マルチプレックス法によるバクテリアゲノムのde novo DNA配列解読

摘要

次世代DNAシーク工ンサー（NGS）の技術開発により． 1解析あたり600Gb以上という超大量のDNA配列を得ることができるようになった．今後もアウトプットは増加し，パクテリアゲノムも代表的な株だけでなく，株ごとの解読も行われると考えられる． そこで． デー夕量の多いショートリードNGSでのマルチプレックス法を用いて複数のバクテリアゲノムのdenovo DNA配列解読の結果，リビート配列以外の領域をほば解読することができた．本稿では．マルチプレックス法での解析の流れと．de novo DNA配列解読でのアセンブラや冗長度の条件などについて紹介する．