大多为多梳蛋白家族,大多与组蛋白修饰有关。结论:与正常的乳腺组织相比,乳腺癌组织中EZH2 mRNA表达水平明显上调,并与患者生存时间较短有关。EZH2蛋白与SUZ12,EED,AEBP2蛋白相互作用并呈现共表达趋势。