РОЛЬ ДОПОЛНИТЕЛЬНЫХ САЙТОВ СВЯЗЫВАНИЯ БЕЛКА CytR В РЕГУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНА udp Escherichia coli

摘要

Уточнена нуклеотидная последовательность фрагмента хромосомы Е. coli К-12 размером 1000 пн, расположенного между структурными генами metE и udp и включающего промоторную область гена udp. В пределах этого фрагмента идентифицированы дополнительные сайты связывания для белков CytR и CRP,расположенные за пределами "канонического промотора гена udp. На основе плазмид pSKII и pJEL250 получен набор делеционных вариантов с укороченной регуляторной областью гена udp. Показано, что уровень CytR-регуляции гена udp зависит от протяжённости регуляторной области относительно сайта инициации транскрипции. На основании этих данных делается заключение о функциональной значимости локализованных в регуляторной области дополнительных сайтов связывания для белка CytR в регуляции экспрессии гена udp. Это заключение подтверждается поведением промоторного мутанта udpP264, содержащего делецию, которая перекрывает основной сайт связывания белка CytR, находящийся в пределах "канонического" промотора. Несмотря на делецию, экспрессия гена udp у мутанта udpP264 сохраняет зависимость от аллель-ного состояния гена cytR. Показано, что функционирование белка CytR в качестве репрессора или активатора транскрипции зависит от конфигурации промотора и определяется взаимным расположением сайтов связывания для белков CytR и CRP и их количеством.