SAAP力場：単一アミノ酸ポテンシャルを利用した新しいタンパク質力場の開発

摘要

タンパク質の構造や機能を原子レベルで解明するためには力場（force field）の活用が不可欠である．現在，信頼性の高いタンパク質力場としてAMBER，CHARMM，ECEPPなどが広く用いられている．これらの力場は，タンパク質の立体構造ヤフオールディング過程をうまく再現するように，長年にわたって改良が施されてきた．しかしながら，分子シミユレーションによって実験データを正しく再現することは，コンピュータが高速化した現在においても，かなり難しい作業である．別の表現をすれ硯正しい結果が分子シミュレーションで得られるかどうかは，網いた力場の精度に大きく依存している．